Vprašanja s preteklih izpitov Flashcards

1
Q

Kam se veže origin recognition complex?

A

Veže se na mesto ori. Pomemben je za vezavo helikac Mcm2-7 skupaj s Cdc6 in Cdt1.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Meier-Gohrlingov sindrom je povezan z napakami v:

A

genih za porteine pre-replikacijskega kompleksa. Mutacija v domeni BAH proteina Orc1 vpliva na replikacijo DNA in izniči inhibijiso s strani ciklin E-CDK2

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Kje nastane i-motiv?

A

Nastane iz treh do štirih ponovitev citozina.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Kaj je v kratki ročici kromosomov 13, 14, 15, 21, 22?

A

Geni za ribosomalno RNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Kaj je citokineza?

A

Je zadnja faza delitve celic, ko se celici razdelita na dve.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Kaj je značilno za razgradnjo mRNA z eksosomom?

A

Poteka iz 3’ proti 5’ koncu.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Kaj se zgodi z mitohondriji prit staranju?

A

Pride do mutacij v zanki D, ki vsebuje mesto začetka replikacije, zaradi česar število mitohondrijev upade. Poleg tega so manjši.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Kaj se zgodi če utišamo BACE1-AS?

A

BACE1-AS stabilizira BACE1 mRNA in s tem posledično promovira prepisovanje amiloida beta, z utišanjem zato upade koncentracija amiloida beta.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Koliko točkovnih mutacij prenese mama na otroka?

A

15

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Kaj je zanka D?

A

Mesto začetka replikacije mtDNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Naštej tri proteine celičnega cikla.

A

CDK, ciklini, Rb, E2F

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Kako Rb regulira celični cikel? V kateri fazi deluje, kako se aktivira, kakšna je posledica njegovega delovanja?

A

Rb se veže na E2F, ki tako vezana delujeta kot histo deacetilazi, ob vezavi rastnega faktorja na receptor se začnejo izražati CDK G1 faze, ki fosforilirajo Rb, ta se odcepi od E2F om E2F začne promovirati prepisovanje genov za proteine faze S.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Izpotavljenost rotenonu, parakvatu in MPTP, da podobne sindrome kot:

A

Parkinsonova bolezen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

TIA-1, TIAR in G3BP so molekule značilne za:

A

Stresne granule

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Katero glavno spremembo zaznajo proteini, ki popravljajo DNA z izcepom nukleotidov?

A

Zaznajo dimer timin-timin, ki nastane zaradi poškodovanja DNA z UV svetlobo.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Za Klinefelterjev sindrom je značilno:

A

47, XXY

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Kako bi preverili ali kompleks mRNA - LINE1 za tansport v jedro uporablja jedrne pore. Vemo, da se veže na proteine za prenos v jedro

A

Inhibirali bi izračanje CAS, ki omogoča transport prek jedrne membrane, nato pa bi preverili lokalizacijo mRNA-LINE1, če bi ta bila v citoplazmi bi to pomenilo, da uporablja jedrne pore.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Kako drugače bi še lahko prišel v stik s kromosomsko DNA?

A

Lahko bi prišel v stik ob delitvi celic.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Katera ponovitev je značilna za Huntingtonovo bolezen?

A

GAC

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Kaj se zgodi, če je inhibirana poliubikvitinacija sekurina?

A

Iz profaze I ne more nadaljevati v anafazo I. To dela ACP/C

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Kaj so GEF in GAP, kaj delajo?

A

GEF so aktivatorji GTPaz, GAP pa inaktivatorji, saj katalizirajo počasno hidrolizo GTP.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Navedi eno GTPazo in proces, v katerem sodeluje.

A

RanGDP sodeluje v jedrnem transportu

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Pri 1-2% nosečnosti pride do triploidije. Najpogostejši vzrok triploidije je

A

Dispermija

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Kakšna je razlika med RTK in citokinskimi receptorji?

A

RTK imajo gen za receptor in kinazo združen, citokinski receptorji pa narazen.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Kakšne promotorje ima tRNA?

