Microbiologie 1 (intro+bactéries+microbiote) Flashcards
(103 cards)
1
Q
Pour chaque MO, on se démande quoi?
A
- Ou est le réservoir (ou est normalement ce microbe?)
- Comment se transmet-il?
- Par quel(s) mécanisme(s) cause-t-il des dommages?
- Quelles sont les maladies causées par ce MO?
- Symptomes?
- Traitements?
- Prévention?
2
Q
Quels sont les indices qui font douter d’une infection?
A
Fièvre Mal de gorge Diarrhée aigue Éruption cutanée Abcès Frissons Rougeur localisée (cellulite) Polyadénopathie (ganglions gonflés) Pneumonie Neutrophilie
3
Q
Comment le médecin évoque infection?
A
- Questionnaire
- Examen physique
- Diagnostic principal et autres moins probables
- Prescrire analyses (hématologie, biochimie, microbiologie)
- Décide s’il prescrit traitement avant d’avoir résultats (traitement empirique)
- Interprétation résultats
- Réévaluer
4
Q
Quelles catégories de vivants sont des procaryotes?
A
Bactéries
5
Q
Quelles catégories de vivants sont des eucaryotes?
A
Algues, fungi, protozoaires, plantes, animaux
6
Q
Quelles sont les caractéristiques des bactéries (procaryotes) ?
A
- pas de noyau, RE, Golgi ni mitochondries
- chromosome constitué d’ADN
- ribosomes 70S (50S + 30S)
- membrane cellulaire/cytoplasmique sans stérols (SAUF MYCOPLASMES)
- paroi cellulaire complexe (protéines et peptidoglycanes, +/- acide téichoique et/ou lipopolysaccharides)
- reproduction asexuée (fission binaire)
- production d’ATP via membrane cytoplasmique (et non des mitochondries)
7
Q
Comment se fait la classification des bactéries
A
selon forme ou coloration de gram
8
Q
quelles formes de bactéries existe-t-il
A
cocci
batonnet (bacille)
coccobacille
spiralée
9
Q
quelles sont les colorations de gram
A
gram + (bleu)
gram - (rose)
10
Q
sur quoi on fait coloration de gram en clinique
A
prélèvement par infirmière ou médecins (ex : pus)
OU sur colonie bactérienne sur glose nutritive
11
Q
comment se déroule la coloration de gram
A
(moins de 15 min)
- coloration au violet de cristal
- fixation au lugol
- décoloration à l’alcool-cétone
- coloration à la safranine
- 1 LES BACTÉRIES DÉCOLORÉES par alcool sont recolorées ROUGE : gram -
- 2 LES BACTÉRIES NON DÉCOLORÉES par alcool restent BLEUES : gram+
12
Q
Pourquoi le violet de cristal reste accroché à la paroi des bactéries Gram +
A
les bactéries gram+ ont une couche de peptidoglycane plus épaisse et c’est cette couche qui permet au violet de s’accrocher
13
Q
quelle est la morphologie d’une bactérie
A
membrane cytoplasmique, paroi cell, nucléoide, cytoplasme, ribosomes, inclusions, chromosome ADN,
14
Q
quelles structures morphologiques d’une bactérie sont DES ATOUTS (pas toutes les bactéries en ont)
A
capsule (protection)
plasmide (ADN)
pili et fimbriae
flagelle (mouvement)
15
Q
Décrire la membrane cytoplasmique d’une bactérie gram+
A
2 couches de phospholipides
protéines structurales
protéines enzymatiques
16
Q
V OU F
La membrane cytoplasmique d’une bactérie gram- est identique à celle d’une bactérie gram+
A
VRAI
c’est leur paroi cellulaire qui diffère
17
Q
quel est le role de la membrane cytoplasmique
A
- produire de l’énergie (ATP)
- permet entrée de certains nutriments et la sortie de -certaines substances (tourniquet à 2 sens)
- contient protéines structurales qui contribuent à la forme de la bactérie (ex: droite, spiralée ou courbée)
18
Q
V ou f
La membrane cytoplasmique est entourée d’une paroi cellulaire
A
vrai
19
Q
de quoi est constituée la paroi cell des bactéries gram +
A
peptidoglycane, acide techoique, acide lipotéchoique et protéines
20
Q
de quoi est constituée la paroi cell des bactéries gram -
A
peptidoglycane, espace périplasmiqur, membrane externe, protéines, LPS (lipide A, polysaccharide, antigène O)
21
Q
quel est le role des peptidoglycane
A
forme de la cellule et structure
*chez gram+, protège aussi de l’environnement
22
Q
role de l’acide téchoique (gram +)
A
renforce paroi cellulaire, séquestration du calcium
23
Q
role de l’acide lipotéchoique (gram+)
A
active innate host protections
24
Q
role de la membrane externe (bactérie gram -)
A
*elle est constituée de phospholipides, LPS, protéines et enzymes
RÔLE : structure de la cellule, protection de l’environnement
25
quelles sont les protéines dans paroi cell bactérie gram-
```
canaux porines : perméation petites molécules hydrophiles, empêche certains ATB
secretory devices (I-V) : pénètre et livre protéines à travers membranes (incluant facteurs de virulence)
```
26
quel est le role des LPS
structure de la membrane externe : protection (barrière), active des host responses
27
v ou f
| la paroi cellulaire des bactéries gram - est entourée d'un espace périplasmatique et une membrane externe
VRAI
28
quelles sont les structures bactériennes pas toujours présentes
capsule, biofilm, pili, flagelle (principalement)
29
de quoi est constitués capsule
| quel est l'avantage de capsule
- polysaccarides ou polypeptides (anthrax)
| - antiphagotique
30
de quoi est constitué biofilm
| avantage?
