Mutaties

Question 1

Welke mutatie is bij patiënten met AML een voorspeller voor een slechtere prognose?

Answer 1

FLT3-receptor

Question 2

Welke soorten puntmutaties kunnen we krijgen?

Answer 2

Transities: purine –> purine of pyrimidine –> pyrimidine
Transversies: purine <–> pyrimidine
Kleine inserties/deleties

Question 3

Welke chromosomale afwijkingen kunnen we krijgen?

Answer 3

Translocaties
Amplificaties (dicentrische chromosomen, breuken, etc.)
Deleties
Numerieke afwijkingen

Question 4

Welke vormen van chemische instabiliteit kennen we die kunnen zorgen voor DNA schade?

Answer 4

Spontane hydrolyse leidend tot depurinatie
Deaminatie van basen leidend tot omzetting van cytosine in uracil

Question 5

Welke biologische stoffen kennen we die leiden tot DNA schade?

Answer 5

Oxidatieve DNA schade waardoor de complementariteit verandert
Benzoapyreen wat zorgt voor een dubbelhelix storing

Question 6

Welke fysische agens kennen we die DNA schade veroorzaakt?

Answer 6

UV straling wat zorgt voor intrastrengse DNA beschadigingen

Question 7

Wat voor DNA schade repareer je met BER?

Answer 7

Oxidatieve DNA schade, deaminatie van basen, ssDNA breuken

Question 8

Wat voor DNA schade wordt gerepareerd met NER?

Answer 8

Grotere adducten

Question 9

Wat doet het CSB1-eiwit?

Answer 9

Wanneer de DNA-polymerase geblokkeerd raakt, wordt deze door CSB1 achteruit geduwd, om te zorgen dat het beschadigde DNA vrijkomt en gerepareerd kan worden.

Question 10

Welke 2 herstelmechanismen hebben we voor het herstel van dubbelstrengse breuken?

Answer 10

Niet-homologe DNA eindverbinding
Homologe recombinatie

Question 11

Wat is een voordeel van de mutaties die ontstaan door NHEJ?

Answer 11

Ze vergroten de diversiteit van antilichamen

Question 12

Wat is de functie van het RAD51-eiwit?

Answer 12

Het zorgt ervoor dat het homologe DNA gevonden kan worden

Question 13

Wat is het risico van homologe recombinatie met het homologe chromosoom?

Answer 13

Verlies van heterozygositeit

Question 14

Wat is het gevaar van LOH?

Answer 14

Er is een groter risico op het kopiëren van de breuk, waardoor een homozygote mutatie kan ontstaat

Question 15

Wat is het risico van NHEJ?

Answer 15

Genomische instabiliteit

Question 16

Waarmee paart een imino C?

Answer 16

A

Question 17

Waarmee paart een enol T?

Answer 17

G

Question 18

Welk eiwit is nodig voor de reparatie van enkelstrengse breuken?

Answer 18

PARP1

Question 19

Welke mutatie blijkt bij elke patiënt met CML aanwezig?

Answer 19

t(9;22)

Question 20

Welk fusiegen ontstaat ten gevolge van de t(9;22)?

Answer 20

BCR-ABL

Question 21

Welke mutaties bij AML geven de meest gunstige prognose?

Answer 21

inv(16)
t(15;17)
t(8;21)

Question 22

Welke mutatie geeft bij AML de meest slechte prognose?

Answer 22

monosomie 7

Question 23

Welke mutaties zie je bij de standaardgroep van AML?

Answer 23

Geen cytogenetische afwijkingen

Question 24

Welke technieken kunnen gebruikt worden om chromosomen in kaart te brengen?

Answer 24

Aankleuring van chromosomen
FISH in situ hybridisatie
FISH chromosoomspecifiek
Spectrale karyotypering

Question 25

Wat is chromothripsis?

Answer 25

Het uit elkaar vallen en weer in elkaar zetten van een chromosoom

Question 26

Wat is het resultaat voor het chromosoom van chromothripsis?

