I colloquy Flashcards
(197 cards)
1
Q
koks procesas laikomas klasikinės biotechnologijos pradžia?
A
fermentacija
2
Q
koks įvykis žymi šiuolaikinės biotechnologijos pradžią?
A
rekombinantinio žmogaus insulino pagaminimas
3
Q
kas įeina į baltają biotechnologiją?
A
pramonė
4
Q
kas įeina į geltonąją biotechnologiją?
A
maistas
5
Q
kas įeina į žaliąją biotechnologiją?
A
žemės ūkis
6
Q
kas įeina į mėlynąją biotechnologiją?
A
akvakultūra
7
Q
kas įeina į raudonąją biotechnologiją? (2)
A
vaistinės medžiagos, žmogaus sveikata
8
Q
raudonosios biotechnologijos objektai (5)
A
- bakterijos;
- mielės;
- augalų ląst.;
- gyvūnų ląst.;
- virusai
9
Q
3GM augalų grupės
A
- galintys augti ypatingomis sąlygomis;
- pagerintos maistinės vertės;
- biofabrikai
10
Q
kokie maisto produktai daugiausiai gaminami geltonosios biotechnologijos srityje? (4)
A
- vynas;
- sūris;
- alus;
- vabzdžiai
11
Q
kas įeina į violetinę biotechnologiją? (3)
A
- teisė;
- etika;
- filosofija
12
Q
kas įeina į tamsiąją biotechnologiją? (2)
A
- bioterorizmas;
2. biologinis ginklas
13
Q
kas įeina į auksinę biotechnologiją? (3)
A
- bioinformatika;
- informatika;
- čipai
14
Q
kas įeina į rudąją biotechnologiją? (2)
A
- desertai;
2. alkoholis
15
Q
kas įeina į pilkąją biotechnologiją?
A
aplinkosauga
16
Q
5 pramoninio biotechnologinio proceso etapai
A
- žaliava;
- pirminis apdorojimas;
- fermentacija + transformacija;
- antrinis apdorojimas;
- švarus produktas
17
Q
kas įeina į pirminį apdorojimą?
A
biokatalizatoriaus ir jo optimalios biosistemos parinkimas
18
Q
kas įeina į antrinį apdorojimą? (2)
A
- prod. atskyrimas;
2. prod. gryninimas
19
Q
kokia sistema yra geriausia biokatalizatoriui?
A
mikroorganizmai, augalai ir ląstelės, kurios sparčiai auga
20
Q
5 biotechnologijų produktų grupės
A
- fermentai;
- monokloniniai antikūniai;
- rekombinantiniai baltymai;
- organizmai;
- ląstelės
21
Q
kas yra monokloniniai antikūniai?
A
homogeniškų antikūnių populiacija, kuri turi tą patį antigeninį specifiškumą ir yra kilusi iš vieno antikūnius gaminančių ląstelių klono
22
Q
kas yra rekombinantiniai baltymai?
A
baltymai, dirbtinai sintetinami tokiose ląstelėse, kurioms šie baltymai yra svetimi
23
Q
pagal ką fermentai yra atskiriami vieni nuo kitų?
A
pagal katalizuojamą reakciją
24
Q
transferazių funkcija
A
funkcinių gr. pernaša nuo vienos molek. prie kitos
25
hidrolazių funkcija
skaido chem. ryšius dalyvaujant vandeniui
26
liazių funkcija
nedalyvaujant vandeniui skaido ryšius tarp substrato atomų
27
izomerazių funkcija
tos pačios molek. vidumolekulinis persitvarkymas
28
ligazių funkcija
naudodamos ATP hidrolizės metu išsiskiriančia energiją, katalizuoja C-O, C-S, C-C kovalentinių ryšių susidarymą
29
fermentų klasifikavimo kodo pirmojo skaičiaus reikšmė
viena iš 6 klasių
30
fermentų klasifikavimo kodo antrojo skaičiaus reikšmė
poklasis
31
fermentų klasifikavimo kodo trečiojo skaičiaus reikšmė
popoklasis
32
fermentų klasifikavimo kodo ketvirtojo skaičiaus reikšmė
fermento eilės nr. popoklasyje
33
monokloninių antikūnų panaudojimo sritys (4)
1. diagnostika;
2. histologija;
3. klinik. chem.;
4. mikrobiologija
34
kas skalbimo milteliuose pakeitė aplinką teršiančius fosfatus? (2)
lipazės, proteazės
35
kaip vaistų gamybai pasitarnauja fermentai?
sutrumpina vit. C, B2 gamybos laiką
36
kas yra genų rekombinacija?
gen. medž. pasikeitimas tarp dviejų DNR molek.
