prep exam final Flashcards
(27 cards)
Quels sont les avantages d’utiliser des animaux d’expérimentation et plus précisément, les souris
-Développer nos connaissances sur le développement de la vie
-Comprendre les maladies
-Développer et tester (médicaments et vaccins avant la vente)
-Développer de nouvelles chirurgies
-Enseignement
-Protection de l’environnement
SOURIS:
-85% de leur génome est homologue à l’humain
-Petites, facile à manipuler et alimenter
-Maturité sexuelle très rapide, gestation courte et portées nombreuses
-Embryon robustes
-Peu couteuses
Pourquoi doit-on contrôler la génétique des animaux d’expérimentation?
Pour diminuer l’impact des variations génétiques sur les résultats experimentaux et pour assurer des expériences reproductibles, ce qui réduit le nombre d’animaux à utiliser.
Pourquoi préfère-t-on un coefficient d’endogamie élevé chez les animaux d’expérimentation?
pour assurer des expériences reproductibles, ce qui réduit le nombre d’animaux à utiliser.
Quels sont les avantages et désavantages des animaux non consanguins? Dans quel contexte on pourrait préférer l’utiliser et ou il serait mieux adapté?
-Reproduction au hasard (respecte la loi de hardy-weinberg) (25 couples minimum)
-Génotype variable et hétérozygotie maximale
AVANTAGES:
-Simple et peu couteux
-Animaux vigoureux
-Reproduction facile et prolifique
DÉSAVANTAGES:
-Beaucoup de variabilité entre les individus
-Génotypes inconnus
UTILISATION: Recherches sur la reproduction ou l’embryologie
Quels sont les animaux mutants et transgéniques? Dans quel contexte on pourrait préférer l’utiliser et ou il serait mieux adapté?
MUTANTS: Apparition d’une mutation spontanée
TRANSGÉNIQUES: modification de l’ADN par des manipulations génétiques
UTILISATION: Recherches sur le gène muté (alzheimer, obésité, etc)
Quels sont les avantages et désavantages des animaux consanguins (consanguines recombinantes, coisogéniques, congéniques)? Dans quel contexte on pourrait préférer l’utiliser et ou il serait mieux adapté?
Accouplement frère-soeur/parent-enfant pendant 20 générations (homozygotie d’au moins 98.4%)
AVANTAGES:
-Même bagage génétique entre les individus
-Diminue la variabilité des résultats
-Diminue le nombre d’animaux à utiliser
-Histocompatibilité (favorable aux greffes)
DÉSAVANTAGES:
-Dépression de l’endogamie
- baisse de fertilité et de longévité, augmentation de sensibilité au stress
-Demande plus de soins (cages plus stériles, environnement propre)
UTILISATION: Tests de médicaments/drogues
Quels sont les avantages et désavantages des animaux hybrides de première génération? Dans quel contexte on pourrait préférer l’utiliser et ou il serait mieux adapté?
On accouple deux lignées consanguines différentes différentes et on utilise les individus de la F1
AVANTAGES:
-Tous les individus de la F1 sont génétiquement semblables
-Maximise l’hétérozygotie: la vigueur des individus est augmentée
DÉSAVANTAGES:
-Ces hybrides doivent constament être regénéré par croisement des lignées consanguines.
UTILISATION: utiles lorsqu’on veut cartographier les gènes, c’est à dire savoir à quel point les gènes sont proches l’un de l’autre sur un chromosome
Qu’est-ce qu’une souris KI et KO et quelles sont les étapes pour produire ces souris?
Ce sont des animaux transgéniques.
KI (knockin): Introduction ou remplacement du gène par un autre
KO (knockout): enlever/inactiver un gène en introduisant une mutation pour que la protéine ne puisse plus être produite.
MÉTHODE DE PRODUCTION:
-Méthode CRISPR/Cas9
-Méthode ARN interférence
-Méthode des cellules souches embryonaires
Comment est-ce que la contamination, dérive génétique, et la mutation peut modifier le bagage génétique?
