Microbiologie (intra) Flashcards
(213 cards)
1
Q
Quels sont les impacts positifs des microorganismes chez l’Homme?
A
Microbiote (certains degré de protection de nous contre les microbes), Source de nourriture, Antibiotiques et autres molécules et Biotechnologie
2
Q
Quels sont les impacts positifs des microorganismes dans la nature?
A
Décomposition (recyclage), Balance écologique, Biodégradation et Bioremédiation
3
Q
Quels sont les impacts négatifs des microorganismes chez l’Homme et dans la nature?
A
Infections, Détérioration des aliments, Corrosion et Mauvaise odeur (par détérioration)
4
Q
Quels sont les types de microorganismes en ordre de grosseur croissant?
A
Virus et Prions, Bactéries, Mycètes, Protozoaires et Algues
5
Q
Quelle est la caractéristique principale des virus?
A
Besoin d’une cellule pour se multiplier, puisqu’ils n’ont pas d’activités métaboliques
6
Q
Quelle est la définition d’une cellule?
A
Le plus petit dénominateur de la matière vivante
7
Q
Quelles sont les propriétés des cellules?
A
Métabolisme, Reproduction, Différentiation, Communication, Mouvement et Évolution
8
Q
Qu’est-ce que le métabolisme pour la cellule?
A
Les nutriments prélevés dans l’environnement sont transformés dans la cellule et les déchets sont éliminés dans l’environnement. La cellule est un système ouvert (trucs entrent et sortent)
9
Q
Qu’est-ce que la reproduction pour la cellule?
A
Les éléments chimiques de l’environnement se transforment en de nouvelles cellules sous la conduite de cellules préexistantes
10
Q
Qu’est-ce que la différentiation pour la cellule?
A
La formation d’une nouvelle structure cellulaire
11
Q
Qu’est-ce que la communication pour la cellule?
A
Les cellules communiquent ou interagissent par des échanges de molécules chimiques
12
Q
Qu’est-ce que le mouvement pour la cellule?
A
Les cellules possèdent diverses formes de motilité (déplacement des cellules et/ou mouvements internes)
13
Q
Qu’est-ce que l’évolution pour la cellule?
A
Les cellules contiennent des gènes et évoluent, présentant de nouvelles propriétés biologiques
14
Q
Quel est le type de cellule d’une bactérie et quelle est sa taille approximable?
A
Procaryote et la taille d’une mitochondrie animale
15
Q
Quel est le type de cellule pour les cellules animales et végétales?
A
Eucaryotes
16
Q
Quelle est la classification de Carl von Linné (1735)?
A
La première classification
2 règnes :
1. Plantes (immobiles et photosynthétiques)
2. Animaux (mobiles et non-photosynthétiques)
17
Q
Quelles sont les faiblesses de la première classification?
A
- Algues et champignons classés avec les plantes (immobiles)
- Euglène classé en animal par zoologistes et en plante par les botanistes (flagelle et photosynth.)
- Bactéries considérées comme plantes
18
Q
Quelle est la classification de Haeckel (1866)?
A
Deuxième classification
3 règnes :
1. Plantes (graines, fougères…)
2. Animaux (vertébrés et invertébrés)
3. Protistes (Algues, champignons, bactéries, protozoaires)
19
Q
Quel est le problème de la deuxième classification?
A
Fondé sur l’organisation biologique : unicellulaire, pluricellulaire, différentiation tissulaire
20
Q
Quelle est la première classification moderne des organismes?
A
Whittaker (1969)
5 règnes
1. Monères (bactéries)
2. Protistes (algues, protozoaires)
3. Mycètes (champignons, levures)
4. Plantes
5. Animaux
21
Q
Sur quoi est fondé la classification de Whittaker?
A
- Type de cellule : procaryote ou eucaryote
- Organisation biologique : unicell, solitaire et en colonie ou pluricell
- Type de nutrition : autotrophe ou hétérotrophe
22
Q
Que manque-t-il dans la classification de Whittaker?
A
Les virus (on sait pas où les classer)
23
Q
Pourquoi les virus sont difficiles à classer?
A
- Matériel génétique (ADN ou ARN) entouré d’un manteau protéique (capside)
- Parasites intracellulaires obligatoires et pas considérés comme cellules
- Non vivants, mais microorganismes
24
Q
Quelle est la dernière classification trouvée?
A
Classification sur des caractères moléculaires (Woese, 1990)
25
Que propose la classification de Woese?
De nouvelles relations phylogénétiques
- Tous organismes vivants viennent d'un ancêtre commun (progénote)
- Tous organismes vivants classés en 3 règnes : Eubactéries, Archéobactéries et Eucaryotes
- Mitochondries et chloroplastes : endosymbiose (aérobies et photo.)
- Archea plus proches des Eukarya que Bacteria
26
Regarder cours 1 diapos 15-18
VAS-Y POUR DE VRAI
27
Qui débute la théorie de la cellule et quelle est-elle?
Robert Hooke. Décrit des moisissures et trouve mot cellule
28
Qui est le premier à décrire des bactéries?
Anton van Leeuwenhoek
29
Qui attaque la théorie de la génération spontanée avec les microorganismes? Et qui la réfute?
Lazzaro Spallanzani
Louis Pasteur
30
Quel est l'âge d'or de la microbiologie et qu'est-ce qui est découvert?
60 ans de progrès (1857-1914)
- Découverte et identification de plusieurs microorganismes
- Fermentation / Pasteurisation
- Caractérisation du métabolisme microbien
- Amélioration des techniques d'isolement
- Importance rôle de l'immunité
- Développement de vaccin
- Techniques de prévention des infections
31
Qu'est-ce que Robert Koch a découvert?
- Méthodes de culture pure
- Démontre que les microorganismes peuvent causer des maladies
- Invention des géloses solides
32
Qu'est-ce que Hans Christian Gram découvert?
Coloration de Gram (classification des bactéries)
33
Qu'est-ce que Joseph Lister a découvert?
Méthodes antiseptiques : ¸
- se laver les mains
- stériliser les outils avant opérations
34
Qu'a découvert Alexander Fleming?
La pénicilline, par accident
35
Qu'a fait Thomas Roddick et qu'a-t-il étudié?
Chirurgien à l'hôpital Général de Montréal
Étudié l'antisepsie sous Lister
36
Qui ont créés la vaccination?