- polysaccharides
| - protection de la colonie contre : l'environnement, antimicrobes et l'hôte
31
de quoi est constitué pili
| avantage?
- pilin, adhesins
| - adherence, sex pili
32
de quoi est constitué flagelle
| avantage?
- protéines motrices, flagellin
| - mouvement et chimiotaxisme
33
que peuvent faire les bactéries pathogènes
- adhérer à certaines cellules (via pili, protéines, acide techoique)
- essayer d'échapper au système immunitaire
- synthétiser enzymes pour résister au SI
- synthétiser enzymes pour détruire tissus
- synthétiser exo toxines (répercussions locales et à distance)
34
```
Quelle bactérie a :
A) Membrane externe
B) peptidoglycane
C) lipopolysachaaride
D) endotoxine
```
A) Negatif
B) Gram+ : épais, gram - : mince
C) Négatif
D) Négatif
35
quelles bactéries sont cocci gram+
staphylococcus
streptococcus
enterococcus
36
quelles bactéries sont cocci gram-
neisseria
| moraxella
37
quelles bactéries sont bâtonnets gram+
```
bacillus
clostridium
clostridioides
listeria
corynebacterium
```
38
quelles bactéries sont bâtonnets gram-
```
Escherichia coli
Klebsiella
Proteus
Salmonella
Shigella
Yersinia
Campylobacter
Pseudomonas
Haemophilus
Bacteroides
```
39
quelles bactéries sont cocci gram + en AMAS
staphylococcus
40
quelles bactéries sont cocci gram + EN PAIRES OU COURTES CHAINES
streptococcus pneumoniae
41
quelles bactéries sont cocci gram + EN CHAINES
streptococcus (autre que pneumoniae)
| enterococcus
42
parmi les bâtonnets gram+, quelles bactéries peuvent sporuler
clostridium
clostridioides (ex : C. difficile)
bacillus
43
parmi les bâtonnets gram+, quelles bactéries NE peuvent PAS sporuler
listeria
| corynebacterium
44
V ou f
| Les bactéries sporules sont UNIQUEMENT chez certains bâtonnets gram +
VRAI
45
qu'est ce qu'un spore
structure ronde, en dormance (très résistante et peut survivre sans nourriture)
46
quand un spore se forme?
passage de la bactérie de la forme végétative vers forme sporule quand les conditions de survie sont dangereuses pour la bactérie
47
quelles sont les techniques d'identification des bactéries dans les labos
- étalement de l'échantillon sur une lame microscopique (coloration gram)
- étalement de l'échantillon sur des géloses (mises dans incubateurs à 37 degrés)
48
quelles sont les principales géloses
sang de mouton
chocolat
MacConkey
49
après avoir été incubées, quand sont examinées les géloses
le lendemain
| on regarde les colonies
50
quelles sont les différentes atmosphères d'incubation
pour satisfaire les exigences des bactéries :
- dans étuve à l'air ambiant (21% O2)
- dans étuve à CO2
- dans tente anaérobie (oxygène remplacé par azote)
51
quelles sont les bactéries anaérobies strictes (bâtonnets gram +)
clostridium
| clostridioides
52
quelles sont les bactéries anaérobies strictes (bâtonnets gram -)
bacteroides
53
quelles sont les bactéries aérobies strictes (bâtonnets gram -)
pseudomonas
54
V OU F
| si on met des peudomonias dans une atmosphère anaérobie, on va voir une colonie se former
FAUX
| ces bactéries sont aérobies strictes (ont besoin d'oxygène)
55
v ou f
parmi bactéries fréquemment responsables d'infection chez humain, plusieurs peuvent croire en aérobie ET/OU anaérobie stricte
VRAI
56
quelles bactéries ne peuvent PAS être classifiées selon coloration gram
- mycobactéries (paroi riche en acide mycolique qui interfère avec coloration)
- mycoplasma (absence peptidoglycane dans paroi)
- chlamydia (petites bactéries, non cultivables sur géloses et se multiplient seulement dans cellules grâce à "corps élémentaires" et "corps réticulés")
57
la glose de sang de mouton permet la croissance de quelle bactéries?
