Microcalorimétrie

Question 1

L’énergie est libérée dans quelle circonstance? Lorsqu’on forme ou brise des liens?

Answer 1

L’énergie est libérée quand on forme des liens.
Besoin d’énergie pour briser les liens

Question 2

Vrai ou Faux
La quantité d’entropie dans l’univers a tendance à augmenter?

Answer 2

Vrai
Deuxième loi de la thermodynamique
Chaud vers le froid

Question 3

Vrai ou Faux
Un solide parfaitement cristallin au zéro absolu a un entropie positive ?

Answer 3

Faux, entropie de zéro

Question 4

Quelles sont les deux types d’énergie moléculaire d’un système ?

Answer 4

Cinétique et potentielle

Question 5

Qu’est-ce que l’enthalpie?

Answer 5

La quantité d’énergie d’un système (liaisons)

Question 6

Qu’est-ce que l’entropie?

Answer 6

Le désordre d’un système
L’entropie c’est la distribution de l’énergie

Question 7

La création de liens est favorable ou défavorable pour l’enthalpie? et négative ou positive?

Answer 7

Valeur négative ***FAV??

Question 8

La création du désordre est favorable ou défavorable ? Et valeur positive ou négative?

Answer 8

Favorable et valeur positive*

Question 9

Lorsqu’un système thermodynamique nécessite plus d’efforts, est-ce qu’il y a moins ou plus de gains au final?

Answer 9

Plus de gains

Question 10

Qu’est-ce que la capacité calorifique ?

Answer 10

Quantité de chaleur nécessaire pour faire
varier la température
Pour une biomolécule, c’est sa capacité
d’absorber de la chaleur sans faire
augmenter la température

Question 11

La capacité calorifique augmente dans quelle phase de l’eau?

Answer 11

Solide -> eau -> vapeur (+désordre)

Question 11

La température augmente ou diminue le désordre?

Answer 11

Augmente le désordre proportionnellement

Question 12

Un ligand flexible restreint dans un site actif est favorable ou défavorable pour l’entropie?

Answer 12

Entropiquement défavorable

Question 13

La relâche d’une molécule d’eau est favorable ou défavorable pour l’entropie?

Answer 13

Entropiquement favorable

Question 14

Quels sont les éléments qui influencent la thermodynamique?

Answer 14

• Changement du degré de liberté
• Liaisons (ponts H ou de Van der Waals)
• Hydrophobique
• Surface accessible du solvant
• Changement de conformation

Question 15

Les liaisons influencent l’entropie ou l’enthalpie?

Answer 15

Enthalpie

Question 16

L’effet hydrophobe influence l’entropie ou l’enthalpie?

Answer 16

Entropie principalement

Question 17

Le changement de conformation influence l’entropie ou l’enthalpie?
Et favorable ou défavorable?

Answer 17

Entropie et défavorable

Question 18

Quelle constante désigne l’affinité?

Answer 18

Kdissociation = Constante de Gibss (DeltaG)

Question 19

La création de liaisons est favorable ou défavorable pour l’enthalpie?

Answer 19

Favorable

Question 20

Quelles sont les deux aspects à connaitre pour comprendre la fonction d’une macromolécule?

Answer 20

• Structure
• Mouvement/Énergie

Question 21

On veut qu’un inhibiteur ait un Delta G et Delta H élevé ou faible?

Answer 21

Élevé dans les deux cas
On recherche une meilleure affinité, un inhibiteur rigide, mais également libre pour mieux s’adapter en cas de mutations.

Question 22

Pour observer une croissance bactérienne, y a-t-il mieux que la densité optique?

Answer 22

Oui, la microcalorimétrie

Question 23

Nommez deux applications pour la microcalorimétrie?

Answer 23

• Développer un packaging pour un vaccin ARN
• Déterminer la stabilité d’une molécule (Température et temps)

Question 24

Quelles sont les techniques de calorimétrie? (4)

Answer 24

- Calorimétrie isobarique - Calorimétrie isochorique - Titrage calorimétrique isotherme (ITC) - Calorimétrie différentielle à balayage (DSC)

Question 25

À quoi sert la calorimétrie isobarique?

Answer 25

Mesurer la quantité de chaleur d'une réaction

Question 26

À quoi sert la calorimétrie isochorique?

Answer 26

Mesurer la chaleur de combustion Mesurer la quantité d'énergie d'un aliment

Question 27

À quoi sert l'ITC?

Answer 27

* Mesurer quantitativement les interactions entre macromolécules * Mesurer directe de la chaleur relâché ou absorbé par une interaction * Détermination des paramètres de liaison : - Affinité (KD / ΔG) - Stœchiométrie (n) - Enthalpie (ΔH) - Entropie (ΔS)

Question 28

Quelles sont les utilités de l'ITC?

Answer 28

Mesurer des interactions : Prot-Prot Prot-ADN etc

Question 29

Quels sont les avantages de l'ITC?

Answer 29

* Mesure directe * Donne beaucoup plus que l’affinité - Aide à élucider les mécanismes sous-jacents des interactions moléculaires * Mesures thermodynamiques et cinétiques simultanées

Question 30

Nommez 4 aspects techniques d'un ITC

Answer 30

- Concentration adéquate - Exactement le même solvant - Éviter la formation de bulles - Minimiser la chaleur d'oxydation

Question 31

Quelles sont les 4 parties d'un ITC?

Answer 31

- Coquille adiabatique - Cellules jumelles - Seringue agitatrice - Module thermoélectrique

Question 32

Comment fonctionne l'ITC?

Answer 32

Série d'injection espacé d'un retour à l'état de base (titration) De - en - de chaleur libéré car moins de liaisons à faire

Question 33

Comment prévenir la résistance aux médicaments?

Answer 33

En augmentant la flexibilité de la molécule (entropiquement moins favorable) et en compensant enthalpiquement

Question 34

Comment savoir si la protéine est bien repliée?

Answer 34

En mesurant la stoechiométrie Voir la valeur relié au centre de la pente du graphique

Question 35

Un graphique ayant une meilleure affinité a une pente plus abrupte ou moins?

Answer 35

Une pente plus abrupte signifie une meilleure affinité

Question 36

À quoi sert le DSC?

Answer 36

* Étudier des changements de conformation * Suivre la stabilité (dénaturation) d’une macromolécule * Étudier/améliorer la durée de vie d’une macromolécule

Question 37

Nommez 3 aspects techniques d'un DSC?

Answer 37

- Exactement le même solvant dans la cellule de référence - Éliminer les agrégats - Minimiser la chaleur d'oxydation

Question 38

Quelles sont les 3 parties d'un DSC?

Answer 38

- Coquille adiabatique - Cellules jumelles - Module thermoélectrique **Pas de seringue

Question 39

Vrai ou Faux Un DSC mesure en continue la chaleur spécifique d'un système en fonction du solvant?

Answer 39

Faux Mesure en continue la chaleur spécifique d’un système en fonction de la température.

Question 40

Est-ce qu'on peut suivre une dénaturation de protéine sur DSC?

Answer 40

Oui, Les bris de liaisons ont besoins de plus d'énergie donc plus grande température jusqu'à saturation (Tm)

Question 41

Un pH plus acide diminue ou augmente la capacité calorifique?

Answer 41

Diminue

Question 42

Quels sont les optimisations possibles pour la stabilité d'enzymes ?

Answer 42

pH Force ionique Osmolytes Potentiel rédox Mutagénèse Synthèse

Question 43

Vrai ou Faux La microcalorimétrie est utile pour le contrôle qualité de produit biologique?

Answer 43

Vrai