Edward Jenner, Louis Pasteur et Emil von Behring
37
Quelles sont les caractéristiques des bactéries? (12)
- Monères
- Petites cellules (1-10 um)
- S'adaptent très facilement
- Paroi bactérienne
- Peu d'organelles
- Petit génome
- Colonisent toutes sortes d'environnements
- Dominent la biosphère en nombre par leur activité métabolique
- Passent inaperçues
- Grande majorité est inoffensive
- Décomposent organismes morts et recyclent éléments chimiques vitaux
- Eucaryotes besoin de procaryotes pour vivre (pas contraire)
38
Qu'elle est la morphologie bactérienne générale?
Taille : 0,05 à 500 um
Forme : Sphérique ou ovale (coque), allongée (bâtonnet ou bacille)
Arrangement : isolé, amas, paire, chaîne, grappe, tétrade...
39
Quelle est l'importance historique de l'AGAR?
- Agent solidifiant ; polymère de D-galactose (algue)
- Poudre ajoutée à un milieu liquide
- Solubilise à ébullition : solidifie à 42 C
- Non toxique, non métabolisable
Culture pure : Koch et collaborateur
Petri : Julius Richard
40
Quelle est la définition d'une culture pure?
Culture composée d'une seule espèce de micro-organisme
- Isolement toujours en gélose et pas en milieu liquide
41
Quelle est la définition de la membrane cytoplasmique?
Fine structure essentielle à la survie qui entoure la cellule
42
Quelle est la composition de la membrane cytoplasmique?
- Bicouche de phospholipides
- Hopanoïdes (stabilité membrane, pas cholestérol)
- Oligosaccharides : glycolipides
- Protéines membranaires (plus abondantes que eucaryotes)
43
Quelles sont les fonctions de la membrane cytoplasmique?
- Limite cytoplasme
- Barrière de perméabilité sélective
- Métabolisme : respiration, photosynthèse, synthèse de lipides et constituants de la paroi
- Détection des signaux (chimiotactisme)
- Transport des éléments nutritifs et déchets
44
Quels sont les deux types de protéines membranaires?
Périphérique : faiblement associée à la membrane
Intrinsèque : fortement associée à la membrane, insoluble. Glucides peuvent s'y attachés à l'extérieur.
- Fonction : transport, sécrétion, transfert d'électron
45
Qu'est-ce que le mésosome?
Invagination profonde de la membrane plasmique en forme de vésicule
- Probable artéfact
- Fonction inconnue
46
Dans quelles bactéries sont présents les autres systèmes membranaires internes?
- Cyanobactéries
- Bactéries pourpres
- Bactérie ayant une activité respiration intense (Bactéries nitrifiantes)
47
Que contient le cytoplasme?
Eau
Corps d'inclusion
Ribosomes
Nucléoïde
Inclusions cytoplasmiques
48
Quelles sont les caractéristiques des ribosomes?
Site de la synthèse protéique
- Environ 10 000 ribosomes ou + par cellule
- Élément complexe (ARN et protéines)
49
Quelles sont les caractéristiques d'un nucléoïde?
Région dense et irrégulière qui contient :
- L'ADN (1 chromosome; plasmide)
- L'ARN
Repliement du chromosome
50
Quelle est la description des inclusions cytoplasmiques?
Granules composées de matières organiques ou inorganiques (réserves)
- Peuvent être entourées ou non d'une membrane (un seul feuillet)
51
Qu'est-ce qui cause les inclusions cytoplasmiques?
Les éléments nutritifs en excès
52
Quelles sont les types d'inclusions organiques et inorganiques?
- Glycogène : source de carbone et d'énergie
- Polygydroxybutyrate : réserve de carbone et d'énergie (lipide)
- Vacuoles gazeuses : bactéries aquatiques, permet de flotter
- Réserve de phosphate : granules de volutine ou polyphosphate (ATP)
- Réserve de soufre : donneur d'électrons pour bactéries photosynthétiques pourpres
- Fer (magnétite) : permet à certaines bactéries de s'orienter avec le champ magnétique
53
Quelle est la définition et les fonctions de la paroi des bactéries?
Structure solide à l'extérieur de la membrane plasmique
Fonctions :
- Morphologie bactérienne
- Protection contre la lyse osmotique
- Essentielle
54
Quel est le composant majeur de la paroi des bactéries?
Peptidoglycane (muréine) : polymère de glucides ramifiés reliés par de courts peptides
- Liés par des liaisons chimiques
55
Quels sont les deux agents antibactériens qui altèrent la paroi bactérienne?
Lysoyme : Présent dans larmes et salive
- Hydrolyse : coupe la liaison qui unit le NAM au NAG
Pénicilline : Empêche la formation des ponts peptidiques
- Gram - : + résistantes car membrane externe protège
56
Quelles sont les deux types de paroi chez les bactéries et par quoi se distinguent elles?
Gram positive et Gram négative
Distinguent par le type de pontage et la quantité de peptidoglycane
- Négative : pont/lien direct
- Positive : liaison de 5 glycines
Changement au niveau de l'épaisseur des parois
57
Quelles sont les caractéristiques des paroi des bactéries Gram+?
1. Couche importante de peptidoglycane
2. Présence d'acides téichoïques et lipotéichoïques
3. Périplasme peu abondant ou inexistant
58
Quelles sont les caractéristiques des paroi des bactéries Gram-?
1. Membrane externe (phospholipides/ lipopolysaccharides)
2. Peu de peptidoglycane
3. Espace périplasme important
- Protéines transmembranaires : porines et lipoprotéines
- Absence d'acides teichoïques
59
Quelles sont les fonctions de la membrane externe Gram -?
Protection contre la lyse
Résistance à certains antibiotiques
Rétention d'enzymes au niveau du périplasme
60
Quelle est la composition des Lipopolysaccharides (LPS)?
1. Lipide A : souvent toxique (LPS endotoxine). Stabilise membrane
2. Polysaccharide central (négatif) composé de KDO et de sucres
3. Chaîne latérale O ou antigène O
61
Quelles sont les couleurs des types de bactéries Gram?
Gram - : rose
Gram + : mauve (pas décoloré par l'alcool)
62
Qu'est-ce que le glycocalyx et ses fonctions?
Couche de polysaccharides entourant la paroi bactérienne
Fonctions :
- Adhérence
- Protection contre les bactériophages et le système immunitaire (phagocytose)
- Protection contre déshydratation
63
Quelle sont les différentes parties du Glycocalyx?
