Non Coding RNA: 1 Flashcards
What are the types of ncRNA that we are aware of and what is their general role?
miRNA,
siRNA
lncRNA
Régulent l’expression des gènes au niveau
Act in an epigenetic way| no changes of the DNA: heterochromatine vs euchromatine
transcriptionnel, post-transcriptionnel et l’épissage du pré-ARNm
What is the role of siRNA?
RNA interférence (iRNAs) joue un rôle important dans la défense des cellules contre les séquences nucléotidiques parasites - virus et transposons
siRNA synthétiques introduits dans les cellules peuvent inhiber de manière sélective et robuste l’expression de gènes d’intérêt spécifiques
What is the role of microRNA?
régulation post-transcriptionnelle de l’expression génique
inhibent l’expression génique en ciblant des ARNm
True or False,
miRNA are not conserved across species.
FALSE
La plupart de ces miRNA sont conservés entre les espèces
et ont des fonctions importantes
On peut donc les étudier chez la souris
pour comprendre leur fonctions chez l’humain
How can a miRNA inhibit a gene?
molécules d’ARNm ciblés par les miRNA sont silenciées par un
ou plusieurs des processus suivants:
cut a mRNA in two pieces
Destabilazation of mRNA by destroying poly A tail
Réduction de l’efficacité de traduction de l’ARNm en protéines
What is brin guide and brin passager?
When miRNA is diced, one of the strands of the tige boucle will be used while the other will be degraded.
Both of these strands could be functional however it is up to
Argonaute (Ago), which choisi un seul brin seulement, le Brin Guide (miRNA)
Le Brin Guide avec Ago et d’Autres protéines formant RNA-Induced Silencing Complex RISC
What is RISC?
Argonaute (Ago), choisi un seul brin seulement, le Brin Guide (miRNA)
Le Brin Guide avec Ago et d’Autres protéines formant RNA-Induced Silencing Complex RISC
Difference between an extensive and less extensive match of miRNA (RISC) complex?
SLICING: si l’appariement entre miRNA et le mRNA est parfait (extensive) , le mRNA cible est clivé puis dégradé -> irreversible
P-bodies: Si l’appariement de bases est partiel la traduction est inhibée, le mRNA déstabilisé -> reversible
Why is it difficult to study LcRNA?
Very weak conservation across species and there is a lot a lot a lot of them
True or False
Contrary to mRNAs LncRNA will not have a 5’ Cap or a Poly A tail as they do not need to be matured.
FALSE
Les lncRNAs sont transcrits et matures comme les
mRNA codants pour des protéinés
mais pas traduits
What are the roles of LncRNA?
A. dirigent des modificateurs de la chromatine
vers des gènes cibles spécifiques
déplacent des régulateurs de l’expression
(activateurs ou répresseurs) des séquences
régulatrices de l’expression
D. modulent des évènements d’épissage et
interfèrent avec la traduction
**Positive: **
entrent en compétition avec des miRNA et
protègent des ARN messagers de la dégradation
par ces miRNA (fonction éponge
promeuvent l’association des facteurs à des
séquences amplificatrices et promotrices pour initier
la transcription
True or False,
LncRNA can only inhibit or reduce gene transduction not increase.
FALSE,
One of their roles is:
entrent en compétition avec des miRNA et protègent des ARN messagers de la dégradation par ces miRNA (fonction éponge).
Also;
promeuvent l’association des facteurs à des
séquences amplificatrices et promotrices pour initier
la transcription
miRNA length?
22 nucleotides
lncRNA intergéniques vs antisense
lncRNA localisés dans une région entre gènes
