Section 1.3

Question 1

Le ribosome

Qu’est-ce que le ribosome?

Answer 1

La machine macromoléculaire qui dirige la synthèse des protéines

Question 2

Vrai ou faux? Chez les procaryotes, la machinerie de transcription et de traduction est localisée dans le même compartiment.

Answer 2

Vrai, cela permet au ribosome de procéder en tandem avec l’ARN polymérase.

Question 3

Vrai ou faux? Chez les eucaryotes, la machinerie de transcription et de traduction est localisée dans le même compartiment.

Answer 3

Faux, chez les eucaryotes la traduction et la transcription sont séparées complètement

Question 4

Dans quels endroits sont effectuées la transcription et la traduction chez les eucaryotes?

Answer 4

Transcription : dans le noyau
Traduction : dans le cytoplasme

Question 5

La traduction des eucaryotes est-elle plus lente ou plus rapide que celle des procaryotes?

Answer 5

Elle est plus lente (2 à 4 a.a./s vs 20 a.a./s)

Question 6

Quelles sont les deux sous-unités du ribosome?

Answer 6

Il y a une grande sous-unité et une petite sous-unité.

Question 7

Quelle est la taille (chez les procaryotes et les eucaryotes) et que contient la grande sous-unité du ribosome?

Answer 7

La grande sous-unité à une taille de :
50S chez les procaryotes
60S chez les eucaryotes

Elle comporte le centre peptidyl-transferase qui est responsable de la formation des liens peptidiques

Question 8

Quelle est la taille (chez les procaryotes et les eucaryotes) et que contient la petite-sous unité du ribosome?

Answer 8

La grande sous-unité à une taille de :
30S chez les procaryotes
40S chez les eucaryotes

Elle comporte le centre de décodage, qui permet aux ARNt chargées de lire ou décoder les codons de l’ARNm.

Question 9

Quelle unité représente la grosseur des sous-unité du ribosome et que représente-t-elle?

Answer 9

La grosseur est définie par les Svedberg (S) et représente l’unité de sédimentation dans un gradient de sucrose.

Question 10

Quelle est la taille du ribosome total intact chez les procaryotes et les eucaryotes?

Answer 10

Procaryotes : 70S
Eucaryotes : 80S

Question 11

Pourquoi le ribosome intact procaryote fait-il une taille de 70S alors qu’il est composé de sous-unités de 30S et 50S?

Answer 11

La vitesse de sédimentation est déterminée par la forme et la taille du ribosome, et non seulement par son poids.

Question 12

Chez les procaryotes, quelle est la proportion ARNr vs Protéines ribosomiques?

Answer 12

Plus de 2/3 d’ARN et 1/3 de protéines composent la masse du ribosome.

Question 13

Quels ARNr comportent la sous-unité de 50S et la sous-unité de 30S chez les bactéries?

Answer 13

Sous-unité de 50S : ARNr 5S et ARNr 23S

Sous unité de 30S : ARNr 16S

Question 14

Qu’est-ce que le cycle ribosomique?

Answer 14

À chaque fois qu’une protéine est synthétisé, une série d’évènements est effectuée par le ribosome : les sous-unités du ribosome s’associent ensemble et avec l’ARNm, traduisent l’ARNm, et se dissocient.

Question 15

Quelles sont les étapes du cycle ribosomiques?

Answer 15

1 - Association de l’ARNm et d’un ARNt initiant à une petite sous-unité du ribosome libre.

2 - Le complexe (petite sous-unité-ARNm-ARNt d’initiation) recrute une grand sous-unité pour créer un ribosome intact avec un ARNm entre les deux sous-unités.

3 - Initiation de la synthèse protéique (de 5’ à 3’). À chaque codon différent, un ARNt chargé s’attache dans les centres de décodage et peptidyl-transférase des sous-unité.

4 - Au codon stop, la chaîne polypeptidique est libérée, et le ribosome se dissocie de l’ARNm. Le cycle se répète.

