Mikrobiologi Flashcards
Hvad er forskellen på grampositive bakterier og gramnegative bakterier?
Forskellen på grampositive bakterier og gramnegative bakterier er deres “cell envelope”
Grampositive bakterier:
1)Cytoplasmamembranen
2)Tykt lag peptidoglykan
Gram negative bakterier:
1)Cytoplasmamembranen
2)Tyndt lag peptidoglykan
3)Ydre membran
De består hertil af periplasma
Er en bakteriecelle en prokaryot eller en eukaryot?
En bakteriecelle er en prokaryot, de har IKKE en cellekerne
Arkæer
Prokaryoter
Enkeltcellede og omtrent 1-10
Beregning af bakterier i oprindelig prøve
For at beregne antallet af bakterier i den oprindelige prøve kan du følge disse trin:
1. Tæl antallet af kolonier på agarpladen.
2. Beregn den samlede fortynding af prøven ved at multiplicere den oprindelige fortynding med den fortynding, der blev brugt til at lave agarpladen.
3. Beregn antallet af bakterier i prøven ved at multiplicere antallet af kolonier med den samlede fortynding.
For eksempel, hvis man tæller 50 kolonier på en agarplade og har lavet en 100x fortynding af prøven, vil den samlede fortynding være 100 x 1 = 100. Antallet af bakterier i prøven vil så være 50 x 100 = 5000 bakterier.
CFU colony forming unit
Estimerer antallet af levedygtige mikrobielle celler i en prøve, her tæller man antallet af kolonier på et fast medium
Væksthastighedskonstant
k=0,693/g er en formel, der bruges til at beregne den specifikke vækstrate af en bakteriepopulation. Den naturlige logaritme af 2 (k) er en konstant- og generationstiden (g) er tiden det tager for en bakteriepopulation at fordoble sig i antal
Den eksponentielle fase
I den eksponentielle fase deler bakterierne sig hurtigt og antallet af bakterier i populationen stiger eksponentielt. Høj vækstrate i antallet af bakterier. Her foregår der aktivt binær fission. Her sker der en fordobling, for hver generationsperiode.
Den stationære fase
I den stationære fase holder antallet af bakterier op med at stige og forbliver konstant. Dette skyldes normalt mangel på næringsstoffer eller ophobning af affaldsprodukter. Ingen vækst i antallet af bakterier, der dør lige så mange, som der kommer til.
Dødsfasen
I dødsfasen dør flere bakterier end der dannes og dette skyldes også mangel på næringsstoffer eller ophobning af affaldsprodukter.
Eksempel på katalasepositive mikroorganismer
Stafylokokker
Eksempel på oxidasepositive bakterier
Typiske gramnegative som eksempelvis Pseudomonas
Virus
· Obligate parasitter, der kun replikerer inden for værtscellen
· Obligat parasitisme er en type symbiose, hvor en organisme er afhængig af en anden organisme(værten) for overlevelse. Obligate parasitter kan kun overleve og formere sig inden for værtscellen og kan ikke overleve uden for værten.
· Virus er ikke en celle
· Virus har ikke en metabolisme
· Klassificeret baseret på struktur, genomsammensætning og værtsspecificitet
· Virus er mikroorganismer, som består af DNA eller RNA og en proteinkappe. Virus kan ikke formere sig selvstændigt, men trænger ind i og udnytter levende celler til at lave flere viruspartikler.
Eksempler på mikrobiel aktivitet ikke alle mikroorganismer kan
Bevægelse:
Såfremt mikroorganismer har flageller, kan de bevæge sig
Genetisk udveksling:
Genetisk udveksling mellem mikroorganismer er en proces, hvor mikroorganismer udveksler gener med hinanden. Det kan ske på flere forskellige måder, herunder vha. plasmider, transduktion og transformation.
Kommunikation:
Mikroorganismer kan kommunikere med hinanden på forskellige måder, herunder vha. kemiske signaler
Differentiering:
Mikroorganismer kan differentiere sig til forskellige celletyper, hvilket betyder, at de kan udføre forskellige funktioner i en population af mikroorganismer. Et eksempel på differentiering er dannelse af biofilm, hvor bakterierne kan differentiere sig til at udføre forskellige funktioner i biofilmen.
Eksponentiel vækst
Mikroorganismers vækst er eksponentiel under ideelle forhold. En celle deler sig til 2, 2 celler deler sig til 4, 4 deler sig til 8. Væksten sker med mikroorganismens vækstrate. Altså er eksponentiel vækst en væksttype, hvor antallet af organismer vokser med samme antal procent, hver gang der er gået et bestemt stykke tid.
