Taxonomie Animale Flashcards

(93 cards)

1
Q

Qu’est-ce que la taxonomie?

A

Branche de la bio cherchant à décrire les organismes vivants et à les regrouper en taxons afin de les classer et les reconnaître.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Quelle est la science qui organise le classement des taxons et leurs relations?

A

La systématique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Quel est l’objectif de la taxonomie?

A

Distinguer les espèces actuelles et les arranger dans un ordre hiérarchique.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

À quoi sert la classification en taxons?

A

À reconstituer les relations évolutives et à construire des arbres phylogénétiques.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

À quoi sert la description d’organismes?

A
  • Décrire et nommer de nouvelles espèces.
  • Distinguer les espèces entre elles.
  • Créer des outils d’identification.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Quels types de recherches sont faits en taxonomie?

A
  • Recherche en conservation de la biodiversité (avec des listes d’espèces)
  • Science citoyenne.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Quels sont les concepts de base de l’utilisation des clés d’identification?

A

1- La clé n’est pas universelle, donc fonctionne dans un contexte défini.

2- Pas de limites au nombre de taxon inclus.

3- Suivre l’ordre numérique de la clé.

4- Critères dichotomiques morphologiques (2 par catégorie)

5- Ne représente pas la classification/relations évolutives des organismes.

6- Prioriser les critères de même catégorie et selon le contexte.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Quelles sont les deux méthodes de construction d’un arbre phylogénétique?

A

Cladistique et phénétique

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Quels sont les grands principes de la classification cladistique?

A
  • Basée sur la proximité évolutive avec un ancêtre commun présumé.
  • Cladistique = reflet de l’évolution, pas du degré de ressemblance.
  • En perpétuel changement selon les nouvelles informations.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Qu’est-ce qu’un noeud en classification cladistique?

A

Point entre deux branches signifiant les innovations spécifiques de l’ancêtre commun présumé par rapport au design de base.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Quelles sont les innovations pertinentes à utiliser comme noeud?

A

Les innovations fortes, c’est-à-dire celles nécessitant plusieurs étapes évolutives et ayant une importante utilité évolutive.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Qu’est-ce que le principe de parcimonie?

A

La classification cladistique la plus probable est celle qui considère le moins de changements évolutifs.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Sur quoi est fondé le principe de parcimonie?

A

Sur le fait que les grosses évolutions drastiques sont très improbables et prennent beaucoup de temps, et donc qu’il faut s’attarder aux étapes graduelles.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Qu’est-ce qu’un caractère homologue?

A

Un caractère issu de la même structure de base d’un ancêtre commun, mais qui se présente différemment d’une espèce à l’autre.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Qu’est-ce qu’un caractère analogue?

A

Un caractère similaire entre deux espèces qui n’ont pas d’ancêtre commun. Ce caractère est apparu par convergence évolutive et est souvent superficiel.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Comment débusquer des caractères analogues?

A

En étudiant attentivement le plan d’organisation des membres/organes.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Qu’est-ce qu’un groupe monophylétique?

A

Un groupe contenant tous les descendants d’un ancêtre commun.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Qu’est-ce qu’un groupe paraphylétique?

A

Un groupe comprenant une espèce ancestrale et seulement une partie de ses descendants.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Quelles sont les étapes de l’analyse cladistique?

A

1- Délimiter le groupe d’intérêt.
2- Définir un groupe de référence.
3- Déterminer toutes les combinaisons d’arbres phylogénétiques possibles.
4- Choisir les caractères utilisées et identification de l’état ancestral et dérivé. (ancestral = 0, dérivé = 1)
5- Coder une matrice avec ces caractères.
6- Évaluer chaque arbre pour trouver celui avec le moins d’étapes (principe de parcimonie).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Qu’est-ce que le principe de base de la classification phénétique?

A

La comparaison de plusieurs caractères doit refléter l’évolution et la phylogénie.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Statistiquement, que permet la classification phénétique?

A

Permet d’agréger un grand nombre de mesures en un indice global de similarité phénétique.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Quelles propriétés phénotypiques peuvent servir à la classification phénétique?

A

N’importe quelle propriété mesurable, que ce soit la longueur d’un os, des couleurs, un nombre de chromosomes, etc.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Qu’est-ce qu’une matrice de distance?

A

Tableau présentant les pourcentages de différences entre les taxons.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Comment construire une matrice de distance?

