Transcripción 2

Question 1

Papel de la TRCF

Answer 1

TRCF desplaza la polimerasa detenida y recluta las enzimas de reparación necesarias, específicamente la endonucleasa Uvr[A]BC, que se encarga de reparar la lesión en el DNA.

Question 2

Tipos de terminaciones en bacterias

Answer 2

1. dependientes de Rho
2. independientes de Rho

Question 3

Explicar las terminaciones dependiente de Rho

Answer 3

Necesitan SITIOS RUT para que el factor rho
pueda adherirse y favorecer la separación de la polimerasa del ADN.

Question 4

Explicar las terminaciones independiente de Rho

Answer 4

+ “terminaciones intrínsecas”
+ no requiere de sitios o proteínas para actuar
+ Depende de secuencias específicas en el RNA que forman estructuras de tallo-asa y secuencias ricas en A:T, causando la disociación de la RNA polimerasa sin la necesidad de factores adicionales.

Question 5

los 6 elementos de reconocimiento del promotor eucariota

Answer 5

1. ER TFIIB
2. Elemento (o caja) TATA
3. Iniciador (Inr)
4. E. promotores correinte abajo (DPE)
5. DCE
6. MTE, motif ten element

Question 6

5 elementos adicionales corriente arriba

Answer 6

1. E. promotores proximales
2. Secuencias activadoras corriente arriba (UAS)
3. amplificadores
4. silenciadores
5. limítrofes y aislantes

Question 7

Cuales son los factores transcripcionales involucrados?

Answer 7

1. TFIID
2. TAFs
   + TFIIA
   + TFIIB
   + TFIIF
   + TFIIH
   + TFIIE

Question 8

Qué contiene el FT TFIID?

Answer 8

1. TBP (TATA Binding Protein)
2. TAFs (TBP Associated Factors)

Question 9

Qué es la TBP (TATA Binding protein)?

Answer 9

+ subunidad de TFIID que se une a la caja TATA del promotor
+ se une al surco menor del ADN, induciendo una deformación en el ADN sin separar las cadenas, lo que ayuda a posicionar correctamente la RNA pol II y otros factores de transcripción.

Question 10

Qué son los TAFs (TBP Associated Factors)?

Answer 10

Proteínas asociadas a TBP que ayudan a reconocer otros elementos del promotor, como el Inr (Iniciador), DPE (Downstream Promoter Element) y DCE (Downstream Core Element).

Question 11

TFIIA

Answer 11

controla la unión de TBP al ADN y permite a TFIID reconocer la región que se extiende hacia el extremo 5’.

Question 12

TFIIB

Answer 12

se une de manera adyacente a TBP, en la secuencia
de promotor basal BRE y proporciona mayor sitio de anclaje para la RNA pol II

Question 13

TFIIF

Answer 13

permitir la unión de la ARN pol II al complejo de transcripción.

Question 14

TFIIH

Answer 14

Tiene función de helicasa y también permite el
anclaje de la RNA pol II.

Question 15

TFIIE

Answer 15

factores transcripcionales basales o generales

Question 16

Cuando ocurre el escape del promotor eucariota?

Answer 16

Después de etapa abortiva

Question 17

Pasos del escape del promotor eucariotico

Answer 17

1. Hidrolisis del ATP
2. Fosforilacion de la polimerasa

Question 18

Que contiene la subunidad grande de la Pol II?

Answer 18

un dominio carboxilo terminal (CTD) que se extiende como una “cola” que contiene una serie de repeticiones de la secuencia hepta peplídica: Tyr-Ser-Pro-
Thr-Ser-Pro-Ser

Question 19

Cuales son las 3 proteínas adicionales del inicio de la transcripción?

Answer 19

1. Proteínas reguladoras de la transcripción
2. complejo mediador
3. enzimas modificadoras de los nucleosomas

Question 20

Qué hacen las Proteínas reguladoras de la transcripción?

Answer 20

Contribuyen a reclutar la polimerasa hacia el promotor y estabilizan su unión en ese sitio.

Question 21

Qué hace el complejo mediador?

Answer 21

gran estructura multiproteica que interactúa con la maquinaria de transcripción básica.
eliminacion conduce a la falta de expresion de genes

Question 22

Proteínas que estimulan el alargamiento por la Pol II en eucariotas

Answer 22

1. P-TEFb
2. Familia ELL
3. TFIIS
4. FACT (factor que facilita la transcripción cromatínica)

Question 23

Rol de la cinasa P-TEFb

Answer 23

Una vez unida a la Pol II, esta proteína fosforila el
residuo de serina en la posición 2 de las repeticiones del CTD. Ese fenómeno de
fosforilación se correlaciona con el alargamiento

Question 24

Proteinas recluatadas por la P-TEFb

Answer 24

1. SPT5
2. TAT-SF1

Question 25

Rol de la familia ELL

Answer 25

se unen a la polimerasa alargadora y suprimen el desarrollo de pausas temporales por parte de la enzima.

Question 26

Rol del TFIIS

Answer 26

Acelera el alargamiento al reducir el tiempo de pausa de la polimerasa en secuencias difíciles y contribuye a la corrección de errores durante la transcripción

Question 27

Rol del factor FACT

Answer 27

Facilita la transcripción en plantillas de DNA condensado en cromatina, aumentando la eficiencia sobre estas plantillas más complejas

Question 28

Qué implica la terminación de la transcripción eucariota?

Answer 28

implica el reconocimiento de una secuencia que contiene una región rica en GC, en una serie de seis o más adeninas contenidas en el transcrito de ARN

Question 28

Pasos clave de la maduración

Answer 28

1. Adición del Capuchón (Capping) en el Extremo 5’ 2. Poliadenilación del Extremo 3’ 3. Corte y Empalme (Splicing) 4. Edición del RNA

Question 29

En qué se basa el capping y cuales son las enzimas involucradas?

Answer 29

Se añade una guanina modificada (7-metil guanosina). Enzimas: 1. ARN trifosfatasa: Elimina un fosfato. 2. Guanilil transferasa: Añade una guanina. 3. Metil transferasa: Metila la guanina.

Question 30

funcion de la Poliadenilación del Extremo 3’

Answer 30

Adición de una cola de adeninas (poli-A) para finalizar la transcripción.

Question 31

funcion del Corte y Empalme (Splicing) y que involucra

Answer 31

Eliminación de intrones y unión de exones. involucra el Complejo Ayustoma (Spliceosoma): Formado por 150 proteínas y 5 pequeños RNA nucleares (U1, U2, U4, U5 y U6) que medían el proceso de corte y empalme.