LA RÉPLICATION (2) Flashcards
(22 cards)
c’est quoi la réplication ? C’est quoi l’ADN
La réplication : Mécanisme conduisant à la duplication de l’ADN permettant la transmission de l’information génétique d’une cellule mère à 2 cellules filles.
➔ ADN : Séquence nucléotidique contenant toute l’information génétique.
c’est quoi la transcription ? C’est quoi l’ARN
Transcription : Mécanisme permettant de transcrire l’information génétique sous forme d’ARN fonctionnels à partir de l’ARN.
➔ ARN : Séquence nucléotidique utilisée comme intermédiaire dans la synthèse des protéines.
C’est quoi la Traduction ? (ADN)
Mécanisme permettant de traduire l’information génétique des ARNm en protéine.
➔ Protéines : Séquence d’acides aminée conférant des caractères biologiques.
La replication est basé sur un modèle…?
la replication est semi conservative (≠ dispersif, conservative
C’est quoi la polymerisation ?
Par quoi est catalysé la réaction de polymerisation ?
la réaction de polymérisation de l’ADN
est catalysée par des enzymes appelées
ADN polymérase
Toutes les ADN polymérases ont besoin d’une
amorce hybridée à la matrice
avec une extrémité 3’-OH libre
Procaryote vs eucaryote def
°procaryote = micro-organisme unicellulaire dont la cellule, très petite, est dépourvue d’organites et de noyau
°eucaryote = cellule avec un noyau
c’est quoi un telomère ? Ils jouent quel rôle ?
telomère sont situé à l’extrémité des chromosomes
Ce sont des structures particulières avec séquences nucléotidiques
répétées et très conservéesC
Son rôle est de protéger l’extrémité de l’ADN (structure et maintien)
Régénération des télomères ???
Comment régénérer les télomères ?
- Au cours des division cellulaires successives, les
télomères se raccourcisses (sauf dans les cellules souches
où ils gardent leur taille initiale).
- La télomérase :
➔ Permet de conserver la longueur des chromosomes en
ajoutant une séquence répétée à l’extrémité 3’ des
télomères.
➔ C’est une ribonucléoprotéine (complexe d’une sous-
unité protéique et d’une sous unité ARN).
➔ Elle a une activité reverse transcriptase (ADN
polymérase qui utilise comme matrice un ARN).
C’est quoi la chromatographie d’exclusion ?
Ce type de chromatographie, également appelé tamisage moléculaire ou gel-filtration, vise à séparer les molécules en fonction de leur masse moléculaire, bien que la forme intervienne également. Le principe consiste à faire migrer l’échantillon à analyser au milieu de billes poreuses.
fragment de Klenow ?? C’est quoi ?
fragment de Klenow est défini comme le plus grand des 2 sous-fragments polypeptidiques obtenus à la
suite de la digestion de l’ADN polymérase I (ADN Pol I) par la subtilisine, une protéase.
C’est quoi la PCR ?
La réaction PCR (Polymerase Chain Reaction) permet d’amplifier in vitro une région spécifique d’un acide nucléique donné afin d’en obtenir une quantité suffisante pour le détecter et l’étudier.
Pour se faire, une série de réactions permettant la réplication d’une matrice d’ADN double brin est répétée en boucle. Ainsi, au cours de la réaction PCR, les produits obtenus à la fin de chaque cycle (amplicons) servent de matrice pour le cycle suivant, l’amplification est donc exponentielle.
Pour avoir réplication d’un ADN double brin, il faut agir en trois étapes.
Il faut dénaturer l’ADN pour obtenir des matrices simple brin : dénaturation.
Borner et amorcer la réplication de la séquence à amplifier à l’aide d’oligonucléotides amorces spécifiques : hybridation.
Réaliser la réaction de polymérisation du brin complémentaire. A la fin de chaque cycle, les produits sont sous forme d’ADN double brin : polymérisation.
Les trois étapes, constituant un cycle de PCR, sont effectuées à des températures différentes permettant de contrôler l’activité enzymatique. Pour effectuer ces transitions de températures, les microtubes contenant le mélange réactionnel sont placés dans un appareil programmable : un thermocycleur. Cet appareil présente un bloc chauffant qui permet d’exposer les tubes qui contiennent le mélange réactionnel à des températures choisies et pour des durées déterminées par l’expérimentateur. La réaction PCR est extrêmement rapide et ne dure que quelques heures (2 à 3 heures pour une PCR de 30 cycles).
À quoi correspondent Ta et Tm (ADN) ?
Ta (temperature d’hybridation = Tm - 5°C (utilisé en hybridation de la PCR)
Tm (temperature de demi-dénaturation) = 2 * (A+T) + 4 * ( C+G)
quels éléments sont nécessaire à la replication in vitro (PCR) ?
Une ADN polymérase thermostable (comme Taq polymérase)
* 4 dNTPs (dATP, dTTP, dGTP, dCTP)
* 2 amorces (oligonucléotides) complémentaires aux extrémités du fragment A
* Un tampon adapté (Mg²+, pH ~8, enzymes, etc.)
C’est quoi une hélicase ?
1er étape replication
dnaB
c’est quoi la primasse ?
synthèse l’amorce de l’ARN
C’est quoi la SSB ?
C’est quoi les topoisomérases ?
La topoisomérase est une enzyme qui ajoute et enlève des
supertours dans les molécules d’ADN. Elles contrôlent
donc la structure topologique de l’ADN.
- Toutes les topoisomérases connues ont 2 caractéristiques :
➔ Elles sont capables de couper et de reformer une
liaison phosphoester de l’ADN par l’intermédiaire de 2
réactions de trans-estérification.
➔ La coupure transitoire permet le passage d’un segment
d’ADN simple brin ou double brin (relâchant ainsi la
torsion de l’ADN).
C’est quoi la décaténation ?
Comment est ce que les amorces ARN sont éliminés ?
Replication ADN cicurlaire double brin
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C’est quoi les caténanes ? (Réplication)