CONTAMINATION: Intriduction de matériel étranger dans une lignée d’origine accidentelle (ex: erreur de cage, souris échappée, etc)
DÉRIVE GÉNÉTIQUE: Fréquence allélique varie en raison de phénomènes aléatoires (ex: on écrase par hasard que des bibittes verte et non les brunes)
-La production de lignée consanguine est sujette à la dérive génétique (un seul couple de départ)
-Dans les lignées non consanguines, l’effet fondateur peut mener à la fixation d’allèles (tous les individus seraient homozygotes à ce locus)
MUTATION: Apparition spontanée d’un changement dans l’ADN d’un individu (ne modifiera pas systématiquement le pool génétique d’une population. Si elle est présente peut activer, inactiver ou avoir aucun effet sur la protéine
Quelle est la différence entre le clonage d’ADN et le clonage reproductif? Quelles sont les méthodes de chacune? (2 et 3)
CLONAGE D’ADN: Produire plusieurs copies d’un gène ou d’une séquence d’ADN afin d’étudier le segment d’ADN, de modifier l’ADN ou de produire la protéine.
2 méthodes:
-Clonage avec des bactéries
-Le PCR: amplification en chaine par polymérase
CLONAGE REPRODUCTIF: Reproduire un organisme complet
3 méthodes:
-Par scission d’embryon
-Par transfert nucléare (noyau de cellule souche embryonnaire ou cellule somatique)
Qu’est ce que le séquençage et son utilité?
Technique qui permet d’établir la squence complète de nucléotide dans une molécule d’ADN
(Par nanopore: L’ADN déroulé passe par un nanopore qui détercte des variations de charcges électriques correspondant aux différents nucléotides)
Quel est le fonctionnement et les différentes étapes à suivre pour le clonage d’ADN en utilisant des bactéries ou le PCR
BACTÉRIE:
1. On insère un gène d’intérêt dans le plasmide d’une bactérie (à l’aide d’enzymes de restriction)
2. La bactérie contenant l’ADN recombiné va se multiplier (réplique le plasmide recombiné)
3. On peut extraire l’ADN recherché et/ou la protéine produite par l’ADN recherché
PCR:
1. Dans ce type de cycle, on obtient un très grand nombre de copies ne notre séquence d’intérêt à partir de très peu d’ADN. Lorsqu’on sépare les brins, une nouvelle amorce se colle à ces brins
2. Après le PCR, on peut utiliser l’ADN pour faire d’autres manipulations génétiques ou Vérifier si notre échantillon testé contenait la séquence d’intérêt (ex: labo avec électrophorèse sur gel)
Qu’est ce qu’un plasmide?
Petite molécule circulaire d’ADN capable de se répliquer de façon autonome (qui possède quelques gènes non essentiels à la survie en situation normale, mais avantageuse dans un ,ilieu particulier)
Comment fonctionne une enzyme de restriction?
Chaque enzyme peut couper l’ADN à un endroit spécifique nommé le site de restriction. Elle coupe le plasimde et l’ADN qu’on veut introduire.
Qu’est ce que le génie génétique?
la capacité de modifier le génome d’un animal, en inactivant, remplaçant un gène ou en faisant une insertion d’un nouveau gène, comme un gène conférant une résistance à la sécheresse chez une fraise par exemple.
Comment fonctionne le CRISPR-Cas9?
Ce système comprend 2 composantes qui permettront de modifier l’ADN
Cas9: une enzyme qui coupe l’ADN avec précision
ARNguide: une séquence d’ARN qui est complémentaire à l’ADN cherché et qui guide Cas9
Il faut connaitre la séquence d’ADN recherché afin de créer l’ARNguide correspondant
Lorsque Cas9 coupe l’ADN, la cellule active des cascades enzymatiques qui répareront l’ADN. Soit elles l’inactivent, éliminent, corrigent ou introduisent un gène dans un organisme
Pourquoi modifie-t-on préférablement les cellules souches/embryonnaires?