37
kas yra DNR replikacija?
DNR sintezė, vykstanti prieš ląst. dalijimąsi
38
genų inžinerijoje taikomi metodai (6)
1. geno išskyrimas;
2. geno perkėlimas į vektorių;
3. vektorių kūrimas;
4. vektorių įterpimas į ląst. ir genomą;
5. perkelto geno veiklumo užtikrinimas;
6. ląst., kuriose perkeltas genas veiklus, atranka
39
kas yra DNR vektoriai?
mažos DNR molekulės, pritaikytos svetimos DNR fragmentų įsiuvimui ir padauginimui
40
kas yra plazmidės?
mažos DNR, galinčios egzistuoti viduje ląstelių atskirai nuo ląstelės DNR
41
3 prokariotinių ląst. grupės
1. termofilai;
2. mezofilai;
3. psichofilai
42
kam naudojami termofilai?
genų produktų, stabilių aukštose temp., gavimui
43
psichofilų panaudojimo pvz.
toksinių teršalų šaltuose vandenyse biodegeneracijai
44
kokį ploidiškumą ir kiek chromosomų paprastai turi prokariotai?
haploidai; 1 chrom.
45
kokia dažniausiai yra mikroorganizmų chromosoma?
žiedinė
46
kokia yra E. coli Gramo dažymo būdu?
neigiama
47
kokiose sąlygose auginama E. coli, kad būtų gauta didesnė išeiga?
aerobinėse
48
kas yra nukleoidas?
kompaktiškai supakuota DNR ląstelėje
49
F plazmidės funkcija
genų info perdavimas į kitas ląst.
50
2 R plazmidės funkcijos
1. atsparumas antibiotikams;
| 2. toksinų, adhezinų gamyba
51
4 reikalavimai plazmidėms
1. mažas dydis;
2. kirpimo vietos;
3. replikacijos pradžios seka ORI;
4. atrankos genetiniai markeriai
52
kokios DNR sekos yra būtinos plazmidės replikacijai?
ori
53
kas jungiasi prie ori?
DNR polimerazės
54
kur turi būti klonavimo sritis?
plazmidės regione, kuris nėra būtinas replikacijai ar kitai svarbiai plazmidės išsilaikymo ląst. funkcijai
55
kodėl reikia atrankos geno?
nes bakterinės plazmidės transformacija nėra efektyvi
56
ką reiškia bla?
atsparumą ampilicinui
57
ką reiškia tc?
atsparumą tetraciklinui
58
kiek plazmidžių maždaug būna genome?
20
59
kas yra transformatų selekcija?
klonų, į kuriuos transformacijos metu pateko plazmidė, atranka
60
kur dauginasi Ff bakteriofagai?
E. coli F+ kamienuose
61
kodėl Ff bakteriofagai dauginasi E. coli F+ kamienuose?
nes adsorbcijai prie infekuojamos bakterijos jie naudoja F faktoriaus formuojamus pilius
62
lėčiau ar greičiau auga bakterijos, infekuotos M13 bakteriofagu?
lėčiau
63
kas yra fagemidės?
vektoriai, savyje kombinuojantys plazmidžių ir bakteriofagų savybes
64
bakteriofago lemda 2 vystymosi alternatyvos
1. lizuojantis vystymosi kelias;
| 2. lizogeninis vystymosi kelias
65
kas yra kosmidės?
plazmidės, leidžiančios klonuoti ir dauginti didelius DNR fragmentus
66
kas yra Ylp plazmidės?
vektoriai, kurie turi mielių ar kitokį geną transformantų atrankai, bet neturi sekos, užtikrinančios plazmidės replikaciją mielėse
67
ką galima padaryti su Ylp plazmidėmis?
integruoti DNR sekas į mielių genomo homologines dalis
68
kodėl Ylp plazmidės tinka integravimui į DNR sekas mielių genomo homologinėse dalyse?
