Introduction cellules et méthode Flashcards

1
Q

cellules

A

unité fondamentale du vivant

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2
Q

exemples de cellule isolée

A

bactéries, protozoaires

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3
Q

organismes supérieurs

A

communautés de cellules

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4
Q

types cellulaires

A

procaryote et eucaryote

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5
Q

procaryote

A

cellule sans noyaux (1-2 micromètre)
-> organisme rudientaire

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6
Q

eucaryote

A

cellule complexe avec noyau et des organites (5 - 100 micromètre ou plus)

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7
Q

composition de cellule eucaryote (schéma à faire)

A

Membrane plasmique, Noyau, Appareil de Golgi, Membrane nucléaire, vésicule, réticulum endoplasmique, mitochondrie (correction schéma dans diapo)

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8
Q

ex organisle unicellulaire

A

bactéries, archées et plupart des protistes

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9
Q

Orga pluri ou multicellulaire

A

constitué de plusieurs cellules comme les plantes et animaux

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10
Q

caractéristique membrane plasmique

A

bicouche lipidique asymétrique + (glycol) proteines
- Glycocalyx

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11
Q

but membrane plasmique

A

intégrité cellulaire / Homéostasie

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12
Q

cytoplasme

A

Phase liquide où baigne les organites
• Fraction liquide du cytoplasme sans les organites soit obtenue après centrifugation

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13
Q

position cytoplasme

A

entre la membrane plasmique et l’enveloppe nucléaire

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14
Q

organites dans le cytosol du cytoplasme

A

Golgi
• Lysosome
• Mitochondrie
• Réticulum endoplasmique

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15
Q

Composition moléculaire du cytosol

A

Gel colloïde (4 fois plus visqueux que l’H2O)
Ph =7,0 (pH intracellulaire 7,4)
85% d’H2O
Ions: Na+, K+, Cl-, Mg2+, Ca2+
Gaz: O2, CO2
Molécules: Glucides, lipides, acides aminés, nucléotides, autres métabolites…
Macromolécules: Protéines, polysaccharides, glycoprotéines, acides nucléiques

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16
Q

biomolécules dans la cellule

A

des protéines
- des acides nucléiques, organisées ou non dans le cadre d’organites.

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17
Q

caractéristique du protéine du cytosol

A

La concentration protéique du cytosol est très élevée (estimation de 200 mg/mL)
- Les protéines représentent environ 20 à 30% du volume du cytosol
- Nombreuses protéines liées aux membranes (membrane plasmique ou des organites)

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18
Q

organites à double membrane

A
  • Noyau (chromatine, nucléole et enveloppe nucléaire double)
  • Mitochondrie (membrane externe perméable, membrane interne(crête),
    matrice contenant ADNmt
  • Chloroplaste: ADN, chlorophylle
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19
Q

système endomembranaire

A

Ensemble des cavités cytoplasmiques limitées par des membranes inter-communicantes entre elles

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20
Q

ex de système endomembranaire

A

Réticulum endoplasmique (RE), appareil de golgi, lysosomes, endosome, peroxysome

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21
Q

def RE

A

réseau de cavités en continuité avec membrane nucléaire

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22
Q

types de RE

A

RE rugueux + ribosomes
RE lisse sans ribosome

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23
Q

def Appareil de golgi

A

empilement de saccules aplatis

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24
Q

def lysosomes

A

vésicules de digestion (enzyme)