A

Notranje promotorje - ti so del gena za tRNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Zakaj mutacije BRCA2 povečajo tveganje za nastanek raka na dojkah?

A

BRCA2 sodeluje pri popravljanju mutacij DNA s homologno rekombinacijo. Mutacija BRCA2 tako omogoči več mutacij posledično nastanek raka.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

1) RPA specifičnost vezave na DNA?

A

RPA se ne veže na specifično vezavno zaporedje

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
28
Q

Kje opazimo lokalizacijo označene RNA polimeraze I?

A

RNA polimeraza I je lokalizirana v jedru kjer deluje kot prpeisovalka rRNA.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
29
Q

Na obdukciji možganske skorje opazimo nahajanje TDP-43 v citoplazemskih tlakih. Pri celicah smo zaznali tudi znižano količino proteina CAS. Opiši, kaj je lahko razlog za tako lokalizacijo TDP-43 ter za katero bolezen je značilno opisano stanje

A

CAS omogoča transport v jedro preko jedrnih por, zato odsotnost to onemogoča. Značilno je za bolezen ALS.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
30
Q

Kaj se dogaja z IDE (insulin degrading enzyme) v možganih pri AD?

A

Njegova koncentracija se zmanjša

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
31
Q

Kateri je pravilni vrstni red celičnega cikla?

A

G1, S, G2, M

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
32
Q

Kako se imenujejo homologne regije na koncih kromosomov X in Y? (kratek odgovor)

A

Psevdoavtosomalne regije

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
33
Q

Na kakšen način proteaze ADAM vpliva na nepravilno proliferacijo?

A

Poveča koncentracijo rastnih faktorjev v ECM in razgrajuje ECM.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
34
Q

V katero miRNA bazo se dodajajo novo odkrite miRNA?

A

mirBase

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
35
Q

Napiši ime encimov, ki regulirajo celični cikel

A

Ciklini

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
36
Q

mtDNA se podvojuje:

A

Asinhrono v obe smeri

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
37
Q

Katerih zdravil ne uporabljamo v kombinaciji z L-DOPA za zdravljenje Parkinsonove bolezni?

A

Agonistov dopaminskih receptorjev

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
38
Q

Napiši 2 metodi, s katerima detektiramo tarče miRNA

A

RNA mikromreže in RNA-seq

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
39
Q

Kaj so histonski šaperoni? (napiši)

A

So proteini ki pomagajo pri nastanku centrosoma

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
40
Q

V celici je več mitohondrijev. Koliko pa je v vsakem mitohondriju kopij mtDNA? (napiši)

A

Dva do deset

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
41
Q

Kaj je rekurzivno izrezovanje? (napiši)

A

To je pojav izrezovanja pri daljših intronih, kjer pride do več zaporednih izrezov intronov.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
42
Q

Kateri snoRNA 2’-O’metilacija?

A

C/D snoRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
43
Q

Kateri alel poveča verjetnost za nastanek AD?

A

Alel 4

44
Q

Če genetsko različne celične linije znotraj osebka izvirajo iz dveh različnih zigot govorimo o ______.

A

himerizmu

45
Q

2 razliki med mitozo in mejozo

A

pri mitozi nastajata dve celici z enakim dednim zapisom, pri mejozi pa štiri celice z različnim dednim zapisom

46
Q

Mutacije v kateri družini proteinov so vzrok za bolezni Wernerjev sindrom, Bloomov sindrom, Rothmund-Thomson/RAPADILINO/Baller-Gerold sindrom?

A

helikaze recq

47
Q

Če bi označil polimerazo II, kje bi opazil temno liso?

A

Na evkromatinu

48
Q

Alu elementi: koliko kopij?

A

milijon

49
Q

Ali imajo Alu elementi LTR

A

Ne

50
Q

Iz česa nastanejo Alu?

A

SLRNA

51
Q

transport katerih molekul ni vezan na sistem RanGTP?

A

mRNA

52
Q

Katero spremembo povzroči APOBEC?

