מצגת 1 Flashcards

(267 cards)

1
Q

כדי להגדיל את נפחו, תא האב הקדמון היה צריך לשמור על יחס ….. כדי לקיים את התפקודים החיוניים הרבים שמבצעות ….. לשם כך, נוצרו …. בתא האאוקריוטי

A

כדי להגדיל את נפחו, תא האב הקדמון היה צריך לשמור על יחס שטח פנים לנפח כדי לקיים את התפקודים החיוניים הרבים שמבצעות ממברנות. לשם כך, נוצרו האברונים בתא האאוקריוטי

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

ייתכן ששטח פני הממברנה גדל תחילה ע”י …. שבסופו של דבר …..

A

ייתכן ששטח פני הממברנה גדל תחילה ע”י בליטות (protrusions).
מה שאפשר החלפת מטבוליטים מוגברת עם הסביבה והקל על יחסים סימביוטים ובהדרגה התפתחו תאים גדולים יותר. בסופו של דבר המרווחים בין אותן בליטות נאטמו מהסביבה החיצונית הודות לאיחוי.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

הממברנה הגרעינית הפנימית מקורה ב….

A

הממברנה הגרעינית הפנימית מקורה בממברנת פלזמה קדמונית שהקיפה את הגנום, לכן היא רציפה עם ממברנות פנימיות אחרות שמקורן בממברנת הפלזמה, כולל הממברנה הגרעינית החיצונית.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

האברונים שמקורם בפרוקריוטים הם … וההוכחות לכך הן ….

A

האברונים שמקורם בפרוקריוטים הם מיטוכונדריה ופלסטיד (כלורופלסט). ההוכחות לכך הן שלאברונים אלו יש גנום משלהם וחלבונים שדומים לחלבונים שיש בבקטריות כיום. בנוסף, כמו הפרוקריוטים הם עטופים בממברנה כפולה ונשארים מבודדים מהתנועה הוסקולרית התאית שמחברת בין שאר האברונים וחוץ התא.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

האברונים שמקורם מחוץ התא הם … וההוכחה לכך היא ….

A

האברונים שמקורם מחוץ התא הם אי-אר, גולג’י, אנדוזום, ליזוזום ופרוקסיזום. ההוכחה לכך היא העובדה שהאברונים הללו מתקשרים זה עם זה ועם הסביבה החוץ תאית (החלל, הלומן, שלהם זהה מבחינה טופולוגית לחוץ התא).

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

ניתן לבצע התקשרות בין …. ע”י וזיקולות טרנספורט/תובלה (כולל חוץ התא). …. לא לוקחים חלק בתקשורת הזו.

A

ניתן לבצע התקשרות בין מדורים הזהים מבחינה טופולוגית ע”י וזיקולות טרנספורט/תובלה (כולל חוץ התא). מיטוכונדריות ופלסטידים לא לוקחים חלק בתקשורת הזו ומבודדים מההולכה הויזוקלרית.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

ניתן לחלק את המדורים התוך תאיים בתא אאוקריוטי ל- 3 משפחות מרכזיות. מהן?

A

1 . הגרעין והציטוזול
שווים טופולוגית (למרות ששונים מאד פונקציונלית )nuclearporecomplex ומחוברים דרך ה
2 . מערכת ההפרשה והמערכת האנדוציטית
ER , גולג’י, אנדוזומים, ליזוזמים, וזיקולות תובלה ביניהן והפירוקסיזומים.
3 . האורגנלות שנובעות מאנדוסימביוזה
.(מיטוכונדריה ופלסטידים (בצמחים בלבד

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

הגנום החיידקי, הכלורופלסטי והמיטוכנודריאלי בדרך כלל …. ומאורגן בצורה דומה.

A

הגנום החיידקי, הכלורופלסטי והמיטוכנודריאלי בדרך כלל מעגלי ומאורגן בצורה דומה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

הריבוזומים של הכלורופלסט מאוד דומים לריבוזומים של חיידקים הן …. והן
….

