Partie B Flashcards
la polymérase forme le brin d’ARNm a partir de quel brin de l’ADN et bouge de quelle extrémité à l’autre
à partir du brin matrice (3’-5’) et non du brin codant (5’-3’)
la pol bouge du 5’ à 3’
formation de la liaison phosphodiester lors de la transcription (addition nucléotide)
attaque du 3’OH du nucléotide déjà attaché sur la chaine 5’ triphosphate du nouveau nucléotide et relache ainsi deux phosphate (pyrophosphate)
amont vs aval
amont: avant
aval: apres
au début de la transcription, des chaines de …. nucléotides sont … avant d’arriver a faire une transcription productive
2-9 bases sont synthétisées et relachées
Sous unités de l’ARN polymérase bactérienne (nombre, location et fonction)
template = ADN transcrit
les ARN polymérase eucaryote synthétisent différents type d’ArN, lesquels
ARNPol1: gros précurseurs d’ARN (28S,18S,5.8S)
ARNPol2: surtout les arnm (ArNm, ARNsn, ARNmi)
ARNpol3: surtout ARNt et petits arn
(ARNt, U6snARN,7SL ARN, 7SK ARN)
quelle ARN polymérase eucaryote a plus de sous-unités
ARN pol 2
dans la liaison de l’arn polymérase bactérienne, quelle sous unité reconnait le site spécifique de liaison et permet l’ouverture de la bulle de transcription
s-u sigma
ARN pol bactérienne associé à l’ADN, qu’est ce qui est associé ou
les s-u alpha en amont du site d’amorcage
les s-u beta et beta’ fixées au site d’amorcage
sigma 70 aux séquences particulières voisine des position -10 et -35 du promoteur (attention il existe différente sigma qui se lie a différents sites proche de ces deux positions pour transcrire différents gènes)
gene des différentes sigma chez e.coli avec leur utilité
en général de quoi ressemble -35 et -10 chez les bactéries
-35: TTGACA
-10:TATAAT
Explique la technique de l’empreinte à l’ADNase1 et le but
but: déterminer les endroits ou une protéine se lie à l’ADN
on ajoute du 32P au bout de nos ADN
on met un tube avec ADNase1 et la prot et l’autre tube sans la prot avec ADN ase1
L’aDNase1 hydrolyse la liason phosphdiester ce qui fait une cassure dans l’aDN mais ne peut pas cliver si une protéine est déjà sur le site.
ensuite ave gel electrophorese on compare pour voir les fragments protégés de la digestion qui sont ceux ou on avait une protéine (empreinte de la prot sur l’ADN)
Technique de l’empreinte au diméthyl sulfate (DMS)
But: permet de définir le site de liaison d’une protéine sur l’ADN et de réveler la capacité d’une protéine à induire un désapparient de base de l’ADN (ouvrir la boucle)
ajout dune protéine qui va s’attacher a l’adn et ouvrir une boucle à cet endroit.
ajout de DMS qui méthyle plusieurs sites sur l’AdN (mais un par molécule)
Ajout de piperidine pour briser l’ADN aux sites méthylés (par contre incapable de cliver si la prot est a cet endroit)
electrophorese pour voir le footprint de la prot
si la bande est plus foncée, ca veut dire que plus de méthylation a cet endroit parceque cetait la la bulle de transcription mais on a pas pu briser avec piperidine parceque la prot était la
principales composantes du complexe PolII-ADN-ARN
quel élément mobile permet la translocation de la Pol2 et ainsi l’ajout de NTPs
la pont (bridge)