nes mielėse S. cerevisiae homologinė rekombinacija vyksta labai efektyviai ir tiksliai
69
ką turi YRp plazmidės?
mielių genomo fragmentą (ARS seką)
70
ką užtikrina ARS seka?
plazmidės autonomišką replikaciją
71
YRp plazmidžių pliusas
labai efektyviai transformuoja mieles
72
YRp plazmidžių minusas
transformantai būna labai nestabilūs
73
YRp plazmidžių transformantų nestabilumo priežastis
netolygus plazmidės pasiskirstymas tarp motininės ir dukterinės ląstelių mielių pumpuravimo metu
74
kodėl YRp plazmidė lieka motininėje ląstelėje ir tik maža dalis patenka į atsipumpuruojančią dukterinę ląst.?
nes šios plazmidės neturi pasiskirstymo tarp pumpuruojančių ląstelių mechanizmo
75
kas yra YCp plazmidės?
centromeros seką turinčios plazmidės
76
kiek nukleotidų seka sudaro S. cerevisiae centromera?
100-200
77
S. cerevisiae centromeros sekos įjungimo į YRp plazmides rezultatai (2)
1. padidina stabilumą iki 99 proc.;
| 2. kopijų sk. sumažėja iki 1-2 plazmidžių ląstelei
78
kas yra YEp?
episominės plazmidės
79
kaip sukurtos YEp?
naudojant mielių 2mikrom plazmidę
80
kur randama 2mikrom plazmidė?
daugumoje mielių kamienų
81
ką užtikrina YEp plazmidė? (2)
autonomišką replikaciją;
| pakankamą stabilumą
82
kokiai klasei priklauso 2mikrom plazmidė?
savanaudiškų DNR klasei
83
kokį dydį turi pasiekti linijinės plazmidės, kad pasiektų stabilumą?
100 kb
84
kokius vektorius naudojant sukurti visi mielių vektoriai?
E. coli
85
agrobacterium tumefaciens funkcijos (2)
1. infekuoja augalą per pežeistas vietas;
| 2. aktyvina augalų ląstelių nereguliuojamą dalijimąsi
86
kas yra bakulovirusai?
vabzdžių virusai
87
ką infekuoja bakulovirusai?
Lepidoptera, Diptera, Hymenophera ir kt. vabzdžių lervas
88
kokioje stadijoje esantys vabzdžiai yra labiausiai jautrūs bakulovirusams?
lervų
89
kas sudaro bakuloviruso genomą?
dvigrandė uždara DNR
90
kokio ilgio DNR sudaro bakuloviruso genomą?
80-150 bp
91
kam buvo naudoti vaccinia virusai?
žmonių vakcinacijai prieš raupus
92
kur replikuojasi vaccinia virusai?
citoplazmoje (dėl to turi nepriklausomas replikacijos ir transkripcijos sistemas)
93
kas sudaro vaccinia viruso genomą?
linijinė, dvigrandė, apie 200 kb DNR, suformuojanti linijinį dupleksą su segtuko formos kilpomis galuose
94
iš ko sudarytas virionas? (2)
1. sudėtingos viruso šerdies;
| 2. šerdį supančio lipoproteininio paviršiaus
95
kas yra viruso šerdyje?
baltymai, reikalingi viruso transkripcijai
96
kam dažniausiai naudojami vaccinia vektoriai?
kDNR raiškai
97
kur prijungiama geno kDNR?
prie viruso promotoriaus
98
kodėl yra būtinas viruso promotorių naudojimas?
nes Vaccinia viruso RNR polimerazė atpažįsta tik virusinius promotorius
99
kokiu būdu į viruso genomą yra įvedama ekspresijos kasetė?
rekombinacijos
100
koks yra tradicinis genų įterpimo taikinys?
TK genas
101
Viruso TK funkcija
fosforilina (aktyvina) nukleotidų analogus
102
kodėl yra atsisakoma gyvų vakcinų?
nes imunodeficito sąlygomis bet koks virusas tampa pavojingu
103
kam naudojami Vaccinia viruso vektoriai?
rekombinantinių baltymų gavimui žinduolių ląst.