A

הריבוזומים של הכלורופלסט מאוד דומים לריבוזומים של חיידקים הן במבנה שלהם והן
ברגישות לאנטיביוטיקות )כלורמפניקול, סטרפטומיצין, אריתרומיצין, טטרציקלין(.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

ישנם כ- 1200-1600 מיני חלבונים שונים במיטוכונדריה, כאשר רובם המכריע מקודד ע”י …..
יותר מ- 95% מחלבוני הכלורופלסט מקודדים בדרך כלל ע”י ……

A

ישנם כ- 1200-1600 מיני חלבונים שונים במיטוכונדריה, כאשר רובם המכריע מקודד ע”י הגנום
הגרעיני, כולל האנזימים הנדרשים לביטוי הגנום ברוב המינים.
הגנום של הכלורופלסט גדול מזה של המיטוכונדריה ומקודד לכמה אנזימים המעורבים בשעתוק
ובתרגום, אבל למרות זאת יותר מ- 95% מחלבוני הכלורופלסט מקודדים בדרך כלל בגנום הגרעיני.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Biomolecular condensates

A

ארגונים דינמיים והפיכים של מאקרומולקולות שמשמשים לתא מקור לאחסון או לפעילות ביוכימית כלשהי, ולא עטופים בממברנה.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

חלבון או חומצת גרעין אחת או יותר המקיימים אינטראקציה יכולים לשמש כ… בקונדנסטים ביומולקולריים

A

חלבון או חומצת גרעין אחת או יותר המקיימים אינטראקציה יכולים לשמש כפיגומים (scaffolds) בקונדנסטים ביומולקולריים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

מקרומולקולות הפיגום יוצרות את הקונדנסט באמצעות ….

A

מקרומולקולות הפיגום יוצרות את הקונדנסט באמצעות מספר רב של אינטראקציות חלשות ודינמיות בינן לבין עצמן.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

מקרומולקולות הפיגום מגייסות חלבונים וחומצות גרעין ספציפיות לקונדנסט כ….

A

מקרומולקולות הפיגום מגייסות חלבונים וחומצות גרעין ספציפיות לקונדנסט כמקרומולקולות לקוח (clientmacromolecules) .

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

הלקוחות בקונדנסטים נשארים בתוך הקונדנסט מכיוון ש….. כאשר הלקוח מתנתק ממולקולת הפיגום, ישנו סיכוי גבוה ל….. בדרך זו, ניתן לרכז קבוצה מסוימת של חלבונים וחומצות גרעין למבנה תאי.

A

הלקוחות בקונדנסטים נשארים בתוך הקונדנסט מכיוון שמולקולת הפיגום מכילות אתרי קישור רבים. כאשר הלקוח מתנתק ממולקולת הפיגום, ישנו סיכוי גבוה יותר להיקשר לאתר אחר על מולקולת הפיגום או לאתר סמוך
בתוך הקונדנסט מאשר להתפזר לגמרי. בדרך זו, ניתן לרכז קבוצה מסוימת של חלבונים וחומצות גרעין למבנה תאי.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

הקונדנסט הגדול ביותר בתאים אאוקריוטיים הוא …. , שבו ….

A

הקונדנסט הגדול ביותר בתאים אאוקריוטיים הוא הגרעינון, המבנה בתוך הגרעין שבו מורכבים הריבוזומים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

מרכיב הפיגום המרכזי של הגרעינון הוא

A

מרכיב הפיגום המרכזי של הגרעינון הוא
pre-rRNA
בהתהוות שמשועתק באופן פעיל
מגנים שמקודדים
rRNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

ממה מורכב קונדנסט הגרעינון ובאיזו כמות?

A

בסך הכל, יותר מ-400 חלבונים ורנ”א תורמים ליצירת הקונדנסט העצום הזה

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

קונדנסטים מולקולרים קיימים בכל האורגניזמים/באורגניזמים מסוימים

A

קונדנסטים מולקולרים קיימים בכל האורגניזמים.
תאים אאוקריוטיים מכילים תריסר או יותר סוגים שונים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

מהו קוטרם של הקונדנסטים?

A

קוטרם של הקונדנסטים נע בין 50 ננומטר (קצת יותר מריבוזום) למיקרומטר או יותר במקרה של גרעינון.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

האינטראקציות של הקונדנסט יכולות להיות פחות דינמיות ככל ש……
תכונותיו יכולות להשתנות מ… ל

A

האינטראקציות של הקונדנסט יכולות להיות פחות דינמיות ככל שנוספות אינטראקציות עם הזמן. תכונותיו יכולות להשתנות מנוזל לג’ל ולבסוף אף למוצק כשאינטראקציות הקשירה מתייצבות.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

יש רצף לספקטרום התכונות הפיזיות שמאפיינות קונדנסטים שונים. תאים יכולים לנצל את ההבדלים הללו וליצור …..

A

יש רצף לספקטרום התכונות הפיזיות שמאפיינות קונדנסטים שונים. תאים יכולים לנצל את ההבדלים הללו וליצור קונדנסטים בתוך קונדנסטים

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

מה התופעה של קונדנסטים בתוך קונדנסטים מסבירה בהקשר לגרעינון?

