Metoder Flashcards
Hvad er en nonparamteric test?
Test, der ikke forudsætter at de bagvedliggende populationer er normalfordelte, nemlig de såkaldte ikke-parametriske test. Beskrives ikke ved flere parametre
Hvad er parametric test?
Parametrisk statistik er en gren af statistiske tests, hvor normalfordelings-antagelsen skal være opfyldt.
Normalfordelings-antagelsen er vigtig, da det forudsættes, at data kan beskrives ved hjælp af en mean og standarddeviation. Er normalfordelings-antagelsen ikke opfyldt, kan man altså ikke bruge parametrisk statistik
Hvad betyder “rank”?
Placering.
Hver værdi af et outcome variable er erstattet af dets rank.
Godt i små datasæt, der ikke er normalfordelt eller data ikke kan eller ønskes transformeret.
Hvad er en Wilcoxon rank sum test?
Wilcoxon-testen bruges til at sammenligne to parrede stikprøver, dvs. den er en ikke-parametrisk udgave af t-testen med to parrede stikprøver.
Undersøger forskellen mellem to grupper
Alternativ til two-sample t-test
Nulhypotesen for begge test er at fordelingerne har identiske medianer
Hvad er multiple lineær regression?
En regression, der tager højde for konfoundere ved at inkludere dem. Kan f.eks. være en log-funktion eller Cox-regression.
Log transformeret: respons er binært, justerer for konfoundere.
Hvad er Kruskal-Wallis test?
Undersøger forskelle mellem to eller flere grupper. giver identiske resultater til Wilcoxon, når der er to grupper.
Tester om medianen er ens i populationen
Tester om prøverne kommer fra samme fordeling
Alternativ er one-way analysis of variance/envejs varians analyse
Hvad er Mann-Whitney U-test?
Alternativ til Wilcoxon rank test.
Sammenligner, om der er forskelle mellem to uafhængige grupper.
Mann-Whitney kan anvendes til at sammenligne to uparrede stikprøver, dvs. det er en ikke-parametrisk udgave af “t-test med to uparrede stikprøver
Nulhypotesen for begge test er at fordelingerne har identiske medianer, og især for Mann-Whitney-testen er det en vigtig forudsæting at fordelingerne er identiske bortset fra at de evt. har forskellig median
Hvad er Friedman nonparametric repeated-measures test?
Måler forskelle i behandlinger over flere testforsøg. It is used to test for differences between groups when the dependent variable being measured is ordinal
Alternativ: one-way analysis of variance
Ligesom de ANOVA med gentagne målinger, bruges det til at detektere forskelle i behandlinger på tværs af flere testforsøg. Proceduren indebærer at rangordne hver række sammen og derefter overveje værdierne for rækker efter kolonner
Hvad er post hoc analyse?
Man kigger på data efter et studie er blevet konkluderet og prøver at finde mønstre, der ikke var primær outcome i studiet. Nye analyser til nye aspekter.
Hvad er analyse of covariance?
Man sammenligner én variabel i to eller flere grupper og korrigerer for forskelligheden af andre varianter(covariants). Sammenholder analysis of variance med lineær regression
Hvad er step-down multiple comparisons procedure?
Man sortere p-værdierne fra høj-lav, det laveste ganges med antal i alt og så ser man på om det er under 5% - man fastsætter, hvad der er signifikant.
Korrigerer/justerer for multiple comparisons ved Bonferroni korrektion: man ganger alle p-værdier med antal outcome variabler. Finder den cut-off værdi, hvor noget er signifikant.
The Holm step-down procedure: First, sort your thousand p-values from low to high. Multiply the smallest p-value by one thousand. If that adjusted p-value is less than 0.05, then that gene shows evidence of differential expression. Multiply the third smallest p-value by 998, the fourth smallest by 997, etc. Compare each of these adjusted p-values to 0.05
Hvad er Van Eltern test?
Forlængelse af Wilcoxon rank sum test, sammenligner to behandlinger i stratificeret eksempler (opdeling i subgrupper)
One-sample Wilcoxon prodecure - brugt i Kuehr?
Sammenligner før og efter behandling (standardiseret niveau med hypotesized niveau). Tester medianen af en populations fordeling.
Hvad er Spearman correlation coefficients?
Vurderer, hvor godt forholdet mellem to variable kan beskrives vha. en monoton funktion - et tal mellem -1;1, hvor 0 = ingen korrelation.
Two rank order mål af associationen mellem to numeriske variable.
Parametric alternativ: korrelations koefficient.
Power analyse:
Test af hypoteser. Omhandler primær type 2 fejl (fejlagtig accept af H0 - sammenhæng, selvom der ikke er det). Power analysen udføres før dataindsamlingen og bruges til at hjælpe med at afgøre den mindste sample size, der er brugbar til at finde en effekt af en given test ved det ønskede signifikansniveau.
For lille sample size = type 2 fejl grundet insufficiens power, derfor kan power øges ved flere deltagere. Lille sandsynlighed for at korrekt forkaste H0.
Fx power = 0,8 -> man har mindst 80% sandsynlighed for korrekt at forkaste H0.