104
kokie genai naudojami gauti stabilią žinduolių ląstelių transformaciją?
apsaugantys nuo citotoksinių junginių
105
kur analizuojamas reporterinis baltymas tyrimuose, kur naudojami in vitro žymenys? (2)
ląstelių lizatuose;
| augimo terpėje
106
kokie metodai naudojami in vitro naudojamų žymenų testavimui? (2)
biocheminiai;
| imunologiniai
107
iš ko kilės CAT (chloramfenikolio acetiltreansferazės) genas?
iš bakterijų
108
kodėl CAT yra patogus?
nes žinduolių ląstelėse nėra jam giminingų baltymų, trukdančių testavimui
109
kuo paremtas CAT testavimas? (2)
1. izotopiniais metodais;
| 2. ELISA
110
kas įvyksta, kai substratas sumaišomas su ląstelių lizatu, turinčiu liuciferazės?
lizatas skleidžia trumpą blyksnį, kurį fiksuoja luminometras
111
ką hidrolizuoja E. coli beta galaktozidazė?
galaktozidus
112
iš kur izoliuotas genas GFP?
iš medūzų
113
ką galima stebėti suliejus GFP su tiriamuoju genu? (3)
baltymo sintezę, lokalizaciją, judėjimą ląstelėje
114
2 virusinių vektorių klasės
1. RV, Lentivirusai, AVV - integruojasi į genomą;
| 2. Adv, HSV1, AVV - kaip ekstrachromosominiai elementai
115
4 grupės fermentų, naudojamų DNR manipuliacijoms atlikti
1. nukleazės;
2. ligazės;
3. polimerazės;
4. modifikacijos fermentai
116
nukleazių funkcijos (3)
1. kerpa;
2. trumpina;
3. degraduoja nukleor. molek.
117
ligazių funkcija
sujungia nukleorūgščių molek.
118
polimerazių funkcija
kopijuoja molekules
119
modifikacijos fermentų funkcija
prideda/pašalina spec. chem. grupes
120
kokį ryšį suardo nukleazės, ardydamos DNR molekules?
fosfodiesterinį
121
kam naudojama DNRazėI?
pašalinti DNR priemaišoms iš RNR preparatų
122
kam naudojama DNRazėA?
pašalinti RNR priemaišoms iš DNR preparatų
123
egzonukleazės III savybės (2)
1. degraduoja vieną grandinę 3'-5';
| 2. neskaido DNR, jei 3' OH galas atsikišęs
124
pageidautinas substratas egzonukleazei III
buki DNR galai arba buki 3' galai
125
Bal31 egzonukleazės panaudojimas (3)
1. DNR trumpinimui;
2. trūkių identifikavimui;
3. delecijų ruošimui
126
S1 endonukleazės funkcija
degraduoti viengrandžius fragmentus (RNR, DNR)
127
kam naudojama S1 endonukleazė?
išsikišusių DNR fragmentų pašalinimui
128
ką daro Dnazė I?
nespecifiškai skaldo viengrandę ir dvigrandę DNR
129
kas gaunama DNR paveikus Dnaze I?
mononukleotidų ir labai trumpų oligonukleotidų mišinys
130
kam naudojama Dnazė I?
DNR pašalinimui iš įv. preparatų
131
restrikcijos endonukleazių funkcija
skaldyti DNR specifinėse atpažinimo vietose
132
3 restriktazėms duodamų pavadinimų dalys
1. pirma raidė - gentis, kitos dvi - rūšis;
2. kamieno tipas;
3. kelintas fermentas, atrastas tame organizme
133
ką bakterijoms atstoja restrikcijos-modifikacijos sistema?
imuninę sistemą, apsaugančią nuo svetimos DNR
134
iš kiek ir kokių subvienetų sudaryta I tipo R-M sistema?
5: 2 R, 2 M ir S.
135
M subvienetų funkcija
metilinimas
136
iš ko sudaryta II tipo R-M sistema?
restrikcijos endonukleazės ir metiltransferazės
137
iš ko sudaryta III tipo R-M sistema?
2 R ir 2 M subvienetų
138
iš ko sudaryta IV tipo R-M sistema?
RE fermento
139
IV tipo R-M sistemos funkcija
skaldo tik modifikuotą DNR (metilintą, pusiau metilintą, gliukzyl-hidroksimetilintą)
140
kiek ir kokie genai sudaro III tipo R-M sistemas?