Question 16

Un ARNm peut-il être traduit par plusieurs ribosomes en même-temps?

Answer 16

Oui, on apelle cela un polyribosome/polysome. Les ribosomes dirigent alors la synthèse de plusieurs polypeptides en même temps.

Question 17

Dans quelle ordres sont synthétisés les chaînes polypeptidiques?

Answer 17

Chaque acide aminé est ajouté au carboxyle terminale de la chaîne (direction amine- à carboxy-terminal)

Question 18

Vrai ou faux? La chaîne polypeptidique est toujours attachée à au moins un ARNt pendant sa synthèse.

Answer 18

Vrai, la chaîne est attachée par un ARNt et le nouvel acide aminé est aussi attaché à un ARNt.

Question 19

Quelles sont les deux substrats de chaque ronde d’addition d’un acide aminé?

Answer 19

Un ARNt-aminoacyl et un ARNt-peptidyl.

Question 20

Quel est le mécanisme chimique permettant l’attachement de l’acide aminé et la chaîne polypeptidique (aka réaction peptidyl-transferase)?

Answer 20

L’ARNt chargé d’un a.a. s’approche de l’extrémité carbonyle de la chaîne. Le groupement amine du nouvel acide aminé attaque le groupement carbonyle de la chaîne, ce qui forme un nouveau lien peptidique. La chaîne est transférée de l’ARNt-peptidyl à l’ARNt-aminoacyl

Question 21

Pourquoi la formation du lien peptidique prend-il place sans l’hydrolyse d’un NTP?

Answer 21

L’énergie de la formation du lien peptidique provient du brisement du lien acyl qui joint la chaîne polypeptidique à l’ARNt. Cette énergie provient d’une réaction catalysée par aaRS qui inclut l’hydrolyse de l’ATP (ce qui explique l’énergie contenue dans le lien acyl).

Question 22

Qu’ont permis les analyse 3D à haute résolution des structures ribosomales?

Answer 22

De comprendre que les ARNr sont beaucoup plus que des simples composants structuraux du ribosome : par exemple, la boucle anticodon d’un ARNt chargé contacte l’ARNr 16S et non les protéines ribosomiques.

Question 23

Combien de sites de liaisons à l’ARNt comportent les ribosomes? Quels sont les noms de ces sites et à quoi se lient-ils?

Answer 23

3 sites de liaison :
Le site A se lie à l’ARNt-aminoacyl
Le site P se lie à l’ARNt-peptidyl
Le site E est le site de liaison dégagé après que la chaîne soit transférée à l’ARNt-aminoacyl

Question 24

Comment les polymères entrent-ils et sortent-ils du ribosome afin d’être dans le centre de décodage lors de la traduction?

Answer 24

La ribosome a une structure qui comporte 2 tunnels pour entrer et sortir de la petite sous-unité, qui font une petite taille permettant seulement à l’ARN d’entrer et la chaîne polypeptidique de sortir.

Question 25

Quels sont les trois étapes de la traduction?

Answer 25

1 - Initiation de la synthèse d'une nouvelle chaîne polypeptidique 2 - Élongation du polypeptide 3 - Terminaison de la synthèse polypeptidique

Question 26

# Initiation de la traduction (procaryotes) Quels sont les trois évènements requis à l'initiation de la traduction?

Answer 26

1 - Recrutement du ribosome par l'ARNm 2 - Un ARNt chargé doit être placé dans le site P du ribosome 3 - Le ribosome doit être positionné précisément sur le codon STAR.

Question 27

# Initiation de la traduction (procaryotes) Pourquoi le positionnement adéquat du ribosome sur le codon start est il essentiel?

Answer 27

Car il établit le cadre de lecture pour la traduction de l'ARNm. Même 1 base de différence synthétiserait un polypeptide complètement différent.

Question 28

# Initiation de la traduction (procaryotes) Comment l'association de la petite sous-unité est-il effectué?

Answer 28

Par des intéraction qui permet le pairage des bases entre le site de liaison du ribosome et l'ARNr 16S. Idéalement la petite sous-unité est positionnée pour que le codon START soit sur le site P quand la grande sous-unité rejoint.

