ZOOM sur les protéines

Question 1

Protides

Answer 1

Famille de biomolecules:
Peptides + protéines
Assemblage d’aa

Question 2

Cbn d’aa chez les Peptides

Answer 2

Nb d’aa< 50

Question 3

Cbn d’aa chez les protéines

Answer 3

> 50

Question 4

Qu’est ce que la structure primaire

Answer 4

L’enchaînement des acides aminés dans un ordre précis

1e niveau d’organisation protéique

Question 5

Cbn de protéines

Answer 5

20

Question 6

Comment appelle t on Les AA qui participent à la synthèse peptidique ?

Answer 6

AA protéinogènes

Question 7

AA essentiels

Answer 7

Provenant de l’alimentation

Question 8

AA non essentiels

Answer 8

Produits par la cellule

Question 9

Quelle est la masse moyenne d’un AA?

Answer 9

110 Dalton

Question 10

Qu’est ce que le Carbonne alpha

Answer 10

Le C sur lequel est fixé le grpmt amine -NH2 et le groupement acide carboxylique -COOH

Question 11

Que signifie : caractère amphotère

Answer 11

Un AA est amphotère c’est a dire qu’il a à la fois une fonction basique ( NH2) et une fonction acide ( cooH)

Question 12

Que ce passe-t-il a l’Aa quand le pH est acide

Answer 12

Fonction COOH n’est pas ionisée

La fonction NH2 est ionisée (+)

Question 13

Que ce passe-t-il a l’Aa a pH basique

Answer 13

Fonction COOH est ionisée (-)

Fonction NH2 pas ionisée

Question 14

Que ce passe t il a pH neutre pour l’Aa

Answer 14

Les 2 groupement sont ionisés
NH3+
COO-

Au lieu de NH2 et cooH

Question 15

Comment nommer la structure primaire d’une protéine ?

Answer 15

Écrire séquence d’aa de l’extrémité Nter a Cter

AA+suffixe -yl sauf pour le dernier dont le nom est en entier

Question 16

Comment classifier les AA

Answer 16

En fonction de

• l’encombrement stérique ( dépend de la taille de R)
• le caractère polaire ou apolaire de R

Question 17

Qu’est ce qu’un AA apolaire non ionisable

Answer 17

Ne peut pas interagir avec les molécules d’eau
Les AA apolaires non ionisables se regroupent entre eux quand ils sont en solution
Interactions hydrophobes-> lien avec architecture des protéines

Question 18

Quelles sont les 2 types de chaînes chez les AA apolaires?

Answer 18

Aliphatique

Aromatique

Question 19

Nommer Les AA apolaires à chaînes latérales aliphatiques

Answer 19

Faible hydrophobicité :
Glycine 
Alanine 
Forte hydrophobicité:
Valine 
Leucine
Isoleucine
Méthionine ( Relativement hydrophobe) 
Proline

Question 20

AA apolaires a chaîne laterale aromatique

Answer 20

Phénylalanine ( très hydrophobe)

Tryptophane ( pas très hydrophobe)

Question 21

Caractère des AA polaires

Answer 21

Ionisables
Caractère hydrophile

AA polaires chargé - ( acides)
AA polaires chargés + ( basiques)
AA polaires non chargés ( neutres)

Question 22

Nommer les AA polaires neutres

Answer 22

(Chaîne lateral A fonction alcool)
Sérine 
Thréonine 
Tyrosine 
(Chaîne laterale soufrée)
Cystéine 
(Chaîne laterale a fonction amide)
Asparagine 
Glutamine

Question 23

AA polaires ionisables

Answer 23

Chaîne laterale à fonction acide
Aspartate 
Glutamate
A fonction basique 
Histidine 
Lysine 
Arginine

Question 24

Le pHi=

Answer 24

pH de l’Aa auquel sa charge est nulle ( AA électroniquement neutre)

Question 25

pHi=

Answer 25

(pKa + pKb)/2

Question 26

Si pH ( di milieu) < pHi ( de l'Aa)

Answer 26

Alors AA est chargé+

Question 27

Si pH > pHi de l'Aa

Answer 27

Alors l'Aa est chargé-

Question 28

Si pH = pHi

Answer 28

Alors AA neutre

Question 29

Isomères:

Answer 29

Molécules de composition identique mais d'organisation différente

Question 30

Enantiomeres

Answer 30

Molécules qui sont images l'une à l'autre dans un miroir plan mais pas superposables Même propriété physique mais par rotatoire différents

Question 31

Domaine d'absorption des AA aromatiques

Answer 31

Absorbent UV entre 260 et 280 nm

Question 32

Ordre d'absorption des AA aromatiques

Answer 32

Tryptophane> Tyrosine> Phenylalanine | (280->260)nm

Question 33

Classement par hydrophobicité des AA

Answer 33

Hydrophobes: Valine leucine isoleucine phénylalanine Neutres Cystéine Méthionine Glycine Alanine Hydrophiles: Aspartate glutamate lysine arginine histidine Tryptophane sérine thréonine tyrosine asparagine et glutamine

Question 34

Qui fait de la glycosylation

Answer 34

Asparagine

Question 35

Qui fait de la phosphorylation

Answer 35

Sérine tyrosine et thréonine | Au bar on sert tire et trinque

Question 36

Qui fait de l'iodation

Answer 36

Tyrosine

Question 37

Qu'est ce que le pont disulfure

Answer 37

Liaison covalente entre 2 atomes de soufre et 2 cysteines

Question 38

Ou se trouve l'angle phy ( o)

Answer 38

Entre C alpha et N

Question 39

Où se trouve L'angle psy ( Y)

Answer 39

Entre Calpha et C

Question 40

Angle entre C et N

Answer 40

1,33 Angst

Question 41

Angle entre N et Calpha

Answer 41

1,45 Ang

Question 42

Angle entre C et O

Answer 42

1, 23 Angst

Question 43

Torsion autour d'une liaison C N

Answer 43

Soit 0° ( CIS) Soit 180° ( trans) Généralement on est en trans car plus stable ( pas d'encombrement)

Question 44

Endopeptidase:

Answer 44

coupe au milieu de la chaîne d'AA

Question 45

Exopeptidase

Answer 45

Coupe en n ter ou en c ter

Question 46

Structure primaire basée sur quel type de liaisons?

Answer 46

Covalentes