Traffic Flashcards

1
Q

Quelles sont les deux voies principales du traffic intracellulaire?

A

1) Endosomale
2) De sécrétion

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Q

Grossièrement, que comprend la voie endosomale?

A

L’endocytose, le recyclage et la dégradation.

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3
Q

Grossièrement que comprend la voie de sécrétion?

A

Biosynthèse et exocytose

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4
Q

Vrai ou faux, la membrane plasmique est impliqué dans les deux voies de trafic intracellulaire?

A

Vrai. Elle est le compartiment donneur (endocytose) et le compartiment cible (exocytose)

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5
Q

Vrai ou faux, le cytoplasme n’est pas très dense?

A

Faux. Extrêmement dense.

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6
Q

Que permet la formation et la fusion de vésicules?

A

Le transport intracellulaire.

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7
Q

Comment appelle t’on la formation de vésicules à partir de la MP?

A

Endocytose (internalisation)

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8
Q

Comment appelle t’on la fusion de vésicule avec la membrane plasmique?

A

Exocytose (sécrétion)

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9
Q

Lors de l’endocytose où de l’exocytose, le feuillet côté lumière est équivalent à quel feuille de la MP?

A

Le feuillet externe.

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10
Q

Quels sont les trois mécanismes d’internalisation à la MP et qu’est-ce qu’ils ciblent?

A

1) Phagocytose ; particules larges
2) Macropinocytose; liquide, non spécifique
3) Endocytose; particules moyennes petites

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11
Q

Nomme un synonyme d’endocytose?

A

Micropinocytose

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12
Q

Quels sont les trois types d’endocytose?

A

1) Dépendante à la Clathrine
2) Dépendante à la cavéoline
3) Indépendante à la clathrine et à la cavéoline

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13
Q

Comment est-ce qu’un vésicule est formé durant la phagocytose?

A

Formation de pseudopodes (ACTINE), qui vont “manger” la particule

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14
Q

Quel est le rôle des phosphatylserines dans la phagocytose?

A

Agissent comme un signal qui induit la phagocytose des corps apoptotiques.

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15
Q

De quoi dépend la macropinocytose?

A

De l’actine

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16
Q

Par quelle protéine est activé la macropinocytose?

A

Ras-GTP (voie Pl3K…) Bonus

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17
Q

Quelles sont les étapes de l’endocytose dépendante à la clatherine?

A

1) Recrutement de clatherine
2) Formation d’un puit mantelé
3) Scission du vésicule mantelée
4) Perte du manteau de clatherine

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18
Q

Comment est-ce que la clathrine est recrutée?

A

Elles sont attachées à des récepteurs de chargements liés à leur chargement.

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19
Q

De quelle forme est la clathrine dans le cytosol?

A

En forme de triskèle

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20
Q

Par quoi est médiée la scission?

A

Par la dynamine et aidée par l’actine.

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21
Q

Quelle molécule est hydrolyser lors de la scission?

A

GTP

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22
Q

Quelle molécule est hydrolysée lors de la perte du manteau?

A

ATP

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23
Q

Vrai ou faux; il existe différents types de manteaux dépendant du type de membrane donneuse?

A

Vrai (ie: COPI, COPII)

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24
Q

Quelle est la grosse différence entre endocytose dépendant à la clathrine et endocytose dépendant à la cavéoline?

A

Vésicules plus petits

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25
Q

Comment appelle t’on les vésicules formés par la cavéoline?

A

Cavéolae

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26
Q

Comment se forme les calveolae?

A

La calvéoline (prot membranaire) s’associe avec les radeaux lipidiques (donc présence de PL, SL et chol.)

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27
Q

Qu’est-ce qu’un endosome?

A

Une vésicule entourée d’une simple membrane.

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28
Q

Comment est-ce qu’un endosome précoce peut maturer en endosome tardif?

A

En devenant de plus en plus acide

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29
Q

Quelle est la fonction de l’endosome précoce?

A

Tri et recyclage

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30
Q

Quelle est la fonction de l’endosome tardif?

A

Dégradation

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31
Q

Qu’est-ce que l’endosome recycle?

A

Il va trier les récepteurs et leur contenu et recycler les récepteurs à la MP.

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32
Q

Vrai ou faux; les lysosomes sont acides?

A

Vrai (pH~5)

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33
Q

Quels types d’enzymes retrouvons nous dans un lysosome?

A

Hydrolases (nucléases, protéases…)

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34
Q

Vrai ou faux: les hydrolases sont activés dans le cytosol?

