Replicación, transcripcion Flashcards

1
Q

Características de la replicación

A

-sintesis acdenas es de 5´a 3´
-semiconservadora
-bidireccional
-continua y discontinua

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2
Q

Que significa que sea semiconservadora la replicación?

A

que en cada replicación se conserva una de las cadenas originales

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3
Q

Que significa que sea bidireccional la replicación?

A

que a partir del origen de replicación se sintetizan dos cadenas en ambos sentidos

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4
Q

Que caracteristicas tienen los sitios de origen?

A

son sitios ricos en A y T

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5
Q

Porque los sitios donde hay mas adeninas y timinas son los que se rompen primero?

A

Porque los enlaces entre ellas son de 2 puentes de hidrógeno, entonces es mas fácil de romper

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6
Q

Cual es una característica que diferencia la replicación de los eucariontes a los procariotas?

A

que en los eucariotas es multifocal– significa que hay múltiples origenes de replicación

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7
Q

Características de la hebra discontinua

A

-forman fragmentos okazaki
-replicación cadena 5´a 3´

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8
Q

Características de la hebra continua

A

-replicación de 3´a 5´
-hebra líder

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9
Q

Función helicasa

A

-separa las dos hebras DNA
-rompe puentes hidrógeno
-ocasiona super enrollamientos

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10
Q

Función de proteínas unión a cadena sencilla (RPA o SSB)

A

-evitan formación de puentes de hidrógeno
-mantiene hebras separadas uniendose a la cadena

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11
Q

Función primasa

A

-sintetisa los primers
-8 a 10 nt de longitud
-proporciona un extremo 3´—en conjunto con la DNA polimerasa alfa

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12
Q

Función toposimoerasa

A

-desenrollan, cortan y luego vuelven a hacer enlaces fosfodiester

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13
Q

Función RNAsa H1

A

-retira los primers de hebra continua

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14
Q

Función endonucleasa FLAP 1

A

remueve primers de fragmentos de okazaki– después llega DNA polimerasa (discontinua)

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15
Q

Función de ligasa

A

forma enlace fosfodiester entre nucleótidos contiguos–une a todos los fragmentos de DNA

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16
Q

Función de telomerasa

A

-transcriptasa reversa que sintetiza una secuencia determinada de DNA

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17
Q

Función antigeno nuclear de proliferación celular (PCNA)

A

-junta todas las proteínas para que puedan actuar
-sirve como pinza que sostiene la DNA polimerasa sobre la cadena de DNA

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18
Q

Función DNA polimerasa

A

trata de poner la base nitrogenada contraria y después formar enlaces

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19
Q

En que dirección sintetiza DNA polimerasa

A

-sintetiza de 5´a 3´
-necesita un extremo OH libre para poder sintetizar
-la primasa se lo pone

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20
Q

Función DNA pol alfa

A

trabaja con primasa RNA primasa

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21
Q

Función DNA pol delta

A

elongación hebras rezagadas (discontinua)

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22
Q

Función DNA pol epsilon

A

elongación hebras DNA líder (continua)