Question 29

# Initiation de la traduction (procaryotes) Vrai ou faux? L'initiation de la traduction est le seul moment où un ARNt se lie au site P sans occuper le site A au préalable?

Answer 29

Vrai, car l'ARNt en question est un ARNt spécial (ARNt initiateur) qui se lie au codon start.

Question 30

# Initiation de la traduction (procaryotes) Quel groupe est rapidement ajouté au groupement amine de la méthionine de départ par l'enzyme Met-ARNt transformylase?

Answer 30

Un groupe formyle (ce qui transforme la méthionine en N-formyl methionine)

Question 31

# Initiation de la traduction (procaryotes) Comment nomme-t-on l'ARNt chargé de N-formylméthionyne?

Answer 31

fMet-ARNt_i^fmet

Question 32

# Initiation de la traduction (procaryotes) Quel enzyme est responsable d'enlever le groupement formyle pendant ou après la formation de la chaine polypeptidique?

Answer 32

La deformylase

Question 33

# Initiation de la traduction (procaryotes) Par quelle sous-unité la traduction commence-t-elle?

Answer 33

À partir de la petite sous-unité

Question 34

# Initiation de la traduction (procaryotes) Par quoi est catalysée l'initiation de la traduction?

Answer 34

3 facteurs d'initiations : IF1, IF2 et IF3

Question 35

# Initiation de la traduction (procaryotes) Expliquez le rôle de chacun des facteurs initiation (IF1, IF2 et IF3)

Answer 35

IF1 empêche l'ARNt de se lier à la portion de la petite sous-unité qui fera partie du site A IF2 est une GTPase qui intéragit avec 3 composantes de la machinerie d'initiation : la petite sous-unité, IF1 et l'ARNt initiateur chargé IF3 se lie à la petite sous-unité et l'empêche de se ré-associer à la grande sous-unité

Question 36

# Initiation de la traduction (procaryotes) Que permet IF2 en s'assoçiant aux trois composantes?

Answer 36

* Facilite l'association de l'ARNt initiateur chargé avec la petite sous-unité. * Empêche les autres ARNt chargés de s'associer avec la petite sous-unité

Question 37

# Initiation de la traduction (procaryotes) Que requiert l'association de la petite-sous unité avec l'ARNm?

Answer 37

Le pairage entre RBS et l'ARNr 16s

Question 38

# Initiation de la traduction (procaryotes) Qu'arrive-t-il quand le codon start et l'ARN initiateur chargé se pairent?

Answer 38

La petite sous-unité change de conformation : * Libération d'IF3 * Sans IF3 - la grande sous-unité se lie à la petite sous-unité * IF2 sert de prot d'attache de la grande sous-unité, ce qui stimule l'activité GTPase de cette dernière

Question 39

# Initiation de la traduction (procaryotes) Quel est le résultat net de l'initiation?

Answer 39

La formation d'un ribosome de 70S intact assemblé au site de départ de l'ARNm avec l'ARNt initiateur chargé dans le **site P** et un site A libre. Le site A libre est prêt à accepter un ARNt chargé dans le site A et commencer la synthèse polypeptidique.

Question 40

# Initiation de la traduction (eucaryote) Quelles sont les similitudes entre l'initiation de la traduction chez les procaryotes et les eucaryotes?

Answer 40

Les deux utilisent : * Un codon start + un ARNt initiateur dédié * Les facteurs d'initiations pour former un complexe avec la petite sous-unité qui s'assemble sur l'ARNm avant l'addition de la grande sous-unité

Question 41

# Initiation de la traduction (eucaryote) Quelle est la grande différence et les autres différences entre l'initiation de la traduction chez les procaryotes et les eucaryotes?

Answer 41

Les eucaryotes utilisent une méthode distinctes pour reconnaître l'ARNm et le codon start. Beaucoup plus de facteurs auxiliaires dans l'initiation de la traduction eucaryote.

