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Biochimie examen 2 > Les acides nucléiques > Flashcards

Les acides nucléiques Flashcards

1
Q

Donnez la définition d’un génome.

A

L’ensemble de l’information moléculaire qui code les instructions nécessaires à la fabrication d’un organisme.

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Q

Que veut dit ADN

A

acide désoxyribonucléique

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Q

Que veut dire ARN

A

acide ribonucléique

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4
Q

Vrai ou faux? L’ADN est moins stable que l’ARN.

A

Faux, c’est l’ADN est PLUS STABLE.

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5
Q

De quoi est composé un nucléotide?

A
  • Un sucre à 5 carbones
  • Une base azotée
  • Une groupe phosphoryle
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6
Q

Quels sont les 5 bases azotées ainsi que la catégorie à laquelle elles appartiennent?

A

-Uracile (pyrimidines)
-Thymine (pyrimidines)
-Cytosine (pyrimidines)
-Adénine (purines)
-Guanine (purines)

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7
Q

Qu’est ce que le nucléoside?

A

Le sucre + la base azotée

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8
Q

De quel sucre s’agit-il?

A

Ribose

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9
Q

De quel sucre s’agit-il?

A

Désoxyribose

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10
Q

Identifiez la base azotée.

A

Adénine

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11
Q

Identifiez la base azotée.

A

Uracile

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12
Q

Identifiez la base azotée.

A

Thymine

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13
Q

Identifiez la base azotée.

A

Cytosine

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14
Q

Identifiez la base azotée.

A

Guanine

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15
Q

Quelle est la différence dans les molécules ATP, ADP et AMP

A

Le nombre de groupement phosphate présents.
ATP = adénosine triphosphate (3)
ADP = adénosine diphosphate (2)
AMP= adénosine monophosphate (1)

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16
Q

Les acides nucléiques sont des ________ de nucléotides.

A

Polymères

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17
Q

Qu’est-ce que la règle de Chargaff en résumé ?

A

1- QA=QT et QG=QC
2- La composition en base de l’ADN est caractéristique d’un organisme.
Elle est indépendante de l’âge, du sexe, de l’état nutritionnel et des facteurs environnementaux.

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18
Q

Quel est le type de liaison unissant deux bases azotées?

A

Les liaisons hydrogènes

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19
Q

Quel est le lien le plus fort; A+T ou G+C ?

A

La liaison G+C puisqu’elle comprend 3 liaisons H tandis que A+T comprend que 2 liaisons H.

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20
Q

Quelle est la structure de l’ADN?

A
  • 2 chaînes
  • Association en forme d’hélice
  • Association anti-parallèle des 2 chaînes
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21
Q

Qu’est-ce que le lien phosphodiester?
(encerclé en rouge dans l’image)

A

C’est la liaison entre le sucre (désoxyribose) d’un nucléotide et le groupement phosphate d’un autre nucléotide. Ce lien est formé par la perte du OH en position 2 et de la liaison entre le OH et le phosphate en position 3.

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22
Q

Comment se nomme la liaison encerclée en rouge dans l’image?

A

Liaison N-glycosidique

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23
Q

Dans une double hélice, les deux brins d’ADN sont complémentaire et de (même sens/sens opposés) __________________? Ils sont donc dit _________________

A
  1. Sens opposé
  2. Antiparallèles
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24
Q

Quels sont les facteurs qui influencent la conformation que va prendre l’ADN?

A
  • Degré d’hydratation
  • Sa séquence
  • Taux de surenroulement
  • Des modifications chimiques des bases qui le composent
  • Nature et [ ] des ions métalliques en solution
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25
Q

Quels sont les trois types de conformères de l’ADN?

A
  • ADN A
  • ADN B
  • ADN Z
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26
Q

Quelle est la forme la plus courante de la double hélice dans les conditions physiologiques?

A

L’ADN B

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27
Q

Dites ces caractéristiques suites pour l’hélice B
1- Enroulement
2- Diamètre
3- Nucléotide/tour
4- Pas de l’hélice
5- Rotation de l’hélice/pb

A

1- Droite
2- 2,4 nm
3- 10 pb/tour
4- 3,4 nm
5- 36 degrés

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28
Q

Qu’est ce qui engendre la torsion de l’hélice?

A

Le noyau (coeur, intérieur) composé des paires de bases qui sont hydrophobes.

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29
Q

Où passe l’axe de l’hélice?

