jokse<3

Question 1

Wat zijn de 2 hoofdtypes fungi o.b.v voortplanting?

Answer 1

Filamenteuze fungi en gisten

Question 2

Teken de mitose (standaard)

Question 3

Wat is het grootste verschil tussen open en gesloten mitose?

Answer 3

Open mitose (klassiek) gaat altijd gepaard met cytokinese, het splitsen van de 2 cellen na deling.

Gesloten mitose vinden we bij filamenteuze fungi en gebeurt intranucleair en gaat niet automatisch gepaard met cytokinese.

Het apicaal compartiment (waar tip-extensie en dus celdeling gebeurt) zal groeien tot een kritische verhouding van cytoplasmatisch volume/kernen bereikt zal er septatie plaatsvinden. Deze verhouding varieert van soort tot soort.

Question 4

Bij normale mitose worden chromosomen uit elkaar getrokken door microtubuli en volgt cytokinese. Wat gebeurt er met de kernen na gesloten mitose?

Answer 4

een van de kernen beweegt traag richting het oud mycelium en de andere beweegt snel richting de tip (grafiek afstand/tijd)

De kernen bewegen met behulp van de astrale microtubuli, vertrekkend vanuit de spindle pole bodies. Deze blijven vastzitten! na deling en worden gebruikt om te ‘wandelen’ langsheen celwand (zie figuur)

Question 5

Wat zijn de verschillende stappen van gesloten mitose? vergelijk met open mitose?

Answer 5

Interfase
- voorbereiden op celdeling (bij beiden hetzelfde)

Profase
- Spoelfiguur vormt in de kern bij gesloten mitose, over de hele cel bij open mitose (daar verdwijnt het kernmembraan ook, bij gesloten mitose niet!)

Metafase
- Gecompacteerd DNA (chromosomen) gaan in het evenaarsvlak liggen liggen van de kern (van de hele cel bij open mitose)

Anafase
- spoelfiguur trekt chromosomen uit elkaar en naar tegengestelde kanten van de kern (van de hele cel bij open mitose)

Telofase
- Splitsing van de dochterkernen (van de dochtercellen bij open mitose)

CYTOKINESE SOWIESO NA OPEN MITOSE, NIET NA GESLOTEN MITOSE!!!!

Question 6

Waar vindt negatief autotropisme plaats?

Answer 6

Aan de tips (nieuw mycelium), om zo veel mogelijk verspreid te gaan groeien en nieuwe plaatsen met nieuwe nutrienten te vinden.

Question 7

Waar vindt positief autotropisme plaats?

Answer 7

In oud mycelium, bijvoorbeeld
- om nutriententransport efficienter te maken > cellen groeien naar elkaar toe en versmelten om zgn. rhizomorfen (‘snelwegen’) te vormen

• ook sporocarpen (fruiting bodies) zijn gewoon versmeltingen van hyfen

Question 8

Bespreek laterale branching van hyfen

Answer 8

= enige manier om van 1 hyfe 2 hyfen te maken (anders gewoon lineaire groei)

• gebeurt subapicaal (niet thv apex) > celwand al verhard dus er moet celwand remodelling gebeuren
• branching gebeurt meestal op hetzelfde punt als septatie (cytokinese)
• frequentie branching afhankelijk van veel factoren, mechanismes niet helemaal duidelijk.
• een van de stoffen die een invloed blijken te hebben zijn heat shock proteins

Question 9

Hoe gebeurt septatie bij filamenteuze fungi?

Answer 9

ring van actine trekt samen terwijl nieuw celwandmateriaal voor het septum wordt aangevoerd in microvesikels

net zoals bij dieren en planten

Question 10

Welke organellen hebben fungi ter hoogte van de septa?

Answer 10

Ascomycota: Woronin bodies (peroxisoom-derived)
Basidiomycota: parenthosomen (ER-derived)

Question 11

Hoe worden Woronin bodies gevormd?

Answer 11

peroxisomen bevatten naast enzymen voor AZ- en vetzuuroxidatie ook self-assembly eiwitten voor woronin bodies

> vorming Woronin Body Sorting Complexes worden door deze eiwitten

> afsnoering van het peroxisoom met de vorming van een Woronin body als gevolg

> Woronin body wordt naast de porie aan de celwand gehecht via tethering factors

Question 12

Waarvoor dienen Woronin bodies?

Answer 12

Regulatie van de porie
> kunnen het sluiten wanneer er bv. toxische componenten aanwezig zijn
> kunnen het openen wanneer transport van van nutrienten/ organellen nodig is bv. bij transport van biomateriaal om aan tip-extensie te doen

Question 13

Waarom past de myceliale groei perfect bij de levensstijl van fungi?

