IVd. Secuenciación de proteínas y cristalografía Flashcards

(81 cards)

1
Q

_______determinó la secuencia de ______ de las cadenas polipeptídicas de la hormona insulina:

A

Frederick Sanger
Aminoácidos

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Es posible determinar la secuencia de aminoácidos a partir del conocimiento de________

A

Secuencia del genoma

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

La secuencia de _________ en un péptido o _______ se halla especifícada________

A

Aminoácidos
Proteínas
Genéticamente

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Si una proteína se aísla puede analizarse para encontrar:

A

La secuencia de aminoácidos que la conforman

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Se clona la secuencia de _______ que codifican a la__________, la cual también se clona para su estudio y hacer cambios en la secuencia. A esto se le llama:

A

ácidos nucleicos
proteína
Análisis funcional y/o estructurales

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Es el flujo de trabajo para secuenciación:

A
  1. Extracción de proteínas
  2. Separación de proteínas
  3. Procesamiento para secuenciación
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

La cuantificación, por ejemplo Bradford, se usa en este paso de la secuenciación:

A

Extracción de proteínas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

La SDS PAGE, 2D, se usa en este paso de secuenciación de proteínas:

A

Separación de proteínas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

El SDS PAGE,2D, permite la separación de proteínas por:

A

Su criterio de pureza

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Además del SDS PAGE, 2D, las proteínas pueden separarse por:

A

Cromatografía de exclusión molecular, de afinidad, de intercambio iónico

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Los agentes reductores y alquilación de cisteínas se usan en este paso de secuenciación de proteínas:

A

Procesamiento para secuenciación

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Eliminar puentes disulfuro:

A

Agentes reductores

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Evita puentes disulfuro:

A

Alquilación de proteínas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Permite determinar cuáles aminoácidos están presentes y en qué proporción:

A

Hidrólisis completa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Son los pasos de procesamiento de secuenciación de proteínas:

A
  1. Extracción
  2. Separación
  3. Proceso de secuenciación:
    3.1 Agentes reductores
    3.2 Alquilación de proteínas
    3.3 Hidrólisis completa
    3.4 Digestiones individuales , purificación de los fragmentos, secuenciación de cada fragmento, determinación de la secuencia global
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

En el procesamiento para secuenciación; las digestiones individuales son:

A

Por 2 diferentes agentes

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

En el procesamiento para secuenciación, las digestiones individuales con dos agentes es para obtener:

A

Péptidos menores a 3 KDa

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

En el procesamiento para secuenciación, la determinación de la secuencia global es por:

A

Traslape de los fragmentos individuales

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Los métodos de fragmentación de cadenas polipeptídicas todos son:

A

Proteasas

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Los métodos de fragmentación de cadenas polipeptídicas todos son proteasas, excepto:

A

Bromuro de cianógeno

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

La ruptura de cadenas polipeptídicas por proteasas puede ocurrir en estas partes del aminoácidos indicado:

A

Extremo carboxilo (C)
Extremo amino (N)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

La tripsina, de páncreas bovino, corta el aminoácido en esta parte:

A

Lisina (Lys) y Arginina (Arg)–> C

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

La proteasa submaxilar, corta el aminoácido en esta parte:

A

Arg (C)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

La quimiotripsina, corta el aminoácido en esta parte:

A

Phe, Trp, Tyr –> C

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Sthapylococcus aureus, corta el aminoácido en esta parte:
Asp, Glu (C)
26
La proteasa Asp-N-proteasa, corta el aminoácido en esta parte:
Asp, Glu (N)
27
La pepsina, corta el aminoácido en esta parte:
Leu, Phe, Trp, Tyr-->N
28
El bromuro de cianógeno, corta el aminoácido en esta parte:
Met (C)
29
La secuenciación de proteínas tiene lugar por estas 2:
1. Reacciones para identificar el aminoácido N-t 2. Espectrometría de masas
30
Las reacciones para identificar el aminoácido N-t son:
-Sanger -Edman
31
MALDI, ESI y MS/MS son sistemas de ionización para:
Espectrofotometría de masas
32
Reactivo de Sanger:
2,4-dinitro-fluoro-fenilo
33
La reacción de la degradación de________ ha sido empleada en secuenciadores automáticos:
Edman
34
Los equipos que emplean la degradación de Edman solo pueden secuenciar los________ del extremo_____:
40 primeros aminoácidos N-t
35
V o F, el rendimiento de la reacción de Edman es del 100%:
No, pierde el péptido poco a poco y al final ya no queda
36
En la degradación de Edman, se puede hidrolizar la proteína original y realizar la_________ de cada fragmento por________
Secuenciación separado
37
La secuencia de una proteína es:
Única
38
La proteína al ser cortada origina:
Patrón peptídico específico
39
Los valores exactos del conjunto de __________ de los péptidos es la representación única de la ___________ de una determinada proteína:
Masas moleculares estructura primaria
40
Es falso respecto al espectro de masas: 1. Información bidimensional 2. Representa la abundancia de los diferentes tipos de iones en función de su relación masa/carga de cada uno 3. Evidencia la relación masa/carga (m/z) y se convierte en una huella digital:
Todas son correctas
41
La espectrometría de masas es la ionización de los componentes de la muestra en_________:
Fase gaseosa
42
Se separan las especies iónicas resultantes de la espectrometría de masas de acuerdo a:
Su relación masa/carga eléctrica usando campos electromagnéticos
43
¿Por qué la relación masa/carga eléctrica no se podía aplicar para macromoléculas?
Debido a que el calentamiento para transitar a fase gaseosa las descomponía
44
Permite deducir la masa de la molécula con mucha presición:
Espectrometría de masas
45
V o F, la espectrometría de masas requiere muy poca cantidad de muestra:
Verdadero--> ng ej. spot del 2D
46
Son 3 componentes básicos de espectrometría de masas:
1. Sistema de ionización 2. Analizador de masas 3. Detector de iones
47
El sistema de ionización de espectrometría de masas incluye________ e_________ a partir de moléculas____________:
Vaporización --> moléculas en fase gaseosa Ionización Neutras
48
El analizador de masas de la espectrometría de masas separa los iones en función de:
La relación masa/carga m/z
49
El detector de iones de la espectrometría de masas detecta:
Iones formados y registro adecuado de la infor.
50
Son los 2 sistemas de ionización usados en la espectrometría de masas:
MALDI ESI
51
El sistema de ionización MALDI, usa muestras en esta fase:
Fase sólida
52
El sistema de ionización ESI, usa muestras en esta fase:
Fase líquida
53
Son analizadores de masas de la espectrometría de masas:
TOF TOF-TOF Trampa de iones tridimensional (ion trap) Q (Quadrupolo)
54
V o F, en el TOF, la muestra de iones se acelera después de salir del tubo:
Falso, se acelera antes de entrar al tubo de tiempo de vuelo
55
En el TOF, los iones más pesados se desplazan más:
Lento
56
En el TOF, el tiempo que tardan en atravesar los iones el tubo nos dice:
Su masa
57
Los iones son atrapados aplicando una radiofrecuencia en la dirección radial y un potencial continuo repulsivo en la lente de salida:
Trampa de iones
58
En la trampa de iones, al acumularse estos, salen de la trampa por un:
Voltaje auxiliar
59
Analizador de masas que funciona como un verdadero filtro de masas:
Quadrupolo
60
Por los pares alternos de las 4 barras metálicas se aplica un potencial constante que origina un movimiento lateral oscilante de los iones:
Quadrupolo
61
En el Quadrupolo, determinado ion se puede mover sin chocar con las barras e ingresar a:
Detector
62
Sistema de ionización, que consiste en una técnica de estado sólido que da préstamos en pulsos, más adecuada para el tiempo de vuelo:
MALDI
63
Sistema de ionización que es una técnica de solución que proporciona un flujo continuo de lentes, mejor para cuadrupolo, trampas de iones, etc.
ESI
64
En la detección de iones, se detecta:
Flujo iónico
65
El espectro de masas evidencia el número de __________en la muestra y el ___________ de cada uno:
Componentes Peso molecular
66
En la interpretación de la detección de iones se puede identificar también:
Coafactores unidos iones metálicos modificaciones covalentes
67
Método que determina la estructura tridimensional de una macromolécula:
Cristalografía de rayos X
68
La cristalografía de rayos X determina la estructura tridimensional de una macromolécula por medio de:
Un análisis del patrón de difracción de rayos x por un compuesto cristalino
69
La cristalografía de rayos X determina la separación de los_____ en una red cristalina, midiendo las ___________ producidas en una _________ por un_____________ difractado:
Átomos Ubicaciones de manchas Película fotográfica Haz de rayos X
70
Distancia mínima a la cual el equipo puede mostrar dos puntos como entidades separadas:
Resolución
71
La resolución depende de:
La longitud de onda de la luz
72
A menor longitud de onda de luz, hay:
Mayor resolución
73
Los rayos x tienen longitudes de onda comparables a:
Las distancias atómico
74
Los rayos X se producen al someter una carga eléctrica a:
Una aceleración (lanzar electrones sobre un metal)
75
V o F, los electrones de la macromolécula en estudio emiten a su vez rayos x:
Verdadero
76
Conforme pasa la onda los electrones______________ y la emisión es__________:
Oscilan, se aceleran En todas direcciones
77
Las emisiones de varios electrones experimentan______________:
Interferencia en diferentes direcciones
78
Son las interferencias que presentan las emisiones de los electrones:
Interferencia constructiva Interferencia destructiva
79
En la interferencia constructiva en la pantalla aparece:
Una mancha
80
En la interferencia destructiva en la pantalla aparece:
No existe señal y se observan regiones oscuras
81
La amplitud de las ondas se incrementa cuando se hallan en:
Fase