A

התופעה של קונדנסטים בתוך קונדנסטים מסבירה איך הגרעינון מופרד לאזורים שונים מורפולוגית שכל אחד מהם מועשר בסט של חלבונים שונים שמיועדים לאספקטים שונים של בניית הריבוזומים.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

מה מונע ממאקרומולקות חיצוניות מהסביבה להצטרף לקונדנסט?
ומי בניגוד אליהן יכול להכנס אליו?

A

האינטרקציות בין המאקרומולקולות בתוך הקונדנסט מונעת ממאקרומולקולות חיצוניות מהסביבה להצטרף אליו.
בניגוד אליהן, נוקליאוטידים, מטבוליטים, קו-פקטורים ומולקולות קטנות נוספות יכולות לעבור דיפוזיה מהירה אל הקונדנסט ולעבור אינטראקציה ותגובות עם אנזימים המצויים בו

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
מה גורם לתגובות האנזימתיות בקונדנסט לקרות בצורה מהירה ויעילה?
התוצרים שנוצרים מהתגובות האנזימתיות יכולים להגיב בתגובות אנזימתיות אחרות עם אנזימים אחרים שמצויים באותו קונדנסט לפני שהתוצר מתפזר החוצה. כך תגובות אנזימתיות קורות בצורה מהירה ויעילה יותר, משום שהאנזימים מרוכזים במקום אחד.
26
כיצד ניתן ניתן ליצור ולפרק קונדנסט?
קונדנסטים ביומולקולרים נוצרים ומתפרקים בהתאם לצורך ניתן ליצור ולפרק אותם ע"י שינוי האינטראקציות בין המאקרמולקולות. ניתן לעשות זאת לרוב על ידי מודיפיקציות כמו פוספורלציה (מנגנון שנמצא בשימוש רב על מנת ליצור ולפרק במהירות צברי סיגנל על הממברנה הפלזמטית) היווצרות ופירוק הקונדנסט יכולים להישלט גם ע"י שינויים במצב התא כמו טמפ', אסומולריות ו pH
27
?מהו היתרון של הרברסביליות של הקונדסט
הרברסביליות של הקונדסט מנוצלת על ידי התאים לבקרה וזה מאפשר לתא גמישות ומהירות באדפטציה לצרכים משתנים
28
מתי גרנולות סטרס נוצרות? למה הן משמשות? stressgranule
גרנולות סטרס נוצרות רק כשהתא חווה סוגים מסוים של סטרס והן מתפרקות כשהסטרס מוסר. הן נוצרות כשיש חסימה להתחלת תרגום וחשיפת אזורים ב-אמ רנ"א שבאופן נורמלי אמורים להיות מכוסים על ידי ריבוזומים מתרגמים. כשהאזורים הללו נחשפים, האמ רנ"א יוצרים אינטראקציה אחד עם השני ועם חלבונים קושרי רנ"א ומצטברים לקונדנסט. מאמינים כי הקונדנסטים שנוצרים בתהליך משמשים כמחסן לאותן מולקולות רנ"א והפקטורים הנדרשים כל עוד הן לא בשימוש פעיל. בכך באופן זמני אותן מאקרומולקולות עוברות סיקווסטרינג במקום דגרדציה בזמן הסטרס, וכשיוסר הסטרס התא לא יצטרך לייצר אותן מחדש.
29
גרנולות סטרס הן דוגמה ל.... stressgranule
לכך שקונדנסטים ביומולקולרים נוצרים ומתפרקים בהתאם לצורך
30
למרות הפונקציות השונות שלהם, לכל הממברנות הביולוגיות יש מבנה כללי משותף: כל ממברנה היא שכבה דקה מאוד של .... ו....., המוחזקים יחד בעיקר על ידי אינטראקציות .....
למרות הפונקציות השונות שלהם, לכל הממברנות הביולוגיות יש מבנה כללי משותף: כל ממברנה היא שכבה דקה מאוד של שומנים וחלבונים, המוחזקים יחד בעיקר על ידי אינטראקציות לא קוולנטיות
31
הממברנה הדו-שכבתית מספקת מבנה .... ומשמשת כמחסום אטום יחסית למעבר לרוב המולקולות ה .....
הממברנה הדו-שכבתית מספקת מבנה פלואידי ומשמשת כמחסום אטום יחסית למעבר לרוב המולקולות המסיסות במים.
