Physiologie bactérienne, taxinomie, virus et mycètes

Question 1

Comment classifier les bactéries?

Answer 1

Grâce à la taxinomie.
Niveau de précision décroissant (+ au - précis) :
Espèce
Genre
Famille
Ordre
Classe
Embranchement
Règne
Domaine
Monde vivant

Question 2

Comment classer et identifier les bactéries?

Answer 2

Via des caractéristiques morphologiques
-Forme et taille de la cellule
-Présence de cils et flagelles
-Inclusions cellulaires (spores)

Via des caractéristiques physiologiques et métaboliques
-Sources d’É
-Constituants de la paroi cellulaire
-Relations avec l’O2
-Métabolites secondaires

Question 3

Qu’est-ce que le métabolisme bactérien?

Answer 3

L’ensemble des transformations chimiques qui assurent la survie de la bactérie (synthèse et fonctionnement des constituants de la bactérie).
Catabolisme : dégradation
Anabolisme : synthèse

Question 4

Nommer les différentes classes de bactéries.

Answer 4

Source d’É :
É lumineuse
-Phototrophes
É chimique
-Chimio-lithotrophes (molécules minérales)
-Chimio-organotrophes (molécules organiques)

Source de carbone :
Inorganique (CO2, HCO3-)
-Autotrophes
Organique
-Hétérotrophes

Température :
-Psychrophile : 0-20C
-Mésophile : 20-45C
-Thermophile : + que 45C

pH :
-Neutrophile : 6.5-7.5
-Acidophile : 1-5
-Alcalophile : 8-12

Oxygène :
-Aérobie stricte
-Microaérophile
-Anaérobie facultative
-Anaérobie stricte

Question 5

Décrire la courbe de croissance bactérienne.

Answer 5

1. Phase de latence
   (n constant, adaptation)
2. Phase exponentielle
   Temps de génération (G) : temps pour que n double
   Taux de croissance : vitesse de multiplication, nombre de division par unité de temps
3. Phase stationnaire
   Plateau, n constant
4. Phase de déclin
   + de bactéries qui meurent que celle créées, épuisement substance nutritives et accumulation produits toxiques

Question 6

Quels sont les différents milieux de culture?

Answer 6

-Liquide (bouillon) : permet croissance abondante et homogène, ne permet pas l’isolement de microorganismes, mesure de la turbidité
-Solide (gélose) : formation de colonies (lisse, muqueux ou rugueux), permet énumération, différenciation et isolement des bactéries
-Semi-solide (gélose molle)

Question 7

Quelles sont les techniques d’identification des bactéries?

Answer 7

-Morphologie cellulaire
-Coloration de Gram
-Réponse à l’O2
-Tests biochimiques (test de la catalase, enzyme qui décompose H2O2 produit par bactérie aérobie)
-PCR (pour cibler un gène)
-Séquençage du gène de l’ARN 16S (précis jusqu’au genre)
-Séquençage de type Shotgun (génome entier, détermination de l’espèce)

Question 8

Quel est le meilleur moyen de conserver des bactéries?

Answer 8

La lyophilisation (déshydratation sous vide), permet la conservation pendant plusieurs années.

Question 9

Qu’est-ce qui caractérise les virus?

Answer 9

-Plus petits agents infectieux
-Cellules hôtes requises pour la multiplication
-Impossible de se reproduire dans des milieux artificiels
-Matériel génétique sous forme d’ADN ou ARN (circulaire ou linéaire)

Question 10

Qu’est-ce qu’un bactériophage? Quelle est sa structure?

Answer 10

Virus infectant spécifiquement les bactéries. Tête de glycoprotéine qui contient le matériel génétique. Queue de protéine qui sert de fixation à la bactérie pour injecter le matériel génétique. *Pas de pénétration dans la bactérie, seulement injection.

Question 11

Comment différencier les virus?

Answer 11

-Hôte (animal, végétal, bactérien)
-Matériel génétique (ARN/ADN, simple ou double brin)
-Type de capside
-Présence ou non d’une enveloppe

Question 12

Quel est le mécanisme d’infection du bactériophage?

Answer 12

1. Rencontre de l’hôte par reconnaissance spécifique
2. Fixation
3. Contraction de la queue
4. Pénétration du matériel génétique

Question 13

Décrire le cycle de vie du bactériophage.

Answer 13

1. Injection du matériel génétique dans la cellule hôte
2. Transcription et traduction du matériel génétique en protéines
3. ADN de l’hôte dégradé
4. Assemblage des bactériophages
5. Lyse de la bactérie et libération des bactériophages dans l’environnement

Question 14

Quels sont les différents types de mycètes et leurs principales caractéristiques?

Answer 14

Levures
-Forme ovale ou sphérique
-+ gros qu’une bactérie
-Anaérobie facultatif

Moisissures
-Spores
-Peut être assez gros (jusqu’à quelques mm)
-Aérobie strict

Peuvent se reproduire de façon sexuée ou asexuée. Ils sont hétérotrophes (besoin de nourriture organique)

Question 15

Quels sont les mycètes pathogènes?

Answer 15

Mycoses superficielles
-Candida albicans (muguet ou vaginite)

Mycoses en profondeur
-Aspergillus fumigatus (aspergillose, aux poumons)