A

1- Déterminer les deux taxons avec le moins différences.
2- Créer un nouveau groupe formé des deux taxons précédents pour recalculer une nouvelle matrice de distance.
3- Recommencer l’étape 1 avec la nouvelle matrice.
4- Construire l’arbre phylogénétique en fonction des différences de pourcentage observées.
5- Recommencer jusqu’à ce qu’il ne reste plus de taxons à comparer.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Qu'est-ce que la phénétique ne prend pas en compte?
- La signification évolutive des caractères. - Les convergences et groupes paraphylétiques.
26
Quel est le principe de base de la taxonomie évolutive?
- La cladistique peut mener à des classifications non-intuitives. - Marquée par des percées adaptatives.
27
Qu''est-ce qu'une percée adaptative?
Une évolution rapide de caractères et de nouvelles adaptations dues à une nouvelle niche écologique.
28
Comment procède-t-on à la taxonomie évolutive (méthode)?
Incorporation des méthodes et principes de la cladistique et de la phénétique.
29
Quels sont les avantages de la taxonomie évolutive?
- éviter les conclusions inattendues de la cladistique - Éviter le puritanisme de la cladistique - Pratique pour la vulgarisation scientifique
30
Quel est le principal désavantage de la taxonomie évolutive?
Puisque basée sur les percées adaptatives, peut créer des groupes paraphylétiques.
31
Qu'est-ce qu'un caractère taxonomique?
Attribut d'un membre d'un taxon par lequel il diffère d'un membre d'un autre taxon. Permet de discriminer les taxons.
32
Comment choisir un caractère taxonomique?
Le caractère doit correspondre avec la signification évolutive désirée, l'information qu'il procure, ou sa capacité de résolution.
33
Quelles sont les grandes familles de caractères?
- Morphologiques - Écologiques - Biochimiques et moléculaires.
34
Qu'est-ce que les caractères morphologiques?
Données quantitatives ou qualitatives référant à l'apparence de l'organisme (anatomie, développement embryonnaire)
35
Qu'est-ce que les caractères écologiques/éthologiques?
Caractéristiques faisant référence à la niche écologique, au comportement, etc. (ex. reproduction, régime alimentaire)
36
Qu'est-ce que les caractères biochimiques et moléculaires?
Caractéristiques telles que la structures des protéines, des acides nucléiques, etc.
37
Qu'est-ce que la séquence moléculaire?
Analyse moléculaire permettent de déterminer l'ordre d'enchainement des nucléotides d'un fragment d'ADN donné afin de comparer le % de différences entre des taxons.
38
Pour quelle analyse (phénétique ou cladistique) la séquence moléculaire est-elle plus appropriée?
Pour l'analyse phénétique.
39
Quelles sont les propriétés des données moléculaires?
1- Caractères simples à analyser et jamais subjectifs. 2- Offrent une grande quantité d'informations. 3- Indépendance des caractères étudiés. 4- Poids égal entre les caractères, c'est-à-dire que toutes les mutations ont la même importance.
40
Pourquoi les données moléculaires ne sont-elles pas la solution rêvée en taxonomie?
- Les caractères morphologiques sont plus précis que ceux moléculaires (surtout entre les espèces à risque d'hybridation). - La génétique ne résout pas la phylogénie de certaines espèces (par exemple les becs croisés). - Ont souvent besoin de s'appuyer sur la morphologie classique pour confirmer certains résultats. - Les molécules évoluent à des vitesses différentes, il faut donc porter attention à celles utilisées selon le type d'analyse.
41
Qu'est-ce que l'appariement reproductif?
Quand un individu choisi un partenaire reproductif appartenant au sexe opposé de la même espèce.
42
Quel type de molécule utiliser quand on veut étudier un taxon ancien?
Une molécule à évolution lente.
43
Quel types de molécule utiliser quand on veut étudier un taxon récent?
Une molécule à mutation rapide, tel que l'ADN mitochondrial.
44
Quelle est l'utilité de l'ADN mitochondrial?
Très utilisée pour la recherche phylogénétique, car c'est une petite molécule se transmettant par la mère et donc qui accumule les mutations de la mère.
45
Qu'est-ce que la spéciation allopatrique?
Spéciation permise par une barrière géographique.
46
Quelles sont les 4 concepts d'espèce?
1- Concept d'espèce phénétique (selon la morphologie) 2- Concept d'espèce biologique 3- Concept d'espèce par reconnaissance mutuelle 4- Concept d'espèce écologique
47
Sur quoi est basé le concept d'espèce phénétique?
Basé sur la similarité phénétique (des caractères). Une espèce est composée d'individus suffisamment semblables entre eux mais différents des autres espèces.
48
Quel est le défaut du concept d'espèce phénétique?