2 genai (mod ir res)
141
kaip III tipo R-M sistemų fermentas skelia DNR?
per specifinį atstumą nuo vieno iš 2 taikinių
142
per kokį atstumą III tipo R-M sistemų fermentas skelia DNR?
20-30 nt
143
kam III tipo sistemos svarbios patogeninėse bakterijose?
virulentiškumui
144
kam naudingos IV tipo R-M sistemos?
apsisaugant nuo bakteriofagų, turinčių labai modifikuotą DNR
145
kokiu atstumu skeliama DNR IV tipo R-M sistemomis?
30 bp nuo taikinio
146
kas yra izošizomerai?
restrikcijos endonukleazės, atpažįstančios ir vienodai skaldančios tokią pat DNR seką, bet išskirtos iš skirtingų organizmų.
147
kas yra neošizomerai?
fermentai, atpažįstantys tą pačią seką, bet kerpančios skirtingai.
148
kas yra aktyvumo vienetas?
fermento kiekis, per 1 val. suskaldantis 1 mikrogramą DNR
149
kas yra nikazės?
fermentai, atpažįstantys specifinę seką ir skeliantys tik vieną DNR grandinę
150
kam naudojamos nikazės? (2)
1. viengrandės DNR paruošimui;
| 2. linijinių DNR galų "uždarymui", suformuojant uždarais galais dvigrandes DNR
151
kokia ligazė daugiausiai naudojama genų klonavimo praktikoje DNR fragmentų sujungimui?
T4 bakteriofago DNR ligazė
152
kas naudojama norint padidinti DNR galų susidūrimo tikimybę?
PEG (polietilenglikolio) tirpalas
153
ką daro ribonukleazė H?
skaldo RNR, esančią hibride su DNR (šalina RNR pradmenis iš Okazaki fragmentų 5' galų)
154
kam naudojama Klenow fragmentas? (4)
1. DNR galų bukinimui;
2. 3' galo žymėjimui;
3. antros grandinės sintezei;
4. kDNR žymėjimui atsitiktinių pradmenų metodu
155
kuo T7 polimerazė išsiskiria nuo kitų?
gebėjimu sintetinti in vitro didelius DNR fragmentus (dideliu procesyvumu)
156
kaip veikia Taq polimerazė?
įgaliną DNR sintezės aktą kartoti daug kartų nepridedant papildomai fermento
157
kam naudojama atvirkštinė transkriptazė? (5)
1. kDNR sintezei;
2. RNR virusų diagn. (AT-PCR);
3. RNR galų kartiravimui pradmenų pratempimo reakcijoje;
4. DNR 3' galų žymėjimui, sekvenavimui;
5. norimų DNR fragmentų sintezei naudojant RNR matricą (AT-PCR)
158
kam naudojamos RNR polimerazės?
RNR sintezei in vitro
159
šarminių fosfatazių funkcija
nuo DNR galų pašalina fosfatą
160
pop. fosfatazės (3)
1. bakterijų;
2. veršio žarnų;
3. krevečių
161
krevečių šarminės fosfatazės savybės (2)
1. jautri temp.;
| 2. lengvai inaktyvuojama aukštoje temp.
162
ką skaldo agarazė? (2)
1. agarą;
| 2. agarozę
163
kam naudojama agarazė?
DNR ir RNR išgryninimui iš agarozės gelio
164
kas yra kompetentiškumas?
ląstelių sugebėjimas transformuotis, paimti svetimą DNR
165
kokie 2 parametrai naudojami vertinant transformaciją?
1. transformacijos dažnis;
| 2. efektyvumas
166
rekombinantinės DNR įvedimo į ląstelę 4 žingsniai
1. norimo geno izoliavimas, naudojant restrikcinius fermentus;
2. geno įterpimas į vektorių (ligazės pagalba);
3. vektoriaus įterpimas į šeimininką (transformacija);
4. ląst. šeimininkių padauginimas
167
kas yra konjugacija?
gen. medž. pernešimas esant kontaktui tarp dviejų ląst.
168
kokie 2 faktoriai reikalingi konjugacijai?
1. DNR vieta, kur prasideda DNR pernešimas (oriT);
| 2. baltymai pernešimui (su tra genais plazmidėje)
169
kiek ir kokius genus koduoja F+ faktorius?