Answer 13

Fungi komen voor in zeer heterogene omgevingen, ze kunnen door myceliale groei

• heel ver gespreid groeien om nutrienten te zoeken (bv. pionieerssituatie)
• heel compact groeien, met veel vertakkingen wanneer een patch nutrienten is gevonden (bv. bij een volwaardig bos met veel dood materiaal)

> verschillende exploration types maakt myceliale groei perfect voor heterogene omgevingen

Question 14

Bespreek in detail de profase t.e.m de anafase tijdens de gesloten mitose

Answer 14

• spindle pole bodies die vastzitten aan nucleaire enveloppe vormen de spoelfiguur uit hun MTOC.
• Elke kern heeft 2 spindle pole bodies; één waaruit spindle microtubuli vertrekken (naar de binnenkant van de kern om de chromosomen uit elkaar te trekken) en één waaruit astrale MT vertrekken (hechten vast aan celmembraan en verantwoordelijk voor beweging van de kern binnen de cel)
• De kinetochoor is een proteine complex die de microtubuli verbindt aan de centrosomen van de chromatiden
• een H3 histone variant zorgt voor de binding met DNA
• Motoreiwitten (dyeine, dynactine en kinesine) zijn verantwoordelijk voor het uit elkaar trekken van de chromosomen

Question 15

Hoe kan een kern gesplitst worden tijdens de telofase?

Answer 15

1) Median constriction (gelijke deling van het nucleoplasma)
2) double constriction > 2 splitsingen dus 3 delen in totaal, 2 delen worden bijgehouden als dochterkernen en één wordt afgebroken voor nutrienten
3) Nieuw kernmembraan wordt gewoon gevormd in een bestaande nucleus

Question 16

Vergelijk mitose bij S. cerevisieae, S. pombe en bij filamenteuze fungi (best tekenen)

Answer 16

S. cerevisieae

• budding (gelijkaardig aan tip-extension) =POLAIRE GROEI
• op een bepaald punt mitose waarbij nieuwe kern in ‘bud’ terecht komt door trekken van astrale microtubuli
• altijd gevolgd door cytokinese!

S. pombe

• eerst een beetje polaire groei maar vrij snel al New End Take Off > beide eindes beginnen groeien en kern komt in het midden terecht
• op een bepaald punt kerndeling, dochterkernen worden door astrale microtubuli naar elke kant gebracht
• altijd gevolgd door cytokinese!

Filamenteuze fungi

• gesloten mitose in apicaal compartiment
• kernen behouden astrale microtubuli na deling en wandelen ermee naar tegenovergestelde kanten
• niet altijd gevolgd door cytokinese!!!

Question 17

Vergelijk de vacuoles van planten met die van filamenteuze fungi

Answer 17

Dienen beiden voor opslag van nutrienten

Bij planten grootste deel van cel en oefenen druk uit

Bij fungi veel kleinere vacuolen die verbonden zijn met een complex netwerk van tubuli. Bij fungi zijn ze ook beweeglijk

Question 18

Bespreek de spitzenkorper

Answer 18

Organel specifiek voor filamenteuze fungi dat aan de tip van de hyfen zit
= cluster van vesikels en cytoplasmatische componenten aangevoerd van golgi apparaat & endosomen
- verantwoordelijk voor de organisatie van de groei; bepaalt welke vesikels naar waar moeten op welk tijdstip

Eventueel kan er een satteliet spitzenkorper net achter zitten die materiaal recycleert en terug naar de echte spitzenkorper brengt

Question 19

Wat is de functie van het cytoskelet in fungi? Wat is het belangrijkste verschil met ander eukaryoten?

Answer 19

= Transport van vesikels, organellen, en chromosomen

Bij andere eukaryoten ook heel belangrijk als structurele component, maar daar hebben fungi een celwand voor

Question 20

Wat zijn 3 hogere orde structuren van actine?

Answer 20

• kabels
• patches (bv. bij endosoom vorming)
• contractiele ringen (bv. bij cytokinese)

Question 21

Bespreek de polymerisatie van actine

Answer 21

G-actine (globulair) wordt in F-actine (filamenteus) omgezet door polymerisatie

Septines en formines zijn nodig

bv. Fungi 1 formine bevindt zich in de tip (actinekabels nodig voor tip-extensie) en in de septatiesites (actineringen voor cytokinese)

Question 22

Wat bedoelen we met onvolledige cytokinese?