Les critères n'ont pas de base cohérente, ce sont souvent des décision subjectives et arbitraires.
49
Sur quoi est basé le concept d'espèce biologique?
Basé sur la capacité d'organismes interféconds de procréer entre eux, mais pas avec les autres espèces.
50
Quels sont les mécanismes d'isolement reproductif?
- Isolement mécanique (incompatibilité génitale) - Létalité des hybrides (ne survivent pas ou sont infertiles) - Isolement éthologique (comportements différents)
51
Sur quoi est basé le concept d'espèce par reconnaissance mutuelle?
Basé sur les systèmes de reconnaissance de partenaires sexuels afin de s'engager dans le reproduction. Correspond à une extension du concept biologique de l'espèce.
52
Sur quoi est basé le concept d'espèce écologique?
Basé sur le regroupement d'organismes adaptés à une niche particulière dans la nature (pressions externes/compétition et partage des ressources permettent de constituer des ensembles phénétiques/espèces).
53
Comment s'effectue la spéciation selon le concept d'espèce écologique?
De la compétition est causée par des pressions de l'environnement ou le partage des ressources, ce qui mène à de l'exclusion compétitive. L'exclusion compétitive pousse à une pression de sélection menant à des disparitions ou à un déplacement de caractères formant éventuellement une nouvelle espèce.
54
Qu'est-ce qu'un anneau d'espèces?
Situation où plusieurs espèces s'hybrident entre elles puisque géographiquement interconnectées, avec 2 formes extrêmes dans la distribution ne pouvant pas s'hybrider malgré le fait qu'elles coexistent. (penser à un cycle interrompu) Crée plusieurs problèmes en taxonomie.
55
Qu'est-ce que le polymorphisme trophique?
Quand une même espèce a plusieurs formes d'utilisation de la chaine trophique, menant à des subtilités morphologiques liées à leur régime alimentaire.
56
Que représente le polymorphisme trophique d'un point de vue évolutif?
1ère étape de l'évolution d'une espèce/spéciation, car représente un début d'isolement reproductif et de différentiation génétique. - Spéciation sympatrique.
57
Qu'est-ce que la spéciation sympatrique?
Spéciation se déroulant à l'intérieur d'une même zone géographique.
58
Quel est le principal problème taxonomique avec les jeunes espèces?
Elles n'ont pas suffisamment de spéciation, faisant en sorte qu'elles sont encore capables de s'hybrider entre elles, rendant flou le concept d'espèce.
59
Qu'est-ce qu'une sous-espèce?
Ensemble d'individus isolés évoluant en parallèle de l'espèce de référence, tout en gardant des caractéristiques communes. - Capacité de se reproduire entre elles.
60
Qu'est-ce que l'inflation taxonomique?
Problème découlant du fait que trop de sous-espèces ou de groupes mal définis sont élevés au rang d'espèce, causant une augmentation importante dans la nombre d'espèces.
61
Quels problèmes cause l'inflation taxonomique?
- Une perte de crédibilité, car inflation n'est pas basée sur une réalité biologique. - Beaucoup basé sur des données moléculaires et génétiques, sans se fiers à d'autres données.
62
Quelles sont les informations à inclure dans le traitement descriptif d'une nouvelle espèce?
- Proposition d'un nom latin (nomenclature binomiale) suivi de la mention sp. nov. - Proposition d'un nom anglais - Détails sur l'holotype et les paratypes. - Diagnose de la nouvelle espèce. - Tableau comparatif des principales caractéristiques. - Observations sur l'habitat, comportement, reproduction, écologie. - Étymologie.
63
Qu'est-ce qu'un holotype?
1er individu découvert/capturé d'une nouvelle espèce, et servant à faire sa description.
64
Qu'est-ce qu'un paratype?
Les prochains individus capturés de la nouvelles espèces servant à confirmer l'holotype.
65
Qu'est-ce qu'une diagnose de nouvelle espèce?
Les caractéristiques permettant de différencier la nouvelle espèce des autres taxons apparentés. (desciption qualitative de l'espèce).
66
Quelle est la principale règle de nomenclature scientifique?
Utiliser la nomenclature binomiale, où le premier nom est générique, et où le deuxième est spécifique.
67
Qu'est-ce que le principe de priorité?
En cas de conflit sur les noms d'espèces, le nom le plus ancien a priorité.
68
Quelles organisation règle les cas litigieux de nomenclature?
L'ICZN, la commission de nomenclature.
69
Est-il impossible de faire changer le nom d'une espèce? Pourquoi?
Non, pas impossible! Mais, on a besoin de justifications scientifiques qui doivent être approuvées par plusieurs comités.
70
Dans quels contextes la validation de noms d'espèce est-elle nécessaire?
- Changements de noms fréquents - Guides d'identification désuets - Guides d'identification vulgarisés - Utilisation de régionalismes
71
Comment retracer les bon noms d'espèces?