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25
def endosome
réseau de vésicules à pH acide
26
def peroxysome
vésicules riches en enzyme
27
disfonctionnement cellulaire =
pathologie
28
Nombres à connaitre pour les méthodes d'étude
- atome = 0,2 nm = 2 Ångström(s) = 2 Å - ribosome = 20 nm - bactérie = mitochondrie = 2 µm - cellule = 20 µm
29
Conditions de qualité d’une analyse morphologique
- qualité de l’échantillon - qualité du microscope.
30
1 m = (en mm, micro, nm)
10e3 mm 10e6 micromètre 10e9 nm
31
qualité du microscope
capacité de résolution du microscope
32
caractéristique cellule
minuscules - incolores - transparentes
33
autre nom microscopie optique
microscopie photonique
34
caractéristique optique
La plus ancienne utilisée. Le plus de variantes.
35
type de microscopie optique
microcopie : en lumière directe en constraste de phasae à fluorescence
36
principe microscopie en lumière directe
en absorbant certaines longueurs d'onde de la lumière.
37
principe microscopie en contraste de phase
en provoquant un déphasage des différents rayons lumineux.
38
principe microscopie à fluorescence
en émettant de la lumière à une autre longueur d'onde que celle d'origine.
39
But microscopie optique
elle va nous permettre d’observer des détails espacés de 0,2 µm et de structures plus petites que sa longueur d’onde. • Sa limite de résolution est définie par la longueur d’onde de la lumière visible qui varie de 0,4 µm(violet) à 0,7µm (rouge vif)
40
Première limite à l’observation en microscopie photonique
la limite de résolution de l’œil
41
conséquence d'observation d'objet trop petit en microscopie optique
plus de details
42
causes des effets de diffraction en microscopie optique
les photons ne suivent pas un trajet strictement rectiligne - ils traversent donc l’objet observé selon des parcours légèrement différents, interférant les uns avec les autres
43
résolution petite =
image detaillé
44
résolution grande =
Qualité d'image "pas bonne" (content Étienne ?)
45
caractéristique microscopie optique en lumière directe
le plus simple. • Utilisation de colorants (Naturels ou permettant le marquage)
46
principe de la microscopie optique en lumière directe (MOELD)
La lumière blanche émise par une lampe est concentrée sur la préparation et la traverse. Selon l'intensité de la coloration, la lumière sera plus ou moins absorbée et l'endroit apparaitra plus ou moins sombre, les zones peu marquées restant relativement claires.
47
principe coloration pour MOELD
La coloration est due soit à un colorant qui se fixe de façon préférentielle à une molécule particulière ou une famille de molécules, soit à un précipité sombre
48
origine précipé coloration du MOELD
du à l'action d'une enzyme et se produit à l'endroit ou celle-ci se trouve, ce qui permet d'observer la répartition de l'enzyme dans la structure biologique.
49
principe du microscope optique à contraste de phase (MOCDP)
basé sur le fait que les structures biologiques sont transparentes, mais qu'elles ont un indice de réfraction différent. Les rayons lumineux vont donc subir des déviations en passant d'un milieu à un autre, cela se traduit par un déphasage entre les rayons.
50
caractéristique MOCDP
basé sur le fait que les structures biologiques sont transparentes, mais qu'elles ont un indice de réfraction différent.
51
but MOCDP
observation des cellules vivantes. (important en culture cellulaire)
52
impact suppression des rayons lumineux en fonction du déphasage en MOCDP
permet d’obtenir une image en niveau de gris qui visualise tous les changements de milieu à l'intérieur de l'objet observé
53
étape microscopie optique (sauf MOCDP)
fixation inclusion coupe coloration
54
produits de fixation en optique
formol, formaldéhyde: pontage des protéines alcool: fixation des glucides Bouin: formaldéhyde + acide picrique + acide acétique
55
supports d'inclusion pur l'optique
paraffine, résines, acrylique et époxy, celloïdine (congélation possible)
56
épaisseur de coupe selon l'inclusion en optiqque
5 µm dans paraffine, ≤ 1 µm ‘’semi fines’’ dans résine.
57
appareil pour coupe en optique