32
יש סוגים רבים של חלבוני ממברנה שמאפשרים לתא לתפקד ולקיים אינטראקציה עם סביבתו. ההערכה היא שכ.... מהחלבונים שמקודדים בגנום של בעלי חיים הם חלבוני ממברנה.
30%
33
הליפידים שמרכיבים את הממברנה מסודרים בדו- שכבה בעובי של כ....
5 ננומטר
34
ניתן לייחס את המבנה הדו-שכבתי של הממברנה באופן בלעדי לתכונות המיוחדות של מולקולות ...., הנאספות באופן ... לממברנה דו-שכבתית אפילו בתנאים מלאכותיים פשוטים
ניתן לייחס את המבנה הדו-שכבתי של הממברנה באופן בלעדי לתכונות המיוחדות של מולקולות הליפידים, הנאספות באופן ספונטני לממברנה דו-שכבתית אפילו בתנאים מלאכותיים פשוטים
35
מולקולות ליפידים מהוות כ ... מהמסה של רוב הממברנות של התאים האנימליים, כמעט כל השאר הוא ...
מולקולות ליפידים מהוות כ 50% מהמסה של רוב הממברנות של התאים האנימליים, כמעט כל השאר הוא חלבון
36
כמה מולקולות שומנים יש בתא דם אדום?
יש בערך 6^10*5 לפידים באזור של 1Mn*1Mn או 7*8^10 מולקולות שומנים בממברנה תא דם אדום.
37
כל הליפידים בממברנת התא הם .... בעלי קצה .... וקצה .....
כל הליפידים בממברנת התא הם אמפיפיליים (Amphiphile) בעלי קצה הידרופילי ("אוהב מים") או קוטבי וקצה הידרופובי ("ירא מים") או לא קוטבי.
38
הליפידים הנפוצים ביותר בממברנה הם ..... ולהם ראש פולרי שמכיל ......, וזנב הידרופובי שמכיל .....
הליפידים הנפוצים ביותר בממברנה הם הפוספוליפידים - phospholipids. להם ראש פולרי שמכיל קבוצת פוספט, וזנב הידרופובי שמכיל שתי שרשרות פחמנים.
39
בתאי בעלי חיים, צמחים וחיידקים, הזנבות של הפוספוליפידים הם חומצות שומן שיכולות להיות שונות באורכם. בדרך כלל הן מכילות .... אטומי פחמן.
בתאי בעלי חיים, צמחים וחיידקים, הזנבות של הפוספוליפידים הם חומצות שומן שיכולות להיות שונות באורכם. בדרך כלל הן מכילות בין 14 ל- 24 אטומי פחמן.
40
בפוספוליפיד, לזנב אחד יש בדרך כלל קשר כפול מסוג ..... ואילו בזנב השני .....
בפוספוליפיד, לזנב אחד יש בדרך כלל קשר כפול מסוג cis אחד או יותר (הוא בלתי רווי), ואילו בזנב השני אין (קשר כפול (הוא רווי כל קשר כפול מסוג cis יוצר עיוות בזנב.
41
כל קשר כפול מסוג .... יוצר עיוות בזנב הפוספוליפיד
cis
42
הבדלים באורך וברוויה של זנבות חומצת השומן משפיעים על .....
הבדלים באורך וברוויה של זנבות חומצת השומן משפיעים על נזילות הממברנה.
43
הפוספוליפידים העיקריים ברוב ממברנות תאי בעלי החיים הם ..... ומה שמאפיין אותם זה.....
הפוספוליפידים העיקריים ברוב ממברנות תאי בעלי החיים הם גליצרופוספוליפידים ( glycerophospholipids ) מה שמאפיין אותם זה שלד של גליצרול.
44
קונדנסטים קיימים רק באאוקריוטים/גם בפרוקריוטים?
קונדנסטים קיימים גם בפרוקריוטים
45
קונדנסטים קיימים רק בתוך הגרעין או גם מחוצה לו?
קונדנסטים קיימים גם בתוך וגם מחוץ לגרעין
46
מהם הגליצרופוסופליפידים הנפוצים ביותר בממברנות של תאי יונקים?
פוספטידיל-סרין, פוספוטידיל-אתנול-אמין ופוספטידיל כולין
47
?מהו המטען של פוספטידיל-סרין
סרין הוא ניטרלי, פוספט הוא שלילי. לכן פוספטידיל-סרין הוא שלילי.
48
?מהו המטען של פוספוטידיל-אתנול-אמין