La capsule
- Structure bien organisée qui s'enlève difficilement
La couche mucoïde
- Structure diffuse non organisée qui s'enlève facilement
64
Qu'est-ce que la couche S?
Couche de protéines et glycoprotéines
- Protège, rigidité, adhérence
65
Qu'est-ce qu'un Fimbriae ?
- Environ 1000 cellules
Structures filamenteuses minces à la surface cellulaire qui ne sont visibles qu'au microscope électronique
Composé de protéines disposées en forme d'hélice
Fonctions : Adhérence, biofilms, facteurs de virulence et mobilité
66
Qu'est-ce qu'un Pili sexuels et ses fonctions?
- 1à 10 cellules
Structure similaire aux fimbriae, mais plus épaisse
Déterminés génétiquement par des plasmides
Fonctions : conjugaison et récepteurs pour les bactériophages
67
Que sont des flagelles?
Appendices locomoteurs s'étendant à l'extérieur de la membrane cytoplasmique et de la paroi cellulaire
- Mesurent 15 à 20 um (long) et 20 nm de diamètre
- Présent chez 50% des procaryotes
68
Quelles sont les types de cellules flagellées?
Monotriche : 1 flagelle à un bout
Lophotriche : Touffe de flagelles à une ou deux des bouts
Amphitriche : 1 flagelle à chaque bout
Péritriche : flagelles distribués sur toute la surface
- Tous flagelles peuvent se coller ensemble pour en faire un géant
69
Quelles sont les trois éléments de l'ultrastructure du flagelle?
1. Filament
- Partie la plus longue qui émane de la surface de la cellule
- Cylindre creux (non flexible) formé de flagellines
- Forme d'hélice pouvant se régénérer
2. Crochet
- Segment court et courbe qui unit le filament au corps basal
- Plus large que flagelle
3. Corps basal
- Moteur fournissant l'énergie nécessaire à la rotation
- Enfoui dans la cellule
- Différent selon Gram +/-
70
Qu'est-ce que le chimiotactisme?
La fréquence des culbutes diminue quand la bactérie s'approche de la solution attractive plus concentrée.
Possible grâce à l'interaction entre récepteurs et molécule attractive
71
Quelle est la définition d'une endospore bactérienne?
Organite facultatif qui se forme au sein du cytoplasme de certaines bactéries au moment de stress. L'endospore diffère de la cellule végétative par sa forme, structure, équipement enzymatique et résistance
72
Quelles sont les caractéristiques des endospores?
- Résistance à la chaleur, sécheresse, U.V et désinfectants chimiques
- Composées d'acide dipicolinique complexé au Ca++
- Petites protéines acido-solubles
73
Quels sont les types d'endospores?
Centrale
Subterminale
Terminale
Sporange gonflé
74
Qu'est-ce que la sporulation?
Phénomène de différenciation qui conduit de la forme végétative à l'endospore.
Cellule mère restante : sporange
75
Quelles sont les différentes parties de l'endospore?
Exosporium (EX) : enveloppe mince et délicate
Tunique (SC) : Plusieurs couches protéiques assez épaisse. Imperméabilité (toxines et produits chimiques)
Cortex (CX) : Plus que moitié volume spore, fait de peptidoglycane, paroi de spore (CW) est dans cortex
Protoplaste : Nucléoïde et ribosomes cytoplasmiques, métaboliquement inerte
76
Quelles sont les 7 étapes de la sporulation?
1. Formation d'un filament axial du matériel nucléaire
2. Invagination de la membrane (séparation de l'ADN)
3. Membrane entoure la préspore (dépôt de matériel entre les deux couches)
4. Formation du cortex, accumulation d'acide dipicolinique et de calcium
5. Formation de la tunique (protéines)
6. Endospore arrive à maturité
7. Lyse de la sporange
77
Qu'est-ce que la germination? et ses étapes
En conditions favorables, l'endospore peut germer et donner naissance à une cellule active
1. Activation (étape réversible)
2. Germination (gonflement, rupture de la tunique, perte de résistance)
3. Croissance (émergence, synthèse de nouveaux composés = bactérie active)
78
Comment est défini la croissance des bactéries? Et pour les procaryotes?
Accroissement du nombre de cellules ou de la masse cellulaire totale
- Plupart procaryotes : croissance de la cellule se poursuit jusqu'à sa division en deux cellules (fission binaire)
79
Comment peut être représentée la courbe de croissance microbienne et quelles sont les 4 phases de croissance?
Le log 10 de la concentration bactérienne en fonction du temps d'incubation
4 phases :
- Latence
- Exponentielle
- Stationnaire
- Mortalité
80
Quelles sont les caractéristiques de la phase de latence?
Phase d'adaptation dans laquelle il n'y a aucune division cellulaire
Durée varie selon :
- âge des bactéries
- origine (composition, temp. du milieu)
80
Quelles sont les caractéristiques de la phase exponentielle (logarithmique)?
- Accélération de la croissance des bactéries et division cellulaire
- Microorganismes se développent et divisent à vitesse maximale
- Population uniforme (propriétés)
- Courte durée
- Viabilité de la culture est maximale
80
Quelles sont les caractéristiques de la phase stationnaire?
Nb total de microorganismes viables reste constant (équilibre entre division et mort cellulaire)
Causes :
- Limitation des nutriments
- Accumulation de déchets toxiques, acidité
80
Quelles sont les caractéristiques de la phase de mortalité?
Arrêt de la division cellulaire
Nb de bactéries viables ou cultivables diminue de façon constante en fonction du temps
Causes :
- Dommages irréparables conduisant à une perte de viabilité
- Réponse génétique déclenchée (mort cellulaire programmée)
- Formation de cellules viables non cultivables (dormance)
80
Quelles sont les caractéristiques de la méthode directe de la mesure de croissance des microorganismes de décompte total?
Compter des cellules (selon la taille)
- Chambres de comptage observée au microscope
Avantages : facile à utiliser, rapide et peu coûteux, informations sur la taille/morphologie
Inconvénients : densité microbienne élevée, décompte des cellules mortes et vivantes
81
Quelles sont les caractéristiques de la méthode directe de la mesure de croissance des microorganismes de décompte des unités viables?
