La réplication de l'ADN Flashcards
Combien de temps dure environ la réplication de l’ADN?
10h
Quels éléments sont nécéssaires à la réplication de l’ADN?
- dNTP
- Jonction amorce:matrice
- ADN polymérase
En quoi consiste la matrice dans jonction amorce:matrice?
Le brin-mère simple brin
En quoi consiste l’amorce dans la jonction amorce:matrice?
Brin complémentaire au brin-mère
Quel groupement effectue une attaque nucléophile sur le groupement phosphate du dNTP?
L’extrémité libre 3’-OH de l’amorce
D’où provient le dNTP qui s’ajoute à l’amorce?
Du noyau
Vrai ou faux.
La liaison entre le dNTP et l’amorce peut se faire même si les bases ne sont pas appariées entre elles. (Ex: Ajout d’un A sur un C)
Vrai, mais la liaison sera 10 000x plus efficace si la base est appariée
Quels sont les 2 activités de la paume de la main de l’ADN polymérase?
- La polymérisation
- L’exonucléase
Quels sont les rôles des ions métalliques divalents présents dans la paume de la main?
- Modifier l’environnement chimique du 3’-OH et du dNTP
- Un des ions rédiut le 3’-OH en 3’-O
- L’autre ion stabilise les phosphates B et Y
Quel est le rôle de l’exonucléase?
Vient couper les nucléotides mésappariés
Quel est le rôle des “doigts” de la main de l’ADN polymérase?
Lors d’un appariement correct, les doigts se referment sur le dNTP
Quel est l’effet de la fermeture des doigts sur le dNTP?
- Rapprocher le nucléotide des ions métalliques
- Augmenter la vitesse de catalyse
Qu’est-ce qui empêche tout appariement d’un dNTP avec la 2eme base?
La rotation de 90 degrés induite entre la 1ère et la 2ème base de la matrice
Quel est le rôle du pouce de la main de l’ADN polymérase?
- Maintient l’amorce et le site actif de la paume en position optimale
- Permet de maintenir une association forte entre l’ADN polymérase et son substrat
Pourquoi l’ADN polymérase est dite processive?
Parce qu’à chaque liaison à son substrat, elle catalyse l’ajout de plusieurs nucléotides
Qu’est-ce que la fourche de réplication?
L’endroit où l’ADN passe de 1 ADN bicaténaire à 2 ADN bicaténaire
Dans quel sens se fait la réplication?
5’ - 3’
À quoi sert la primase?
Créer des petits ARN qui servent d’amorces
Quel est le rôle de la RNase H?
Dégrade spécifiquement les ARN appariés à l’ADN, sauf le dernier ribonucléotide
Pourquoi la RNase H ne peut pas enlever le dernier ribonucléotide?
Parce qu’il peut seulement cliver la liaison d’un ribonucléotide (ARN-ARN)
Quel enzyme enlève le dernier ribonucléotide?
L’exonucléase 5’
Quel type d’énergie les hélicases utilisent-elles?
L’ATP
À quoi servent les protéines SSB?
Se lient à l’ADN simple brin pour empêcher le réappariement, la dégradation et la formation de boucles
Vrai ou faux.
Les SSB sont spécifiques.
Faux, car elles ne forment pas de liaisons hydrogènes avec les bases