Viable plate count
- Spread plate
- Pour plate
Viable plate count
Viable plate count er en metode til at estimere antallet af levedygtige bakterier i en prøve. Denne metode involverer at fortynde prøven og derefter sprede den fortyndede prøve på en fast agaroverflade. Efter inkubation kan antallet af kolonier tælles for at estimere antallet af levedygtige bakterier i prøven
Spread plate
Inoculum spredes ud på det faste substrat vha. en steril drigalski spatel. Her kan man isolere klonekolonier.
Spread-plader bruges ofte til at isolere specifikke klonekolonier. Hvis du vil isolere en bestemt type bakterie fra en prøve, kan du sprede prøven på overfladen af en agarplade og lade den vokse. Når bakterierne vokser, vil de danne klonekolonier på overfladen af agarpladen. Du kan derefter isolere en enkelt klonekoloni og dyrke den separat.
Pour plate
Det smeltede agar hældes ovenpå inoculum. Pour plate metoden anvendes til at tælle antallet af kolonidannende bakterier i en væskeprøve. Det kan også anvendes til identifikation af, hvorvidt der er tale om aerobe, anaerobe eller fakultativt aerobe bakterier.
Pour-plader bruges ofte til at tælle antallet af kolonidannende bakterier i en væskeprøve. Når du laver en pour-plade, hælder du den smeltede agar på inokulum og lader den stivne. Bakterierne i prøven vil vokse og danne kolonier på overfladen af agarpladen. Du kan derefter tælle antallet af kolonier for at bestemme antallet af bakterier i prøven.
Er en bakteriecelle en prokaryot eller en eukaryot?
En bakteriecelle er en prokaryot, de har IKKE en cellekerne
Ulemper ved mikroskopisk optælling af mikrobielle celler
Kan ikke skelne mellem levende og døde celler
Ikke stor præcision
Små celler kan overses
Snavs kan forveksles med en celle
Mobilitet kan skabe kaos under optælling
Eukarya
· Omfatter alle organismer med eukaryote celler, dvs.
celler med en kerne og andre membranbundne organeller.
· Omfatter planter, dyr, svampe og protister
· Mange varierende former og størrelser
Typer af mikroorganismer
Bakterier
Arkæer
Eukarya
Virus
Fejl der kan forekomme ved optælling
· Ukorrekt fortynding af prøven
· Ukorrekt forberedelse af prøven
· Kontaminering
· Ukorrekt inkubationstid eller temperatur
Turbidimetri
· Måles ofte vha. et spektrofotometer
· Kan anvendes til at estimere antallet af bakterier i en opløsning ved at måle ændringer i turbiditeten over tid
· OD optisk densitet er en måleenhed for turbiditet
· Bakterier kan give forhøjet turbiditet
· Turbiditet er en betegnelse for en væskes uklarhed, partikelindhold eller koncentrationen af uopløst stof
· Antallet af bakterier kan beregnes ud fra en standardkurve for turbiditet ved at sammenligne turbiditetsværdien af den ukendte prøve med standardkurven
Forklar opbygningen og funktionen af bakteriers cellevægge
Bakterier har cellevægge, der giver strukturel støtte og beskyttelse af cellen. Cellevæggen består af peptidoglycan, en sammensætning af sukker- og aminosyrekæder. Grampositive bakterier har en tyk peptidoglycan-lag og mangler den ydre lipidmembran. Gramnegative bakterier har en tynd peptidoglycan-lag og har både en indre og en ydre lipidmembran.
Bakterier har cellevægge, der giver struktur og beskyttelse af cellen mod mekanisk stress. Cellevæggen består af peptidoglycan, en sammensætning af sukker - og aminosyrekæder. Grampositive bakterier har en tykt lag peptidoglykan og mangler den ydre lidpidmembran. Gramnegative bakterier har en tyndt lag peptidoglycan og har både en indre og ydre lipidmembran. Har proteiner og LPS på yderste membran, hvilket giver dem en ru overflade.
Total cell count
Total cell count estimerer antallet af alle celler, både de døde og levende
Hvad består cytoplasma af?
Cytoplasmaet består af cellekomponenter, enzymer og forskellige organiske molekyler (I hvert fald den flydende del, der kaldes for cytosol)
Sessil vækst
Sessil vækst refererer til vækst af mikroorganismer, der er fastgjort til en overflade. Her vokser mikroorganismerne på en overflade og kan dermed danne biofilm
Hvad består cytoplasmaet af i prokaryote celler?