Méthodes de dilutions en milieu liquide et étalement sur gélose ou méthode des filtres de cellulose
Avantages : colonies proviennent juste des cellules vivantes qui se reproduisent
Inconvénients : Amas de cellules = 1 colonie (trop difficile à compter)
82
Quelles sont les caractéristiques de la méthode indirecte de la mesure de croissance des microorganismes de mesure de l'activité?
En mesurant la consommation de substrats, la concentration des constituants cellulaires ou l'excrétion de certains produits : peut évaluer concentration microbienne d'un échantillon
83
Quelles sont les caractéristiques de la méthode directe de la mesure de croissance des microorganismes de la mesure de masse cellulaire?
- Poids sec : récolte de microorganismes (filtration sur membrane) et pesée
- Turbidité par la densité optique
84
Quelles sont les caractéristiques de la culture continue (milieu ouvert)?
- Apport de nutriments
- Élimination des déchets
- Phase de croissance exponentielle est maintenue sur longue période
- Concentration constante de la biomasse
- 2 types : chémostat (apport constant à mm vitesse que éliminé) et turbidostat (vitesse dilution dét. par densité)
85
Quelle est la différence principale entre le fonctionnement du chémostat et du turbidostat?
Chémostat : débit d'apport de nutriments LIMITE croissance, puisque tenu à taux fixe
Turbidostat : pas de limitation des nutriments, croissance au taux MAXIMAL
86
Quels sont les types de milieux de culture?
1. Liquides : bouillons de culture (produisent suspension microbienne)
2. Solides : même composition que les bouillons, sauf avec ajout d'agar à 1-2% (colonies microbiennes)
87
Comment sont classés les différents types de milieux de culture?
Selon la composition : synthétique ou empirique
Selon l'usage : sélectif ou différentiel (ou les deux)
88
Quels sont les types de milieux de culture selon la composition?
1. Synthétiques ou définis : composition chimique entièrement connue - Milieux pauvres
2. Empiriques ou complexes : composition chimique indéterminée - Milieux riches
89
Quels sont les types de milieux de culture selon l'usage?
1. Milieux de base ou propagation : permettent la croissance de plupart
2. Milieux sélectifs : composés qui inhibent de façon sélective, sans affecter d'autres
3. Milieux différentiels : substances spécifiques permettant de distinguer différentes bactéries par couleur des colonies
90
Quelles sont les caractéristiques des nutriments nécessaires aux bactéries?
Substances utilisées pour la biosynthèse et la conversion de l'énergie, et donc, requises pour la croissance microbienne
- 10 éléments nécessaires en grande quantité : C, H, O, N, P, S, K, Mg, Ca, Fe
- Facteurs de croissance (acides aminés, vitamines et bases azotées)
91
De quoi tous les êtres vivants ont besoin pour subsister?
- Source de carbone : autotrophes (seule/principale source), hétérotrophes (molécules organiques préformées)
- Source d'énergie : phototrophes (lumière), chimiotrophes (oxydation des composés organiques)
- Source d'électrons : lithotrophes (mol. inorganiques réduites), organotrophes (mol. organique réduites)
92
Quelles sont les exigences nutritionnelles en carbone?
Unité structurale de base de toutes les molécules organiques
- Source carbone inorganique pour autotrophes
- Source carbone organique pour hétérotrophes
- Presque toutes substances carbonées peuvent être dégradées
- Si aucun chimiohétérotrophe peut dégrader substance : NON-biodégradable
93
Quelles sont les exigences nutritionnelles en azote?
Synthèse des acides aminées (protéines), bases azotées (purines, pyrimidines), certains glucides/lipides
- Forme inorganique : azote atmosphérique (N2), ammoniaque (NH3), nitrites (NO2), sels d'ammonium (NH4+)
- Forme organique : composés azotés comme aa, bases azotés, phospholipides
94
Quelles sont les exigences nutritionnelles en phosphore?
Élément essentiel des acides nucléiques, phospholipides et de nombreux coenzymes de l'ATP
- Absorbé sous forme inorganique (PO42-)
95
Quelles sont les exigences nutritionnelles en soufre?
Élément essentiel de certains acides aminés (cystéine, méthionine)
- principalement absorbé sous forme de sulfate
96
Quelles sont les exigences nutritionnelles en ions inorganiques?
Na+, K+, Mg 2+, Ca 2+, Co 2+, Cu 2+, Mn 2+, Zn 2+
Essentiels pour l'équilibre physicochimique de la cellule (constituants des enzymes et des coenzymes, constituants des structures cellulaires, cofacteurs enzymatiques)
97
Quelles sont les exigences nutritionnelles en facteurs de croissance?
Composés organiques essentiels à la croissance que la bactérie ne peut synthétiser elle-mêm
3 types
1. Acides aminés
2. Vitamines
3. Bases azotées
98
Quelles sont les deux types de bactéries concernant les facteurs de croissance?
1. Prototrophe : de type sauvage, du point de vue nutritionnel : autonome, pouvant croître sur milieu minimal
2. Auxotrophe : perte de capacité à synthétiser certains métabolites essentiels, incapable de croître sur milieu minimal
99
Quelles sont les exigences nutritionnelles en eau?
Principal constituant cellulaire des microorganismes, indispensable comme solvant et dans réactions biochimiques
États de l'eau
- Liée : liée aux macromolécules, ions ou toute surface hydrophile
- Libre : suffisamment éloignée d'une surface et libre des ses mouvements, propriétés physico-chimiques normales
100
Quelles sont les exigences nutritionnelles en oxygène?
Accepteur final d'électrons dans la chaîne respiratoire aérobique
Toxique pour les bactéries anaérobiques
- Procaryotes : soit nécessaire, toléré ou toxique
- Eucaryotes : presque toujours essentiel
101
Quelles sont les caractéristiques des bactéries aérobies stricts?
Exigent obligatoirement l'oxygène libre pour se multiplier
Oxygène libre utilisé comme accepteur final d'électrons dans la chaîne respiratoire
102
Quelles sont les caractéristiques des bactéries microaérophiles?
Se développent qu'en présence d'une faible pression d'oxygène libre, inférieure à celle de l'atmosphère (21%)
Pression d'oxygène libre de 2-10%
103
Quelles sont les caractéristiques des bactéries anaérobies stricts ou obligatoires?