microtone
58
type de coloration
"Naturels" (Hematoxyline, éosine...) Synthétique (Giemsa) Bichromes (deux colorant en même temps) Trichrome (deux colorants en même temps)
59
principe microscopie à fluorescence
La lumière émise par une source de lumière blanche est filtrée pour isoler la longueur d'onde qui va exciter la préparation puis focalisée sur la zone d'observation par l'objectif..
60
caractéristiques MF
- Utilise la capacité de molécules à émettre de la lumière quand on les éclaire avec une longueur d’onde supérieur - L'image obtenue est inverse de celle obtenue en lumière directe - les objets observés se détachent en lumineux sur le fond sombre, le contraste final étant alors beaucoup plus élevé. - il est possible d'utiliser plusieurs marquages simultanément qui seront excités et émettront avec des longueurs d'onde différentes. (faut faire plusieur photo et les racommodé pour voir mouv des cellules ou position particulier)
61
def microscopie confocale
microscopie optique réalisée sur une très faible profondeur de champ (environ 400 nm)
62
principe confocale
En positionnant le plan focal de l’objectif à différents niveaux de profondeur dans l’échantillon de réaliser des séries d’images à partir desquelles on peut obtenir une représentation tridimensionnelle de l’objet.
63
but confocal
reconstruction de l’objet par ordinateur permet de faire une construction 3D.
64
le microscope confocal fonctionne en
lumière réfléchie ou en fluorscence
65
source de lumière confocal
laser -> microscope confocal à balayage
66
en quel sciences est utilisé confocal
en biologie ainsi qu’en sciences des matériaux.
67
Principe MET
Utilise un faisceau de particules d'électrons pour illuminer un échantillon et en créer une image très agrandie.
68
résolution MET
Grande résolution (jusqu'à x 5 millions de fois et microscopes optiques limités x 2000 fois).
69
caractéristique MET
S’explique la longueur d'onde d'un électron beaucoup plus petite que celle d'un photon de lumière visible. ◦ Des lentilles électrostatiques et électromagnétiques pour former l'image en contrôlant le faisceau d'électrons et le faire converger sur un plan particulier par rapport à l'échantillon
70
étapes MET
fixation inclusion coupe cryofixation
71
fixation MET
glutaraldéhyde: pontage des protéines tétroxyde d’osmium: fixation (et coloration) des lipides
72
Inclusion MET
résines époxy: Epon, Araldite
73
coupe MET
≈ 50 nm ‘’ultra fines’’, couteau verre ou diamant
74
Cryofixation MET
Congélation brusque (propane liquide, Hélium liquide, hydrogène liquide en ‘’haute pression’’) Observation directe ou inclusion-coupe…..
75
ou sont disposés les échantillons en MET
grille de cuivre (3 mm) recouvert de carbone et/ou d'un film plastique
76
autre type de MET
Ombrage Immunomarquage tomographie cryomicroscopie
77
def ombrage
faire un moule pour observer
78
def immunomarquage
utilise anticorps associés à des particules d’or, avant fixation.
79
principe tomographie
technique qui consiste à reconstruire le volume d’un objet à partir d’une série de mesures déportées à l’extérieur de l’objet. Ces mesures peuvent être effectuées à la surface même ou à une certaine distance. Après une reconstruction informatique, le résultat fournit de nombreuses informations
80
principe cryomicroscopie
permet de réduire les dommages d’irradiation causés par le faisceau d’électrons. Elle permet également de préserver la morphologie et la structure des échantillons.
81
avantages/inconvénients cryomicroscopie
- Pas d’utilisation de colorant ou de fixateur chimique: congélation très rapidement des échantillons biologiques sous forme hydratés dans de l’éthane liquide • Nécessite une reconstruction 3D
82
principe MEB
technique de microscopie électronique capable de produire des images en haute résolution de la surface d’un échantillon en utilisant le principe des interactions électrons-matière. A noter que le MET permet d’observer des coupes !
83
caractéristique MEB
- Grandissement: de ≈10 à … ≥100 000, ◦ Spécimen fixé ou congelé, ◦ Souvent recouvert d’une pellicule métallique.