Week 2

Question 1

Welke puntmutaties zijn er?

Answer 1

Transities
Transversies
Kleine inserties/deleties

Question 2

Wat zijn transities?

Answer 2

purine –> purine (A–>G of G–>A)
pyrimidine –> pyrimidine (C–>T of T–>C)

Question 3

Wat zijn transversies?

Answer 3

purine –> pyrimidine of andersom, dus A/G –> C/T of C/T –> A/G

Question 4

Wat zijn puntmutaties?

Answer 4

Kleine veranderingen op basepaar niveau

Question 5

Wat zijn chromosomale afwijkingen?

Answer 5

Grote veranderingen waar te nemen op chromosomaal niveau

Question 6

Welke chromosomale afwijkingen zijn er?

Answer 6

Translocaties
Amplificaties
Deleties
Numerieke afwijkingen

Question 7

Wat zijn de oorzaken van DNA schade?

Answer 7

Chemische instabiliteit
Chemische verbindingen
Biologische stoffen
Fysische agentia
Foutieve replicatie

Question 8

Wat voor soort DNA beschadigingen zijn er?

Answer 8

Chemische adducten
Intrastreng crosslinks
Interstreng crosslinks
DNA strengbreuken
Basepaar mismatches

Question 9

Hoe geeft chemische instabiliteit DNA schade?

Answer 9

1. Spontane hydrolyse.
   Dit leidt tot depurinatie: een base gaat eraf. Dit geeft 1 basepaar deletie.
2. Deaminatie van basen. Een cytosine (C) wordt dan een uracil (U) –> verandering complementariteit; C –> T want U hoort bij A en na replicatie krijg je T.

Question 10

Welke biologische stoffen geven DNA schade?

Answer 10

1. Endogene stoffen
   Zuurstofradicalen geproduceerd door metabole processen. Guanine (G) wordt dan 8-oxoguanine die paart met Adenosine (A): G –> T transversie.
2. Benzo(a)pyreen
   Aanwezig in sigarettenrook en wordt metabolisch geactiveerd naar BPDE. Tegenover G-BPDE wordt A ingebouwd, dus G –> T (transversie)

Question 11

Welke chemische adducten verstoren de DNA dubbelhelix NIET?

Answer 11

Spontane hydrolyse
Deaminatie
Oxidatieve DNA schade

Question 12

Wat is fysische agentia die DNA beschadigt?

Answer 12

UV: Intrastreng DNA beschadigingen door straling

Question 13

Hoeveel beschadigingen per cel per dag?

Answer 13

75 000

Question 14

Welke twee excisie reparatie mechanismen zijn er?

Answer 14

Base Excisie Reparatie (BER)
Nucleotide Excisie Reparatie (NER)

Question 15

Wat zijn kenmerken van Base Excisie Reparatie (BER)?

Answer 15

BER dient voor herstel van kleine adducten (oxidatieve DNA schade; deaminatie van basen)

DNA schade herkend door een schade-specifieke DNA glycosylase (uracil glycosylase).

Endonuclease herkent AP-site en maakt een knip in het DNA.

Herstel: DNA polymerase en ligase.

Question 16

Wat zijn kenmerken van Nucleotide Excisie Reparatie (NER)?

Answer 16

NER dient voor herstel van grote adducten (6-4 fotoproducten)

Question 17

Welke twee soorten Nucleotide Excisie Reparatie (NER) zijn er?

Answer 17

Globaal Genoom NER (traag proces)

Transcriptie Gekoppeld NER

Question 18

Wat voor ziekte is Xeroderma pigmentosum (XP)?

Answer 18

• door defect Globaal Genoom NER (GG-NER)
• zongevoeligheid
• droge, harde huid
• pigmentatie afwijkingen
• huidkanker (>1000x) !!!!
• versnelde neurologische achteruitgang
• autosomaal recessief

oorzaak: minstens 8 genen XPA, XPB, .. XPG

Question 19

Wat voor ziekte is Cockayne syndroom (CS)?

Answer 19

• door defect Transcriptie Gekoppeld NER (TC-NER)
• zongevoeligheid
• groeiachterstand
• neurologische achteruitgang
• netvliesafwijkingen
• versnelde veroudering (!!)
• GEEN huidkanker
• autosomaal recessief

Oorzaak: 2 genen CSA en CSB met XP: XPB, XPD, XPG