Virologi Flashcards
(43 cards)
Vad är definitionen av ett virus?
Obligata intracellulära parasiter utan egen metabolism
Vad särskiljer virus från andra mikroorganismer?
Ingen metabolism, ingen syntes, är absolut beroende av en annan cell för sin egen förökning
Hur stora är virus?
- Mellan 20 - 360 nm, behövs elektronmikroskop för att se de
- Det finns även gigantiska virus som infekterar amöbor
Hur är virus uppbyggda, dvs vilka komponenter består virus av?
Virus har ett proteinskal- kapsiden, som består av små proteinenheter- kapsonärer. Innanför kapsiden finns en nukleokapsid med arvsmassan. Vissa virus har ett lipidmembran som kallas hölje, på vissa proteiner sitter det ytproteiner- spikes, på höljet.
De strukturella proteinerna är de proteinerna som viruset är uppbyggt av, icke- strukturella används inte för att bygga upp nya proteiner med, den har andra uppdrag i cellen
Enligt vilka fyra huvudprinciper är virus uppbyggda på?
Virusen kan ha olika former, tex Icosahedral eller Helical.
De kan antingen ha hölje eller vara nakna (inte hölje)
Vilka olika typer av arvsmassa kan virus ha?
- DNA:
- Dubbelsträngad eller enkelsträngad
- Linjär eller cirkulär- har en start och stopp eller sitter ihop
- RNA:
- Enkelsträngad
- Positiv (kan använda sin arvsmassa direkt som ett mRNA) eller negativ (arvsmassan fungerar inte som ett mRNA) sense
- Dubbelstängad i vissa fall!
- Vissa virus kan omvandla enkelsträngat till dubbelsträngat!
Vilka är kriterierna som International Committee for Taxonomy of Viruses (ICTV) använder sig av för att klassificera virus i familjer?
Deras utseende och egenskaper
Vad baseras Baltimore metoden för att klassificera virus på?
Hur deras mRNA bildas
Vad innebär begreppet serotyp?
En gruppering av virus utifrån hur antikroppar binder till dem. Virus kan ha en eller flera serotyper. Antikroppar kommer bara binda till den serotypen som den ha specificerat sig för. Om antikroppen inte neutraliserar viruset tillhör den en annan serotyp.
I vilket sammanhang är det viktigt att känna till serotypen hos ett virus?
Tex i framställningen av vaccin, då måste man veta vilken serotyp för att få rätt antikropp och rätt vaccin
Hur förökar sig virus?
Viruset tar sig in i en cell, släpper lös sin arvsmassa och gör cellen till sin virusfabrik. Cellen börjar då skapa virs istället för att göra de den är gjord för, och fler virus släpps ut och kan infektera fler celler
Beskriv replikationscykeln för ett virus, utifrån dess specifika arvsmassa
- Fastsättning till cell-receptor
Viruspartikeln binder till en värdcell genom receptorer och sockermolekyler. - Upptag i cellen
Virus med lipidhölje kan ta sig in med direkt fusion då lipidhöljena smälter ihop och den släpps in direkt. Annars kan det ske via receptormedierad endocytos då en vesikel skapas runt viruspartikeln och släpps in i cellen. Arvsmassan släpps lös: RNA direkt i i cytoplasman, DNA måste ta sig in i cellkärnan. - Tidigt genuttryck (Early gene expression)
Det produceras icke strukturella proteiner. - Kopiering av arvsmassan
Arvsmassan kopieras. mRNA skapas på olika sätt. - Sent genuttryck (Late gene expression)
Cellen börjar producera nya proteiner för att bygga upp nya virus, strukturella proteiner. - Ihopsättning av komponenterna
Det nya viruset byggs ihop. - Frisättning
De nya viruspartiklarna tar sig ut genom antingen avknoppning (exocytos) eller att cellen sprängs
Vad är ”attachment” eller fastsättning?
Viruset sätter sig på immunreceptorerna på cellen (alt sockermolekyler), virus med lipidhölje kommer in via direkt dusion och virus utan kapslas in i vesicklar och kommer på så sätt in i cellen. Virus kan vara olika specifika, men de kan bara fästa på de celler som har rätt receptorer för de.
Vad använder virus för typ av receptorer på celler?
Sockermolekyler och vanliga proteinreceptorer
Beskriv de två huvudsakliga sätten som virus tar sig in i celler
- Direkt fusion- endast för virus med lipidhölje. Arvsmassan sprudas direkt in i cellen
- Receptomedierad endocytos- viruset tas in i cellen i en vesickel, och bryter sig sedan loss och arvsmassa kommer på så sätt in i cytoplasman
Vad kännetecknar fasen under replikationscykeln som kallas ”early” eller tidig?
Icke-strukturella proteiner produceras, dessa tillhör inte viruspartikeln utan hjälper till med andra saker i den infekterade cellen (bygger ihop de nya viruspartiklarna?)
Vad kännetecknar fasen under replikationscykeln som kallas ”late” eller sena fasen
Strukturella proteiner produceras, dessa bygger ihop de nya viruspartiklarna.
Fundera på hur mRNAn bildas utifrån de olika typerna av viral arvsmassa
- Dubbelsträngat DNA: måste vandra in i kärnan, men när de väl är i kärnan ser cellen de som vilken annan DNA- seknvens som helst och mRNA skapas genom transkription
- Retrovirus: gör om sig från positivt RNA tilll DNA (omvänd transkription) och integreras i cellens egna arvsmassa- kallas även för provirus.
- Positivt RNA virus: de positiva kan använda sin arvsmassa direkt som ett mRNA, ribosomerna tror att deras arvsmassa är ett vanligt mRNA och börjar translatera nya virusproteiner
- Negativt RNA virus: arvsmassan hos negativa RNA virus kan inte direkt användas som mRNA, utan detta måste skapas av enzymer som viruset tagit med sig
Varför kallas vissa enkelsträngade RNA virus positiva respektive negativa?
I de positiva RNA virusen kan viruset använda sin arvsmassa som mRNA direkt, ribosomerna tror då att de är deras arvsmassa och använder de som ett vanligt mRNA
I negativa RNA virus så måste viruset göra sitt eget mRNA med hjälp av enzymer som den har med sig
Nämn tre unika virala enzymer:
Integras, omvänt transkrpitas och proteas är alla viktiga för att viruset ska kunna föröka sig hos HIV virus
Med vilka tre olika mekanismer muterar virus sin arvsmassa?
- Punktmutation- om viruset råkar sätta fel basparning
- Reassortment- blandning av två olika virus, deras RNA- segment blandas och det kommer ut nya virustyper
- Rekombination- delar av en kromosom byter plats med samma delar av kromosomen i ett annat kromosompar, på så vis bildas nya kombinationer och genetisk variation uppstår
Varför talas det om löpande band principen när virus produceras?
Eftersom de nya virusets delar görs först i olika “produktionsled”, innan de sammanfogas till en hel virus
Varför talas det om löpande band principen när virus produceras?
Eftersom de nya virusets delar görs först i olika “produktionsled”, innan de sammanfogas till en hel virus
Varför packas enbart virus arvsmassa i viruspartikeln?
Eftersom de inte har behov av något annat för att föröka sig
