PROTEİN 3D YAPI

Question 1

Protein yapısında bulunan atomların uzaysal düzenlenmesi

Answer 1

konformasyon

Question 2

Doğal konformasyonu kararlı hale getiren bağlar

Answer 2

disülfit (kovalent)
bağları ve kovalent olmayan zayıf etkileşimlerdir (hidrojen
bağları, hidrofobik ve iyonik etkileşimler)

Question 3

protein kararlılığında en
baskın zayıf etkileşimdir

Answer 3

hidrofobik etkileşimler

Question 4

Peptit bağındaki C-N bağı kısmi

Answer 4

çift bağ niteliğinde . serbest dönmez

Question 5

Dönüş Ca-C ve N-Ca bağları etrafındadır

Question 6

a sarmalın dönüşü

Answer 6

sağ el

Question 7

Sarmalın bir dönüşü

Answer 7

3.6 aa

Question 8

Amino asitlerin hangi
grupları sarmalın dışına
uzanır.

Answer 8

R

Question 9

Aynı protein ailesinde yer alan poteinlerin globin ailesi

Answer 9

Birincil ve üçüncül yapıları önemli oranda benzer, işlev benzer

Question 10

Protein ailesindeki proteinler

Answer 10

evrimsel olarak ilişkilidir

Question 11

Amino asit dizisinde küçük benzerlik olan iki ya da
daha fazla aile aynı temel örgüyü kullanıyor ve
işlevsel benzerlik söz konusu ise bu aileler

Answer 11

üst aile / üst protein ailesi

Question 12

multimer

Answer 12

Çoklu alt birimlere sahip proteinler

Question 13

protomer

Answer 13

multimer ama hep aynı birim tekrarlanıyor

Question 14

oligomer

Answer 14

sadece birkaç altbirimli protein

Question 15

Üç-boyutlu yapısı belirlenmiş ille oligomerik protein, dört polipeptit
zinciri ve dört hem prostetik grubu içeren, demir atomlarının ferröz
(F e+2) durumda bulunduğu

Answer 15

Hemoglobin

Question 16

dönüşlü simetri ya da sarmal
simetri ye sahiptir

Answer 16

oligomerler

Question 17

Virüs kılıfı ve kapsitlerde
yaygın olarak bulunan
yapıdır.

Answer 17

İkozahedral simetri

Question 18

2130 özdeş alt birimden oluşan sağ el dönüşlü
sarmal bir iplikçiktir

Answer 18

TMV

Question 19

sarmal simetri nerede yer alabilir

Answer 19

oligomerlerden bazıları sarmal simetrili
viral kapsitler sarmal simetri
TMV

Question 20

denatürasyon

Answer 20

protein üç boyutlu yapısının kaybı ile proteinin aktivitesini yitirmesi

Question 21

denatürasyonda birincil yapı nasıl etkilenir

Answer 21

birincil yapı hiçbir kovalent bağ denatürasyon sırasında yıkılmadığından bozulmaz aynı kalır

Answer 22

sıcaklık
ph
organik çözücüler:aseton
deterjanlar
üre veya guanidin hidroklorür

Question 23

sıcaklık proteinlerin bozulmasında hangi bağları yıkarak etki eder

Answer 23

hidrojen

Question 24

Ökaryotik Hsp70 ve Hsp40
proteinlerinin benzeri E. coli’de

Answer 24

Dna J ve Dna K proteinleridir

Question 25

şaperoninler

Answer 25

kendilğiğnde katlanmayan bazı hücresel proteinlerin katlanması için gerekli olan karmaşık protein komplexleri

Question 26

GroEl ve GroEs

Answer 26

ŞAPERONİN ÖRN E.COLİ DE BULUNUR

Question 27

Bazı proteinlerin katlanma yolakları izomerleşme tepkimelerini katalizleyen 2 enzime ihtiyaç duyar.Bu enzimler

Answer 27

1.Protein Dİsülfid İzomeraz PDİ 2.Peptid prolil cis trans izomeraz PPİ

Question 28

Bu hastalıklara amiloidozlar adı verilir

Answer 28

Tip 2 diyabet * Alzheimer * Hungtington * Parkinson

Question 29

Protein katlanması sonucu oluşan amiloidoz hastalıklar nasıl oluşur?

Answer 29

1.Çözünür yapıdaki bir protein yanlış katlanma sonucu çözünmeyen bir proteine dönüşür. 2.Hücre dışında amiloid lifleri birikir 3.Lifler 7-10 nm çapta ve yüksek oranda b tabaka yapısı

Question 30

Proteinin ligandına tersinir olarak bağlanmas

Answer 30

oksijen bağlayan proteinler

Question 31

Protein tarafından tersinir olarak bağlanan moleküle

Answer 31

LİGAND denir

Question 32

ligandın bağlandığı bölge

Answer 32

bağlanma bölgesi

Question 33

Enzimler diğer molekülleri bağlar ve kimyasal olarak değiştirir. Enzimlerin etkilediği moleküller ligand değil substrat olarak adlandırılır. Ligand bağlayan bölgesi de katalitik bölge veya aktif bölge olarak adlandırılır

Question 34

Hem =

Answer 34

protoporfirin + ferröz demir

Question 35

protoporfirin

Answer 35

Protoforfirin dediğimiz yapı ferröz durumda (Fe+2) tek bir demir atomunun bağlandığı durumdur

Question 36

Miyoglobinin oksijene afinitesi hemoglobinden daha

Answer 36

yüksektir

Question 37

CO serbest hem molekülüne O2 den 20.000 kat daha fazla bağlanır.

Question 38

yüzde 78 alfa sarmal yaoısında bir hem bir polipeptid zinciri içeren kas proteini

Answer 38

miyoglobin

Question 39

miyoglobinin hem grubuna bağlı olan aa

Answer 39

HİSTİDİN

Question 40

hemositoblast

Answer 40

İnsanda bulunan eritrositlerin kök hücreleri

Question 41

Allosterik protein

Answer 41

bir bölgeye bir ligand bağlandığında farklı bir bölgenin bağlanma özelliklerinin etkilendiği proteinlere denir

Question 42

c=o grup ismi

Answer 42

karbonil

Question 43

n-c

Answer 43

karboksil amin