Peuvent pas se multiplier si y'a de l'oxygène libre
Oxygène pas utilisé comme accepteur final de chaîne d'électrons (utilisent nitrates, sulfates, etc. = respiration anaérobie)
- Si accepteur final est composé organique : fermentation
104
Quelles sont les caractéristiques des bactéries anaérobies facultatifs?
Bactéries capables de croître en présence ou en absence totale d'oxygène libre
- Soit respiration aérobie ou fermentation (anaérobie)
*Très grande majorité des espèces bactériennes*
105
Quelles sont les caractéristiques des bactéries anaérobies aérotolérants?
Bactéries anaérobies, mais oxygène libre ne les tue pas
Avec oxygène : croissance plus faible que anaérobies facultatifs, car utilisent pas l'oxygène
106
Quelles sont les caractéristiques de la toxicité de l'oxygène?
Vital, mais potentiellement toxique, car réduction de l'oxygène (gain d'électrons) produit série de radicaux libres
Processus de réduction accéléré par 2 enzymes :
1. Superoxyde dismutases (SOD)
2. Catalase
107
Comment faire croître des bactéries anaérobies?
1. Bouillon au thioglycolate
2. Système GasPak (jarre anaérobique)
3. Chambre de travail anaérobie
108
Où sont placées les bactéries dans une gelée de croissance en tube, selon leur type?
Aérobies strictes : haut
Anaérobies stricts : fond
Anaérobies facultatifs : partout
Microaérophiles : pas bcp, haut
Anaérobies aérotolérantes : plus de croissance dans zone anoxique qu'oxique
109
Quels sont les facteurs influençant la croissance des microorganismes?
1. Température
2. Acidité (pH)
3. Pression osmotique
110
Comment la température affecte la croissance des bactéries?
Facteur très important, affecte directement les réactions enzymatiques (métabolisme) des microorganismes
- Minimale : temp. plus basse ou microorganisme peut croître
- Optimale : temp. idéale permettant un taux de croissance maximal
- Maximal : temp. plus élevée où peut croître
111
Comment l'acidité affecte la croissance des bactéries?
Activité enzymatique bactéries directement influencée par le pH
Milieu acide ou alcalin, enzymes normalement inactivées
- pH minimal : pH plus bas où peut croître
- pH optimal : taux de croissance maximal
- pH maximal : pH plus élevé où peut croître
112
Quels sont les types de microorganismes selon leur pH optimal?
1. Acidophiles : pH 0 - 5,5
2. Neutrophiles : pH 5,5 - 8
3. Alcalophiles : pH 8,5 - 11,5
Bactéries : 6-7
Mycètes : 5-6
113
Comment la pression osmotique affecte la croissance des bactéries?
Microorganismes affectés par modifications des concentrations
- Hypotonique : eau entre dans cellule
- Isotonique : échanges
- Hypertonique : eau sort et cellule se déshydrate (plasmolyse et faible disponibilité en eau libre)
114
Quels sont les types de microorganismes selon leur réponse à la pression osmotique?
1. Osmotolérants : tolèrent pression élevée (ex : champignons)
2. Osmophiles : nécessitent pression élevée pour croître (milieux hypertoniques)
3. Halophiles : nécessitent concentration en NaCl > 0,2 M (hypotonique)
115
Qu'est-ce qu'un transfert vertical?
D'une cellule parente à sa descendance
116
Qu'est-ce qu'un transfert horizontal?
Entre deux organismes distincts (voisins)
117
Quels sont les principes de l'expérience de Griffith?
A. Types morphologiques de pneumocoques (S et R)
B. Transformation des pneumocoques de forme R en pneumocoques de forme S
C. Agent transformant : ADN
118
Qu'est-ce que Frederick Griffith étudie?
Le transfert de la virulence de la bactérie pathogène Streptococcus pneumoniae
119
Quels sont les types morphologiques des pneumocoques?
1. Sauvages encapsulé et virulents (S). Colonies lisses
- Tuent les souris
2. Pneumocoques mutants non capsulés et non virulents (forme R). Colonies dentelées
- Tuent pas les souris
120
Quelles sont les caractéristiques de la transformation des pneumocoques de forme R en forme S?
Souris inoculés avec mélange de pneumo. S virulents tués à la chaleur (non pathogènes) et pneumo. R non virulents vivants (non pathogènes) MEURENT.
- Débris (agent transformant, ADN) des S morts transforment les R vivants en forme S
121
Qu'Est-ce que la transformation bactérienne?
Processus dans lequel une bactérie receveuse absorbe de l'ADN nu libéré dans le milieu par la lyse, accidentelle ou provoquée, de
bactéries donneuses
- Fragments peuvent se recombiner et donner des transformants
122
Qu'est-ce que la compétence bactérienne?
Aptitude de certaines bactéries à absorber des fragments d'ADN libre et de les incorporer dans son génome
- Facteurs de compétence : récepteurs, nucléases, protéines liant l'ADN simple brin
123
Quelles sont les étapes de la transformation bactérienne?
1. Absorption de l'ADN (récepteur de surface)
2. Entrée de l'ADN (simple brin)
3. Recombinaison homologue
4. Bactérie transformée (transformant ou recombinant)
124
Comment peut on induire la compétence chez E. coli (transformation artificielle)?
Par traitement au chlorure de calcium et d'un choc thermique
Entrée forcée par déstabilisation paroi par choc électrique (électroporation)
125
Quelles sont les caractéristiques essentielles de la conjugaison bactérienne?
1. Besoin contact physique entre bactéries
2. Présence de facteur de fertilité (F)
3. Transfert linéaire de l'ADN (plasmide ou chromosome) de la bactérie donneuse dans receveuse (F-)
126
Comment le contact entre les cellules à été prouvé pour la conjugaison?
Expérience de tube en U de Davis/Griffith
127
Quelles sont les caractéristiques des bactéries donneuses F+ ?
Avec facteur de fertilité
Lors de croisement F+xF-, descendants rarement modifiés en auxotrophie, mais souches F- deviennent F+
128
Où est situé le facteur de fertilité?
Sur un plasmide
129
Quelles sont les caractéristiques des bactéries donneuses Hfr ?
Haute fréquence de recombinants
Transforment pas bactéries receveuses en F+, même si transfert de gène très efficace
- Facteur F intégré dans chromosome bactérien à des sites spécifiques
130
Quelles sont les caractéristiques des bactéries donneuses F' ?
