Mathématiques Flashcards
(46 cards)
Sens de la lecture du nucléotide et de l’ajout d’un nucléotide
3’ vers 5’ et ajout 5’ vers 3’
Conséquence que la longueur du génome est plus grand chez eucaryote
Il faut travailler plus vite
Diff. de réplication entre procaryote et eucaryote
1 origine de réplication vs 1000 origine de réplication
Qu’est-ce que la fourche de réplication?
L’endroit où se sépare initialement les brins d’ADN
Noms des sites de spécifiques où débutent la réplication
Origines de réplications
Qu’est-ce que le réplicateur?
Ensemble complet de séquences suffisantes pour permettre initiation de la réplication
Propriétés des sites 9 mères
Se lie les protéines initiatrices
Particularités de la protéines initiatrices
La seul qui est spécifique de séquence dans l’initiation de la réplication.
Sert de socle pour le complexe d’initiation
Les autres prot. utilisent des interactions prot-prot et la reconnaissance de la forme générale de l’ADN
Quels sont les sites initiaux de la séparation des brins et qui sont riches en nucléotides A:T?
13-mères
Fonctions des prots. initiatrices
- Trouver et lier l’ORI
- Recruter les autres prot nécessaire à la réplication (forme complexe avec hélicases)
- Chez certains procaryotes, ouvre la double hélice à l’ORI. (DnaA, prot. initiatrice, se lie avec site-9-mères. Si activation par ATP, interaction avec site 13-mères qui sépare les brins
Les hélicases permettent de…
Briser les liens entre BA
Quand est la formation des complexes de reconnaissances de l’ORI et Hélicase?
Avant l’ouverture, il entoure l’ADN et attend d’être activé par Cdk
Qu’est-ce qui empêche la formation de nouveau complexe pré-réplicatifs(pré-RC)?
Activation des kinases qui dégrade les complexes par phosphorylation dépendantes de cycline (Cdk)
Reconnaissance de l’origine de réplication chez les eucaryote
Ne passe pas par une séquence spécifiquement reconnue, mais par des motifs structurels avec carac suivantes:
- séquences riches en AT ou en ilots CpG
- structure d’ADN particulière
- régions libres de nucléosomes
- régions impliquées dans initiation de la transcription
Qu’est-ce qu’un ilots CpG
Alternance de BA CGCGCGCG… sur le même brin
Définition des hélicases
enzyme hexamérique en forme d’anneau qui se fixe sur ADN simple brin et se déplace rapidement (1000nt par seconde) le long de la chaîne
Caractéristique de l’hélicase
- Hydrolyse ATP pour son déplacement
- Entraine séparation des brins
- Haute processivité (fait vrm beaucoup de brins d’ADN avant de se détacher)
- Forme des boucles supp de l’ADN se qui crée une source de tension
Comment, structuralement l’hélicase vient forcer l’ADN à se détacher?
Chaque sous-unité de l’hélicase s’aggripe à la charpente d’un nucléotide et oblige l’ADN à passer dans son pore central
Rôles des prot. fixatrices d’ADN monocaténaire
1) Empêche formation des liens d’hydrogène entre bases complémentaires des brins
2) Stabilisent les brins séparés jusqu’à la synthèse de nouveaux brins
3) Empêche formation de d’épingle entre nucléotide complémentaire du même brin d’ADN
Qu’est-ce que la topoisomérase
Enzymes qui coupent et ressoudent ADN bicaténaire pour réduire la tension devant la fourche de réplication
Ce qu’à besoin l’ADN polymérase pour commencer la synthèse de l’ADN…
Une amorce avec un C’3-OH libre.
Qu’est-ce que la primase?
C’est une ARN polymérase qui fabriquent de courtes amorces ARN (5 à 10 nucléotide) (remplacer à la fin par des désoxyribonucléotide
Que fait le poseur d’anneaux coulissant?
Elle reconnait les amorces d’ARN et vient y poser un anneau coulissant et une ADN pol.
Caractéristique de l’anneau coulissant (ou complexe Clamp)
Composés de sous-unité identique organiser en beignet. Encercle le double brin d’ADN sans y toucher.
- Lie à l’amorce et s’associe avec polymérase et l’entraine avec elle
- Empêche la polymérase de partir du brin de matrice (augment processivité de la polymérase)
- À la suite de la réplication, maintient et aide au recrutement de tétramères d’histones H3-H4 à la fourche de réplication