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23
Q

Función DNa pol beta

A

reparación errores

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24
Q

Función DNA pol gamma

A

replicación DNA mitocondrial

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25
Pasos para formar hebra continua
1. actua DNA polimerasa alfa forma primer 2. actua DNA polimerasa epsilon y empiez a pegar bases con enlaces fosfodiester
26
Pasos para formar hebra discontinua
1. actúa DNA pol alfa primer 2. actúa DNA pol delta y empieza a pegar bases con enlaces fosfodiester
27
En que consiste el inicio de la replicación
en reconocer el punto de origen (ORI)
28
Como se llama el complejo que reconoce el punto de inicio?
ORC
29
Que hacen las proteínas iniciadoras?
empiezan a romper puentes de h
30
Cuantas horquillas de replicación hay y que pasa ?
Hay 2 horquillas de replicacion y las helicasas llegan de los dos lados
31
Que necesita la helicasa para actuar?
se fosforila
32
Que hace PCNA?
mantiene pegada DNa polimerasa a la hebra de DNA
33
Que hace RPA?
separa las cadenas para evitar que se unan la replicacion
34
Cuantos primers se ponen en la hebra líder?
solo un primer
35
Cuantos primers se ponen en la hebra rezagada?
-varios primers -fragmentos de okazaki
36
Que pasa en la terminación de la replicación?
-se unen todos los fragmentos -se eliminan los primers -desacoplan las proteínas -replican los telómeros
37
Que son los telómeros?
secuencias de nucleótidos al final de los cromosomas que protegen el ADN de la degradación.
38
Que es un tandem?
pueden estar en cualquier parte del genoma y su expansión puede causar enfermedades genéticas
39
Cual es la secuencia de telómeros en humanos?
GGGTTA
40
Función de la telomerasa
-reconoce la punta de los telomeros -contiene secuencia de RNA , con la cual elonga los telóremos -actua en la hebra rezagada
41
En que consiste la transcripción
síntesis de una cadena de RNA complementaria y antiparalela
42
Porque se dice transcripción?
es de nucleótido a nucleótido
43
Porque se dice traducción?
de nucleótido a proteína
44
Que es un gen?
secuencia de nucleótidos en la molécula de DNa, que contiene la información necesaria para síntesis de un RNA m,t y r funcional
45
Tipo de secuencias que puede tener un gen
Regulatorias y codificantes
46
Dentro de las regulatorias cuales existen?
promotores potenciadores silenciadores
47
Dentro de las codificantes cuales existen?
intrones y exones
48
En donde se pueden encontrar los promotores?
se pueden encontrar rio arriba y rio abajo
49
A que se le llama transcrito primario/RNA inmaduro?
a cuando ya se transcribe pero sin la region regulatoria aun tiene intrones y exones
50
Como sabemos que el RNAm ya esta completo?
cuando ya tiene puros exones, con caperuza y cola de poli a
51
Cuando se usa la caja tata ?
cuando es un gen que se expresa de vez en cuando o cuando se necesita --- esta río arriba
51
La caja TATA es un promotor o regulador ?
es un promotor
52
Cuando se usa CAAT?
genes con alta expresión y regulación---- esta río arriba
53
Cuando se usa CG?
se usa para genes constitutivos, SIEMPRE ACTIVOS ej. rna polimerasa, proteínas ribosomales y enzimas
54
Cuando se usa DPE?
genes sin caja TATA pero con inicio preciso esta río abajo se encuentra dentro del código
55
Que es un factor de transcripción?
son proteínas, que regulan (aumentan o disminuyen) la tasa de transcripción
56
Como se activan las proteínas reguladoras ?
tiene que fosforilarse
57
Que proteínas detectan el inicio para la transcripción?
los factores de transcripción
58
Cuantos tipos de RNA polimerasa existen?
RNA pol I, RNA pol II y RNA pol III
59
Cual es la polimerasa que se usa en los humanos ?
RNA pol II
60
Paso 1 de la transcripción
-TFIID se une a la caja TATA -la parte TBP de TFIID reconoce a TATA
61
Paso 2 de la transcripción
Cuando se une TBP se provoca una deformación del DNA se dobla (80°)
62
Paso 3 de la transcripción
TFIIB se una a la parte TBP de TFIID y pone a la RNA polimerasa la posiciona
63
Paso 4 de la transcripción
TFIIF agarra una RNA polimerasa y se pega al complejo porque TFIIB la atrae
64
Paso 5 de la transcripción
TFIIA estabiliza la unión y mantiene unida la TFIID (en su parte TBP), con el DNA
65
Paso 6 de la transcripción
llega TFIIH -tiene función de helicasa para que pase RNA pol -fosforila el carboxilo terminal de RNa pol
66
Que pasa cuando TFIIH fosforila el carboxilo terminal del RNA pol?
cambia de posición y la hace avanzar
67
Que proteína regula la fosforilación de TFIIH?
TFIIE
68
Que le pasa a la RNA pol cuando esta fosforilada ?
empieza a avanzar
69
Si hay un potenciador quien lo va a detectar?
activador
70
Si hay un silenciador quien lo va a detectar?
represor
71
Por donde se manda la señal ya sea del activador o del represor ?
por un mediador
72
Función del mediador
permite que las proteínas activadoras se comuniquen con la polimerasa
73
Función complejo de remodelación de la cromatina
-facilita el deslizamiento de nucleosomas -promueve el desalojo de los nucleosomas
74
Función de la enzima modificadora de histonas
-acetilación, metilación y fosforilación
75
Nombra los factores que pausan a la RNA pol II
NELF, Gdown y PAFC1
76
Cuales son las proteínas que al llegar hacen que NELF y Gdown se salgan y que PAFC1 se convierta en activador ?
SPT4 y 5
77
Para que se necesitan SPT4 y 5?
para mantener unido a RNA polimerasa al DNA y que no se separe hasta que termine
78
Función de PTEFb
-vuelve a fosforilar la colita del RNA pol y la activa -activa a las proteínas de la cola
79
Donde se encuentran las proteínas para poner caperuza y cola de poli a ?
En la cola de la RNA pol II
80
Nombre de las tres enzimas que ponen la caperuza
-RNA tirofosfatasa -Guanil transferasa -Metil transferasa
81
En la terminación que nos falta ponerle al RNA m?
la cola poli a
82
Nombra las enzimas que actuan en la terminación de la transcripción
CPSF CstF Poli A polimerasa
83
Función CPSF
-terminación AAUAAAAA -reconoce que el RNA m esta acabando para que se de cuenta necesitamos muchas adeninas
84
Función CstF
-participa en la escisión -separa todas las proteínas
85
Función poli A polimerasa
-añade 200nt de adenina al final de la hebra