F' issu de l'excision d'un Hfr et d'ADN chromosomique
- Parfois dans processus, plasmide fait erreur d'excision et emporte portion de chromosome
- Croisement F'xF- : descendants F- devinent fréquemment F+ et intègrent ADN excisé avec Hfr
Conjugaison avec F' = Sexduction
Facteur F' sur un plasmide
131
Quelles sont les caractéristiques du plasmide F?
Petite molécule ADN bicaténaire circulaire de 95-100 kpb, extra ou intrachromosomique (épisome), autoréplicable et autotransférable
132
Qu'Est-ce qu'un épisome?
Plasmide libre ou intégré au chromosome de l'hôte
Élément génétique susceptible de se répliquer dans un de ces 2 états :
- Intégrés au chromosome de c. hôte
- Libre dans cytoplasme : plasmide F (F+)
132
Qu'est-ce que la définition de la conjugaison bactérienne?
Mécanisme qui consiste en un transfert linéaire et unidirectionnel du chromosome bactérien (Hfr) ou du plasmide F de la cellule donneuse à la cellule
receveuse (F-) à l'aide d’un contact direct entre les cellules
133
Pourquoi la conjugaison bactérienne est importante?
- Transfert génétique horizontal ou latéral
- Cartographie du chromosome bactérien : conjugaison interrompue
134
Qu'est-ce qu'un bactériophage?
- Virus de bactéries constitué d'une capside protéique contenant une molécule d'ADN ou d'ARN et pouvant être en stade intracell. ou extracell.
135
Quel sont les types de bactériophages?
A) Phages virulents (cycle lytique) : phages détruisent toutes les bactéries qu'ils infectent
B) Phages tempérés (cycle lytique ou lysogénique) : peut être comme phage virulent ou demeurer état latent dans bactérie hôte
C) Prophage : forme latente du génome viral qui réside dans l'hôte sans le détruire
- ADN du lambda s'intègre par recombinaison dans un site spécifique du chromosome E. coli et y demeure en état passif
136
Qu'est-ce qu'une bactérie lysogène?
Bactérie qui possède et transmet à sa descendance le pouvoir de produire des phages en absence d'infections (possède ADN du phage)
- Forme dormante du phage qui existe dans la cellule
137
Quelle est la définition de la transduction bactérienne?
Transfert génétique où un ou plusieurs gènes bactériens sont transmis d'un donneur à un receveur par intermédiaire d'un bactériophage (vecteur d'une portion du chromosome bactérien)
138
Quels sont les deux types de transduction et leurs définitions?
Généralisée : phages tempérés ou virulents transportent un exogénote bactérien (n'importe quel fragment du chromosome, pas viral)
Spécialisée : un phage tempéré, défectif pour une partie de son information génétique, a inséré dans son génome un fragment d'ADN de la bactéries donneuse
139
Qu'est-ce que la stérilisation?
L'élimination complète ou la destruction de tous les micro-organismes viables (forme végétative et forme sporulée). Utilisée sur les objets inanimés. (+ puissant)
140
Qu'est-ce que la désinfection?
Destruction ou élimination des agents pathogènes végétatifs, mais pas des endospores bactériennes. Ordinairement utilisée uniquement sur les objets inanimés. (2e + puissant)
141
Qu'est-ce que l'antisepsie?
Agents chimiques appliqués sur des surfaces du corps pour détruire ou inhiber les agents pathogènes
142
Qu'est-ce que l'activité "statique" des agents antimicrobiens?
Bactériostatique, fongistatique
Inhibe la croissance des microorganismes sans les tuer
Effet RÉVERSIBLE
143
Qu'est-ce que l'activité "cide" des agents antimicrobiens?
Bactéricide, fongicide, algicide, virucide
Substances qui tuent les microbes
Effet IRRÉVERSIBLE
144
Quels sont les facteurs affectant l'efficacité d'un agent antimicrobien?
Biologiques, chimiques ou environnementaux et durée d'exposition
145
Quels sont les facteurs biologiques qui affectent l'efficacité d'un agent microbien?
- Taille population (+ pop. grosse, + prend temps)
- Composition de la pop. (type de microbes)
Endospores : + résistantes
Bactéries : + résistantes avec capsule (glycocalyx)
Cellules plus jeunes = plus vulnérables
146
Quels sont les facteurs chimiques qui affectent l'efficacité d'un agent microbien?
- Concentration de l'agent : plupart temps, efficacité croît avec concentration produit
Courbe efficacité pas tjrs linéaire
Parfois : agent + efficace à faible concentration
- Temps de contact : + durée exposition longue, plus microbes tuées
147
Quels sont les facteurs environnementaux qui affectent l'efficacité d'un agent microbien?
- Température : efficacité monte avec température
Temp élevée : peut utiliser agent en concentration moindre
- pH : modifie charges électriques des macromolécules et influence dissociation et ionisation
- Présence de matière organique : protéines grande affinité pour antiseptiques
148
Quelles sont les 4 méthodes physiques pour le contrôle des microorganismes?
1. Température
2. Filtration
3. Radiations
4. Pression osmotique
149
Quel est l'effet des basses températures sur les microorganismes?
Ne tuent pas, mais ralentissent métabolisme et multiplication
- Réfrigération : ralenti fortement croissance et multiplication, mais arrête pas
- Congélation : arrête croissance (-20 C), certains microorganismes tués par rupture membranes après formation cristaux de glace, mais pas tous
150
Quel est l'effet des hautes températures sur les microorganismes?
Traitement thermique : méthode plus employée pour contrôler dév. microorganismes
- Chaleur tue micro. (BACTÉRICIDE)
- Chaleur humide : dénature protéines et ADN
- Chaleur sèche : agit par oxydation
151
Qu'est-ce que la stérilisation thermique?
Tuer tous microbes (végétative et sporulée) contenus dans une préparation
152
Qu'est-ce que la stérilisation par la chaleur humide?
Autoclave, à 121 degrés
Microbes tués en 15 minutes
Avantages : simple, rapide, efficace et peu dangereux
153
Qu'est-ce que la stérilisation par la chaleur sèche?
Four pasteur et flambage direct
Au four pendant 2 heures
- Chaleur sèche moins pénétrante que humide
Objets en verre ou en métal, matières grasses peu miscibles avec eau
- Flambage direct : 1 méthode plus simple
154
Qu'est-ce que la désinfection thermique?