Question 42

# Initiation de la traduction (eucaryote) Comment les eucaryotes reconnaissent-ils le codon start?

Answer 42

La petite sous-unité est déjà associé avec l'ARN initiateur, et est recrutée à l'extrémité 5' de l'ARNm. Elle scanne l'ARNm de 5' à 3' jusqu'à ce qu'il atteigne le codon start (5'-AUG-3').

Question 43

# Initiation de la traduction (eucaryote) Quelles sont les 4 étapes générale de l'initiation de la traduction chez les cellules eucaryotes?

Answer 43

1. Association de l'ARNt initiateur à la petite sous-unité **avant** l'association avec l'ARNm 2. Facteurs auxiliaires régulent la reconnaissance de l'ARNm 3. La petite sous-unité lié à l'ARN initiateur scanne l'ARNm pour la première séquence AUG 4. La grande sous-unité du ribosome est ensuite recrutée après le pairage entre l'ARNt initiateur et le codon start

Question 44

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 1 Que se passe-t-il après un cycle de traduction du ribosome (avant l'étape 1)?

Answer 44

Il se dissocie en deux, et 4 facteurs d'initiations (eIF1, eIF1A, eIF3 et eIF5) se lient à la petite sous-unité.

Question 45

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 1 À quoi servent eIF1, eIF1A et eIF5?

Answer 45

Ils agissent de manière homologue à IF3 et IF1 pour **bloquer la grande sous-unité et l'association de l'ARNt sur le site A**

Question 46

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 1 À quoi sert eIF2?

Answer 46

Il lie le GTP et se charge de recruter l'ARNt initiateur chargé au site P (comme IF2)

Question 47

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 1 Comment s'apelle le complexe liant l'ARNt initiateur à EIF2?

Answer 47

Le complexe ternaire

Question 48

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 1 Quelle est la différence entre l'ARNt initiateur chargé eucaryote et procaryote?

Answer 48

Pour les eucaryote, l'ARNt initiateur est chargé avec de la méthionine et non de la N-formyl methionine

Question 49

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 1 Comment apelle-t-on la formation après le positionnement de l'ARNt initiateur au site p?

Answer 49

Le complexe de pré-initiation 43S

Question 50

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 2 Comment la petite sous-unité reconnaît-elle l'ARNm? Quelles sont les étapes suivant cela?

Answer 50

1. La coiffe 5' est reconnue par eIF4E. 2. eIF4G se lie à eIF4E et l'ARNm 3. eIF4A se lie à eIF4G et l'ARNm (le niveau de traduction est contrôlé par cette étape par une famille de protéines qui compétitionnent avec eIF4G (protéines liantes eIF4E) 4. eIF4B se lie à l'ARNm qui active l'activité ARN hélicase de eIF4A (qui permet de délier les structures secondaires (ex. hairpin)

Question 51

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 2 Quelle est l'étape finale qui relie l'ARN au complexe de préinitiation 43S pour former le complexe de préinitiation 48S?

Answer 51

Des intéractions entre eIF4G et les facteurs d'initiation de la petite sous-unité recrutent le complexe de préinitiation 43S

Question 52

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 3 Vrai ou faux? Le déplacement de la petite sous-unité sur l'ARNm est un processus qui requiert de l'ATP.

Answer 52

Vrai

Question 53

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 3 Comment le codon start est-il reconnu?

Answer 53

Par pairage entre l'anticodon de l'ARNt initiateur et le codon start.

Question 54

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 3 Qu'arrive-t-il après la reconaissance du codon start, jusqu'au recrutement de la grande sous-unité?

Answer 54

1. La conformation du complexe 48S change : eIF1 est libéré et eIF5 change de conformation. 2. Cela stimule l'hydrolyse de la GTP par EIF2 3. eIF2 ne lie plus l'ARNt initiateur et est libéré de la petite sous-unité avec eIF5.