Answer 26

Collectie van translocaties en deleties

Question 27

Waarom wil je cytogenetische afwijkingen bekijken?

Answer 27

Relevant voor diagnose Belangrijk voor voorspellen prognose Respons op chemotherapie Identificatie van betrokken genen

Question 28

Welke numerieke chromosomale afwijkingen kennen we?

Answer 28

Winst van een compleet chromosoom Verlies van een compleet chromosoom

Question 29

Welke gebalanceerde structurele chromosomale afwijkingen kennen we?

Answer 29

Translocaties Inversies binnen een chromosoom (paracentrisch en pericentrisch) Insertie

Question 30

Welke niet-gebalanceerde structurele chromosomale afwijkingen kennen we?

Answer 30

Deleties Amplicaties Niet-gebalanceerde translocaties Genmutaties (op niveau van baseparen)

Question 31

Welke type deleties komt veel voor bij AML?

Answer 31

Terminale deletie chromosoom 7 Interstitiële deletie chromosoom 5q-

Question 32

Welke cytogenetische afwijkingen geven de slechtste prognose bij AML?

Answer 32

Complex karyotype Monosomaal karyotype

Question 33

Wat zijn voordelen van FISH?

Answer 33

Aantonen microdeleties Detectie breekpunt Aantonen cryptische translocaties Aantonen complexe genoomveranderingen Snel stellen diagnose Demonstratie kleine hoeveelheden aberante cellen

Question 34

Wat zijn nadelen van FISH?

Answer 34

Gelimiteerde sensitiviteit Alleen antwoord op onderzochte vragen Niet veel targets tegelijkertijd bekijken

Question 35

Op welke cellen verricht je metafase FISH?

Answer 35

Lymfocyten Leukocyten Solide tumoren

Question 36

Op welke cellen verricht je interfase FISH?

Answer 36

Kernen van niet/slecht delende cellen voor snelle analyse

Question 37

Wanneer gebruik je een fusieprobe set voor FISH?

Answer 37

Translocaties

Question 38

Wanneer gebruik je break-apart probes?

Answer 38

Ongebalanceerde translocaties

Question 39

Welke mutatie zie je bij chronische neutrofiele leukemie (CNL) en wat is hiervan het directe gevolg?

Answer 39

T618I-mutatie, waardoor de GSF3R-receptor spontaan kan dimeriseren

Question 40

Wat is het effect van een JAK2-mutatie?

Answer 40

Een mutatie in het JH2-domein, waardoor het JH1-domein niet wordt geremd bij PV of ET.

Question 41

Wat is het gevolg van een MPL-mutatie?

Answer 41

De TPO-receptor (MPL) kan spontaan dimeriseren en daarmee activeren.

Question 42

Wat is de meest relevante mutatie voor PV?

Answer 42

JAK2

Question 43

Welke mutatie veroorzaakt Familiaire Adenomateuze Polyposis (FAP)?

Answer 43

Een kiembaanmutatie in het APC-gen

Question 44

In welke genen kunnen mutaties zijn optreden in het geval van het Lynch syndroom?

Answer 44

MMR-genen MLH1, MSH2, MSH6 of PMS2

Question 45

Welke mutatie is opgetreden bij een plaveiselcelcarcinoom van de long?

Answer 45

Inactiverende mutatie van p16INK4 En vaak p53

Question 46

Welke mutatie zie je bij rokers met een adenocarcinoom van de long?

Answer 46

K-RAS

Question 47

Welke mutatie zie je bij niet-rokers met een adenocarcinoom van de long?

Answer 47

EGFR

Question 48

Welke mutaties zie je bij neuroendocriene tumoren van de long?

Answer 48

Rb p16-overexpressie p53

Question 49

Welke mutatie is het belangrijkst voor het ontwikkelen van coloncarcinoom en kan zowel sporadisch als in kiembaan vorm voorkomen?

Answer 49

APC-mutatie