RNA NON-CODANTS Flashcards

1
Q

un ARN non codant est une..

A

molécule d’ARN fonctionnelle qui est transcrite, mais pas TRADUITE en protéine

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2
Q

mRNA =

A

ARN messager
Code pour une protéine

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3
Q

ncRNA =

A

non-coding RNA
ARN non-codant
ne code pas pour une protéine

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4
Q

Les séquences d’ADN peuvent être classées en..

A

séquences “utiles” correspondant aux gènes (environ 10-20% du génome/EXONS - 1.5-2% du génome)

séquences intergéniques “inutiles/junk” (environ 80-90% du génome)

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5
Q

une large proportion des séquences intergéniques sont..

A

des séquences répétées

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6
Q

il y a 6 types d’ARN non-codant, nommez les 2 qu’on s’intéresse dans le cours

A
  1. ARN d’interférence
    -miRNA (microARN)
    -siARN (small interfering ARN)
  2. Large non-coding ARN (LncARN)
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7
Q

Quels RNA non-codants régulent l’expression des gènes?

A

miRNA, siRNA, IncRNA

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8
Q

on peut classifier les ARN selon leur longueur, explication

A

plus de 200 nucléotides : long non-coding RNA

moins de 200 nucléotides : small non-coding RNA inclient miRNA et siRNA

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9
Q

les miRNA, siRNA, IncRNA régulent l’expression des gènes au niveau..

A

transcriptionnel, post-transcriptionnel et l’épissage du pré-ARNm

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10
Q

les miRNA, siRNA et IncRNA participent à quoi

A

formation d’hétérochromatine, modification d’histones, ciblage de la méthylation et silençage des gènes

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11
Q

Large ncRNAs ont combien de nucléotides

A

Plus de 200

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12
Q

Small non-coding RNAs ont combien de nucléotides et ils incluent quoi

A

Moins de 200

Micro-ARNs
Et small interfering ARN

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13
Q

Les micro-ARNs fonctionnent quand dans l’expression génique

A

Fonctionne dans la régulation POST-TRANSCRIPTIONNELLE DE L’EXPRESSION GÉNIQUE

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14
Q

Micro-ARNs caractéristiques

A

-22 nucléotides
-se trouvent chez les plantes, les animaux et certains virus
-sont abondants dans de nombreux types de cellules de mammifères
-semblent cibler environ 60% des gènes humains
-la plupart de ces miRNA sont conservés entre les espèces et ont des fonctions importantes

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15
Q

Fonctions de miRNAs

A

Poir la plupart, les miRNA inhibent l’expression génique en diblant des ARNm

Les miRNA fonctionnent via l’appariement de bases avec des séquences complémentaires au sein de molécules d’ARNm cibles

Les molécules d’ARNm ciblés par les miRNA sont silencées par un ou plusieurs des processus suivants
-clivage du brin d’ARNm en deux morceaux
-déstabilisation de l’ARNm par clivage de sa queue poly(A)
-réduction de l’efficacité de traduction de l’ARNm en protéine

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16
Q

Cmt ecq les miRNA inhibent l’expression génique

A

En ciblant des ARNm

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17
Q

Les miRNA fonctionnent via quoi au sein de molécules d’ARNm cibles

A

Via l’appariement de bases avec des séquences complémentaires au sein de molécules d’ARNm cibles

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18
Q

Biogenèse des miRNAs dans le noyau, les gènes miRNAs sont généralement transcrits par quoi

A

ARN polymérase II

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19
Q

Les arns d’interférence jouent un rôle dans quoi

A

Dans la défense des cellules contre les séquences nucléotidiques parasites - virus et transposons

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20
Q

iRNA est un processus biologique dans lequel..

A

Des molécules d’ARN inhibent l’expression ou la traduction des gènes en neutralisant les molécules d’ARNm ciblées

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21
Q

Que font les siRNA synthétiques introduits dans les cellules

A

Peuvent inhiber de manière sélective et robuste l’expression de gènes d’intérêt spécifiques

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22
Q

Biogenèse des miRNAs dans le noyau, quels arn poly

A

2 et 3

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23
Q

Les miRNA font partie d’un transcrit précurseur contenant un ou plusieurs miRNA appelé

A

Pri-miRNA

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24
Q

Un seul pri-miRNA peut contenir quoi

A

1 à 6 précurseurs de miRNA nommés pré-miRNA

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25
Q

Chaque structure à ARN double brin des épingles à cheveux dans un pri-miRNA est reconnue par une protéine nucléaire appelée

A

Dgcr8 ou pasha

26
Q

Chaque pré-miRNA a

A

Une structure en tige-boucle composées d’environ 70-80 nucléotides

27
Q

Pri-miRNA est reconnue par quoi

A

Par une protéine nucléaire appelée DGCR8 chez les vertébrés ou PASHA chez les invertébrés

28
Q

Qu’est-ce qui forme le complexe microprocesseur

A

DGCR8 et DROSHA

29
Q

Que fait drosha

A

L’activité enzymatique de drosha découpe les pré-miRNA à partir du pri-miRNA

CROPPING : drosha libère les pré-miRNA (épingles à cheveux) des pri-miRNA

30
Q

Quel est le produit résultant du copping

A

Le pré-miRNA a deux nucléotides non-appariés à son extrémité 3’