Consiste à tuer les pathogènes sans nécessairement stériliser
- Ébullition
- Appertisation
- Pasteurisation
155
Qu'est-ce que l'ébullition?
Eau bouillante 10 minutes
Détruit rapidement microorganismes non sporulants et majorité des virus
- Pratique pour détruire entérobactéries et entérovirus
- Pas considéré méthode de stérilisation
156
Qu'est-ce que l'appertisation?
Procédé de conservation des denrées alimentaires par ébullition aliments dans récipients hermétiquement fermés
- Pas méthode de stérilisation
157
Qu'est-ce que la pasteurisation?
Procédé où expose un produit thermosensible à une température modérée pendant courte période de temps
- Permet inactivation microorganismes pathogènes sans altérer caractères nutritifs
- Pas méthode de stérilisation
158
Qu'est-ce que le temps de réduction décimale (D)?
Temps requis pour tuer 90% des microbes ou des endospores d'un échantillon à temp. spécifique
159
Qu'est-ce que la filtration?
Utile pour réduire le nb de bactéries dans solution thermosensible
- Bactéries pas détruites, seulement retenues dans filtre
- Certains microorg. pas de parois et super petits donc passent quand même
160
Quelles sont les types de filtration des solutions?
1. Filtres épais (très poreux)
- Faits de matières fibreuses ou granuleuses
- Retiennent bactéries par piégeage dans canaux sinueux ou surface
2. Membranes filtrantes
- Disques poreux et minces de 0,1 mm d'épaisseur
- Plusieurs grosseurs de pores, mais souvent 0,2 um
161
Qu'est-ce que la filtration de l'air?
Stérilisation de l'air en le faisant passer dans filtres qui retiennent microorganismes
- Élimine présence des bactéries, mais PAS bactéricide
162
Quelles sont les radiations qui affectent les microorganismes?
Radiations UV
- Dommages à l'ADN
- Sert à désinfecter, décontaminer les surfaces, l'air et les matériaux
Radiations ionisantes (rayons X et gamma)
- Agents de stérilisation excellents
- Stérilisation à froid d'antibiotiques, hormones, fils de suture...
163
Comment fonctionne la pression osmotique pour le contrôle des microorganismes?
Utilisation de grandes concentrations de sel ou de sucre pour conserver les aliments
- Crée un milieu hypertonique, provoque sortie de l'eau de la cellule microbienne = plasmolyse (meurent)
*Microorganismes potentiellement résistants = osmophiles et halophiles
164
Quels sont les agents chimiques pour le contrôle des microorganismes?
1. Composés phénoliques
2. Alcools
3. Agents oxydants
4. Halogènes
5. Métaux lourds
6. Additifs de conservation
7. Agents de surface
8. Aldéhydes
9. Gaz stérilisants
165
Quelles sont les caractéristiques du phénol?
1er antiseptique et désinfectant utilisé à grande échelle (pas de nos jours = irritant)
- Mode d'action : Endommage membrane plasmique (lipides), dénaturation des protéines à haute concentration
166
Quelles sont les caractéristiques des alcools?
Désinfectants et antiseptiques souvent utilisés
BACTÉRICIDES et FONGICIDES, mais non sporicides
- Mode d'action : dénaturation protéines et dissolution lipides membranaire
167
Quels sont les types d'agents oxydants? et leur manière d'agir
Peroxyde d'hydrogène (H2O2)
Peroxyde de benzoyle
Acide peracétique
Ozone (O3)
- Libération d'O2 pendant décomposition peut inhiber croissance bactéries anaérobies et oxydation des constituants cellulaires par radicaux libres
Bactériostatique
168
Quelles sont les caractéristiques du peroxyde d'hydrogène?
Antiseptique et bon désinfectant pour objets inanimés
- Même SPORICIDE à haute température
169
Quelles sont les caractéristiques de l'acide peracétique?
Tue bactéries végétatives et mycètes en - 5 min
Tue endospores et virus en 30 min
- Désinfection matériel et en agroalimentaire
170
Que sont les agents chimiques halogènes?
Éléments du tableau périodique, agents microbiens efficaces
171
Quelles sont les caractéristiques de l'iode?
Actif contre tous types de bactéries, bcp endospores et différents mycètes et virus
- Mode d'action : inactivation enzymes/protéines (BACTÉRICIDE?)
172
Quelles sont les caractéristiques du fluor?
À faible dose, inhibe enzymes et entraine destruction des bactéries (BACTÉRICIDE)
173
Quelles sont les caractéristiques du chlore?
Désinfectant pour l'eau et nettoyage surfaces
- Acide hypochloreux : détruit bactéries, mycètes, virus mais pas endospores
174
Quelles sont les propriétés des métaux lourds?
Propriétés désinfectants ou antiseptiques
- Détruisent PAS endospores
Mode d'action : inactivation enzymes/protéines en s'y fixant
175
Quelles sont les propriétés des additifs de conservation?
Retarde détérioration aliments
- Mode d'action : perturbent le métabolisme des microbes (BACTÉRIOSTATIQUE)
Nitrates :
- Mode d'action : inhibe les enzymes contenant du fer
176
Quelles sont les propriétés des agents de surface?
Agents surfactants : tensioactifs
- Solubilisent membranes et dénaturent protéines (BACTÉRICIDE)
Savons : pas vrm antiseptique
Détergents anioniques : désinfectants large spectre
- Mode d'actions : altération membrane plasmique (BACTÉRICIDE)
177
Quelle sont les propriétés de détergents cationiques
Désinfectants efficaces qui dénaturent protéines et solubilisent membrane
- Composés ammonium quaternaires : actif envers bactéries, FONGICIDES, amibicides et virus à enveloppe lipidique, inactifs contre endospores
- Chlorure de benzalkonium : tuent plupart bactéries (BACTÉRICIDE)
178
Quelle sont les caractéristiques des aldéhydes?
Formaldéhyde et glutaraldéhyde
BACTÉRICIDE, FONGICIDE, VIRUCIDE, ALGICIDE
- Désinfectants chimiques
179
Quelles sont les caractéristiques des gaz stérilisants?
Exposition à un stérilisant chimique en phase gazeuse
BACTÉRICIDE ET TOUS LES MICROORGANISMES
180
Qu'est-ce qu'un antibiotique?
