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Lab. de Genética > Lab. 9 Geles > Flashcards

Lab. 9 Geles Flashcards

1
Q

los amino acidos tienen estructura primaria, secundaria, terciaria o cuarternaria

A

los amino acidos tienen estructura primaria

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2
Q

menciona ejemplos de dos cosas que tengan estructura secundaria

A

helices alfa y hojas beta

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3
Q

el ADN del fago Lambda es digerido con que

A

el ADN del fago Lambda es digerido con la endonucleasa Hind III

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4
Q

del ADN del fago Lambda, el cual es digerido con la endonucleasa Hind III, se obtienen cuantos fragmentos discretos en pares de bases

A

8

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5
Q

que es caracteristico de los fragmentos de 23.130kb y 4.361kb en el ADN del fago Lambda digerido con la endonucleasa Hind III

A

son cohesivos y pueden anillarse formando una banda adicional

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6
Q

que se debe hacer con el marcador del ADN del fago Lambda antes de usarse

A

se debe calentar a 65 grados C por 5 minutos

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7
Q

mediante su division en partes, que significa la palabra electroforesis

A

electro - la electricidad
foresis - del griego phoros, trasladar

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8
Q

electroforesis

A

el movimiento de particulas con carga, bajo la influencia de un campo electrico a traves de un medio semisolido

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9
Q

el medio semisolido utilizado en la electroforesis puede ser de

A
  1. agarosa
  2. poliacrilamida
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10
Q

el ADN es de carga _____, gracias a _____

A

negativa, su grupo fosfato

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11
Q

las particulas de ADN viajan del electrodo _____ al electrodo _____

A

negativo al positivo

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12
Q

el electrodo negativo se conoce como

A

catodo

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13
Q

el electrodo positivo se conoce como

A

anodo

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14
Q

la migracion de particulas de ADN es inversamente proporcional a

A

el peso molecular de las muestras

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15
Q

menciona los materiales necesarios para llevar a cabo una electroforesis

A
  1. gel de agarosa o poliacrilamida
  2. camara de electroforesis
  3. fuente de energia, o power supply
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16
Q

menciona los reactivos utilizados durante una electroforesis

A
  1. loading dye
  2. tinte (EtBr)
  3. ADN
  4. amortiguador/buffer
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17
Q

el gel de agarosa es utilizada para moleculas de que tamaño y de que tipo

A

de mayor tamaño (100pb-25kb)
ADN, ARN y proteinas

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18
Q

el gel de poliacrilamida es utilizado para moleculas de que tamaño y de que tipo

A

de menor tamaño (<1,500pb)
ADN, ARN y proteinas

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19
Q

cual tipo de gel provee un mayor poder de resolucion

A

poliacrilamida

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20
Q

de donde es extraida la agarosa

A

de algas rojas del genero Gellidium y Gracillaria

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21
Q

agarosa

A

polisacarido que en diluciones de baja concentracion (de 0.5 a 2%) puede mantenerse liquido en temperaturas mayores de 50 grados C y formar un gel semisolido a temperaturas menores

el gel es una matriz de fibras, polimeros entrelazados en abundante cantidad de diluyente que atrasa la migracion de las moleculas grandes

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22
Q

para pasar del estado solido al gel inicial de agarosa, cual es la temperatura que se requiere

A

aprox. 45 grados C

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23
Q

para pasar del gel inicial de agarosa al estado solido, cual es la temp. que se requiere

A

aprox. 100 grados C

24
Q

para pasar de la estructura de gel final de agarosa al gel inicial, cual es la temp. que se requiere

A

aprox. 100 grados C

25
Q

como es la matriz del gel de agarosa

A

porosa

26
Q

una cantidad menor de agarosa en el gel es optimo para separar fragmentos lineales de ADN de que tamaño

A

de mayor tamaño

27
Q

menciona los pasos para preparar un gel de agarosa

A
  1. mezclar la agarosa y el buffer
  2. echar la mezcla en el microondas hasta que este hierva
  3. sacar la mezcla del microondas y permitir que esta se enfrie hasta 65 grados C
  4. echar la mezcla en el molde
28
Q

para los geles de agarosa, se hace una tincion con

A

bromuro de etidio (EtBr)