En vandig opløsning bestående af ioner, DNA, RNA, proteiner, enzymer og ribosomer
Planktonisk vækst
Planktonisk vækst refererer til vækst af mikroorganismer i vandmiljøer
Metaboliske processer
Kemisk omdannelse af næringsstoffer
Hvad betyder DNA-genomet for eukaryote og prokaryote celler?
Hvordan ser de ud?
Genom er “blueprint” for en levende organisme, deres karakteristika, aktiviteter og selve overlevelsen af en celle styres af dens genom.
Genomet for prokaryote celler og eukaryote celler er organiseret i strukturer kaldet kromosomer
I eukaryote celler er DNA til stede som flere lineære molekyler i den indesluttede membrankerne
I modsætning hertil er genomerne af bakterier og arkæer typisk lukkede cirkulære kromosomer
Lagfasen
Lagfasen er den første fase i bakterievækstcyklussen. I denne fase tilpasser bakterierne sig deres nye miljø og forbereder sig på at dele sig. Der er altså ingen vækst i antallet af bakterier i denne fase. Varigheden af denne fase varierer afhængigt af diverse faktorer, såsom bakterieart.
Hvad er biofilm og kom med et eksempel hertil?
Biofilm er en slimet masse af mikroorganismer, kolonier af mikroorganismer som sætter sig på noget materiale.
Biofilm dannes, når mikroorganismer klæber sig sammen på overflader og producerer en slimet substans, der består af polysakkarider, proteiner og DNA. Eksempler på biofilm kan være plak på tænderne.
Hvorfor laver man en 100x fortynding?
Man foretager ofte en 100x fortynding, når man tæller kolonier, fordi det normalt giver en passende mængde kolonier på agarplader til optælling og beregning
Hvad er cytoplasmamembranens funktion?
At adskille det indre miljø i cellen fra det ydre miljø, altså det intracellulære miljø fra det ekstacellulære miljø.
Hvordan inddeler man bakterier i grampositive og gramnegative?
Gramfarvning:
· Bakterien farves med et farvestof ”krystal-violet” og bliver efterfølgende affarvet vha. et andet stof
· Gramfarvningen inddeler herefter bakterierne efter, hvorvidt de er grampositive eller gramnegative afhængigt af, hvordan de lader sig farve.
· De grampositive bakterier har en tyk cellevæg, der absorberer farve og vil derfor fremtræde violette under mikroskop
· De gramnegative bakterier vil derimod farves røde eller lyserøde, fordi de har en tynd cellevæg og en membran, der står i vejen for optagelsen af farve oveni
KOH-test:
· Her kræves rendyrkede kolonier på et fast substrat
· Baggrunden for en KOH-test er at gramnegative bakteriers cellevæg ikke kan tåle en behandling med 3% KOH. Det vil ødelægge cellevæggen og medføre at cellens indhold af DNA – der er en meget slimet substans trænger ud af cellerne.
· Grampositive bakteriers cellevæg er derimod tilstrækkeligt modstandsdygtige til at modstå en KOH-behandling.
Hvad er der specielt ved blodagar
Blodagar:
Blodagar er en type agarmedie, der indeholder blodkomponenter som erytrocytter (røde blodlegemer).
Det bruges til at differentiere mikroorganismer baseret på deres evne til at forårsage hæmolyse (nedbrydning af røde blodlegemer).
Mikroorganismer kan producere tre typer hæmolysin: alfa-hæmolysin (delvis nedbrydning), beta-hæmolysin (komplet nedbrydning) og gamma-hæmolysin (ingen nedbrydning). Dette kan hjælpe med at identificere forskellige bakterier, f.eks. Streptococcus spp.
Hvordan er en bakteriecelle opbygget?
En bakteriecelle er en prokaryot celle, dvs. at den ingen cellekerne har
Den består af DNA i et område kaldet nukleoid-regionen
Den har ydermere:
En cellevæg
En eller 2 cellemembraner
Ribosomer over det hele i cytoplasmaet
Plius, som er proteinstykker, der stikker ud og kan overføre genetisk materiale
En eller flere flageller til bevægelse (behøver ikke have flageller)
De kan have plasmider, som er små stykker cirkulære DNA-molekyler, der bærer gener, som kan give værten fordele… såsom antibiotikaresistens
OBS. Arkæer har nærmest selvsamme design
Hvad er en cytoplasmamembran og hvad er cytoplasma?
