Sélection naturelle Flashcards

1
Q

Qu’est-ce que la sélection naturelle

A

Mécanisme très lent. Changements significatifs des fréquences alléliques prend bien plus longtemps que la vie d’une personne. Possible observation si: La force de sélection est très forte, ou L’organisme a un temps de génération très court

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2
Q

C’est quoi la valeur adaptative

A

Caractère complexe même dans le cas d’un seul locus biallélique. Dominance parmi les allèles soumis à la sélection a des effets importants sur le résultat de la sélection. Les allèles délétères à l’état homozygote sont presque tous récessifs

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3
Q

Quels sont les résultats de la sélection

A

4 résultats possibles
p devient 1: fixation
p devient 0: disparition
p devient p barre : sélection équilibrée
p ne change pas
Les 4 sont possibles et le résultat dépend du lien de
dominance entre les allèles et des fréquences alléliques

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4
Q

Qu’est-ce que la dominance incomplète

A

0A1A2>A2A2 devient s>0
Le signe dans l’équation ci-dessous dépend donc de ph+q(1-h) :
toujours >0 quand 0

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5
Q

Quel est l’avantage hétérozygote

A
h<0 
A1A1A2A2
Si p très faible Dp>0,
p va augmenter. Si p très élevée Dp<0,
p va diminuer
p va tendre vers un équilibre où deltap=0
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6
Q

Quelle est l’infériorité hétérozygote

A

h>1
A1A1>A1A2w12 p barre )
p ne change pas si p = p barre

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7
Q

Comment mesurer la variation phénotypique adaptative

A

La sélection et l’adaptation jouent sur le phénotype: Utilité d’observer la variation génétique liée au phénotype. Le phénotype (P) est influencé par la génétique (G) et l’environnement (E). La variance du phénotype peut donc être divisée en variance génétique (VG) et environnementale (VE)

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8
Q

Qu’est-ce que la variation génétique additive

A

La variation génétique additive (VA ) est une mesure de la variance phénotypique parmi les individus directement liée au patrimoine génétique hérité

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9
Q

Quelle est la variance de la dominance

A

La variance de dominance (VD), les interactions entre les allèles d’un même locus, et la variance épistatique (VI), les interactions entre allèles de plusieurs loci, contribuent également à VG

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10
Q

Quels sont les problèmes d’estimation de la QST

A

La variance génétique entre les populations (VG,inter) doit être estimée selon le modèle du jardin commun sinon elle inclut aussi la plasticité phénotypique et des effets environnementaux. Sans l’expérience de jardin commun, on mesure en fait le PST (la variance phénotypique entre les populations). Même avec l’expérience de jardin commun, des effets génétiques non-additifs sont inclus dans le VG,inter. Très difficile d’estimer VA,intra

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11
Q

C’est quoi l’estimation de Va

A

VA est la composante de la variance génétique responsable de la ressemblance entre les parents et les descendants et qui est affectée par la sélection naturelle. Elle permet donc l’adaptation. VA peut être estimée à partir de la ressemblance entre les individus
apparentés. Souvent exprimée comme une fraction de la variation phénotypique nommée héritabilité (h2)

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12
Q

Que nous dit l’estimation de l’VA

A

Besoin d’une population très grande par rapport aux autres applications de la génétique des populations. Besoin de données généalogiques fiables et des marqueurs génétiques. Données phénotypiques souvent plus difficiles à collecter que les données génétiques. Les paramètres (variances et héritabilité) sont spécifiques des caractères et des populations. Très difficile de séparer les effets environnementaux et les effets maternels des effets génétiques. Si on peut estimer l’influence génétique sur un caractère, on ne sait toujours pas combien de gènes influencent ce caractère et leur importance relative

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13
Q

Qu’est-ce que la génétique des populations

A

Besoin d’un nombre limité de marqueurs neutres. Chaque marqueur peut être très polymorphique et informatif (A et H élevés). Positions des marqueurs dans le génome généralement inconnues. But: Description de la diversité de la population, parenté ou la structure génétique. Prend en compte des processus démographiques plutôt que la sélection et l’adaptation au niveau moléculaire. Regarde l’effet moyen de loci plutôt que chaque locus

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14
Q

Qu’est-ce que les génomiques des populations

A

Examine généralement de nombreux marqueurs (SNPs). Marqueurs peu polymorphiques et pas nécessairement neutres. Positions des marqueurs dans le génome généralement connues. But: Trouver des gènes qui sont importants pour l’adaptation. Prend en compte la sélection et l’adaptation au niveau
moléculaire. Examine les loci individuellement

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15
Q

C’est quoi le carte de liaison

A

Ensembles de marqueurs génétiques placés
à intervalles réguliers le long des chromosomes. Utilisées pour identifier les régions des chromosomes qui ont des gènes qui affectent la variation d’un caractère

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16
Q

Quels sont les gènes candidats

A

Gènes ayant une fonction connue dans un organisme
modèle et dont on peut supposer une fonction similaire
dans un autre organisme. En alignant les séquences connues des gènes candidats, les éléments conservés peuvent être identifiés et utilisés comme des cibles pour des amorces de PCR. Séquençage du gène candidat dans un nouveau taxon et on cherche des régions polymorphiques qui peuvent être utilisées
comme des marqueurs (i.e. SNPs). Ces marqueurs peuvent être des QTN potentiels ou liés à un
polymorphisme fonctionel

17
Q

C’est quoi les valeurs aberrantes

A

Si tous les loci ne sont influencés que par des effets démographiques (dérive et migration), tous les loci devraient avoir le même niveau de différenciation basé sur le FST. Si un locus est soumis à la sélection, on peut observer des différences. Si un même allèle ou génotype est toujours favorisé, on devrait observer une faible différenciation (faible FST) de ce locus par rapport aux autres loci. Si différents allèles ou génotypes sont favorisés dans différentes
populations, on devrait alors avoir une différenciation importante (FST élevé). Si les hétérozygotes sont favorisés, on devrait avoir un FIS faible. Le profil des statistiques F sur de nombreux loci peut nous permettre d’identifier les loci influencés par la sélection
puisqu’ils vont avoir des valeurs aberrantes par rapport à la distribution des loci neutres