1- Vérification rapide avec des outils instinctifs 2- Valider le nom français avec la liste de la faune vertébrée du Québec. 3- Valider le nom scientifique dans des bases de données spécifiques à chaque groupe scientifique.
72
Quel outils utiliser pour valider le nom scientifique des plantes et comment fonctionne-t-il?
Vascan. Possibilité de recherche avec noms vernaculaires en français ou anglais. Présente clairement les autres noms vernaculaires et les changements de nom.
73
Quel outils utiliser pour valider le nom scientifique des mammifères et comment fonctionne-t-il?
Mammal Diversity Database. Pour chercher, on doit déjà connaitre le nom scientifique de l'espèce. Donne les nom scientifique complet, le nom commun anglais et la liste des anciens noms.
74
Quel outils utiliser pour valider le nom scientifique des amphibiens et comment fonctionne-t-il?
AmphibiaWeb. Recherche par noms communs en anglais. Possibilité de n'écrire qu'une partie du nom et de fournir une location. Fournit beaucoup d'informations sur chaque espèce.
75
Quel outils utiliser pour valider le nom scientifique des oiseaux et comment fonctionne-t-il?
Checklist of bird species. Recherche de noms communs en anglais et en français. Cliquer sur le lien Avibase pour avoir le nom commun complet. Aussi, e.bird est pratique!
76
Pourquoi est-ce difficile d'appliquer la taxonomie en contexte légal?
Car il n'existe pas de concept d'espèce précis. Ce n'est qu'un gradient, mais cette explication est rarement utile ou acceptée dans le volet légal.
77
Quelle est la solution aux problèmes légaux de la taxonomie?
Établir une définition d'espèce inclusive et sans ambiguïté qui inclut les spécificités des groupes taxonomiques.
78
Quels sont les concepts fréquemment retrouvés dans la description légale d'une espèce?
- Aspect faunique et logistique - Inclus souvent les sous-espèces, variétés, etc. - unité biologique identifiable comme différente d'une autre.
79
Définition large de l'espèce juridique?
Unités biologiques irremplaçables présentant des différences taxonomiques, une différenciation génétique et des évidence d'adaptations locales.
80
Qu'arrive-t-il quand on a pas assez de preuves pour démontrer qu'une population est une espèces distincte?
Le simple fait d'être en doute est une réponse acceptée, puisqu'on ne veut pas prendre de risques.
81
Quelles sont, en ordre, les catégories de statut selon la LEP (Loi des Espèces en Péril du Canada)
- Non en péril - Préoccupante - Menacée - En voie de disparition - Disparue
82
Quel est l'objectif de la loi sur les espèces en péril?
- Empêcher la disparition des espèces indigènes. - Prévoir le rétablissement des espèces en péril - Favoriser la gestion des autres espèces pour qu'elles ne soient pas en péril.
83
Quel est l'objectif de la conservation de la biodiversité?
Maintenir le plus grand nombre d'espèces possible.
84
Quelle sont les alternatives au concept d'espèce en conservation?
-L'isolement phylogénétique - L'unicité taxonomique - Le parcours génétique unique
85
Comment calcule-t-on l'efficacité d'un effort de conservation?
( Bénéfice x Unicité taxonomique x Probabilité de succès ) / Coûts
86
Qui détermine l'unicité taxonomique, les coûts et la probabilité de succès.
Unicité = Taxonomiste Coûts = Économiste Prob. de succès = Biologiste
87
Pourquoi les applications d'identification, tel que iNaturalist ou Merlin, ne sont pas valables d'un point de vue de collecte de données scientifique ?
Car ces applications utilisent des pixels et des probabilités, par les méthodes établies utilisées par les vrais biologistes (ex. caractères physiologiques établis). Ainsi, toute identification, pour être valide, doit être vérifiée par un humain.
88
Quel est le rôle du statisticien en phylogénie?
- Analyse plus poussée des données pour établir leur validité d'un point de vue statistique.
89
Pourquoi les espèces apparentées ne représentent pas des unités d'informations indépendantes?
Car elles se ressemblent trop pour que leurs différences soient aléatoires.
90
Quel est le principal problème statistique en biologie?
Les données biologiques ne sont jamais indépendantes, très peu normales et les échantillons sont souvent très petits.
91
Quelle méthode employons-nous pour corriger le manque d'indépendance des espèces?
Des méthodes statistiques corrigeant pour la phylogénie.
92
Quelle est l'utilité des musées pour les taxonomistes?
- Collections de spécimens - Permettent d'effectuer des mesures, des descriptions, d'identifier des espèces, tester des hypothèses.
93
Pourquoi les collections des musées sont-elles menacées?
- Manque de financement dans la recherche l'entreposage.