Cytoplasmamembranen er en membran der omgiver cytoplasmaet i en celle
Hvilken aktivitet har alle mikrobielle celler?
Vækst:
Mikroorganismer kan vokse ved forskellige temperaturer og pH-værdier. De kan også vokse i forskellige miljøer såsom jord, vand og luft. Deres vækst afhænger også af næringsstoffer og andre faktorer.
Evolution:
Evolution er, hvor arterne ændrer sig over tid. Ved evolution tilpasser mikroorganismen sig altså forskellige miljøer, herunder kan et eksempel være antibiotika – resistens.
Metaboliske processer:
En metabolisk proces er de kemiske reaktioner, der foregår i cellen. Mikroorganismer kan have forskellige metaboliske processer, herunder fermentering.
Hvilke typer af vækstmedier findes der og hvad bruges de til?
Basalmedie
· Indeholder de grundlæggende næringsstoffer, der er nødvendige for at understøtte væksten af mikroorganismer såsom kulstof og nitrogenkilder
· Kulstof, nitrogen, svovl, fosfor og mineraler
Beriget medie
· Indeholder ekstra næringsstoffer, der ikke er tilstede i basalmediet
· Understøtter vækst af næringskrævende mikroorganismer
· Eksempler: Blodagar
Selektive medier
· Indeholder kemikalier, der hæmmer vækst af visse mikroorganismer og fremmer væksten af andre
· Bruges til at isolere specifikke mikroorganismer fra en prøve
Differentiale medier
· Indeholder kemikalier, der kan skelne mellem forskellige typer af mikroorganismer ud fra deres metaboliske egenskaber
· Bruges til identificering og adskillelse af mikroorganismer
Hvad er en eukaryot, hvordan ser den ud?
En eukaryot omfatter mennesket, dyr, protozoer, svampe, herunder gærsvampe
En eukaryot er meget mere kompleks end en prokaryot og også større
Den indeholder:
En cellekerne bestående af dets arvemateriale (DNA)
Cytoplasma
Ribosomer
Golgi-apparat
Membran
Memban om cellekernen
Mitokondria
RER
SER
Hvilke former for celledeling findes hos prokaryote organismer og hvordan foregår de?
Binær fission:
Binær fission er en form for aseksuel reproduktion, her deler cellen sig til 2 lige store datterceller. Altså er det en slags celledeling, som bakterier og andre prokaryote organismer kan udføre, når organismerne skal formere sig. Prokaryoten replicerer DNA´et i sit kromosom og sine plasmider inden celledelingen.
Knopskydning:
Knopdannelse er en proces, hvor en lille celle vokser ud af en større celle og bliver fastgjort til moderen. For eksempel kan gær (en type prokaryotisk celle) dele sig ved knopskydning. Knopdannelse begynder med dannelsen af en lille knop på moderens celle. Knoppen vokser gradvist og bliver til en selvstændig celle. Men noglegange forbliver knoppen fastgjort til moderen og danner en koloni.
Det er en form for aseksuel reproduktion. Det foregår således, at et nyt individ dannes fra en segment af et allerede eksisterende individ. Dette segment er en bule eller fremspring kaldet en ”knop”, der vises på forælderens knop og vokser gradvist.
Hvad er en prokaryot og, hvordan ser den ud?
En prokaryot omfatter eubakterier, hvilket er alle former for bakterier af medicinsk betydning og arkæer
Den har ikke en cellekerne, men DNA i et område kaldet for nukleoidregionen
Den består af cytoplasma fyldt med ribosomer
Den består af plasmider
Den består af en cellevæg, hvilket afhænger af, hvilken type bakterie, der er tale om eller, hvorvidt der haves at gøre med arkæer. Generelt set består den af komplekse polysakkarider
Den har ingen membranbundne organeller
De består endvidere af flageller, som de anvender til bevægelse
Cellevæg omkring plasmamembranen
Hvad menes med mikroorganismers vækstrate?
Med vækstrate menes, stigningen i celleantallet pr tidsenhed ved startbetingelsen. Ud fra vækstraten kan man beregne generationstiden eller fordoblingstiden, der betegner den tid, det tager mikroorganismerne at fordoble sig i antal
Hvad er et et septum?
Septum er en skillevæg mellem delende celler, klemmer af mellem 2 datterceller
Hvad menes med mikroorganismers ideelle forhold?
Med ideelle forhold menes, at de har den rette temperatur, pH – værdi samt næringsstoffer.
Hvad menes med generationstiden og hvad er formlen hertil?