31
Q

DESCRIPTION EXPORT EN BIOGÉNÈSE

A

EXPORT
Les pré-miRNA sont exportés par exportin-5 qui reconnaît les 2 nucléotides laissés à son extrémité 3’ par drosha

32
Q

Le transport de l’exportine-5 vers le cytoplasme est dépendent de quoi

A

De l’énergie du GTP lié à la protéine Ran (RAN-GTP)

33
Q

Description DICING

A

Dans le cytoplasme, l’épingle à cheveux pré-miRNA est processé par DICER

DICER est une endoribonucléase qui coupe la boucle reliant les bras de l’épingle à cheveux et donnant un duplex miARN:miARN* imparfait d’environ 22 nucléotides de long

34
Q

DICER est une endo ou exonucléase et qu’est-ce qu’elle fait

A

DICER est une endoribonucléase qui coupe la boucle reliant les bras de l’épingle à cheveux et donnant un duplex miARN:miARN* imparfait d’environ 22 nucléotides de long

35
Q

miRNA est nommé cmt

A

Brin guide

36
Q

miRNA* est nommé cmt

A

Brin passager

37
Q

Dans le duplex, quel brins peut potentiellement agir en tant que miRNA fonctionnel

A

LES 2

38
Q

Argonaute choisi quoi

A

Un seul brin, le brin guide

39
Q

Le brin guide et ago forment quoi

A

Le brin guide avec ago et d’autres protéines forment RISC (complexe silencing induit par l’ARN) dans lequel le miRNA et sa cible d’ARNm interagissent

40
Q

Le miRNA fait parti de quoi

A

Du RISC contenant argonaute et de nombreuses protéines associées

41
Q

RISC est aussi appelé cmt

A

Complexe miRNA ribonucléoprotéine

42
Q

Les argonautes jouent un rôle central dans la fonction de quoi

A

Risc

43
Q

Les ago lient quoi

A

Le miRNA mature et le guide pour une interaciton avec ARNm cible

44
Q

Définir SLICING

A

Si l’appariement entre miRNA et le mRNA est étendu (presque parfait) le mRNA cible est clivé puis dégradé

45
Q

Si l’appariement de bases n’est pas extensif, que ce passe-t-il

A

Si l’appariement de bases n’est pas extensif, argonaute ne slice pas, la traduction est inhi(partiel)bée et le mRNA déstabilisé

Les mRNAs sont séquestrés dans des structures cytosoliques dites P-bodies où a lieu la dégradation des mRNAs

46
Q

Définir p-bodies

A

Des structures dynamiques contenant l’enzyme dcp1 (decaping) ainsi que des enzymes de dégradation de mRNAs

47
Q

Les miRNA partiellement complémentaires peuvent faire quoi

A

Inhiber l’initiation de la traduction de l’ARNm cible en se liant au début du ARNm

Accélérer la déadénylation entraînant la dégradation préoce des ARNm

48
Q

Les miRNA provoquent parfois quoi

A

La modification d’histones et la méthylation de l’ADN des sites promoteurs, ce qui affecte l’expression des gènes cibles

49
Q

Rapport mirna et cancer

A

Le suppresseur de tumeurs p53 dans le cancer du sein

miRNA régulent p53

50
Q

La majorité des miRNA sont..

A

Intracellulaires

51
Q

Définition de lncRNA

A

Permet de distinguer les lncRNA des petits ARN régulateurs tels que les miRNA et les autres petits ARN nucléaires

52
Q

Les lnRNA sont exprimés plus fortement ou plus faiblement que les gènes codants pour des protéines

A

Plus faiblement

53
Q

Caractéristiques des lnRNA

A

-leur expression est remarquablement spécifique dans certains tissus
-sont généralement enrichis dans le noyau
-montrent une plus faible conservation de séquence, bien que certains d’entre eux soient fortement conservés

54
Q

Les gènes de lncRNA sont définis par quoi

A

Leur positive relative aux gènes codants qui sont situées à leur proximité

55
Q

lncRNA intergéniques veut dire

A

Des lncRNA localisés dans une région entre gènes

56
Q

Les lncRNA antisens sont..

A

Des lncRNA transcrits dans la direction opposée d’un gène codant et dont la séquence chevauche en partie ou totalement le gène codant lui étant associé

57
Q

Les lncRNA introniques sont quoi

A

Des lncRNA contenus dans un intron d’un gène codant

58
Q

Les lncRNA divergents sont..

A

Transcrits de façon divergente au promoteur d’un gène codant

59
Q

Les lncRNA peuvent contrôler l’expression des gènes explication

A
  1. Des voisins (en cis, action locale)
  2. Indépendamment de la localisation de leurs gènes cibles (en trans, action distale)

Ce contrôle peut avoir un impact positif ou négatif sur l’expression des gènes cibles (repression ou activation)

60
Q

Rôles des longs ARN non codants

A

Les lncRNAs agissent à travers divers mécanismes pour réguler l’expression des gènes codants :

-dirigent des modificateurs de la chromatine vers des gènes cibles spécifiques

-déplacent des régulateurs de l’expression (activateurs ou répresseur) des séquences régulatrices de l’expression

-entrent en compétition avec des miRNA et protègent des ARN messagers de la dégradation par ces miRNA (fonction éponge)

-modulent des évènements d’épissage et interfèrent avec la traduction

-promeuvent l’association à des séquences amplificatrices et promotrices pour initier la transcription