plupart des bactéries impliquées en pathologie humaine (pas toutes)
cocci gram + : strepto, staphylococcus et entero
58
V OU F
| le test catalase des streptococcus et enterococcus est positif
FAUX
négatif
c'est le test catalase des staphylococcus qui est positif
59
que se passe t il quand test catalase positif
petites bulles après dépôt de H2O2 sur la colonie
60
que se passe t il après une hémolyse ALPHA
hémolyse VERDATRE
61
que se passe t il après une hémolyse GAMMA
pas d'hémolyse
62
que se passe t il après une hémolyse BÊTA
hémolyse COMPLÈTE
63
si on a des streptocoques bêta-hémolytiques, cela veut dire?
hémolyse COMPLÈTE des GB de mouton
64
Quelles sont les manifestations supppuratives (pus) de STREPTOCOCCUS PYOGENES
```
pharyngite
cellulite
impétigo
scarlatine
syndrome choc toxique
mangeuse de chair
```
65
Quelles sont les manifestations non-supppuratives (pus) de STREPTOCOCCUS PYOGENES
- glomérulonéphrite
- RAA (critère de jONES)
J: Joint
O : atteinte cardiaque
N : nodules
E : érythème marginé
S : Sydenham chorea (mouvement incontrôlé)
- Anticorps antistreptolysine O
66
quelle bactérie si cocci gram+, test catalase négatif, colonies alpha-hémolytiques
STREPTOCOCCUS PNEUMONIAE
ou
STREPTOCOCCUS VIRIDANS (plusieurs espèces moins virulentes que pneumoniae)
67
caractéristiques de strepto pneumoniae
-capsule
-sensible à l'optochin
-colonies lysées par la bile
MALADIE MOPS (méningite, otite, pneumonie, sinusite)
68
caractéristiques de strepto viridans
-résistant à optochin
-colonies pas lycées par bile
MALADIES : endocardite, caries dents
69
quelle bactérie si cocci gram+, test catalase positif
STAPHYLOCOCCUS
70
quelle bactérie si cocci gram+ en AMAS et test catalase + et test COAGULASE positif
staph aureus
71
quelle bactérie si cocci gram+ en AMAS et test catalase + MAIS TEST COAGULASE négatif
staph epidermidis ou saprophyticus
72
quelles maladies engendre staphylococcus aureus
```
pneumonie
ostéomyélite
abcès et furoncles
arthrite septique
endocardite aigue
food poisoning
syndrome choc toxique
impétigo
```
73
les colonies de staph aureus sont ...-hémolytiques
BÉTA sur gélose sang
74
Quelles sont les 2 étapes historiques ?
HUMAN GENOME PROJECT
HUMAN MICROBIOME PROJECT (analyse la composition génétique de la population microbienne qui vit SUR et DANS adultes en santé)
75
quel est le ratio bactéries:cellules humaines
10:1
76
Décrire comment bébé acquiert flore
foetus vit dans MILIEU STÉRILE, mais à naissance, contact avec flore normale de sa mère (début de colonisation de sa peau et système digestif)
ensuite, contact avec autres personnes et environnement
77
qsq le microbiote
ENSEMBLE DES MO (bactéries, fungi, virus et eukaryotes) qui résident à un lieu donné (peau, narines, tractus GI, digestif)
78
qsq microbiome
ENSEMBLE DES MO et leurs GÈNES à un site donné
79
qu'est ce que le microbiome central
espèces bactériennes présentes chez plus de 95% des humains à un site donné (moins varié que microbiome secondaire)
80
qu'est ce que le microbiome secondaire
espèces qui différent d'une personne à l'autre (grande variété)
*chaque espèce est en plus petite quantité comparé au microbiome central
81
```
exemple d'espèces du microbiome central
A) PEAU
B) BOUCHE
C) COLON
D) VAGIN
```
A) staph epidermidis
B) streptococcus
C) E.coli
D) lactobacillus
82
V OU F
| le microbiote cutané (peau) varie selon le site
VRAI
- influencé par présence ou non de glandes sébacées et d'humidité
- varie selon sexe
83
pourquoi a ton moins de MO dans l'estomac et intestin grêle
acidité estomac tue certains MO
| intestin ph bas aussi
84
ou a ton bcp de MO
salive, colon, sécrétions vaginales
85
v ou f
| la diversité et quantité de bactéries varient selon segment du tube digestif
VRAI
| on y retrouve plus de 500 espèces (majorité non cultivables et identifiées par séquençage moléculaire)
86
v ou f
| microbiote sain varie grandement
VRAI
d'une personne à lautre
d'une région géo à l'autre
