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bio 1157 > Le noyau (partie 1) > Flashcards

Le noyau (partie 1) Flashcards

1
Q

Quel est l’effet des moteurs protéiques lorsqu’ils se déplacent?

A

Dans une cellule eucaryote, les moteurs protéiques, en circulant le long des filaments, provoquent du mouvement dans le cytoplasme.

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2
Q

Quel est le rôle du noyau?

A

Le noyau protège et séquestre l’ADN, cela évite des collisions avec les protéines moteurs ou les cargos qu’elles traînent.

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3
Q

Quelles sont les deux étapes nécessaires pour obtenir une protéine à partir d’un gène?

A

1-Transcription : gène —> ARN pré-messager —> ARN messager

2-Traduction : ARN messager —> protéine

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4
Q

Que doit subir l’ARNm transcrit à partir de l’ADN avant d’être traduit en protéine?

A

Il doit subir plusieurs étapes de maturation : épissage, coiffe en 5’, poly-adenylation en 3’.

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5
Q

Qu’est-ce que le noyau empêche?

A

Il empêche la traduction précoce des ARNm en contrôlant leur sortie vers le cytoplasme.

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6
Q

Quelles sont les différences entre un procaryote et un eucaryote par rapport à l’obtention d’une protéine (transcription, traduction)?

A

Chez les procaryotes, le cytoplasme des bactéries ne possède pas de moteurs protéiques (pas de mouvements). L’ADN des bactéries est majoritairement sans introns (partie non codante) : la transcription et la traduction ont lieu simultanément dans le cytoplasme. Les procaryotes n’ont pas besoin de noyau.

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7
Q

Que sont les chromosomes mitotiques?

A

Les chromosomes mitotiques (forme la plus condensée) sont de gros complexes d’ADN et de protéines (chromatine).

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8
Q

Comment est-il possible d’observer les chromosomes mitotiques? Quoi utiliser pour mieux les distinguer?

A

Ils sont visibles au microscope photonique.

Pour mieux les distinguer =
-Utiliser différents colorants : Giemsa (patron caractéristique de bandes)
-Sondes fluorescentes complémentaires à des séquences spécifiques (chaque paire de chromosome a une couleur différente)

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9
Q

Qu’est-il possible de retrouver sur un chromosome (4)

A

-Séquences régulatrices (contrôle la transcription du gène, quand et combien il faut faire de protéines)
-Gênes
-Exon
-Intron

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10
Q

Le génome humain contient ________ de paires de bases ce qui équivaut à mille livres de mille pages.

A

3 milliards

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11
Q

Qu’est-ce qu’une séquence codante?

A

Donne une protéine

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12
Q

Qu’est-ce qu’une séquence régulatrice?

A

Régule l’expression des gènes

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13
Q

Qu’est-ce qu’une séquence conservée?

A

En comparant l’ADN de plusieurs organismes différents, on isole et analyse les séquences similaires. Séquence retrouvée chez de nombreux organismes.

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14
Q

Vrai ou faux : Les séquences codantes et régulatrices sont très conservées.

A

Vrai

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15
Q

Il est possible d’aligner les séquences d’ADN (en nucléotides) de plusieurs espèces différentes pour faire quoi?

A

Pour faire un BLAST (Basic Local Alignment SearchTool).

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16
Q

Vrai ou faux : Il est aussi possible d’aligner les séquences des protéines (en acides aminés) connues chez plusieurs espèces.

A

Vrai

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17
Q

Qu’est-ce que la séquence consensus?

A

C’est la séquence conservée. Elle est composée des acides aminés ou nucléotides qui occupent une position donnée le plus fréquemment.

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18
Q

Quelle est la proportion des gènes qui codent dans le génome nucléaire humain? Qui ne codent pas?

A

Gènes codant pour des protéines environ 1,5%
Séquences répétées, ne codant rien, dont la majorité sont mobiles (transposons) environ 50%.

