Microbiologie - Microbiote Flashcards
(28 cards)
Quel est le ratio bactérie : cellule dans le corps humain?
10 : 1
Qu’est-ce qui constitue (la majeur partie du temps) le premier moment de colonisation bactérienne chez le bébé naissant?
Au moment de l’accouchement, le bébé entre en contact avec la flore normale de sa mère (flore vaginale très souvent). Il était dans un milieu stérile avant cela.
Définition du microbiote
Le microbiote est l’ensemble des micro-organismes qui résident sur un site donné.
Définition du microbiome
Ensemble des micro-organismes et de leurs gènes qui résident sur un site donné
Qu’est qu’un microbiome central (caractéristiques) ?
- Espèces bactériennes présentes chez > 95% des personnes
humaines à un site donné - Représente la majorité des bactéries présentes à un site
donné - Moins varié que le microbiome secondaire
Qu’est-ce qu’un microbiome secondaire?
- Espèces bactériennes qui diffèrent d’un individu à l’autre
- Grande variété d’espèces
- Chaque espèce est en plus petite quantité comparativement
au microbiome central
Caractéristiques du microbiote de la peau
- Le micrbiote cutané varie selon le site
- Il est influencé par la présence ou non de glandes sébacées et d’humidité
- Il varie selon le sexe.
Quels sont les lieux dans le corps où il y a présence du plus grand nombre de micro-organismes?
- Salive (10^9 organismes par mL)
- Côlon (10^11 organismes par gramme)
- Sécrétions vaginales (10^9 organismes par mL)
Pourquoi y a-t-il moins d’organismes au niveau de l’estomac comparé à d’autres compartiments du corps?
À cause du pH gastrique qui n’est pas optimal pour la croissance de certains organismes (barrière aux micro-organismes étrangers)
Caractéristiques du microbiote du tractus digestif
- Système ouvert de la bouche à l’anus
- La diversité et la quantité de bactéries varient selon le segment du tube digestif.
- 10^14 bactéries : 100,000,000,000,000
- > 500 espèces dont la majorité sont non cultivables. Elles sont identifiées principalement par séquençage moléculaire.
Pourquoi une coupure au niveau du côlon pourrait être néfaste au niveau du microbiote?
Les bactéries du tracus intestinal pour se déplacer vers un autre compartiment, ce qui pourrait être néfaste considérant que la présence de certaines bactéries dans d’autres milieux ne soient pas avantageux pour notre corps.
Quels sont les sources de variation du micrbiote sain?
- Il varie d’une personne à l’autre, d’une région à une autre et il varie selon l’âge.
Comment évolue le microbiote avec le temps?
- Stade du bébé naissant : Il varie dépendemment de la façon que le bébé est venu au monde. Certaines bactéries sont plus présentes chez les bébés venus au monde par la voie vaginale et d’autres sont plus présentes chez ceux qui sont venus au monde par césarienne. Le microbiote de la voie vaginale est généralement plus riche.
- Enfance : De nouvelles bactéries apparaissent et prennent la place des anciennes. La diversité est plus grande, mais cette croissance engendre de l’instabilité. Le microbiote change en fonction de la diète et des maladies.
- Adulte : Microbiote distinct qui est susceptible aux changements, mais à un rythme plus lent que dans l’enfance.
- Personne âgée: Microbiote différent que celui des jeunes adultes.
Quel autre facteur, à part la naissance par voie vaginale, peut contribuer au développement d’un microbiote riche chez le bébé?
L’allaitement maternel
Quels sont les fonctions du microbiote intestinal?
- Fonctions métaboliques
- Stimule le système immunitaire inné
- Prévient la colonisation par des bactéries pathogènes
Exemples de la fonction de métabolisme du microbiote intestinal?
Métabolise certains nutriments plus facilement ce qui les rend disponibles aux cellules hôtes
- Grosses molécules d’hydrates de carbone comme la cellulose sont transformées en petites molécules (acétate, propionate et butyrate) facilement absorbées par les cellules hôtes.
- Les acides comme l’acétate, le propionate et le butyrate limitent la croissance de certaines bactéries indésirables.
Exemples de la fonction de protection du microbiote intestinal?
Le microbiote intestinal protège contre certaines infections entériques :
- En tapissant la muqueuse (sert de rempart) et en consommant les nutriments (affame les pathogènes)
- En stimulant la production de mucine, d’immunoglobuline IgA et des peptides antimicrobiens ( AMPs
- En stimulant la production d’IL 22 (↑ résistance cell épithéliales) et d’IL 1 β (↑ recrutement de cellules inflammatoires).
Facteurs externes qui influencent le microbiote
- Hygiène personnel (savon, déodorant, rince-bouche, douche vaginale)
- Diète (riche en fibre, graisse, sucre) + diversifié ou non
- Eau (avec chlore vs eau de puit)
- Prise d’antibiotique
Exemples d’altération de la flore normale (dysbiose)
- Diarrhée à Clostridioides difficile (DACD)
- Prise d’antibiotique qui altère la flore normale du côlon
- Prolifération du C. difficile (perte de la compétition alimentaire)
- C. difficile qui produit des toxines responsables de la diarrhée - Colite ulcéreuse
- Prolifération de la bactérie Akkermansia muciniphila qui produit une sulfatase qui dégrade la couche de mucine.
- Augmentation de Prevotellaceae qui produit des chemokines
inductrices d’inflammation. - Maladie céliaque (entéropathie au gluten)
- Vaginite à Candida
- Obésité ( bactéries intestinales plus efficaces à transformer des gros hydrates de carbone en petites molécules facilement absorbables)
Quels sont les effets associés à une bonne symbiose avec le microbiote gastro-intestinal?
- Tolérance immune
- Homéostasie intestinal
- Métabolisme sain
Quels sont les effets associés à une dysbiose avec le microbiote gastro-intestinal?
- Maladie du système immunitaire (ex. atopie, asthme, sclérose en plaque)
- Maladie intestinal (maladie inflammatoire de l’intestin, entérocolite nécrocroissante du nouveau-né)
- Maladie métabolique (ex. diabète, obésité)
La manipulation du microbiome humain est un traitement prometteur pour certaines maladies. Quel pourrait être un exemple?
Le traitement au C. difficile est réfractaire au traitement standard. (efficacité de 40 à 96% après une transplantation)
Que sont les probiotiques?
- Mélanges de bactéries et/ou levures ingérés dans le but de coloniser, même temporairement, l’intestin
- La majorité des probiotiques contiennent des bactéries Gram positif comme Bifidobactérium et Lactobacillus et des levures comme Saccharomyces.
- L’efficacité dépend des microorganismes choisies, de la dose et de la survie de ceux-ci après le passage dans l’estomac.
- Contrairement aux médicaments, il y a un moins bon contrôle sur la composition exacte et la concentration résiduelle de microorganismes après le passage dans l’estomac.
Qu’est-ce que la pouchite?
C’est une inflammation de la poche créée à partir de l’iléon lorsque le côlon a déjà été retiré.