A

Faux, ils sont actifs seulement à bas pH donc pas avant d’entrer dans un lysosome mature.

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35
Q

Quel est le site de dégradation du système endomembranaire?

A

Les lysosomes

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36
Q

D’où proviennent les exosomes?

A

Système endosomale: ils sont libérés lorsque les corps multivésiculaires (MVB) fusionnent avec la MP.

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37
Q

Le bourgeonnement des exosomes se fait où?

A

Dans les endosomes tardifs. (ce qui crée des MVB)

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38
Q

Quelles sont les trois sources de matériel pouvant se rendre au lysosome?

A
  1. Endocytose
  2. Phagocytose
  3. Autophagie
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39
Q

Qu’est-ce que l’autophagie?

A

C’est un mécanisme qui capture la molécule problématique entre deux membranes.

40
Q

Où peut se dérouler l’autophagie?

A

Dans le cytosol

41
Q

Quelles sont les étapes de l’autophagie?

A
  1. Nucléation
  2. Extension
  3. Maturation
  4. Fusion
42
Q

Qu’est-ce qu’un autophagosome?

A

C’est le vésicule formé des organelles, de cytosol entre les deux membranes.

43
Q

Via quoi sont formés les autophagosomes?

A

Via les phagophores

44
Q

La fusion autophalgique se fait entre quoi et quoi? Et quel est le résultat?

A

Entre l’autophagosome et le lysosome et donne l’autophagolysosome.

45
Q

A quoi sert l’autophagie dans une cellule?

A
  1. Maintenir l’homéostasie
  2. Promouvoir la survie en cas de deprivation de nutriments
46
Q

Explique rapidement comment l’autophagie peut répondre à la deprivation de nutriments?

A

Lorsqu’on mange moins, nos cellules reçoivent moins de nutriments.

Il y a détection de cette baisse et stimulation de lautophagie pour aller chercher des ÀA et des AG pour faire de la synthèse de protéine et de l’ATP.

47
Q

Quelles sont les caractéristiques d’un peroxysomes?

A
  1. Présent dans toutes les c eucaryotes
  2. Ressemble au lysosome
  3. Organite sphérique
  4. Simple membrane
  5. Important pour la detoxification
48
Q

Quel est le rôle principal des peroxysomes

A

Oxydation des acides gras

49
Q

Que permet le pH légèrement plus élevé dans l’endosome précoce?

A

La dissociation possible du ligand et de son récepteur. (Permet le recyclage de ce dernier)

50
Q

Par quelles protéines transmembranaires se fait la fusion des membranes?

A

V-SNARE (sur le vesicule)
T-SNARE (target cell)

51
Q

Pourquoi les complexes v- / t- SNARE sont hydrolyser?

A

Pour pouvoir recycler les composantes

52
Q

Quelle autre protéine est nécessaire pour appareiller Le vésicule à la membrane?

A

RAB-GTP

53
Q

Vrai ou faux; GEF active RAB?

A

Vrai, il échange son GDP pour un GTP.

54
Q

Vrai ou faux; GAP désactive RAB

A

Vrai; il phosphoryle son GTP en GDP

55
Q

Comment appelle t’on les phosphadidylinositol phosphorylés?

A

Les phosphoinositides

56
Q

A quoi servent les phosphoinositides?

A

À distinguer les compartiments, puisqu’elles sont différentes sur les différentes membranes.

57
Q

Quel RE a un réseau de tubules?

A

REL

58
Q

Quel RE a un réseau de citerne?

A

RER

59
Q

Quels sont les rôles du REL

A
  1. Synthèse lipidique
  2. Réservoir de Ca
60
Q

Quels sont les rôles du RER?

A
  1. Synthèse protéique
  2. Repliement des protéines
  3. Contrôle de qualité des protéines
  4. Glycosylation des protéines
61
Q

Comment produire des protéines destinées à être sécrétées hors de la c ou à être insérer dans la MP?

A

Grâce à une “séquence signal” N-Terminal.

62
Q

Comment appelle t-on un sequence signal?

A

Signal peptide / etiquette

63
Q

Comment fonctionne le séquencé signal?

A

Dirige le ribosome vers le RE

64
Q

Quelle est la différence entre les ribosomes libres et ceux du RE?

A

Les ribosomes libres vont coder les protéines cytosoliques (ou nucléaires ou mitochondriales)

Alors que les ribosomes du RE vont coder les protéines destinées à être sécrétées ou transmembranaires

65
Q

Vrai ou faux; il existe un pool commun de sous-unités ribosomiques dans le cytosol?