Question 55

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 4 Comment la grande sous-unité est-elle recrutée?

Answer 55

Sans eIF2, eIF5B se lie au complexe et stimule l'association de la grande sous-unité et la petite sous-unité.

Question 56

# Initiation de la traduction (eucaryote) - Étape 4 Pourquoi eIF5B est-il en mesure de lier les deux sous-unités?

Answer 56

Parce que les deux facteurs qui empêchait aux deux sous-unité de se lier ont été libéré (eIF1 et eIF5)

Question 57

# Initiation de la traduction (eucaryote) Quels facteurs auxiliaires sont homologues chez les eucaryotes et procaryotes?

Answer 57

IF1 et eIF1 : se lient au site A pendant l'initiation IF2 et eIF2+eIF5B : recrutement de l'ARNt initiateur + recrutement de grande-sous unité IF 3 et eIF1 : se lient tous les deux au site P et sont libéré après le pairage entre l'ARNt initiateur et le codon start.

Question 58

# Élongation de la traduction À quel moment la synthèse polypeptidique peut-elle débuter?

Answer 58

Dès que le ribosome est assemblé avec l'ARNt initiateur chargé dans le site P.

Question 59

# Élongation de la traduction Quels sont les trois évènements clés qui doivent être effectués pour avoir l'addition correcte de chacun des acides aminés?

Answer 59

1. Le bon aminoacyl-ARNt est chargé dans le site A du ribosome. 2. Un lien peptidique se forme entre l'aminoacyl-ARNt du site A et la chaîne peptidique attaché au peptidyl-ARNt du site P. (réaction peptidyl-transferase) 3. Le peptidyl-ARNt résultat du site A et son codon doivent être translocalisés au site P pour que le ribosome recommence le cycle..

Question 60

# Élongation de la traduction Quels sont les protéines responsables de contrôler les évènements lors de l'élongation? Comment améliorent-ils la vitesse et la précision du ribosome?

Answer 60

Les facteurs d'élongations, qui utilisent le GTP et l'hydrolyse pour améliorer la vitesse et la précision du ribosome.

Question 61

# Élongation de la traduction Quel est la différence majeure entre l'élongation chez les procaryotes et les eucaryotes?

Answer 61

Il n'y en a pas, les deux fonctionnent très similairement.

Question 62

# Élongation de la traduction À quoi sert EF-Tu? Expliquez son mécanisme en détail.

Answer 62

Escorter les aminoacyl-ARNt au ribosome : 1. Lorsque l'ARNt est chargé, EFtu se lie à son extrémité 3', ce qui masque l'acide aminé. Cela empêche la formation de lien peptique. La liaison est seulement possible lorsque EF-Tu est lié à un GTP 2. EF-Tu active son hydrolysation de GTP lorsqu'il s'associe avec le même domaine de la grande sous-unité qui active l'activité GTPase d'IF2. Il peut seulement hydrolyser le GTP si le match codon-anticodon est correct, dans quel cas EF-Tu est libéré du ribosome.

Question 63

# Élongation de la traduction Quel est le premier niveau de sélection permettant de déterminer si l'ARNt chargé est le bon?

Answer 63

Le pairage entre les bases de l'ARNt chargé et le codon du site A du ribosome.

Question 64

# Élongation de la traduction - méchanismes de vérification Quels sont les trois méchanismes permettant de sélectionner les bons ARNt lors de l'élongation?

Answer 64

1. Le ribosome utilise deux adénines adjacentes universellement conservées dans l'ARNr 16s pour vérifier l'intéraction codon-anticodon (paires non Watson-crick ne sont pas reconnues par les adénines) 2. Utilisation de l'activité GTPase de EF-Tu pour vérifier l'interaction codon-anticodon : GTPase ne peut avoir lieu seulement si l'anticodon et le codon sont correctement appariés. 3. Proofreading après libération de EF-Tu (mouvement de rotation qui dissocie les ARNt incorrectemen appariés)

Question 65

# Élongation de la traduction Par quoi est catalysée la formation de lien peptidique dans le centre peptidyl-transferase?