Qu’est ce que le principe de pluripotence?
Pluripotence: cellule souche peut donner plusieurs types de cellules
Quelles sont les différentes techniques de clonage reproductif?
PAR SCISSION D’EMBRYON:
Utile pour des études sur les jumeaux ou pour augmenter la descendance d’un couple champion
PAR TRANSFERT DE NOYAU D’UNE CELLULE SOUCHE EMBRYONNAIRE:
1. On prélève le noyau d’une cellule d’embryon d’animal aux performances intéressantes et on la combine à une ovule énuclée.
2. On la fait grandir in vitro et on la transfert dans une mère porteuse.
-Permet d’engendrer plus de clones que par scission embryonnaire
-Les cellules souches embryonnaires sont pluripotentes, elles sont plus facile à cloner
PAR TRANSFERT DE NOYAU D’UNE CELLULE SOMATIQUE:
1. On prélève le noyau d’une cellule somatique (épithéliale) et on la combine à une ovule énuclée.
2. On la fait grandir in vitro et on la transfert dans une mère porteuse.
-Les cellules somatiques sont plus difficiles à cloner, car elles doivent être reprogrammées pour être pluripotentes
Qu’est-ce qu’une lignée consanguines recombinantes? Quelle est son utilité?
CONSAGUINES RECOMBINANTES:
-Accouplement entre deux lignées consanguines différentes (F1 est accouplé au hasard, F2 accouplé frère-soeur pour 20 génération (donne une lignée consanguine))
-On obtient plusieurs nouvelles lignée consanguines recombinantes (enjambement de 2 lignées différentes)
-Utilisée pour l’étude de cartographie des gènes (gènes liés ou non)
Qu’est-ce qu’une lignée coisogénique? Quel est son avantage et son désavantage?
COISOGÉNIQUE:
2 lignées consanguines identiques génétiquement sauf pour un locus mutant (on attend qu’il apparaisse)
Avantage: Comparer les deux lignées nous donne l’effet du gène muté et comprendre les désordre chez les humains
Désavantage: Il faut attendre la mutation!
Qu’est-ce qu’une lignée congénique? Comment transfert-on un allèle dominant et récéssif?
CONGÉNIQUE: Comme la lignée coisogénique, (tout uniforme et on veut un allèle mutant) mais on introduit nous même le gène mutant
TRANSFERT D’ALLÈLE DOMINANT:
-croisement exogame
-Rétrocroisement (Avec des individus lignée receveuse, 12 générations, élimine les récéssifs)
-Croisement endogame (entre frère et soeurs, 8 générations, élimine les allèles récéssifs)
TRANSFERT D’ALLÈLE RÉCÉSSIF:
-Croisement exogame (2 lignées différentes, hétérozygotes)
-Croisement endogame (entre frère et soeur, élimine les dominants)
-Rétrocroisement (exogamie, avec individus lignée receveuse)
-Croisement endoganme (final, 8 générations, entre frères et soeurs, élimine les dominants)
Quelles sont les méthodes de vérification du matériel génétique et à quoi servent elles?
Elles servent à vérifier s’il y a de la contamination dans notre lignée, ou à savoir si l’intégration d’un gène a fonctionné par exemple. -combinaison de PCR et électrophorèse
-on peut vérifier la présence de protéines dans le sang/ dans les cellules.
-analyses biochimiques
analyse de l’ADN
Pourquoi recherche-t-on le promoteur CaMV p35S?
Ce promoteur est utilisé principalement lorsque l’on veut modifier génétiquement un
organisme végétal. On ne connait pas la séquence du gène qui a été inséré, mais on connait
la séquence du promoteur en amont du gène inséré !
À la fin du protocole d’extraction de l’ADN, que s’attend-on à trouver dans le précipité ?
On retrouve de l’ADN non purifié, c’est-à-dire encore lié à des protéines (histones).