A

Au centre de l’appariement des paires de bases (qui sont perpendiculaires à l’axe)

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30
Q

Quel est l’utilité des sillons dans l’hélice d’ADN (petit et grand)?

A

Cela sert de site de reconnaissance des protéines qui lient l’ADN.

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31
Q

Vrai ou faux? Les atomes de bases sont plus accessibles dans le grand sillon.

A

Vrai

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32
Q

Quelle est la particularité de la conformation de l’ADN Z?

A

Elle est de forme plus contrainte, tordue et serrée.

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33
Q

Dites ces caractéristiques suites pour l’hélice Z
1- Enroulement
2- Diamètre
3- Nucléotide/tour
4- Pas de l’hélice

A

1- Gauche
2- 1,8 nm
3- 12 pb/tour
4- 4,5 nm

34
Q

Où peut-on retrouver le plus souvent des hélices Z ?

A

Dans les régions riches en paires G-C lors de la transcription de l’ADN en ARN.

35
Q

Où peut-on retrouver l’ADN A ?

A
  • Dans les échantillons faiblement hydratés
  • À force ionique plus élevé
  • En présence d’éthanol
  • Avec les hybrides bicaténaires d’ADN et d’ARN
36
Q

Vrai ou faux? L’axe de l’ADN A passe par les paires de bases.

A

Faux, elle ne passe plus par les paires de bases, elle est décentrée.

37
Q

Dites ces caractéristiques suites pour l’hélice Z
1- Enroulement
2- Diamètre
3- Nucléotide/tour
4- Pas de l’hélice

A

1- Droite
2- 2,3 nm
3- 11pb/tour
4- 2,8 nm

38
Q

Quelles sont les forces participant à la stabilisation de la double hélice de l’ADN?

A
  • Hydrophobes (Van der Waals)
  • Liaison H entre les bases complémentaires
  • Interactions électrostatiques
39
Q

Quelle force déstabilise la double hélice d’ADN?

A

Répulsion électrostatique liée à la présence de charges négatives tout le long de chaque molécule.

40
Q

Quel est le type d’ADN plus stable en solution ; mono ou bicaténaire?

A

L’ADN bicaténaire

41
Q

Qu’est ce que la dénaturation de l’ADN?

A

C’est lorsque deux brins complémentaires sont séparés.

42
Q

Lorsque deux brins d’ADN sont séparés, il est possible d’obtenir 3 résultats. Quels sont-ils?

A
  • In vivo =:lors de la réplication et transcription
  • In vitro : augmentation temp = rupture des pont H = désappariement des bases
  • In vitro : agents chaotropes (urée et chlorure de guanidium)
43
Q

Comment est-il possible de suivre la dénaturation de l’ADN?

A

En UV

44
Q

Définissez l’effet hyperchrome.

A

L’ADN monocaténaire possède une absorbance à 260 nm plus élevé que l’ADN bicaténaire due à une plus grande accessibilité des bases.

45
Q

Le processus de dénaturation de l’ADN est visualisable de quelle façon?

A

Par l’Augmentation de l’absorption au fur et à mesure de la conversion des acides nucléiques bicaténaires en monocaténaires .

46
Q

La courbe de fusion qui est donné par l’absorption de l’ADN natif (à 260 nm) en fonction de la température est de quel type?

A

Une courbe sigmoïde.

47
Q

À quoi correspond le point d’inflexion de la courbe de fusion?

A

À la demi-variation d’absorbante qui est la température de fusion de la molécule notée Tm

48
Q

Quelle est l’équation de Tm ?

A

Tm = T° où [ADNdb] = [ADNsb]
où
Tm = température de fusion de la molécule
db = double brin
sb = simple brin

49
Q

Pourquoi peut-on dire que la fusion de l’ADN db est coopérative?

A

Car la dénaturation des extrémités et des régions internes riches en AT déstabilise les régions adjacentes de l’hélice et conduit à une désorganisation progressive et concentrée de toute la structure.

50
Q

Remplissez les cases manquantes.

A
  1. Le coefficient de Chargaff %GC
  2. La force de répulsion électrostatique
  3. La concentration en cation, force ionique
  4. non = dénaturant
  5. Affecte la constante diélectrique
  6. oui= effet stabilisant
51
Q

Qu’est ce que l’hybridation de l’ADN?

A

sa renaturation

52
Q

Comment est-il possible d’inverser la dénaturation thermique de l’ADN ?

A

Le refroidissement de la solution.

53
Q

Vrai ou faux ? La vitesse de refroidissement influence le résultat.

A

Vrai!

