Régulation Transcriptionelle (CC2)

Question 1

De quoi dépend l’expression d’un gène ? (2 facteurs)

Answer 1

Dépend du contexte chromatinien : accessibilité du promoteur, chromatine active ou inactive.
De la présence de TFs au niveau du promoteur.

Question 2

A quoi sert l’analyse fonctionelle ?

Answer 2

Permet de mettre en évidence le produit de la transcription du gène : l’ARN.

Question 3

Définir insulateur.

Answer 3

Région de l’ADN reconnue spécifiquement par un facteur qui définit un domaine dans la chromatine, en empêchant la propagation de l’hétérochromatine ou en isolant un enhancer.

Question 4

Définir enhancer.

Answer 4

C’est une région de l’ADN reconnue spécifiquement par des TF et associé à des marques de chromatines caractéristiques. Il peut stimuler le promoteur indépendamment de sa position par rapport au gène.

Question 5

De quoi est fonction l’expression de gènes ?

Answer 5

du taux des facteurs de la transcription dans la cellule et de l’équilibre entre activateur et répresseur.

Question 6

Qu’est-ce que l’interactome ?

Answer 6

C’est lassociation de protéines avec l’ADN génomique.

Question 7

Qu’est-ce que l’épigénome ?

Answer 7

C’est l’ensemble des modifications chimiques de la chromatine capable de moduler l’expression des gènes.

Question 8

Qu’est-ce que le transcriptome ?

Answer 8

Le contenu en ARN d’une cellule.

Question 9

Comment analyser l’interactome et l’épigénome ? Comment analyser le transcriptome ?

Answer 9

On utilisera CHIP pour l’interactome et l’épigénome. en revanche pour le transcriptose on va utiliser des puces à ARN.
On peut utiliser un séquencage pour les trois.

Question 10

Qu’est-ce que l’on appelle les facteurs de transcription maîtres ?

Answer 10

C’est un petit nombre de TF plus abondants par rapport aux autres qui suffisent à mettre en place un programme d’expression de gènes spécifiques d’un type cellulaire

Question 11

Qu’est-ce que des gènes de ménages ?

Answer 11

Ce sont les gènes opposés aux gènes spécifiques : ils sont exprimés dans tous les types cellulaires.

Question 12

Définir gène spécifique.

Answer 12

Gène exprimés plus abondamment dans un type ou un nombre limité de types cellulaires.

Question 13

Comment peut on induire une reprogrammation des cellules ?

Answer 13

On fait une augmentation artificielle du taux intra cellulaire de facteurs maitres.

Question 14

Qu’est-ce que les modifications épigénétiques ?

Answer 14

Elles permettent d’obtenir des phénotypes différents alors que les cellules sont génétiquement identiques.

Question 15

Quelles sont les trois catégories de modifications épigénétiques ?

Answer 15

Méthylation de l’ADN
Modification des histones
Remodelage de la chromatine ou positionnement des histones.

Question 16

Est-ce que les modifications épigénétiques sont héritées entre les cellules ?

Answer 16

On suppose oui !

Question 17

Quelles sont les marques caractéristiques de la chromatine inactive ou active ?

Answer 17

La présence de modifications covalentes des histones ou de l’ADN.

Question 18

Comment peut on détecter les marques de la chromatine active ou inactive au niveau du génome ?

Answer 18

On utilise la technique de l’immunoprécipitation de la chromatine en présence d’anticorps spécifiques d’un type de modification.

Question 19

Quelle extrémité d’un histone est flexible et accessible ?

Answer 19

L’extrémité N terminale.

Question 20

Quels acides aminés peuvent être modifiés ?

Answer 20

KRYST.

Question 21

Quelle est la nature des modifications des acides aminés ?

Answer 21

Acetylation
Methylation
Ubiquitination
Phosphorylation
Sumorylation
ADPribosylation

Question 22

Par quoi sont faites les modification des aa, et sont-elles réversibles ?

Answer 22

Elles sont mises en places par des enzymes et elles sont effectivement réversibles.

Question 23

Pour une méthylation de Lysine : Quelle enzyme la produit, quelle enzyme l’efface, quelle protéine la lit ?

Answer 23

Produit : KMT
Efface : Lysine Demethylase
Lit : Protéine à Chromodomaine.

Question 24

Pour une acetylation de Lysine : Quelle enzyme la produit, quelle enzyme l’efface, quelle protéine la lit ?

Answer 24

Produit : KAT
Efface : HDAC
Lit : Protéine à Bromodomaine.

Question 25

Qu’indique une acetylation de lysine ?

Answer 25

Perte de charge + : chromatine se relâche, indique que le gène est actif.

Question 26

Qu’est-ce qu’une HAT ?

Answer 26

histone acétyltransférase, qui acetyle les histones et donc active la transcription du gène.

Question 27

A quoi sert lncRNA ?

Answer 27

Permet de recruter un complexe enzymatique qui méthyle les histones.

Question 28

Pour une méthylation de cytosine : Quelle enzyme la produit, quelle enzyme l’efface, quel effet sur les gènes ?

Answer 28

Produit : DNMT
Efface : Déméthylase

Inhibe les gènes.

Question 29

Décrire le mécanisme d’acton des IncRNA dans la régulation de l’expression des gènes.

Answer 29

1) Signal : indique els régions du chromosme à réprimer
2) Titrage d’un TF qui inhibe l’expression des gènes cibles.
3) Forme une cible pour les facteurs impliqués dans la modification de la chromatine.

Question 30

C’est quoi LncARN ? Quel est un de ses rôles concrets chez les mammifères ?

Answer 30

C’est un ARN long et non codant.

Son rôle est par exemple d’inactiver l’un des chromosomes X dans les cellules femelle de mammifères.