Answer 65

L'ARN 23S de la grande sous-unité.

Question 66

# Élongation de la traduction Donnez des preuves expérimentales que ARNr 23S catalyse la formation des liaison peptidiques

Answer 66

L'ARNr 23S purifié d'e. coli catalyse la synthèse du dipeptide N-acetylphenylalanine-phenylalanine, activité qui ne peut pas être due à la présence de protéine résiduelles car ARNr synthétisé montre aussi unactivité peptidyl transférase. L'activité peptidyltransférase est associé au domaine V : site actif de la peptidyl transférase entouré d'ARN.

Question 67

# Élongation de la traduction Une fois que la réaction peptidyl trasnférase est effectuée, qu'arrive-t-il à l'ARNt du site p?

Answer 67

L'ARNt du site P est déacétylée (n'est plus associée à un acide aminé) et la chaine polpypeptidique est lié à l'ARNt du site A.

Question 68

# Élongation de la traduction Que doit il arriver après la formation d'un lien peptide (peptidyl transférase) pour recommencer une ronde d'élongation? Comment appelle-t-on ce phénomène?

Answer 68

**La translocation :** L'ARNt du site P doit se déplacer au site E et l'ARNt du site A doit se déplacer au site P. L'ARNm doit se déplacer de trois nucléotides pour exposer le prochain codon.

Question 69

# Élongation de la traduction - translocation Quels sont les étapes de la translocation?

Answer 69

1. État hybride : l'ARNt du A (contient maintenant la chaine) préfère désormais le site P, et l'ARNt du P préfère maintenant le site E. Rotation de la petite sous-unité qui facilite la suite. 2. EF-G vient se lier au ribosome (avec un GTP lié à EF-G), et hydrolyse son GTP. Cela débloque le ribosome et les ARNt changent de position (comme des dominos) 3. Rotation en sens horaire de la petite sous-unité pour revenir à sa poisition originale.

Question 70

# Élongation de la traduction Comment EF-Tu et EF-G sont ils régénérés après une ronde d'élongation?

Answer 70

GDP a une affinité plus base à EF-G, ce qui fait que le GDP et le phosphate sont libéré de la molécule et que EF-G se relie automatiquement avec un GTP. Pour EF-Tu, une protéine est nécessaire : EF-Ts. C'est un facteur d'échange de GTP, qui permet de déplacer le GDP présent sur EF-Tu-GDP et le dissocier. Le GTP vient se placer sur le complexe et EF-Ts se fait lui-même dissocier.

Question 71

# Élongation de la traduction Quel est le coût total en NTP pour une ronde d'élongation? Expliquez dans quel contexte chacun des NTP concernés sont utilisés.

Answer 71

* 1 molécule d'ATP est consommé par l'aaRS en créant le lien acyle entre l'acide aminé et l'ARNt (nécessaire pour la formation du lien peptidique) * 1 molécule de GTP consommée lorsque ARNt est attaché au site A par EF-Tu (et en assurant que le bon codon-anticodon est en place) * 1 molécule de GTP est consommée lors de la translocation par EF-G. À noter que seulement 1 NTP est utilisé pour la formation du lien, alors que les deux autres sont utilisés pour assurer la précision et l'ordre des élevènements.

Question 72

# Élongation de la traduction Quels sont les noms des facteurs d'élongations chez les eucaryotes? À quel facteur sont-ils homologues?

Answer 72

eEF1 est homologue à EF-Tu eEF2 est homologue à EF-G

Question 73

# Terminaison de la traduction À quel moment s'arrête le cycle de l'élongation?

Answer 73

Dès que le site A devient occupé par un des trois codons stop

Question 74

# Terminaison de la traduction Par quoi sont reconnus les codons stop?

Answer 74

Par les facteurs de terminaisons (release factors)

Question 75

Comment agissent les facteurs de terminaisons?

