Régulation des gènes eucaryotes

Question 1

Que font les silencers et les insulateurs

Answer 1

Silencer: inhibe la transcription
Insulateur: restreint l’utilisation des amplificateurs et silencers

Question 2

Quels sont les éléments de contrôle de la transcription dans l’ADN

Answer 2

-promoteur de base, facteurs de transcription généraux, ARN polymérase II
-éléments de contrôle proximaux dont l’identité varie d’un gène à l’autre
-amplificateurs liant des facteurs de transcription régulateurs dont l’action est indépendante de la position/orientation

Question 3

Définir un reader

Answer 3

Protéine qui reconnait une ou des modifications d’histones

Question 4

Définir un eraser

Answer 4

Enzyme qui enlève une modification acétyl, méthyl ou autre aux histones

Question 5

Définir un writer

Answer 5

Enzyme qui ajoute une modification acétyl, méthyl ou autre aux histones

Question 6

Quelles sont les enzymes impliquées dans les modifications des histones

Answer 6

Méthylation: histone méthyltransférases/déméthylases
Acétylation: histone acétyltransférases/désacétylases
Phosphorylation: kinases/phosphatases

Question 7

Nommez les types de modifications des histones

Answer 7

-lysine: acétylation, méthylation, ubiquitination
-arginine: méthylation
-sérine/thréonine: phosphorylation

Question 8

Définir la modification des histones agissant sur l’empaquetage de la chromatine

Answer 8

-combinaisons différentes de modifications post-traductionnelles des queues N-terminal des histones forment un code génétique
-ces combinaisons entraînent des effets transcriptionnels différents

Question 9

Décrire la méthylation de l’ADN

Answer 9

-associé à la répression de l’expression des gènes
-c’est un changement épigénétique qui peut être transmise d’une génération à l’autre
-peut être réversible
-peut être modifiée par l’environnement

Question 10

Par quoi est caractérisé la chromatine déconcensée dans les cellules mammifères

Answer 10

-dégradation accrue de la chromatine transcriptionnellement active par la DNase I
-présence de sites hypersensibles à la DNase I
-absence de l’histone H1
-contenu en protéines HMG augmenté

Question 11

Quelles sont les méthodes pour altérer les gènes

Answer 11

-amplification: augmentation des copies des gènes encodant les ARNr durant l’ovogénèse
-délétion: élimination du noyau cellulaire des globules rouges
-réarrangement des gènes endodant les anticorps dans les lymphocytes B: déletion de régions d’ADN

Question 12

Quel est le but des médicaments qui ont comme cible les histones

Answer 12

Empêcher l’expression des gènes, tuer la cellule en empêchant la réplication. Se sont souvent des traitements anti-tumoraux

Question 13

Qu’est-ce qui fait que lors de la chimiothérapie, se ne sont pas toutes les cellules saines qui meurent?

Answer 13

Les cellules cancéreuses se multiplient/divisent super rapidement ce qui fait qu’elles captent plus de médicament rapidement contrairement aux cellules saines qui se réplique plus lentement et n’absorbe pas autant rapidement le traitement

Question 14

Quels sont les rôles des facteurs de transcription régulateurs

Answer 14

-augmente ou diminue l’initiation de transcription en recrutant et stabilisant les composants du complexe transcriptionnel
-recrute des coactivateurs
-recrutement d’un complexe appelé « Médiateur »

Question 15

Comment agissent les coactivateurs

Answer 15

Ils remodèlent la chromatine ou modifient les histones menant à des altérations de la structure de la chromatine

Question 16

À quoi sert le Médiateur

Answer 16

Sert de pont entre les facteurs de transcription régulateurs liés à des amplifications et le complexe transcriptionnel

Question 17

Comment sont controlés les niveaux des protéines (facteurs de transcriptions et cyclines)

Answer 17

Sont contrôlés au niveau de leur dégradation par le protéasome

Question 18

Quels sont les étapes de la régulations des gènes eucaryotes, ubiquitination et stabilité des protéines

Answer 18

-Activation de l’ubiquitine (chaine de76 a.a.) en se liant à une enzyme (E1)
-Transfert de l’ubiquitine activée à l’enzyme conjuguant l’ubiquitine (E2)
-Liaison à un résidus lysine de la protéine à dégrader (E3)
-Addition de d’autres molécules d’ubiquitine
-Reconnaissance des chaines par le protéasome et dégradation

Question 19

Quels sont les étapes de la régulations des gènes eucaryotes, microARN, stabilité de l’ARNm et traduction

Answer 19

-Transcription du miARN en pri-miARN avec tige-boucle
-Clivage du pri-miARN en pre-miARN par Drosha
-Transport dans le cytoplasme et clivage du pre-miARN en miARN par Dicer
-Liaison au complexe RISC pour former miRISC
-Intéractions entre miRISC et l’ARNm
-Dégradation de l’ARNm ou inhibition de la traduction par un ou plrs miARN

Question 20

Le modèle combinatoire prévoit que l’expression des gènes dépend de quoi

Answer 20

D’une combinaison de facteurs de transcription régulateurs ubiquitinaires et tissu-spécifiques, liant de multiples éléments de contrôle dans l’ADN et varient d’un gène à l’autre

Question 21

Décrire le contrôle de l’expression des ARNm par les microARN

Answer 21

-près de la moitié des gènes seraient régulés par des miARN
-habituellement transcrits par ARN polymérase II

Question 22

Comment l’amplificateur peut-il affecter l’expression d’un gène à distance?

Answer 22

• des FT régulateurs lient la séquence d’ADN de l’amplificateur
  -liaison entraine formation d’une boucle qui rapproche l’amplificatuer du promoteur
  -Les FT régulateurs intéragissent avec des coactivateurs qui modifient les histones
  -les FT régulateurs lient le complexe médiateur qui stabilise le complexe transcriptionnel

Question 23

Quelles sont les classes de des FT régulateurs selon leurs motifs de liaison

Answer 23

-motif hélice-tour-hélice
-motif doigt de zinc
-motif leucine zipper
-motif hélice-boucle-hélice

Question 24

Caractériser la régulation post-traductionnelle des FT par phosphorylation

Answer 24

Ajout de charges négatives –> chngt conformation:
-augmente/diminue capacité de lier l’ADN
-augmente/diminue capacité d’activation ou répression
-modifie la localisation

Question 25

Écrire les étapes de la régulation de la transcription par phosphorylation

Answer 25

CREB lie un élément de réponse à l’AMPc (CRE):
-suite à un signal, production d’AMPc et activation de la PKA
-translocation de la PKA au noyau
-phosphorylation de CREB sur le site CRE
-recrutement du coactivateur CBP, un HAT qui acétyle les histones

Question 26

Quel est l’objectif des médicaments ciblant la régulation des gènes eucaryotes

Answer 26

Inhiber le cylce cellulaire/tuer la cellule