Lezione 2 Flashcards
Su cosa si basa la tassonomia batterica?
Malattia causata, scopritore, luogo di manifestazione, caratteristiche ecologiche e genetiche.
Tipologie di nomenclatura che si possono riscontrare?
Recente: genere + specie ospite in latino
Meno recente: genere + specie ospite in inglese
Vernacolare: genere + malattia o primo isolamento
La specie può anche essere seguita da un numero se ci sono diverse specie che vengono infettate dallo stesso genere
Prefissi utili?
parvo- piccolo
circo- genoma circolare
toga- sì mantello
ecc…
Classificazione di Baltimore generalità e classi
Si basa sulla strategia di replicazione e quindi sulla polarità dei genomi virali. Descrive come avviene la codifica delle proteine.
- Classe I DNA a doppio filamento
- Classe II DNA a singolo filamento
- Classe III RNA a doppio filamento
- Classe IV RNA a singolo filamento con polarità + (IVa policistronico, IVb monocistronico
- Classe V RNA a singolo filamento -
- Classe VI RNA a singolo filamento + con genoma diploide
- Classe VII RNA a doppio filamento circolare incompleto
Come funziona la Classe I di Baltimore e quali famiglie sono associate?
Classica duplicazione mediata da DNA polimerasi e trascrizione da RNA polimerasi
- Poxviridae
- Orthoherpesviridae
- Iridoviridae
- Polyoviridae
- Papillomaviridae
- Adenoviridae
Come funziona la Classe II di Baltimore e quali famiglie sono associate?
Replicazione a DNA polimerasi cellulare con un intermedio di dsDNA. La trascrizione avviene con RNA polimerasi cellulari.
- Parvoviridae
- Circoviridae
Come funziona la Classe III di Baltimore e quali famiglie sono associate?
RNA polimerasi virale trascrive RNAm + utilizzando il filamento - come stampo. La replicazione avviene utilizzando i filamenti + come stampo per quelli -
- Birnaviridae
- Sedoreoviridae
Come funziona la Classe IV di Baltimore e quali famiglie sono associate?
RNA polimerasi virale permette la replicazione producendo un intermedio - utilizzato come stampo per la trascrizione a +
- Coronaviridae
- Togaviridae
- Flaviviridae
- Caliciviridae
- Astroviridae
Come funziona la Classe V di Baltimore e quali famiglie sono associate?
RNA polimerasi virale trascrive in RNAm + monocistronici, che sono intermedi per la replicazione.
- Pneumoviridae
- Rhabdoviridae
- Filoviridae
- Bunyavirales (arenaviridae)
Come funziona la Classe VI di Baltimore e quali famiglie sono associate?
Viene prodotto un intermedio di DNA tramite una retrotrascrittasi virale che si integra nel genoma. A questo punto duplica e trascrive come fosse della cellula
- Retroviridae
Come funziona la Classe VII di Baltimore e quali famiglie sono associate?
il DNA a doppio filamento circolare incompleto (->) viene trascritto con RNA polimerasi cellulari. la replicazione avviene tramite un intermedio a RNA e poi retrotrascritto a DNA genomico
-Hepadnaviridae
Cos’è un isolato
Virus cresciuto in coltura cellulare per provare la capacità replicativa
Genotipo?
Raggruppamento che differisce per piccole porzioni di genoma
Sierotipo?
Raggruppamento che differisce per antigeni tipo-specifici
Sierogruppo?
più sierotipi che presentano gli stessi antigeni gruppo specifici.
Ogni virus presenta diversi antigeni, alcuni dei quali più esposti e quindi più soggetti a selezione (sierotipi), mentre altri sono più nascosti anche se possono comunque essere bersaglio di anticorpi (sierogruppi)