A

C v T

53
Q

kaj je heteroplazmija?

A

Ko celice vsebujejo več različnih mitohondrijev

54
Q

Katera pot aktivira CREB?

A

GPCR/PKA

55
Q

kako je lokaliziran PKA?

A

V citosolu, v jedro ga prenaša APAK

56
Q

Kaj je Ras?

A

Je gtpaza

57
Q

Kako vpliva HER pri raku dojk?

A

Se konstantno izraža, špri raku dojke je njegova koncentracija povišana, zato bo vodil v pretirano proliferacijo

58
Q

Funkcija Tau?

A

Podaljšuje mikrotubule

59
Q

BACE1-AS funkcija pri AB?

A

Poviša raven amiloida beta

60
Q

Kaj se zgodi, če se prekine fosfodiesterska vez med replikacijo?

A

replikacijske vilice se sesedejo

61
Q

Robertsonove translokacije nastanejo pri:

A

akrocentričnih kromosomih

62
Q

Kaj so mirtroni? (kratek odgovor)

A

miRNA znotraj intronov mRNA ki zapisuje za proteine

63
Q

Kateri je najpogostejši vzrok za triploidijo? (kratek odgovor)

A

dispermija

64
Q

Kateri gen je okvarjen pri najpogostejši otroški mišični distrofiji (DMD)?

A

distrofin

65
Q

Predispozicijo za raka na črevesju imajo ljudje, ki so podedovali mutacijo v enem od genov MLH1 ali MSH2, vloga katerih je:

A

Popravljalni mehanizmi

66
Q

Kateri protein se v 95% akumulira v motoričnem nevronu pri AD?

A

tau

67
Q

Cdc20 aktivira APC/C, ki nato poliubikvitinira protein

A

sekurin

68
Q

Kateri protein ni del nukleosoma?

A

H1 (so pa H2A, H2B, H3A in H3B)

69
Q

Kakšno je zaporedje na telomerni regiji?

A

TTAGGG

70
Q

mRNA se prepiše s:

A

rna pol I ii iii

71
Q

S protitelesom si označil RNA polimerazo II. Kje bo najbolj črna lisa?

A

Na evkromatinu

72
Q

Kaj je proteostaza?

A

Homeostaza proteinov

73
Q

Navedi vsaj 3 funkcije mikroeksonov.

A

toksičnost, sprememba konformacije proteina, več mest za posttranslacijske modifikacije

74
Q

Kako nastane circRNA?

A

dva modela, preskok eksonov z vmesno lariatno strukturo ali direktno povratno izrezovanje

75
Q

Katera so prepoznavna mesta na spliceosomu? (ncRNA)

A

GU-AG

76
Q

Kateri protein se veže na ponovitve pri DM?

A

MBLT

77
Q

Povzročitelj ……… sprememba……….. popravljalni mehanizem

A

ROS - nastanek ciklopurinov - NHEJ, UV - nastanek povezanih timidinov - , 5-metilcitozin - deaminacija lahko povzroči pretvorbo v timin -

78
Q

Pri mejozi I se parijo enaki kromosomi matere in očeta med seboj, kaj se zgodi s kromosomoma X in Y?

A

Preko psevdosomalnih regij da zagotovijo da imajo hčerinske celice oba

79
Q

Robertsonova translokacija je značilna za ____ kromosome

A

akrocentrične

80
Q

Kateri proteini prepoznajo ojačevalce izrezovanja in spajanja?

A

SB in ncRNA

81
Q

V črevesju citidindeaminaza ______ C na mestu 6666 pretvori v U. Iz CAA kodona (glutamin) nastane UAA (STOP)

A

APOBEC1

82
Q

Turnerjev sindrom.

A

Monosomija kromosoma X

83
Q

Opiši celotno signalno pot aktivacije transkripcijskega faktorja CREB.

A

Najprej nek zunanji signal aktivira GPCR, oddisociira alfa podenota ki fosforilira adenilat ciklazo a, ki ATP pretvori v cAMP, ta aktivira PKA, ki se translocira v jedro z AKAP, tam fosforilira CREB, ta se veže na CRE regijo, veže se CAB in promovirata izražanje genov.