26 tra genus
170
ką reikia daryti, kad visos bakterijos turėtų F+ plazmides?
sumaišyti kultūrą su F+ faktoriaus plazmidėmis ir kultūrą be plazmidės
171
kas yra genų terapija?
gydymas, ligos eigos sulėtinimas arba apsaugojimas nuo susirgimo funkcionalių genų įvedimu į organizmą
172
somatinių ląst. genų terapijos pagrindiniai taikiniai (3)
1. cistinė fibrozė;
2. raumenų distrofija;
3. vėžys
173
genų įvedimo metodai (2)
1. virusinės kilmės vektoriai;
| 2. nevirusinės kilmės DNR įvedimo sistemos
174
5 vektorių klasės virusų pragrindu
1. adenovirusų (AdV);
2. adeno-asocijuotų virusų (AAV);
3. onko-retrovirusų (RV);
4. lentivirusų;
5. herpes simplex-ą (HSV)
175
kam naudojami vektoriai, kurie negali integruotis?
laikinai geno raiškai besidalijančiose ląst. arba ilgalaikei raiškai nesidalijančiose
176
ką reikia naudoti norint gauti pastovią geno raišką proliferuojančiose ląst.?
integruojančius vektorius
177
kokie vektoriai naudojami klinikiniuose tyrimuose?
onko-RV (retrovirusai)
178
pagr. onko-RV vektorių trūkumas
galimybė infekuoti tik besidalijančias ląst.
179
kaip buvo įveiktas onko-RV pagr. trūkumas?
prie RV matrikso baltymo NLS prijungtas į branduolį nukreipiantis signalas
180
kam naudojami letivirusų vektoriai?
ramybės būsenoje esančių ląst. (kraujodaros kamieninių, nervinių, smegenų) infekcijai
181
3 svarbiausios vektorių savybės
1. vektorių tropizmas;
2. transgeno ekspresijos laikas;
3. vektoriaus imunogeniškumas
182
didžiausias ir sudėtingiausias iš genų terapijoje naudojamų virusų
Herpes simplex
183
HSV vektorių pagr. privalumai (2)
1. didelė talpa;
| 2. galimybė infekuoti nervines ląsteles
184
kur integruojasi AAV (adeno-asocijuoti virusai)?
į 19 chrom. specifinį lokusą
185
vektorių, nukreiptų į vėžio gydymą, savybės (5)
1. turi anti-angiogeninius faktorius;
2. stabdo kraujagyslių vystymąsi auglyje;
3. turintys supresuojančius genus (p53);
4. turintys imuno-stimuliacinius genus;
5. lizuoja ląsteles
186
kokiu pagrindu konstruojami priešvėžiniai vektoriai? (2)
1. AdV;
| 2. HSV-1
187
2 nevirusinių genų įvedimo metodų tipai
1. chem.;
| 2. fiziniai
188
chem. nevirusinių vektorių rūšys (2)
1. lipopleksai;
| 2. polipleksai
189
kas yra lipopleksai?
katijoninių liposomų/micelių-DNR kompleksai
190
kas yra polipleksai?
katijoninių polimerų-DNR kompleksai
191
kaip chem. nevirusiniai vektoriai patenka į ląst.?
endocitozės būdu
192
pagr. chem. nevirusinių vektorių problemos (3)
1. nestabilūs ir agreguojantys fiziologinėm sąlygom;
2. heterogeniški;
3. mažas efektyvumas
193
fizinių nevirusinių vektorių rūšys (4)
1. genų šautuvas;
2. mikroinjekcijos;
3. nuogos DNR injekcijos;
4. elektroporacija
194
pagr. genų šautuvo trūkumas
sužalojama daug ląstelių
195
kokie įrankiai naudojami DNR mikroinjekcijai suleisti? (2)
1. mikromanipuliatorius;
| 2. mikropipetė
196
pagr. 4 elektrogenoterapijos privalumai
1. paprasta ir saugu;
2. plazmidės paruošimas pigesnis ir paprastesnis nei kitų vektorių;
3. lokalu, tiksliose vietose;
4. nėra apribojimų dėl dydžio
197
pagr. 2 elektrogenoterapijos trūkumai
1. efektyvumas palyginti mažas;
| 2. geno ekspresija neilgalaikė