A

Vrai

66
Q

Comment se déroule la translocation co-traductionnelle au RER?

A
  1. La séquence signal amène les ribosomes chevauchant l’ARNm à la surface du RE
  2. La protéine qui se forme s’allonge dans la citerne du RER grâce au translocon
  3. La séquence signal est clivée par un peptidase
  4. Les modifications se font au fur et à mesure sur la protéine (glycosylation, contrôle de qualité…)
67
Q

Qu’est-ce qui distingue les protéines transmembranaires des autres protéines lors de la traduction dans le RER?

A

Elles ont une séquence hydrophobe de départ de transfert et une d’arrêt de transfert, permettant d’avoir une partie interne et une partie externe.

68
Q

A quoi sert le glycocalyx retrouvé sur certaines protéines transmembranaires?

A

Protection chimique
Reconnaissance immunitaire

69
Q

Quels sont les deux mécanismes de glycosylation et où se passent-ils?

A

N-Glycosylation (RE)

O-Glycosylation (AG)

70
Q

A quoi sert le contrôle de qualité et où se passe t’il?

A

S’assurer que les protéines sont bien repliées.

Dans la lumière du RE

71
Q

Où vont les protéines correctement repliées?

A

Vers AG

72
Q

A quoi servent les chaperonnes calnexin?

A

Retenir les protéines mal repliées.

73
Q

Qu’est-ce que la UPR?

A

“Unfolded protein response”

74
Q

A quoi sert la UPR?

A

Va augmenter la transcription des gènes de chaperons (calnexine).

Cela va augmenter la quantité de RE.

75
Q

Décrire grossièrement la UPR.

A
  1. IRE1 va être activé par la protéine mal pliée
  2. Va activer XBP1
  3. XBP1 est un facteur de transcription qui va augmenter la capacité de synthèse de chaperons
76
Q

Qu’est-ce qui arrive aux protéines qui sont ANORMALEMENT repliées?

A

Signal puis broyées dans le proteasome

77
Q

Quelle est la porte d’entrée de la voie de sécrétion?

A

Le RE

78
Q

Lors de la translocation co-traductionnelle, la protéine va prendre une forme secondaire?

A

Oui

79
Q

Quels sont les trois réseaux de l’appareil de Golgi?

A

Cis
Médian
Trans

80
Q

Comment appelle-t-on l’espace entre le RE et le premier réseau de l’appareil de Golgi?

A

Compartiment intermédiaire RE-Golgien (ERGIC)

81
Q

Quelle est la direction du transport antérograde?

A

RE —> ERGIC

82
Q

Quelle est la direction du transport rétrograde?

A

AG —> ERGIC —> RE

83
Q

Quelles molécules sont responsable de former les vésicules nécessaires au transport antérograde? Au transport rétrograde?

A

COPII
COPI

84
Q

Qu’est-ce qu’un cluster tubulo-vestibulaire?

A

?

85
Q

Comment se déplace le cluster tubulo-vestibulaire?

A

Sur des MT a l’aide de protéines motrices (kinesine et dyneine)

86
Q

Quelle séquence signal permet à une protéine de retourner au RE par transport rétrograde?

A

KDEL

87
Q

Vrai ou faux; le transport rétrograde peut se faire d’un réseau golgien a un autre?

A

Vrai

88
Q

Quels sont les rôles de l’appareil de Golgi?

A
  1. Maturation des protéines du RER
  2. Étiquetage des protéines
  3. Triage dans des vésicules de sécrétion
89
Q

Comment vont cheminer les vésicules de sécrétion entre l’AG et la membrane plasmique?

A

Le long de MT grâce à des protéines motrices (kinesine, dyneine)

90
Q

Vrai ou faux; la
Glycosylation commence dans l’appareil de Golgi?

A

Faux, elle commence dans le RE puis se termine dans l’AG

91
Q

Qu’est-ce que la sécrétion constitutive?

A

Protéines solubles sécrétées en permanence.

92
Q

Qu’est-ce que la sécrétion régulée

A

Protéines sécrétoires

93
Q

Où se fait la sécrétion régulée?

A

Cellules sécrétoires

94
Q

Ou se fait la sécrétion constitutive?

A

Toutes les c

95
Q

Où se fait le tri (entre sécrétions)?

A

Au niveau du réseau trans Golgien

96
Q

Comment se fait le transport endosomale dans les c polarisées (pole apical et pôle basal)

A

Par transcytose