Generationstiden er tiden det tager for en bakteriepopulation at fordoble sig i antal. Formlen for at beregne generationstiden afhænger selvfølgelig af antallet af generationer og den tid, det tager at opnå disse generationer. En almindelig formel er g=t/n, hvor g er generationstiden, t er tiden og n er antallet af generationer.
Hvad er et mætningspunkt?
Et mætningspunkt i vækstkurven referer til det tidspunkt, hvor væksthastigheden for en population af organismer stopper eller aftager betydeligt. Det er det punkt, hvor ressourcerne i miljøet bliver begrænsede for yderligere vækst.
Hvad menes der med ophobning af affaldsstoffer i den stationære fase og dødsfasen?
Når bakterier vokser og deler sig, producerer de affaldsstoffer såsom ammoniak og mælkesyre. Såfremt disse affaldsstoffer ikke fjernes fra miljøet omkring bakterierne kan de ophobes og hæmme bakterievæksten
Hvad er fordelen ved biofilm for mikroorganismer?
Biofilm er en super god overlevelsesmekanisme, som gør dem mere resistente overfor antibiotika, da de har lavet en form for kappe, der beskytter dem. De har gode vækstforhold og det gavner dem på mange forskellige måder.
Hvad hedder de 4 faser i bakterievækstcyklussen?
Lagfasen
Den eksponentielle fase
Den stationære fase
Dødsfasen
Hvad gør cellevæggen hos prokaryoter?
Cellevæggen beskytter bakterien mod omgivelserne ved at give cellen form og stivhed således, at cellen beskyttes mod mekanisk stress(eksempelvis tryk og træk på cellen)
Hvad er forskellen på grampositive bakterier og gramnegative bakterier?
Forskellen på grampositive bakterier og gramnegative bakterier er deres “cell envelope”
Grampositive bakterier:
1)Cytoplasmamembranen
2)Tykt lag peptidoglykan
Gram negative bakterier:
1)Cytoplasmamembranen
2)Tyndt lag peptidoglykan
3)Ydre membran
De består hertil af periplasma
Hvad er ribosomer og hvad gør de?
Ribosomer findes både hos eukaryote og prokaryote celler
De er vigtige for proteinsyntesen
Hvad er forskellen på væksthastighed og generationstid
Væksthastighed og generationstid er to forskellige målinger, der bruges til at beskrive væksten af mikroorganismer som f.eks. E. coli. Her er forskellen mellem de to begreber:
Væksthastighed: Væksthastighed henviser til den hastighed, hvormed antallet af celler i en mikrobiel population øges over tid. Den udtrykkes ofte som antal generationer pr. tidsenhed. Væksthastigheden kan måles ved at overvåge ændringen i celletætheden over tid, f.eks. ved hjælp af absorbansmålinger eller tælling af kolonier på LB-plader. Væksthastigheden kan variere afhængigt af vækstbetingelser, næringsstoftilgængelighed, temperatur og andre faktorer.
Generationsinterval: Generationsinterval (eller genereringstid) er den gennemsnitlige tid, det tager for en enkelt celle at gennemgå en komplet cellesyklus og dele sig i to datterceller. Det er den tid, der går fra starten af en cellepopulation til fordoblingen af antallet af celler. Generationsintervallet afhænger af arten af mikroorganismen og de omgivende vækstbetingelser. Det kan variere fra få minutter til flere timer afhængigt af arten og de specifikke betingelser.
I praksis bruges begge disse målinger til at karakterisere væksten af mikroorganismer. Væksthastigheden giver information om, hvor hurtigt populationen øges, mens generationsintervallet giver en idé om, hvor hurtigt individuelle celler gennemgår cellesyklussen og deler sig. Begge målinger er nyttige til at forstå og sammenligne væksten af mikroorganismer under forskellige betingelser eller i forskellige eksperimentelle indstillinger.
Hvad er peptidoglykan?
Peptidoglykan er en polymer, der består af sukkerstoffer og aminosyrer, der danner et ensartet lag om bakteriers plasmamembran. Dets funktion er at give bakteriernes cellevæg form og styrke, og stoffet modvirker også det osmotiske tryk.
Hvad er periplasma?
Periplasma er en geléagtig væske i det periplasmiske rum mellem den indre cytoplasmiske membran og den ydre membran i gramnegative bakterier
Hvordan ser arkæer ud?
Arkæer har en indre membran, pseudomurerin og et s-layer, der består af glykoprotein
Men alt i alt kan de se forskellige ud
Der findes arkæer som ikke har en cellevæg