Composé de faible poids moléculaire produit par un microorganisme qui, à faible concentration, inhibe la croissance des bactéries (bactériostatique) et dans certains cas tue les bactéries (bactéricide)
181
Quelles sont les propriétés des antibiotiques?
Toxicité sélective : toxique pour microorganismes, mais pas pour l'hôte
Dose thérapeutique : qt requise pour traitement efficace
Dose toxique : qt qui cause la toxicité chez l'hôte
Spectre d'activité : nb d'espèces microbiennes sensibles à un antibiotique
- Spectre étroit : antibio. actif contre nb restreint d'espèce
- Large spectre : actif contre plusieurs espèces microbiennes
Nature de l'activité antimicrobienne:
- statique (réversible, inhibe croissance)
- cide (irréversible, tue)
182
Qu'est-ce que l'indice thérapeutique?
Indice de toxicité sélective
Dose toxique / dose thérapeutique
- Plus indice élevé, plus antibiotique est sélectif vers un microorganisme
183
Quels sont les types d'antimicrobiens?
Antibactériens (bactéries)
Antifongiques (mycètes)
Antiprotozoaires (protozoaires)
Antiviraux (virus)
184
Quelles sont les différences provenances des antibiotiques?
Naturels : synthétisés par microorganismes
Purement synthétiques : synthétisés chimiquement
Semi-synthétiques : antibiotiques naturels ayant subi une modification par addition en laboratoire d'un groupement chimique
185
Quelles sont les différentes mesures de l'activité microbienne?
1. Concentration minimal inhibitrice (CMI) : Concentration plus faible d'un antibio capable d'empêcher croissance d'un microorganisme
2. Conc. minimale létale (CML) (CMB) : conc plus faible d'un antibio capable de tuer un micro.
186
Comment déterminer la CMI/CML?
Méthode de dilution en milieu liquide
187
Comment déterminer l'activité antimicrobienne?
Méthode de diffusion sur gélose
- Disques imprégnés de différents antibiotiques et voir où bactéries poussent
188
Quels sont les mécanismes d'action des antibiotiques?
Inhibition synthèse de la paroi cellulaire, de la synthèse protéines, de la synthèse d'acides nucléiques ou réplication
189
Quelles sont les substances qui inhibent la synthèse de la paroi?
Indice thérapeutique élevé
B-lactamines
- Pénicillines
- Céphalosporines
Glycopeptides
190
Quelles sont les substances qui inhibent la synthèse des protéines?
Indice thérapeutique relativement élevé
Aminoglycosides
- Cible : 30 s ribosomes
- Bactéricides
Tétracyclines
- Cible : 30 s ribosomes
- Bactériostatique
Chloramphénicol
- Cible : 50 s ribosome
- Bactériostatique
Macrolides
- Bactériostatique
191
Quelles sont les substances qui inhibent la synthèse des acides nucléiques?
Indice thérapeutique peu élevé
Quinolones
- Bactéricide
192
Quelles sont les substances antagonistes du métabolisme (antimétabolites)?
Indice thérapeutique élevé
Sulfamidés
- Bactériostatique
193
Quelles sont les substances qui détruisent la membrane plasmique?
Indice thérapeutique peu élevé
Polymyxine B
- Bactéricide
194
Quelles sont les stratégies utilisées pour réduire le risque d'émergence de la résistance?
1. Concentration d'antibio assez élevée pour détruire les mutants spontanés
2. Combinaison d'antibiotiques (pas super)
3. Réduire utilisation antibio à large spectre
4. Éviter abus
5. Nouvelle approche
195
Qu'est-ce que la définition du microbiote humain?
Population de microorganismes que l'on trouve normalement dans un site anatomique spécifique
Origine : foetus possède aucun microbiote
- Colonisation dès la naissance
- Composition définitive vers 2-3 ans
196
Quels sont le rôle du microbiote?
1. interférence à la colonisation
2. contribution nutritionnelle et métabolique
3. stimulation du système immunitaire
4. source d'infections
197
Quel est le lien entre le commensalisme et le parasitisme?
Équilibre précaire entre les deux et peut basculer
- Si introduit dans un autre site anatomique = parasitisme
- Si défenses immunitaires hôte affaiblies
198
Quelles sont les origines des infections exogènes?
Exogène: de l'extérieur
Endogène : agents infectieux provenant de flore commensale
- infection survient suite à affaiblissement système immunitaire ou rupture barrière anatomique
199
Qu'est-ce que l'incidence?
Nombre de nouveaux cas dans une période donnée
200
Qu'est-ce que la prévalence?
Nombre total de cas à une période donnée
201
Quels sont les différents termes pour les maladies et leur définitions?
Sporadique : apparaît occasionnellement et par cas isolés
Endémique : constamment présente
Épidémique : grand nombre de cas dans une courte période de temps
Pandémie : maladie épidémique à l'échelle mondiale
202
Quels sont les types d'infections?
Aiguë: évolue rapidement, mais de courte durée
Chronique : évolue lentement, mais de longue durée
Subaiguë : situé entre aiguë et chronique
Latente : inactive pendant période +/- longue et risque réactivation
203
Quels sont les types de dommages causés à l'hôte?
Infection local ou généralisée
Sepsie : état inflammatoire toxique
Septicémie : multiplication de pathogènes dans le sang
Bactériémie : présence de bactéries dans le sang
Toxémie : présence de toxine dans le sang
Virémie : présence de virus dans le sang
204
Qu'est-ce qu'une infection secondaire?
Infection causée par la même bactérie que primaire, mais à un autre endroit
205
Quelles sont les 5 étapes du cycle infectieux?
1. Incubation : silencieuse et sans symptômes, durée variable
2. Prodromique : premiers symptômes vagues, souvent court
3. Période d'état : symptômes intensité maximale et spécifiques
4. Déclin : moins symptômes
5. Convalescence : rétablissement et retour homéostasie
206
Quelles sont les deux variations possibles de la virulence?
Exaltation : augmentation progressive de la virulence
Atténuation : perte graduelle de la virulence
207
Quels sont les facteurs de risque d'infection chez l'hôte?
âge (jeunes et vieux)
stress (fatigue)
état nutritionnel
prédispositions génétiques
facteurs environnementaux
circonstances favorables
208
Que sont des infections nosocomiales?
Infections attrapées dans hôpitaux où l'hôte est affaibli, il y a une grande présence de microbes et une bonne chaîne de transmission