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19
Q

Que sont des transposons?

A

Ce sont des séquences répétées qui se déplacent de manière autonome.

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20
Q

Que comporte l’ADN répétitif (3)? Sont-ils des séquences mobiles ou non mobiles?

A

-Transposons (mobiles)
-Duplications de segments chromosomiques (non mobiles)
-Séquences simples de 2 à 6 paires de bases, répétée jusqu’à 100 fois (souvent dans les centromères et les télomères) (non mobiles)

21
Q

Quel est la composition du génome d’une bactérie (3)?

A

Il y a des gènes codant des protéines sur le brin «+» et «-». Il y a des ARNt (transfert) et des ARNr (ribosomaux).

22
Q

Différence entre le génome des procaryotes et celui humain

A

Procaryote : principalement des séquences codant pour des protéines.

Eucaryote : Les séquences codant pour des protéines sont la minorité (1,5%).

23
Q

L’ADN eucaryote est très long (___ m) et doit être compacté _________ (où).

A

-2
-à l’intérieur du noyau d’une cellule (10-50µm)

24
Q

Pourquoi le compactage d’ADN est problématique? Quelle est la solution?

A

À cause des groupements phosphate chargés «-» (accumulation de la charge du même type).

Solution : Protéines avec des charges «+». Les protéines constituent la moitié de la masse moléculaire d’un chromosome eucaryote.

25
Q

En interphase, deux niveaux de compaction de l’ADN sont observés. Quels sont-ils?

A

-Fibres condensées de > ou = à 30 nm (région non transcrite)

-Fibre étendues 11 nm (région active pour la transcription), perle sur un fil

26
Q

Qu’est-ce que le nucléosome?

A

Structure de base de la chromatine et le premier niveau de compaction (perle sur un fil).

Bobines autour desquelles s’enroulent 146 paires de bases.

27
Q

De quoi est composé un nucléosome?

A

-ADN
-8 histones (4 paires différents, deux de chaque type).

Il s’agit de la fibre étendue (11 nm)

28
Q

Quels sont les types d’histone qui composent le nucléosome (4)?

A

H2A, H2B, H3, H4

29
Q

À quoi sert l’histone 1 (H1)?

A

Il stabilise l’ADN sortant des nucléosome (approche les 2 extrémités) et permet leur empilement en fibre condensée (30 nm).

30
Q

Les 4 histones du nucléosome possèdent deux régions bien distinctes. Quelles sont-elles? Que permettent-elles?

A

-Une queue N-terminale variable qui permet la régulation de la liaison de l’histone avec l’ADN

-Une partie C-terminale conservée qui permet l’assemblage du nucléosome

31
Q

Que peuvent subir les queues N d’histone? Qu’est-ce que cela permet?

A

Les queues N d’histones sortent du nucléosome et peuvent être modifiées par des enzymes. Permet de réguler le passage d’euchromatine en hétérochromatine et vice versa, H1 pas suffisant (influence le niveau de transcription).

32
Q

Quelles sont les 4 types de modifications que peuvent subir les queues N des histones?

A

-Acétylation : cache la charge «+» sur les lysines et donc il y a une perte d’interaction avec l’ADN chargé «-» (=perte des liens ioniques) = l’ADN se détache et donc moins condensé.

-Phosphorylation : le P ajouté sur les sériées et il va neutraliser une charge «+» voisine de la lysine ou d’arginine. Le P peut aussi augmenter l’effet de répulsion de l’ADN (en ajoutant plus de charges «-»).

-Méthylation et ubiquitination : l’ajout de ces groupement rend l’histone compatible à d’autres protéines (plateforme de recrutement pour les autres = permettent les changements de configuration de la queue N la rendant complémentaire à d’autres protéines … ou d’autres possibilités avec interaction protéine-protéine).

33
Q

Quel est l’ADN transcrit? Non-transcrit? Quels sont leurs noms donnés?