84
Q

Kaj pomeni 7 Evinih hčera? (napiši)

A

To je 7 žensk katerih potomci tvorijo danes obstoječe haploskupine v evropi.

85
Q

Kaj se lahko zgodi, če pride do dvojnega preloma na isti ročici kromatide? (napiši)

A

Intersticialna delecija ali paracentrična inverzija

86
Q

Kaj naredi Vif pri APOBEC3?

A

Označi ga za ubikvitinacijo

87
Q

Xrn1?

A

Sodeluje pri razgranji mRNA tako da jo cepi iz 5’ konca

88
Q

Kdaj pride do rekombinacije?

A

Pahiten

89
Q

Cdc20 aktivira APC/C, ki nato poliubikvitinira kateri protein (je inhibitor encima separaze)?

A

Sekurin

90
Q

kateri so akrocentrični kromosomi?

A

12,13,15, 21, 22, Y

91
Q

Zakaj mutacije MLH1 ali MSH2 povzročajo raka?

A

Ker so udeležene v popravljalne mehanizme DNA

92
Q

Potek aktivnega transporta proteinov v jedro:

A

Importin B prepozna NLS na tovor se veže še importin A po prehodu v jedro skozi NPC se na importin B veže Ran-GTP pri čemer se tovor sprosti

93
Q

Aktivacija preko z G-proteini povezanimi receptorji:

A

GPCR se enota GDP zamenja za GTP na G alfa podenoti oddisociira, se veže na efektor ga fosforilira in ta naprej fosforilira, G alfa podenota pa se vrne

94
Q

Aktivacija STAT:

A

Na tirozin-kinazni receptor se veže signalna molekula, JAK fosforilira konce, na tirozin se veže SH2 domena STAT, dimerizira, potuje v jedro

95
Q

Kaj je značilno za Hedgehog signalno pot?

A

Da se avtoproteolizira, da je receptor v veziklu

96
Q

Kako se v primeru Duchennove mišične distrofije popravi delecija eksona 50 z uporabo protismiselnih oligonukleotidov (ASO)?

A

Izključimo še 51 ekson in tako popravimo bralni okvir zamik katerega povzroči prva delecija

97
Q

Vloga XRN1 in XRN2

A

eksoribonukleazi, ki pomagata pri disociaciji miRNA iz miRISC in režeta mRNA iz 5’ konca

98
Q

Kako oksidativni stres vpliva na razvoj nevrodegeneracije?

A

Povzroči ga sinteza vode v mitohondrijih, omogoča prenos toksičnih zvrsti iz mitohondrijev v celico

99
Q

Kako se popravljajo prelomi DNA?

A

združevanje nehomolognih koncev, homogolna rekomboinacija, popravljanje s prileganjem enojnih verig

100
Q

Katera H2A je pomembna pri vzdržavnju totipotentnosti?

A

H2A.X

101
Q

Koliko RNAznih podenot ima Dicer?

A

4

102
Q

Napiši dva mehanizma celice za preprečevanje L1 retrotranspozicije (kratek odgovor)

A

Inaktivacija L1 s skrajšanjem, uvedbo mutacij ali preureditvijo, inhibicija L1 z metilacijo 5’ UTR

103
Q

Zakaj pri Osteogenesis imperfecta tip I (bolezen krhkih kosti) pride do zmanjšanega učinka COL1A1? (kratek odgovor)

A

Ena od dveh kopij kolagena 1 je mutirana bolniki imajo zato dvakrat manj kolagena tega tipa

104
Q

Če genetsko različne celične linije znotraj osebka izvirajo iz ene same zigote, govorimo o ________.

A

mozaicizmu

105
Q

Kakšna je funkcija XRN1 pri razgradnji mRNA?

A

Cepi jo iz 5’ konca

106
Q

Kateri 3 vrste mikrotubulov sodelujejo pri celični delitvi?

A

polarni, kinetohorni, astralni