VL 6 - tRNAs/rRNAs

Question 1

Welches Enzym synthetisiert tRNA?

Answer 1

RNA Polymerase III

Promotorelemente sind im INNERN des Zielgens (Box A, Box B)

Question 2

Warum führt die Überexpression von RNA Pol III zu Krebs?

Answer 2

• führt zu selektiver Translation von mRNAs die Wachstum von Zellen unterstützen (cycline, c-myc)

Question 3

Haben Fragmente von tRNAs noch eine Funktion?

Answer 3

• titrieren RNA Bindeproteine weg, die Transkripte für Onco Gene bei Brustkrebs stabilisieren

• 3’ Fragment von Leucin tRNA homolog zu mRNA Sequenzen ribosomaler Proteine (RPS28)
⇒ Start Codon erreichbar nach Hybridisierung (vorher ungünstig gefaltet) ⇒ Translationsstart

⇒ Regulierung der Ribosom Biogenese

Question 4

Wie werden tRNAs gespleißt?

Answer 4

• Schneiden von Mini-Introns nahe Anticodon durch Endonukleasen u. Ligasen

Question 5

Was macht die 45S rRNA?

Answer 5

• Enthält Sequenzen der 18S und 28S rRNA

⇒ werden herausgeschnitten

Question 6

Wie werden tRNAs in Eukaryoten und Prokaryoten prozessiert?

Answer 6

• Eukaryoten: RNase P schneidet 5’ Überhang ab, Endonuklease (RNase Z) schneidet 3’ trailer ⇒ CCase hängt CCA Ende ans 3’
• E.coli: RNase P schneidet 5’ Überhang ab, 3’ trailer durch Exo- + Endonukleasen geschnitten

Question 7

Welche drei Enzyme sind bekannt, die Nukleotide zur Nukleinsäure in einer
Primer-abhängigen, aber Template-unabhängigen Art u. Weise hinzufügen

Answer 7

1. CCase
2. Poly(A) polymerase
3. TdT

Question 8

tRNA skizzieren und beschreiben

Answer 8

ZEICHNEN!

Question 9

Warum muss tRNA modifiziert werden?

Answer 9

• Nimmt ohne Edierung, Schneiden u. Methylierung andere Faltung ein

Question 10

Welches Enzym transkribiert rRNA?

Answer 10

• RNA Pol I

Question 11

wie interagiert U3 snoRNA mit der prä-rRNA?

Answer 11

• U3 hybridisiert mit rRNA (kleine Untereinheit) ⇒ Schneiden durch Nuklease

Question 12

An welchen Stellen wird d. rRNA modifiziert?

Answer 12

• hauptsächlich an Schlüsselstellen (coding center)

* nicht da, wo ribosomale Proteine binden!

Question 13

Was sind rRNA modifcation Sites? Wie werden sie durch snoRNAs erkannt?

Answer 13

• sorgen für korrekte Modifizierung an richtiger Stelle

• über hochkonservierte Sequenzelemente (Boxen)
⇒ Boxen von Enzymen erkannt
⇒ Abstand zu Boxen im rRNA:snoRNA-Hybrid bestimmt Methylierungs/Pseudouridinierungsstellen

Question 14

was sind scaRNAs?

Answer 14

• small Cajal Body specific RNAs
• in Cajal bodies
• haben kombinierte C/D und H/ACA Domäne
• reifen snRNAs

Question 15

was sind nicht-kanonische Funktionen von snoRNAs?

Answer 15

• mRNA Basenmodifikation
• degradierte snoRNAs verhalten sich ähnlich miRNAs
• können Spleißen beeinflussen (Basenpaaren mit Intronelementen)

Question 16

Wie sind snRNAs in rRNA Reifung involviert?

Answer 16

• Prozessierung von prä-rRNA (U3, U8)
• Methylierung, Pseudouridinierung von prä-rRNA durch snoRNA
• Spleißen von prä-rRNA (U1, U2, U4, U5, U6)

Question 17

Wie erfolgt die U7 Histon mRNA Reifung?

Wozu?

Answer 17

• in der S-Phase
• U7 bindet HDE (histone downstream element) Rekrutierung von “cleavage” Faktoren zum Schneiden
• wenn außerhalb der S-Phase exprimiert, konkurrieren die replikationsabhängigen Histone mit anderen Histonen, die für epigenetische Regulierung der Genexpression essenziell sind

Question 18

Nenne 2 snoRNA Typen, die zur Reifung/Modifizierung von rRNAs benötigt werden.

Answer 18

• Box C/D snoRNAs: Methylierung durch Fibrillarin (Methyltransferase)
• Box H/ACA snoRNAs: Pseudouridinierung durch Dysekerin (Pseudouridinsynthase)