Virologie végétale

Question 1

structure virus

Answer 1

• macromolécules infectieuses
• ARN simple brin majoritairement -> porte le génome viral
• capside constituée de protéines de structure (protéines capsidiales) entoure le génome
• virion/particule virale = ARN + capside

Question 2

3 morphologie des virus

Answer 2

1. isométrique
2. globuleuse
3. filamenteuse

Question 3

Virus Geminiviridae

Answer 3

• rares virus à ADN
• se répliquent dans le noyau de la cellule végétale
• formés de 2 molécules d’ADN (jumeaux)

Question 4

virus à ADN

Answer 4

• surtout en milieux tropicaux -> à cause de leurs vecteurs qui ne tolèrent pas les T froides (aleurodes et pucerons)
• touchent de nombreuses plantes horticoles
• Amérique du Nord et CAN = nouveau Geminiviridae dans l’industrie viticole = Grablovirus

Question 5

4 stratégies utilisées par les virus ARN pour répliquer son génome?

Answer 5

1. production de polyprotéines (ensuite clivée en morceaux)
2. utilisation de multiples ARN génomiques
3. production d’ARNs sous-génomiques
4. traduction non canonique des ORFs

Question 6

6 principales fonctions jouées par les protéines des phytovirus

Answer 6

1. réplication (réplicase) et transcription du génome
2. encapsidation (CP)
3. protéines de mouvement (MP)
4. surpression des défenses de la plante (VSR)
5. interaction avec les vecteurs (parfois)
6. protéases (parfois) (clivage)

Question 7

2 types de mouvement des virus

Answer 7

1. de cellule à cellule
2. longue distance

Question 8

comment se fait le mouvement de cellule à cellule

Answer 8

1. via les plasmodesmes
2. plusieurs protéines de mouvement (MP) interviennent (car le virus est sous forme d’acide nucléique) par la formation d’un complexe -> acide nucléique génomique + MP

Question 9

comment se fait le mouvement sur longues distances?

Answer 9

• passif
• via le parenchyme phloémique et les cellules compagnes
• de la source vers les puits

Question 10

propriétés des protéines de mouvement de cellule à cellule

Answer 10

1. liaison de la MP à l’ARNsb pour le passage par les plasmodesmes
2. augmentation de la limite d’exclusion des plasmodesmes
3. activité hélicase (défaire l’hélice)
4. liaison avec le cytosquelette de la cellule hôte
5. liaison avec la membrane de la cellule hôte

Question 11

2 types de transmission des virus

Answer 11

verticale ou horizontale

Question 12

transmission verticale

Answer 12

• à la déscendance de la plante infectée

VERTICALE PAR LES GRAINES
- plus rare car virus infectent difficilement les semences
- embryon est infecté ou les téguments de la graine sont contaminés

VERTICALE VÉGÉTATIVE
- tous les organes de multiplication végétative (bouture, tubercule, bulbe…) peuvent entraîner l’infection de la descendance
* moyen de lutte = méristèmes, car majorité des virus sont exclus des méristèmes)

Question 13

transmission horizontale

Answer 13

• à d’autres plantes de la même espèce ou à d’autres espèces

PAR LE POLLEN ET LES POLLINISATEURS
- exceptionnelle
- inoculation plante saine par du pollen infecté = graines virosées sur un plant mère sain

MÉCANIQUE
- outils et microblessures
- greffe, travailleurs
- vecteurs

Question 14

moyens de lutte aux virus

Answer 14

1. HYGIÈNE (eau de javel, moustiquaires, hygiène travailleurs, pas de cigarette…)
2. SEMENCES PROPRES/DÉSINFECTÉES (virus souvent visuel)
3. ÉLIMINATION DES VECTEURS (insecticides)
4. RÉSISTANCE GÉNÉTIQUE (cultivars résistants)

Question 15

talon d’achille des virus?

Answer 15

TRADUCTION -> aucune traduction = aucune protéine virale = aucune infection
virus sont 100% dépendants de la machinerie de l’hôte pour la traduction de leur bagage génétique en protéines

Question 16

résistance génétique au virus

Answer 16

peut être:
- récessive
- dominante (relation gène pour gène, reconnaissance du gène AVR spécifique de l’Agent pathogène)
- polygénique
- basé sur ARNi

Question 17

Résistance VS Tolérance VS Immunité

Answer 17

RÉSISTANCE = très peu d’accumulation de virus et réaction hypersensible

TOLÉRANCE = bon rendement, sans symptômes, malgré une forte accumulation de virus dans la plante
problématique pour l’industrie de la pdt

IMMUNITÉ = aucune réplication du virus

Question 18

pourquoi la tolérance est problématique pour l’industrie de la pdt?

Answer 18

• cultivars tolérants agissent comme un réservoir de virus…
• sélection/certification visuelle des tubercules = évolution des souches du virus PVY
• cultivars avec feuillages asymptomatiques mènent à sous estimer les souches PVYn
• YUKON GOLD est tolérant au PVYn … mais les fermes à côté produisent des JEMSEG … virus vient avec vecteurs (insectes, vent) = nécroses +++ sur tubercules car Jemseg non tolérant = baisse revenus
• humains exercent une force sélective en essayant d’éviter les virus…

Question 19

mécanismes de l’interférence de l’ARN (ARNi)

Answer 19

• mécanisme de résistance aux virus à ARN très efficace chez les plantes
• enzyme de la plante (ARN polymérase) synthétise un 2e brin à l’ARN viral
• on ne retrouve jamais d’ARNdb dans le cytosol des eucaryotes, alors il est immédiatement reconnu comme étrangé par l’ARNi
• ensuite, les endonucléases «DICER» font le clivage des ARNdb viraux en petits ARNs
• le complexe RISC dégrade les petits ARNs et cible l’ARNsb viral par homologie
• approche efficace chez la papaye transgénique (Hawaï)

Question 19

stratégie chez les virus pour contrer l’interférence de l’ARNi

Answer 19

virus de plantes expriment des suppresseurs de silencing (VSR)

Question 20

synergisme entre virus

Answer 20

chaque virus à son VSR… donc plus difficile à contrer pour la plante s’il y en a plus qu’un

Question 21

rétablissement

Answer 21

plante peuvent récupérer ou se rétablir d’une infection mettant en jeux l’interférence de l’ARNi

plantes sont ensuite immunisées contre toute autre infection par le même virus

Question 22

protection croisée

Answer 22

plantes sont immunisées ou très résistantes à une souche virulente de virus quand elles ont été préalablement inoculées avec une souche hyppovirulente ou latente

• majorité Du génome est identique donc il est reconnu quand même