A

L’ADN en fibres de 11 nm (étendues) peut être transcrit en ARN. Il s’agit de euchromatine.

À partir de 30 nm (fibre condensée), on parle d’hétérochromatine. C’est l’ADN non transcrit.

34
Q

Qu’est-il possible de faire avec l’hétérochromatine (fibre condensée)?

A

Il est possible de faire des boucles à l’aide des protéines Sir (une condensation de plus).

35
Q

Plus condensée = ________ accessible aux protéines lors de la transcription, réplication, recombinaison.

A

Moins

36
Q

Quelle est la section du noyau qui apparaît plus sombre au microscope MET?

A

Le nucléole (présence de plusieurs protéines)

37
Q

Le nucléole possède deux zones. Quelles sont-elles?

A

-La zone fibrillaire (au centre) est la zone de transcription des ARN ribosomaux, à partir de 200 gènes arrangés en tandem (distribués sur 5 chromosomes chez l’humain)

-La zone granuleuse (en périphérie) est le site d’assemblage des sous-unités ribosomales (ARNr + protéines)

38
Q

Vrai ou faux : Le nucléole est délimité par une membrane.

A

Faux : Le nucléole n’est pas délimité par une membrane.

39
Q

À quoi sert un ribosome?

A

Il sert à la traduction de l’ARNm en protéine dans le cytoplasme.

40
Q

De quoi est composé un ribosome?

A

De deux sous-unités (grosse et petite) qui s’assemblent uniquement au moment de la traduction.

41
Q

De quoi sont composées les sous-unités des ribosomes?

A

D’ARN (ARNr) et de protéines

42
Q

Où s’effectue la formation des sous-unités du ribosome?

A

Dans le noyau (près du nucléole)

43
Q

Quels sont les 4 sites du ribosome?

A

-Un site de liaison pour l’ARNm

-Un site de liaison de l’amino-acyl-ARNt ou site A, qui fixe la molécule d’ARNt entrante portant un acide aminé

-Un site peptidyl-ARNt ou site P, qui fixe la molécule d’ARNt liée à l’extrémité en croissance de la chaîne polypeptidique

-Un site de sortie de l’amino-acyl-ARNt ou site E

44
Q

Vrai ou faux : L’ARNr et les protéines ribosomales ne passent pas par les mêmes étapes.

A

Vrai

ARNr dans le nucléole avant de sortir dans le nucléoplasme
Protéines ribosomales sont d’abord dans le cytoplasme avant d’entrer dans le nucléoplasme

45
Q

Expliquer la biogenèse des ribosomes (7 étapes)

A

1-Transcription des composants (ARNr, ARNm codant pour les protéines ribosomales (RP) et les facteurs d’assemblage (AF) et snoRNA0

2-Traitement (épissage (couper les introns) des pré-ARNr)

3-Modifications des pré-ARN (coiffe en 5’ et pol-adenylation en 3’), RP et AF

4-Assemblage des sous-unités en périphérie du nucléole (importation nucléaire de RP et d’AF)

5-Transport : exportation de pré-ribosomes vers le cytoplasme

6-Contrôle de la qualité et la surveillance

7-Formation du ribosome avec ses deux sous-unités lors de la traduction

46
Q

Comment les ARNm doivent être épissés?

A

Les ARNm doivent être épissés durant leur maturation à l’aide des complexes ARN-protéines appelés snRNPs. Ces derniers sont utilisés pour lier les séquences spécifiques aux extrémités des introns (ce qui permet de les enlever).

47
Q

Comment les ARNr précurseurs doivent être modifiées?

A

Les ARNr précurseurs doivent être modifiées et coupées par des snoRNPs (complexes ARN-protéines) durant leur maturation.

48
Q

Que sont les corps de Cajals?

A

C’est là que les snRPs sont assemblées et recyclées

bio 1157 (10 decks)

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