Answer 22

Cytokinese maar niet volledige splitsing van cellen > resultaat: cellen nog verbonden maar met septum tussen

komt voor bij filamenteuze fungi

Question 23

Bespreek de structuur van microtubuli

Answer 23

Grote, holle tubes

Opgebouwd uit alfa en beta tubuline

Hebben een polariteit (+ en - end)

Plus End Tracking Proteins (TIPS) zorgen voor onderhoud dynamiek (evenwicht catastrofe/rescue)

Question 24

Wat zijn de verschillende motoreiwitten? Langs welke cytoskeletale elementen bewegen ze?

Answer 24

• Kinesine op microtubuli
• Dyneine op microtubuli
• Myosine op actine

Question 25

Bespreek de werking van motoreiwitten

Answer 25

Motoreiwitten zijn homodimeren met

• 2 zware ketens waar de ATPase activiteit plaatsvind en de microtubuli/actine gebonden zijn
• een heleboel lichte ketens die vasthangen aan cargo

ATP hydrolyse door ATPase zorgt voor het loskomen van één zware keten loskomt en springt naar een plaats verderop het filament

> wandelen langsheen actine/microtubuli

Question 26

Welke eiwitten zijn verantwoordelijk voor de polariteit?

Answer 26

De Tea proteinen zitten aan de polen > signaleren waar biomassa naartoe moet worden getransporteerd

Question 27

Waar en wanneer wordt nieuw celwandmateriaal afgezet?

Answer 27

afzetting celwandmateriaal gaat gepaard met septatie!

• contractiele actine-myosine ring duwt op celwand, knijpt cel samen wat ervoor zorgt dat lokale sepA proteinen uit elkaar gaan
  > dit zorgt voor afzetting chitine rond de krimpende actine-myosine ring (geen idee via welk mechanisme)

Question 28

Hoe zorgt een fungus ervoor dat een septum niet aan eenzelfde kant van beide kernen komt te zitten?

Answer 28

beweging van de kernen met astrale microtubuli

Question 29

Welke eiwitten zijn nodig voor septatie?

Answer 29

Actine/Myosine voor de ring

Septine/Formine/IQGAP voor de regulate (waar moet septum komen enzo)

Question 30

Wat signaleert de plaats waar een septum moet gevormd worden

Answer 30

Als cytokinese en mitose synchroon gebeuren
- positie van spoelfiguur = plaats waar septatie moet gebeuren

Als cytokinese NIET synchroon gebeurt (moet zeker niet)
- SPB zijn eigenlijk overblijfselen van mitose en kunnen ook als signaal dienen voor de plaats van septatie (LANDMARK PROTEINES)

Question 31

3 manieren van kerndeling?

Answer 31

• synchroon (alle kernen tesamen)
• parasynchronie ( eerst kernen dichtst bij tip)
• asynchronie (geen logische volgorde, alle kernen kunnen delen)

Question 32

Bespreek de verschillende fases (G0,…)

Answer 32

S - fase = duplicatie genetisch materiaal
G2 fase = rust
M fase = mitose
G1 fase = rust
G0 = escape uit cyclus vanuit G1 = gewoon groei

Question 33

Wat zijn de functies van de celwand?

Answer 33

• Vorm van de cel
• Stabilisatie van interne osmotische condities
• Bescherming tegen mechanische stress
• Scaffold voor eiwitten (eiwitten kunnen het gebruiken als basis)

Question 34

Welke enzymen zijn verantwoordelijk voor celwandsynthese en hermodellering

Answer 34

Chitine & glucaan synthases

Glucanases en chitinases

Transglycosidases

Question 35

Hoe wordt celwandmateriaal afgezet?

Answer 35

Bouwstenen gaan van binnen naar buiten via exocytose waar ze geassembleerd zullen worden tot functioneel celwand (bouw langs buiten, niet langs binnen!)

Question 36

Hoe ziet de celwand er structureel uit?

Answer 36

Fibrilaire polysacchariden (80% is chitine) vast in een gelmatrix (gelijkaardig aan ECM)

Matrix is zelf ook gemaakt van polysaccharides, glycoproteinen en andere dingen. Dient om alle andere dingen op te hangen, als mechanische barriere maar ook voor communicatie!

Question 37

Bespreek de gelaagdheid van de celwand

Answer 37

Binnenkant: geconseveerd skeletaal weefsel

Buitenkant is meer dynamisch

Question 38

Wat is chitine? Wat doet chitine synthase?

Answer 38

Een b-1-4-glycosidisch gelinkte polymeer van N-acetylglucosamine

Chitine synthase link verschillende N-acetylglucosamines aan elkaar

De polymeer kan op verschillende manieren gebouwd worden. De chitine van kreeft en insectachtigen verschilt sterk van fungi chitine!