54
Q

Que permet le refroidissement rapide de l’ADN?

A
  • Seulement la formation de régions locales d’ADN bicaténaires
  • La diminution de l’absorbante à 260 nm est donc plus petite.
55
Q

Que permet le refroidissement lent de l’ADN?

A
  • Il laisse suffisamment de temps aux brins complémentaires pour se retrouver
  • ADN retrouve sa forme complètement bicaténaire et la sln présente la même absorbance
56
Q

Qu’est-ce que l’ADN mitochondrial ?

A

C’est l’ADN présent dans la matrice des mitochondries

57
Q

Quelle est la structure de l’ADN mitochondrial?

A

Circulaire , bicaténaire et très petit.

58
Q

Vrai ou faux? L’ADN mitochondrial peut coder pour 30 séquences codantes sans introns et sans aucune répétition?

A

Faux, 37!

59
Q

Pour quoi code précisément l’ADN mitochondrial?

A
  • 22 ARNt
  • 2 ARNr
  • 13 prots. membranaires
60
Q

Pourquoi l’ADN mitochondrial est transmis de mère à enfant?

A

Puisque les stermatozoïdes n’ont pas de mitochondries.

61
Q

L’ADN de la mitochondrie prend quelle forme?

A

Circulaire

62
Q

Pour quoi code l’ADN du chloroplaste?

A

Une centaine de gènes
-ARNr
-ARNt
ARNpolymérase
-Prot. ribosomiques
-Prot. impliquées dans la photosynthèse

63
Q

Quel est le sucre de l’ARN?

A

Le ribose

64
Q

Par quoi est remplacée la thymine dans l’ARN?

A

L’uracile

65
Q

Quelle est la conformation de l’ARN?

A
  • simple brin (monocaténaire)
66
Q

Qu’est-ce que la structure secondaire de l’ARN?

A

La description de l’ensemble des appariements internes au sein d’ne molécule simple brin

67
Q

Nommez des exemples de structures secondaires de l’ARN?

A
  • En tige
  • Boucle interne
  • De bulge
  • Tige-boucle ou épingle à cheveux
  • Boucle multiples
  • Empliements
68
Q

Qu’est ce qui permet la formation des structures secondaires au sein de l’ARN simple-brin?

A

L’existence de régions contenant des séquences répétées inversées qui peuvent s’Apparier pour former localement une structure en double hélice.

69
Q

Qu’est-ce que la structure tertiaire de l’ARN?

A

Les structures secondaires qui interagissent entre elles ce qui entraine un repliement de la molécule dans l’espace.

70
Q

Vrai ou faux? La structure secondaire et tertiaire de l’ARN sont essentielles à sa fonction?

A

VRAI!

71
Q

Savoir caractéristiques et rôles des ARN!!!!

A

DIAPO 33

72
Q

Quelle est la première étape de condensation de l’ADN?

A

Le collier de perle. Enroulement de l’ADN autour d’HISTONES pour former les NUCLÉOSOMES.

73
Q

Quelles sont les caractéristiques des histones?

A
  • Riche en Lys et Art ce qui neutralise les charges nég. et donc stabilise l’ADN
  • Séquence en aa bien conservée
  • 5 types : H1, H2A, H2B, H3, H4
74
Q

Quelle est la deuxième étape de compression de l’ADN?

A

Le solénoïde. L’histone H1 vient de positionner sur le double tour d’ADN et stabilise la structure du nucléosome. Les nucléosomes peuvent ensuite s’empiler pour former la fibre de 30 nm, le solénoïde.

75
Q

Quelle est la troisième étape de compression de l’ADN?

A

Le chromosome métaphysique. La fibre de 30 nm forme des boucles qui se fixent à leur base sur une squelette nucléaire pour donner la forme plus compacte.

76
Q

La chromatine dans le noyau est sous deux formes, quelles sont-elles?

A

Euchromatine et hétérochromatine

77
Q

L’euchromatine est la forme _______ où la fibre de 30 nm est accessible aux enzymes de réplication et de transcription.

A

décondensé

78
Q

L’hétérochromatine est la forme _______ où la fibre de 30 nm n’est plus aux enzymes de réplication et de transcription.

A

condensée

79
Q

Qu’est-ce que l’hétérochromatine constitutive?

A

Une région du génome qui ne sera jamais transcrite (ex: centromère)

80
Q

Qu’est-ce que l’hétérochromatine facultative?

A

C’est un état transitoire qui bloque l’expression des gênes.

Biochimie examen 2 (4 decks)

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