Microbiome

Question 1

Définition du microbiome

Answer 1

Totalité des microorganismes associés à un hôte
- Symbiotique ou commensal ou pathogénique

Question 2

Espèces du microbiome (général)

Answer 2

Bactéries, virus, champignons

Question 3

Masse du microbiome

Answer 3

200g

Question 4

Vrai ou faux,
Microbiome comporte davantage de cellules que le corps humain

Answer 4

Vrai

Question 5

Nombre d’espèces

Answer 5

10 000 espèces (100x plus de gènes que le génome humain)

Question 6

Vrai ou faux,
Le microbiome est plastique, mais retourne à un “état de base”

Answer 6

Vrai

Question 7

Vrai ou faux,
Les mêmes fonctions sont forcément exécutées par les mêmes espèces dans tous les contextes

Answer 7

Faux,
Les mêmes fonctions ne sont pas forcément exécutés par les mêmes espèces dans différents contextes

Question 8

Estomac

Answer 8

Acid challenge

Question 9

Petit intestin

Answer 9

• Site primaire de contact: bile et enzymes pancréatiques
• Peyer’s patch: site majeur de l’immunité adaptative

Question 10

Colon (intestin large)

Answer 10

Bioreacteur: Forte activité métabolique
Petite chain d’acides gras

Question 11

Classification du microbiome

Answer 11

En phylae

Question 12

Dominance de quelles espèces dans le microbiome

Answer 12

Firmuicutes et bacteroidetes (à proportion variable)

Question 13

Firmicuites

Answer 13

-Clostridia, Bacillli
- Gram +
- Anaerobes

Question 14

Bacteroidetes

Answer 14

• Gram -
• Forment pas de spores
• Anaerobes ou aerobes
• Très présents dans l’environnement

Question 15

E. coli

Answer 15

• Pseudomonadota/Proteobacteria
• Composante mineure
• 10% des humains en n’ont pas
• Souche non-pathogènes

Question 16

Plasticit du microbiome gastro-intestinal

Answer 16

Le microbiome s’acquiert tout au long de l’enfance, pas encore stable
- Traitement antibiotique pendant la grossesse
- Mode d’accouchement (prevotella, lactobacillus)
- Allaitement (Bifidobacterium)

Question 17

Vrai ou faux,
Le microbiome adulte est relativement stable

Answer 17

Vrai,
Les modifications sont passagères, après retourne à l’état de base

Question 18

Rôle potentiel du cecum/appendix dans la stabilité du microbiome

Answer 18

En cas de diarrhée, l’appendice contiendrait un inoculum pour la reconstitution d’un microbiome sain

Question 19

Fonctions bénéfiques du microbiome gastro-intestinal

Answer 19

• Colonisation
• Métabolisme
• Éducation immune
• Pré-digestion
• Production de vitamines

Question 20

Fonctions nuisibles du microbiome gastro-intestinal

Answer 20

• Pas de colonisation
• Microbes pathogéniques
• Modulation immune (IBD)

Question 21

Principaux aspects métaboliques du microbiome

Answer 21

1) production de vitamines
2) Modulation du métabolisme des acides biliaires
3) Digestion de carbohydrates non-digestibles
4) Productions de SCFA

Question 22

Vitamines

Answer 22

Métabolite essentiel, qui ne peut être synthétisé par l’organisme. Il doit être pris dans la nourriture

Question 23

Microbiome produit quelles vitamines?

Answer 23

Presque toutes les vitamines hydrosolubles (B12) et Vitamine K

Question 24

Lieu absorption des vitamines de la nourriture

Answer 24

Ileum

Question 25

Lieu synthèse des vitamines par le microbiome

Answer 25

Colon

Question 26

Modulation du métabolisme s'Acides biliaires

Answer 26

Recirculation enterohépatique

Question 27

Lieu acides biliaires primaires

Answer 27

Foie

Question 28

Acides biliaires primaires

Answer 28

- CA - CDCA

Question 29

Lieu acides biliaires secondaires

Answer 29

Intestin, transformation effectuée par le microbiome dans le colon

Question 30

Acides biliaires secondaires

Answer 30

- DCA - LCA - UDCA

Question 31

Poucentage des acides biliaires qui atteignent le colon

Answer 31

1-5%

Question 32

Cible des acides biliaires

Answer 32

- ligands de récepteurs de signalisation (TGR5 et FXR) = Influent sur l'expression génique - Ciblent aussi autres récepteurs = propriétés de signalisation différentes

Question 33

Vrai ou faux, Les acides biliaires ne peuvent pas entrer la recirculation entérohépatique

Answer 33

Faux

Question 34

Vrai ou faux, Les bactéries du microbiome intestinal digèrent des carbohydrates non-digestibles (polymères)

Answer 34

VRai

Question 35

Ruminants

Answer 35

L'estomac (le rumen) contient un microbiome capable de digérer de la cellulose = bioréacteur

Question 36

Vrai ou faux, Les ruminants se nourrissent des sucres dérivés de la cellulose

Answer 36

Faux, Ils se nourrissent des SFCA

Question 37

Qu'est-ce qui rend efficace l'absorption des produits bactériens par les ruminants?

Answer 37

La digestion se fait avant l'intestin

Question 38

Vrai ou faux, Chez les humains, l'effet des fibres sur le microbiome est plus important

Answer 38

Vrai, effet sur la composition du microbiome

Question 39

Produits principaux du métabolisme microbien intestinal (fermentation)

Answer 39

SCFA: - Acetate - Propionate - Butyrate

Question 40

Pourcentage des besoins énergétiques des ruminants dérivés des SCFA

Answer 40

75-80%

Question 41

Utilisation des SCFA

Answer 41

Alimenter la gluconogénèse, la synthèse de lipides, et le TCA

Question 42

Carburant principal des colonocytes humains

Answer 42

SCFA

Question 43

Utilisation des SCFA dans le foie

Answer 43

- Synthèse du cholestérol ou acides gras - Alimenter la gluconéogénèse

Question 44

Produits gazeux de la fermentation

Answer 44

H2S, H2, NH4, CH4

Question 45

Vrai ou faux, Le liquide cérébrospinal contient des SCFA

Answer 45

Vrai

Question 46

Probiotiques

Answer 46

- Arrivent bien vivantes dans l'intestin - Sont détectables dans les selles - Ont un effet global sur le microbiome intestinal, qui n'est pas bien caractérisé - Mais l'effet est plutôt transitoire

Question 47

Vrai ou faux, La prise de produits probiotique induit une colonisation durable de l'hôte

Answer 47

Faux, Les lactobacilles ne font pas parti du microbiome normal --- retour état de base