29
Q

por sus siglas en ingles, que significa PFGE

A

pulsed field gel electrophoresis
electroforesis en gel de campo pulsado

30
Q

que es PFGE

A

una tecnica de separacion de fragmentos de ADN desarrollada a partir de la electroforesis de gel de agarosa. aqui la direccion del campo electrico se cambia periodicamente

31
Q

cual es la diferencia entre una electroforesis en un gel de agarosa y PFGE

A

en PFGE, la direccion del campo electrico se cambia periodicamente

32
Q

en PFGE, la alternancia de la direccion del campo electrico permite separar fragmentos _____ de ADN de que tamano

A

grandes
10 kb hasta 10Mb

33
Q

quienes fueron los primeros en separar ADN de alto peso molecular y en que ano lo lograron

A

1984
Schwartz, Cantor y colaboradores

34
Q

cuales son las modificaciones que incorpora PFGE

A
  1. baja concentracion de agarosa (1%)
  2. cambios en la direccion del campo electrico
35
Q

cuales son los parametros importantes en PFGE

A
  1. voltaje
  2. el angulo del campo electrico
  3. el tiempo de conmutacion - el tiempo en cada direccion de campo electrico
  4. tempertaura
36
Q

gel de poliacrilamida

A

forma un gel transparente, es quimicamente inerte e insoluble en agua

37
Q

cual es un beneficio del gel de poliacrilamida

A

se puede controlar el tamaño de los poros, con la concentracion del acrilamida

38
Q

como se forma el gel de poliacrilamida

A

la polimerizacion de acrilamida por accion de un agente entrecruzador (bisacrilamida), un iniciador (TEMED) y un catalizador (S2O8-)

39
Q

cual es la desventaja del gel de poliacrilamida

A

su neurotoxicidad

40
Q

cual es la relacion entre el porcentaje de acrilamida y el diametro del poro

A

son inversamente proporcionales

41
Q

que tipo de camara se usa para el gel de agarosa y para el gel de poliacrilamida

A

horizontal
agarosa
ADN y ARN

vertical o de secuenciacion
poliacrilamida
ADN, ARN y proteinas

42
Q

SDS PAGE separa las proteinas por

A

masa

43
Q

PAGE Nativo (no desnaturalizante) separa las proteinas de acuerdo a

A

su razon de masa:carga
la diferencia en su densidad de carga

44
Q

cual es la tecnica de electroforesis mas ampliamente utilizada

A

SDS PAGE

45
Q

estado nativo de una proteina

A

las proteinas se encuentran en el estado plegado apropiado, no desnaturalizado o sin plegar

46
Q

Native PAGE se usa para saber

A

si algo es una enzima

47
Q

funcion de SDS

A

desnaturaliza, o rompe, proteinas

48
Q

funcion de 2-mercaptoethanol

A

reduce, o rompe, enlaces de disulfuro
hace proteinas lineales

49
Q

las estructuras terciarias contienen

A

puentes de disulfuro

50
Q

que es SDS PAGE

A

detergente/jabon anionico que separa las proteinas por su tamano

51
Q

los microsatelites se pueden apreciar en que tipo de gel

A

poliacrilamida

52
Q

en que tipo de gel las bandas no estan bien definidas

A

gel de agarosa

53
Q

gel de agarosa vs gel de poliacrilamida

A

gel de agarosa:
- menos resolucion
- camara horizontal
- mas acidos nucleicos

gel de poliacrilamida
- camara vertical o de secuenciacion
- mayor resolucion
- mas proteinas

54
Q

por sus siglas en ingles, que significa PAGE

A

poliacrilamida gel electroforesis

55
Q

cual es la funcion del stacking gel en la electroforesis de poliacrilamida

A

asegura que todas las muestras bajen a la misma vez
ej. como un arbitro en una carrera de atletismo

56
Q

menciona la desventaja de la electroforesis de poliacrilamida

A

luchas contra la gravedad

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