en fonction de l'âge
87
comment évolue le microbiote avec l'âge
initial gut bacteria depend upon delivery mode (vaginal ou césarienne) et de l'allaitement
ensuite, a l'enfance, microbiote augmente vite en diversité (dépend de la diète, l'environnement etc)
à l'âge adulte, ne varie peu, est distinct
88
v ou f
| les enfants allaités ont un microbiote plus varié
VRAI, bcp plus varié
89
quels sont les rôles du microbiote intestinal
- fonctions métaboliques
- stimule immunité innée
- prévient colonisation par bactéries pathogènes
- métabolise certains nutriments plus facilement pour les rendre disponibles aux cellules hôtes (ex : grosses molécules d'hydrates de carbone comme cellulose et acides comme l'acétate, propionate et butyrate limitent croissance de bactéries indésirables)
- protège contre certaines infections entériques
90
comment le microbiote intestinal protège contre certaines infx entériques
- en tapissant la muqueuse et en consommant nutriments (affame pathogènes)
- en stimulant production mucine, IgA et peptides antimicrobiens (AMPs)
- en stimulant production d'IL-22 (augmente résistance des cellules épithéliales) et IL-1B (augmente recrutement cellules inflammatoires)
91
quels sont les facteurs externes qui influencent le microbiote
- hygiène personnelle (savon, déodorant, rince bouche, douche vaginale)
- diète (riche en fibre, graisse, sucre), + divers ou non
- H2O : avec chlore vs eau de puits
- prise d'ATB
92
que peut causer l'altération de la flore normale (dysbiose)
- diarrhée à c.difficile (dacd)
ex : prise d'aTB qui altère la flore normale du colon, prolifération de C difficile et elle produit toxines
- colite ulcéreuse
ex : prolifération de la bactérie Akkermansia muciniphila qui produit une sulfates qui dégrade la couche de mucine et augmentation de prevotellaceae qui produit chemokines d'inflammation
- maladie coeliaque (entéropathie au gluten)
- vaginite à candida
- obésité (personnes qui ont des bactéries intestinales plus efficaces à transformer des gros hydrates de carbones en petites molécules)
93
que se passe t'il si souris nourrie avec microbiote de souris obèse
souris devient obèse (le microbiote impacte beaucoup le poids)
94
que cause la symbiose du microbiote gastro-intestinal
tolérance immune, homéostasie intestinale, métabolisme sain
95
que cause une dysbiose
maladies système immunitaire (utopie, asthme, sclérose en plaque), intestinale (ibs, entérocolite nécrosante du nouveau-né), métabolique (diabète, obésité)
96
v ou f
| manipuler microbiome humain a bcp de potentiel thérapeutique
VRAI
| ex : traitement de c difficile réfractaire au traitement standard (efficacité de 40-96% après une seule transplantation)
97
qsq probiotiques
- mélange de bactéries et/ou levures ingérées dans le bus de coloniser intestin
- majorité contiennent bactéries gram+ (bifidobacterium, lactobacillus...) et levures (saccharomyces)
- efficacité dépend des MO choisis, de la dose, de la survie après passage dans l'estomac (acidité)
98
qsq pouchite
une inflammation du réservoir suite à colostomie avec anastomose iléo-rectale (on enlevé le colon et on relie iléum et rectum)
99
qsq entérocolite nécrosante
- maladie qui touche intestin
- enfant né prématuré
- gonflement de l'abdomen, du sang dans les selles et de l'air dans la paroi de l'intestin
- prédisposition génétique, intestin immunoréactif, réponse inflammatoire immature
- dysbiose??
MORTALITÉ : 20-30%
100
v ou f
| on peut utiliser n'importe quels pro biotique pour prévention de pouchite et entérocolite nécrosante chez nouveau né
FAUX
| Certaines compositions de probiotiques reconnus efficaces seulement pour chacun
101
v ou f
| l'INESSS recommande les probiotiques pr prévenir ou traiter DACD
FAUX
102
v ou f
| les probiotiques sont contre-indiqués chez patients immunosupprimés
VRAI
103
qsq prébiotique
produit alimentaire administré pour FAVORISER croissance de MO endogènes désirables
