Introduction à la Structure des Acides Nucléiques

Question 1

Quel est le pourcentage de gènes codant pour les protéines dans le génome

Answer 1

Moins de 3% du génome

Question 2

Pourquoi est-ce qu’on le génome comme constitué plus que du junk ADN

Answer 2

Plus de 75% de l’ADN est transcrit en ARN

Question 3

Nommer 4 types généraux de transcrits d’ARN

Answer 3

-ARNm
-ARN ribosomaux (rARN)
-Petits non-codants (sARN)

Question 4

Quel type généraux de transcrit d’ARN englobe une grande variétés d’ARN possible, avec plus de 100 000

Answer 4

Long ARN non-codant (lncRNA)

Question 5

Quelle est l’utilité de la classe de lncRNA

Answer 5

C’est une classe qui montre tout ce que les ARN sont capables de faire fonctionnellement

Question 6

Nommer 2 fonctions des lncRNA

Answer 6

-Certains rôles critiques dans plusieurs processus biologiques (régulation épigénétique, désactivation chromosome X)
-Plusieurs sont associés à un grand nombre de maladies (cancer, cardiovasculaires,…)

Question 7

Vrai ou Faux
Est-il possible d’obtenir des structures complexes avec les lncRNAs

Answer 7

Vrai
Par le biais d’interactions moléculaires (ARN-protéines, ARN-ARN, …)

Question 8

Nomme des ARN impliquer dans la synthèse protéiques

Answer 8

ARNm, ARNt, ARNr, …

Question 9

Nomme des ARN impliqué dans la réplication de l’ADN

Answer 9

ARN télomérase, ribonucléase MRP (RNase MRP)

Question 10

Nomme des ARN impliqué dans la modification de l’ARN

Answer 10

Petit ARN nucléaire (snRNA), ribonuclease (RNaseP), …

Question 11

Nomme des ARN impliqué dans la régulation de l’ARN

Answer 11

ARN CRISPR (CRISPR-Cas9), microARN (miRNA), …

Question 12

Pourquoi est-ce qu’on considère l’ARN comme le précurseur de la vie sur terre

Answer 12

Il possède la capacité de stocker l’information génétique comme l’ADN et celle de catalyser des réactions chimiques comme les protéines

Question 13

Quel pentose on retrouve dans l’ADN

Answer 13

D2-désoxyribose

Question 14

Qu’est-ce qui différencie les ribose de l’ARN et celle de l’ADN

Answer 14

Le désoxyribose de l’ADN ne contient pas de groupement hydroxyl (OH) à la position 2’

Question 15

Quels sont les composantes des nucléosides

Answer 15

Une base liée à une pentose

Question 16

Quelle liaison retrouve-t-on dans les nucléosides

Answer 16

Une liaison glycosidique

Question 17

Quelle est la propriété du carbone de la liaison glycosidique

Answer 17

Il est anomérique

Question 18

Vrai ou Faux
Les pentoses sont peu soluble dans l’eau, donc il faut les associer à une base azotée pour augmenter sa solublité

Answer 18

Faux
Une base azotée est peu soluble, ainsi, la liaison avec les pentoses permettent une plus grande solubilité dans l’eau du nucléosides comparé à la base

Question 19

Quest-ce qu’un nucléotide

Answer 19

C’est des nucléosides phosphorylés (mono, di ou triphosphorylés)

Question 20

Nommer 2 propriétés des nucléotides

Answer 20

-Ils sont des acides polyprotiques
-Ils absorbent fortement la lumière UV

Question 21

C’est quoi un acide polyprotique

Answer 21

Une molécule qui possède plusieurs sites d’hydrogénation, en d’autres termes, plusieurs pKas.

Question 22

Pourquoi est-il important de déterminer à quel pH on utilise certains nucléotides

Answer 22

Parce qu’il est possible d’avoir différentes charges possibles selon le pH

Question 23

Donner un exemple de la propriété acide polyprotiques de nucléotides

Answer 23

Quand on met de l’ATP dans l’eau, il est impossible de que le pH de l’eau reste à 7. À cause de la propriété polyprotique, il y a une libération des protons de l’ATP dans l’eau (solution devient acide, pH2).

Question 24

Nommer dans quels situations il est pertinent de connaître la nomenclature de la chaîne de phosphate

Answer 24

-Quand il y a des modification
-Quand on travail avec des analogies du nucléotides (analogue radioactif, GTPys)

Question 25

À quel moment la numérotation des riboses sont pertinent

Answer 25

Quand on discute de la chimie des acides nucléiques

Question 26

Nommer les valeurs de pKa pour le 5’-AMP

Answer 26

-Base (N1) = 3,8 -Phosphate 1 = 6,1 -Phosphate 2 = 0,9

Question 27

Nommer les valeurs de pKAs pour le 5’-GMP

Answer 27

-Base (N1) = 9,4 -Base (N7) = 2,4 -Phosphate 1 = 6,1 -Phosphate 2 = 0,7

Question 28

Nommer les valeurs de pKas du 5’-CMP

Answer 28

-Base (N3) = 4,5 -Phosphate 1 = 6,3 -Phosphate 2 = 0,8

Question 29

Nommer les valeurs de pKas du 5’-UMP

Answer 29

-Base (N3) = 9,5 -Phosphate 1 = 6,4 -Phosphate 2 = 1,0

Question 30

Vrai ou Faux Il n’y a jamais de carte sur les riboses

Answer 30

Vrai

Question 31

Quelle propriété structurelle des bases explique la forte absorbante de la lumière UV chez les nucléosides et nucléotides

Answer 31

L’aromaticité de la structure des hétérocycles constituant les bases

Question 32

Nommer 2 situations où la proriété de fortement absorber la lumière UV est utilise pour l’analyse quantitative des nucléosides et nucléotides

Answer 32

-Quantifier le nombre de nucléotide ou nucléosides -Purification des protéines

Question 33

Quelle est la longueur d’onde qui caractérise l’ADN double brin et l’ARN simple brin

Answer 33

Une absorbante à 260 nm

Question 34

Lorsqu’on parle de la purification des protéines, qu’est-ce qui se produit lorsqu’il y a une forte absorbance à 260 nm

Answer 34

Cela suggère qu’il y a une contamination avec les acides nucléiques