Answer 75

Ils déclenchent l'hydrolyse du polypeptide du peptidyl-ARNt

Question 76

Quelles sont les classes de facteurs de rerminaisons et leurs différences?

Answer 76

Classe I : reconnaissent le codon stop et provoquent l'hydrolyse de la chaine peptidique de l'ARNt du site P (procaryotes ont deux facteurs de classe I : RF1 et RF2) Classe II : stimulent la dissociation des facteurs de classe I du ribosome après la libération de la chaine polypeptidique

Question 77

# Terminaison de la traduction Quels sont les facteurs de termainaison de classe I et de classe II chez les procaryotes et eucaryotes? Comment agissent-ils?

Answer 77

Procaryotes : * 2 facteurs de classe I, RF1 et RF2. RF1 reconnait UAG, RF2 reconnait UGA, et UAA est reconnu par les deux * 1 facteur de classe II : RF3 Eucaryotes * 1 facteur de classe I : eRF1, qui reconnait tous les codons * 1 facteur de classe II

Question 78

# Terminaison de la traduction Par quoi sont régulé les codons de classe II?

Answer 78

Par la liaison et l'hydrolyse d'un GTP, com EF-G, IF2 et EF-Tu

Question 79

# Terminaison de la traduction Comment les facteurs de terminaison sont-ils en mesure de reconnaitre les codons stop?

Answer 79

Ce sont des interactions entre les protéines et l'ARN qui régulent la reconaissance des codons stop (les facteurs de terminaisons sont composés entièrement de protéines) Il existe une séquence de trois acides aminés critiques pour la spécificité des facteurs de terminaison : "peptide anticodon"

Question 80

# Terminaison de la traduction Quelle est la séquence d'acide aminé de tous les facteurs de terminaison de classe 1 qui est essentielle pour la libération des polypeptides?

Answer 80

Glycine glycine glutamine (GGQ)

Question 81

# Terminaison de la traduction Vrai ou faux? Les facteurs de terminaison de classe I mimiquent fonctionellement les ARNt. Justifiez.

Answer 81

Vrai, étant donné la présence d'un anticodon peptidique qui interragit avec le codons stop et un motif GGQ qui se rend dans le centre de peptidyl transferase.

Question 82

# Terminaison de la traduction Comment le peptide est-il enlevé du ribosome?

Answer 82

Avec l'aide de RF3, le facteur de terminaison de classe II. RF3 se lie avec du GDP (affinité plus grande que GTP) et au ribosome de mannière à dépendre d'un facteur de classe I. Après la libération du facteur de classe I, il y a stimulation de libération du polypeptide qui induit un changement dans la conformation du ribosome. RF3 échange donc son GDP pour un GTP, ce qui forme une interaction à haute affinité avec le ribosome qui préfère l'était hybride de la translocation, et qui expusle le facteur de classe 1. Le RF3 s'associe avec le centre de la grande sous-unité et hydrolyse un GTP ce qui cause la libération du peptide

Question 83

# Terminaison de la traduction Après la libération de la chaine polypeptidique et des facteurs de terminaison, que doit-il arriver?

Answer 83

**Recyclage du ribosome :** Les ARNt et l'ARNm doivent être enlevés du ribosome et le ribosome doit se dissocier en grande et petite sous-unités.

Question 84

Comment le recyclage du ribosome est-il effectué chez les procaryotes?

Answer 84

Un facteur (**ribosome recycling factor**, facteur de recyclage du ribosome) est utilisé. Ce facteur coopère avec EFG et IF3 pour recycler les ribosomes après la libération d'un polypeptide.

Question 85

Expliquez en détail le fonctionnement d'un facteur de recyclage du ribosome (RRF).

Answer 85

RRF se lie au site A vide en imitant un ARNt. Il recrute EF-G-GTP au ribosome, et EF-G stimule la libération de l'ARNt non chargé du site P et du site E (de manière similaire à l'élongation) Les deux facteurs sont ensuite éjectés de la cellule avec l'ARNm.