Parvovirus

Question 1

Quelle est la géométrie d’un Parvovirus ?

Answer 1

C’est un virus à géométrie icosaédrique.

Question 2

Quel est le type de génome des parvovirus ?

Answer 2

ADN sb, linéaire.

Question 3

Quelle est la particularité des Dépendovirus, une des sous-familles des parvovirus ?

Answer 3

Ce sont des virus satellites, nécessitant la présence d’un virus Helper dans le cas des Adeno-Associated Viruses.

Question 4

En quoi sont utilisés les AAV ?

Answer 4

Vu qu’ils sont dépendants d’autres virus et donc non pathogènes seuls, ils sont utilisés pour la thérapie génique car ils sont dotés d’excellents vecteurs d’expression.

Question 5

Exemple, le B19 : qu’infecte-il, comment se transmet-il ?

Answer 5

Il infecte les précurseurs des globules rouges des humains. Se transmet par voie aérienne.

Question 6

Quelle est la conséquence de l’infection de B19 vis à vis des globules rouges ?

Answer 6

Il dérange la chaine de production des globules rouges dans la moëlle épinière, ou “érythropoiese”.

Question 7

Bien décrire la capside des Parvoviridae.

Answer 7

C’est une nucléocapside non enveoppée.
La symétrie est icosaédrique.
Il y a T = 60 SU.

Pour B19 : 50 SU VP1, 10 VP2.
Pour AAV. 50 SU VP3, 5 VP2, 5 VP1.

Question 8

De quoi sont composées les SU VP1, plus précisément, et leur utilité ?

Answer 8

Elles sont composées de VP2 avec une chaine supplémentaire de 257 AA à activité phospholipase.
Elles sont indispensables à l’infection.

Question 9

Que peut-on voir à la surface de la capside, et quelle est la fonction de cette structure ?

Answer 9

Il s’agit de pores de 10 Angstrom situés aux 12 sommets de la capside.
Ce sont en fait les sites d’encapsidation de l’ADN sb génomique.

Question 10

Qu’est-ce qu’une activié Phospholipase ?

Answer 10

Modification des lipides de la membrane endosomiale, causant un relarguage.

Question 11

Quelles sont les conditions à la fixation de B19 sur la cellule et son entrée dans l’hôte ?

Answer 11

B19 doit :

Fixer son domaine VP2 sur le récepteur cible, GB4CER et son corécepteur (Ku80).
Faire des réarrangements conformationnels pour exposer le domaine VP1u et le fixer au co-récepteur 2 : intégrine a5b1.

Question 12

Une fois le virus correctement fixé, comment entre-il et rejoint le noyau ?

Answer 12

Il entre par endocytose clatherine dépendante, puis est transporté par les MT vers le noyau, ou il rentre en utilisant la nucléocapside.

Question 13

Comment s’organise le génome des Parvovirus ? (Longueur génome, structures secondaires éventuelle, présence de protéines)

Answer 13

Le génome d’ADN sb linéaire fait de 4 à 6 kb.
Courtes séquences complémentaires aux extrémités.
Parfois des ITR (Inverted Terminal Repeat)
Présence de VP et NS.

Question 14

Qu’est-ce que VP et cap ? NS et rep ?

Answer 14

VP est une protéine des parvovirus autonomes strcturale. Cap est la même chose pour les dépendovirus.

NS est une protéine non structurale à activité hélicase endonucéase et ATP ase. Rep est son équivalent des dépendovirus.

Question 15

Ou se fixe NS et Rep ?

Answer 15

Ils sont fixés de manière covalente en 5’ de l’ADN viral.

Question 16

Qu’est-ce qui sert de promoteur pour ces virus ?

Answer 16

Les ITR, en 3’.

Question 17

Quand la transcription démarre, que se passe-t-il au niveau de l’extrémité 5’ ?

Answer 17

Celle-ci étant aussi recopiée et en forme ITR; elle doit être ouverte.

Question 18

Après le passage de la polymérase qui recopie le tout, que se passe-t-il au niveau du brin parental ?

Answer 18

Le brin parental est alors coupé par les protéines NS ou rep.

Question 19

La coupure du brin parental engendre quoi ?

Answer 19

Cette coupure génère une nouvelle extrémité 3’ OH, soit une deuxième amorce ! Puis, fin de la synthèse de l’ADN db. L’ITR en 3’ est ouvert.

Question 20

Une fois l’ADNdb synthétiser, quels sont les deux processus qui vont suivre ?

Answer 20

Transcription et Traduction !

Question 21

Décrire les transcrits viraux, le nombre de promoteurs et le type d’épissage pour les virus Dependovirus.

Answer 21

3 promoteurs
épissage différentiel
leaky scanning

Question 22

Décrire les transcrits viraux, le nombre de promoteurs et le type d’épissage pour les virus B19.

Answer 22

1 Promoteur

épissage différentiel.

Question 23

Décrire les transcrits viraux, le nombre de promoteurs et le type d’épissage pour les virus parvovirus.

Answer 23

2 promoteurs

épissage différentiel.

Question 24

Résumer le parcours du génome des Parvoviridae.

Answer 24

ADN sb -> répliqué en ADN db -> transcrit en ARNm -> exporté du noyau -> traduit en protéines -> modifiées, adressées en protéines de structure et enzymes.

Question 25

D’ou provient la polymérase des parvovirus ?

Answer 25

Leur génome est bien trop petit pour consacrer de la place pour encoder une polymérase : c’est donc celle de l’hôte qui est recrutée.

Question 26

Qu’est-ce que le “rolling hairpin replication” ?

Answer 26

En gros, l’ITR en 3’ est utilisé comme promoteur. Une fois l’ADN synthétisé sur toute la longueur, il faut encore répliquer l’ITR : il y a donc coupure par rep sur le brin template, et l’ITR est déroulé pour être copié par la polymérase. Une fois cette synthèse terminés, les ITR sont reformés pour chaque brin et ces derniers sont séparés et on peut recommencer le cycle.

Question 27

Vis-à-vis de l’hôte de quoi ces parvoviridae sont ils dépendants ?

Answer 27

Du cycle cellulaire de l’hôte ! Il doit absolument se trouver en phase S car ces virus sont incapables de l’induire.

Question 28

En quoi la présence d’un helper aide les parvo ?

Answer 28

Un helper stimule le trafic intracell des virions, leur expression génétique et la libération des virions néoformés.

Question 29

Que se passe-t-il si il n’y a pas de virus présents ?

Answer 29

Infection latente, avec possible intégration spécifique dans le génome.

Question 30

A partir de quelle extrémité de l’ADN se fait l’encapsidation ? La décapsidation ? Quels éléments se retrouvent en dehors de la capside ?

Answer 30

Encapsidation ET décapsidation se font par l’extrémité 3’. La 5’ et NS/rep se retrouvent dehors.