Les génomes viraux

Question 1

Comment peut-on caractériser la composition en bases des virus ?

Answer 1

Elle n’est pas conventionelle !Il y a présence de bases modifiées chez certains bactériovirus.

Question 2

Chez les bactériovirus infectant Bacillus, on distingue 3 groupes selon les bases modifiées. Lesquels?

Answer 2

Groupe 1 : L’‘uracyle remplace la Thymidine.
Groupe 2 : L’hydroxymethyluracyle remplace la thymidine.
Groupe 3 : les bases normales.

Question 3

Par quoi sont incorporées les bases non conventionnelles et comment s’appelle ce procédé ?

Answer 3

Par la polymérase virale. Le procédé s’appelle la glucosylation post-réplication.

Question 4

Quel est le rôle de la glucosylation post-réplication ?

Answer 4

Permet de protéger vs les nucléases de l’hôte.
Permet de protéger des nucléases propres au virus.
Permet d’être bien reconnues pour la transcription.

Question 5

Quel est la fonction du génome virale ?

Answer 5

Pour unique fonction de produire de nouvelles particules virales.

Question 6

Quelles protéines permettent de diriger la synthèse d’autres protéines ?

Answer 6

Les protéines structurales ainsi que les protéines nécessaires à l’amplification du génome.

Question 7

Quel type de génome est directement codant ?

Answer 7

Les génomes à ARN messagers, ou virus à ARN+.

Question 8

Comment se déroule la réplication de l’ARN+ ?

Answer 8

Complexe de réplic reconnait 3’ de l’ARNg.
Réplicase recopie ARNg en ARNc (ARN antigénomique)
ARNc sert de matrice pour nouveaux ARNg.
Nouveaux ARNg -> protéine A.

Question 9

Que fait la protéine A ?

Answer 9

Elle empêche la phagocytose ?

Question 10

Qu’est-ce que ORF ?

Answer 10

Open Reading Frame. C’est la partie d’un génome qui peut potentiellement donner une protéine en étant transcrite.

Question 11

Quelles sont les caracs d’un virus à ARN+ eucaryote ?

Answer 11

Infectent les plantes herbacées, mécaniquement. Génome de 6435 nts, coiffe + polyA.
5 ORFs.

Question 12

Ou est-ce que le génome est coiffé ? Poly A ?

Answer 12

Coiffé en 5’, polyA en 3’.

Question 13

Dans les virus à ARN+ eucaryote, il y a 5 ORF. Lesquels ?

Answer 13

5 ORF : ORF1 pour la réplicase, 2-4 pour 3 gènes, et le ORF5 :CP.

Question 14

quelle est la première protéine exprimée chez les virus eucaryotes ARN+ et a quoi sert elle ?

Answer 14

La polymérase. sert à produire l’ARNc en s’associant à desfacteurs cellulaires.

Question 15

Une fois produit par la polymérase, l’ARNc sert a quoi ?

Answer 15

A faire des nouveaux ARN viraux, ainsi que de synthétiser des ARN subgénomiques (plus courts que génomiques).

Question 16

Le virus TMV a une particularité concernant la structure du génome. Quoi ?

Answer 16

N’a pas de séquence polyA en 3’ mais une structure ressemblant aux ARNt : amino-acylable.

Question 17

Le virus Poliovirus a une particularité concernant la structure du génome. Quoi ?

Answer 17

N’a pas de coiffe 5’ mais une protéine VPg fixée dessus : la traduction est donc coiffe indépendante : structure IRES guide les ribosomes.

Question 18

Qu’est-ce qu’une structure IRES ?

Answer 18

Ce sont des séquences qui permettent de recruter directement les ribosomes pour commencer la traduction de manière interne.

Question 19

Pour exprimer l’ensemble de leurs ORFs, les virus peuvent : …

Answer 19

Produire des ARN subgénomiques
Posséder des génomes segmentés
Utiliser des stratégies -> picornavirus.

Question 20

L’ARN génomique des virus ARN+ sont ils infecteurs ou pas ?

Answer 20

Oui, infectieux !

Question 21

De quoi est constitué l’ARN génomique des virus à ARN non codant ?

Answer 21

Un ou plusieurs ARN simple brin à polarité négative.

D’un ou plusieurs ARN à double brin.

Question 22

Est-ce que l’ARN- a une coiffe ? queue ?IRES ? VPg ?

Answer 22

Rien de tout ça, puisque ARN non codant.

Question 23

Que manque-il aux virus à ARN- pour produire des protéines et comment l’obtient il ?

Answer 23

Il manque de l’ARN messager, qui est transcrit depuis le génome du virus. Le virus fournit alors sa propre enzyme.

Question 24

Qu’est-ce que RdRp ?

Answer 24

Rna Dependant RNA Polymerase.

Question 25

dans les virus à polarité négatives, de quoi sont recouverts le génome et l’antigénome ?

Answer 25

de nucléocapside, qui permettent de se protéger contre les mécanismes de défense innée de l’hôte.

Question 26

C’est quoi l’antigénome ?

Answer 26

C’est le brin complémentaire d’ARN à partir duquel le génome viral est crée.