Kapittel 25 Flashcards
(54 cards)
Hvilke tre regler er grunnleggende for replikasjon?
- replikasjon er semikonservativt
- replikasjon begynner ved et opprinnelsespunkt og fortsetter vanligvis toveis
- syntese av nytt DNA skjer i 5´–>3`-retning og er semidiskontinuerlig
Hva betyr det at DNA-replikasjon er semikonservativt?
hver DNA-tråd fungerer som en mal for syntese av ny tråd. Det produseres to nye DNA-molekyler, hver med én ny tråd og én gammel tråd.
Hva er en replikasjonsgaffel?
dynamiske punkter der foreldre-DNA blir avviklet og separert, og tråder replikert.
Hva heter de korte sekvensene som lages på sinketråden ved DNA-replikasjon?
Okazaki-fragmenter.
Hva er nukleaser?
enzymer som bryter ned nukleinsyrer
Hvor bryter eksonukleaser ned nukleinsyrer?
ved enden av molekylet
Hvor bryter endonukleaser ned nukleinsyrer?
ved spesifikke punkter inni molekylet.
Hva er DNA-polymerase?
komplekse enzymer som kan syntetisere DNA
DNA-polymeraser krever en primer, hva er det?
et strengsegment med en fri 3`-OH-gruppe som et nukleotid kan tilsettes. Må være komplementær til malen.
Hva er en primerterminus?
den frie 3`-enden av primeren
Det aktive DNA-polymerasesetet har to deler, hva er de og hva gjør de?
- Innsetningssted, den delen av det aktive setet hvor innkommende nukleotid binder seg.
- Postinnsetningssted, den delen av det aktive setet hvor det nye baseparet ligger når polymerasen glir fremover.
Hva er prosessivitet?
gjennomsnittlig antall nukleotider lagt til før en polymerase dissosierer.
Hvordan gjør DNA-polymerase I feilretting?
Translokasjon av enzymet er hemmet når et feil nukleotid tilsettes. Mange DNA-polymeraser har en indre 3-->5eksonuklease korrekturlesing, som lar enzymet fjerne et nylig tilsatt nukleotid.
Hvor mange feil er det gjennomsnittlig etter basevalg og korrekturlesing?
1 feil per 106-108 baser.
Hvorfor er det høyere nøyaktighet av E-coli-replikasjon?
pga. mismatch reparasjon.
Hvilke 3 underenheter har DNA-polymerase III* i E-coli?
α, ε og θ.
Hva gjør underenheten α?
polymerisasjonsaktivitet
Hva gjør underenheten ε?
korrekturlesning
Hva gjør underenheten θ av DNA-polymerase III* i E-coli?
assosieres med både α og ε, for å danne kjernepolymerase.
Hva kan konvertere DNA-polymerase III* til DNA-polymerase III Holoenzym?
β-underenheter, som gir en økning i prosessivitet ved å forhindre dissosiasjon av DNA-polymerase III fra DNA.
Hva er et replisom?
et DNA-replikasjonssystem som er hele komplekset av enzymer og proteiner som kreves for replikasjon.
Hva er hovedklassene av replikasjonsenzymer?
- Helikaser
- topoisomeraser
- SSB (DNA-bindende proteiner)
- primaser
- DNA-polymerase I
- RNase H1
- DNA-ligaser.
Hva er helikaser?
enzymer som beveger seg langs DNA og skiller trådene. Krever ATP
Hva gjør topoisomeraser i replikasjon?
Splitting av DNA-trådene (fra hverandre) fører til at resten av DNAet blir mer kveilet og under stress. Topoisomerase lindrer stresset skapt av trådseparasjon før og etter stedet det skjer replikasjon.