אתנולאמין הוא חיובי, פוספט הוא שלילי. לכן פוספוטידיל-אתנול-אמין הוא ניטרלי.
49
מהו המטען של פוספטידיל כולין?
כולין הוא חיובי, פופסט הוא שלילי, לכן פוספטידיל כולין הוא ניטרלי
50
מלבד הגליצרופספליפידים, מחלקה חשובה נוספת של פוספוליפידים הם ה.... הבנויים משלד של.....
מלבד הגליצרופספליפידים, מחלקה חשובה נוספת של פוספוליפידים הם הספינגולידים הבנויים משלד של ספינגוזין.
51
ספינגוזין הוא חומצת שומן ארוכה עם קבוצת .... ושתי קבוצות .....
ספינגוזין הוא חומצת שומן ארוכה עם קבוצת אמינו (NH2) ושתי קבוצות הידרוקסיל (OH)
52
צראמיד מורכב מ.... על הצרמיד יכולות להיקשר קבוצת .... ..... לקבלת..
צראמיד מורכב מספינוגוזין וחומצת שומן אחת. על הצרמיד יכולות להיקשר קבוצת פוספו-כולין לקבלת ספינגומיאלין.
53
לספינגומיאלין, הספינגוליפיד הנפוץ בממברנות, יש זנב של ח.שומן שמצומד ל...., וקבוצת פוספו-כולין מחוברת ל ......
לספינגומיאלין, הספינגוליפיד הנפוץ בממברנות, יש זנב של ח.שומן שמצומד לקבוצה האמינית, וקבוצת פוספו-כולין מחוברת לקצה הטרמינלי של ההידרוקסיל.
54
ספינגומיאלין מורכב מ...
כולין. פוספט. ספינגוזין, חומצת שומן אחת.
55
מה אינו מרכיב של ספינגוזין? א. שרשרת פחמימנים ב. קבוצת אמין ג. הידרוקסיל ד. פוספאט
ד. פוספאט
56
ביחד, כמה הפוספוליפידים פוספטידיל-כולין פוספטידיל-אתנול-אמין, פוספאטידיל-סרין וספינגו-מיאלין מהווים ממסת השומנים ברוב ממברנות תאי היונקים?
ביחד, הפוספוליפידים פוספטידיל-כולין פוספטידיל-אתנול-אמין, פוספאטידיל-סרין וספינגו-מיאלין מהווים יותר ממחצית מסת השומנים ברוב ממברנות תאי היונקים.
57
מהו המטען של ספינגומיאלין?
כולין הוא חיובי, פופסט הוא שלילי, לכן ספינגומיאלין הוא ניטרלי
58
סטרולים הם בעלי מבנה .... הקשורים לסטרואידים, אך מכילים קבוצת ..... אחת וזנב ......
סטרולים הם בעלי מבנה טבעתי קשיח הקשורים לסטרואידים, אך מכילים קבוצת הידרוקסיל פולרית אחת וזנב פחמימתי לא פולרי.
59
סוגים שונים של סטרולים, שמובחנים בעיקר על ידי ..... קיימים בפטריות, צמחים ותאים אנימלים.
סוגים שונים של סטרולים, שמובחנים בעיקר על ידי שרשרת הצד שמחוברת ל scaffold הטבעתי קיימים בפטריות, צמחים ותאים אנימלים.
59
מיהו הסטרול המרכזי בתאים אנימלים וכיצד הוא מתארגן בממברנה?
כולסטרול הוא הסטרול המרכזי בתאים אנימלים. כולסטרול מתארגן בממברנה כך שקבוצת הראש הפולרית קרובה לקבוצות הראש הפולריות של פוספוליפידים סמוכים.
60
הממברנה הפלזמטית של תאים אאוקריוטים מכילה כמות .... של סטרולים- עד לכדי יחס של .... עם המולקולות הפוספוליפידיות.
הממברנה הפלזמטית של תאים אאוקריוטים מכילה כמות גדולה במיוחד של סטרולים- עד לכדי יחס של 1:1 עם המולקולות הפוספוליפידיות.
61
ליפידים עם מרכיב סוכרי כלפי חוץ התא (במקום פוספט) הם
גליקוליפידים
62
גליקוליפידים הם
ליפידים עם מרכיב סוכרי כלפי חוץ התא במקום פוספט
63
בצמחים וחיידקים השלד של גליקוליפידים הוא .... , ובתאים אנימליים השלד הוא .....
בצמחים וחיידקים השלד של גליקוליפידים הוא גליצרול, ובתאים אנימליים השלד הוא ספינגוזין
64
היכן גליקוליפידים נמצאים נמצאים בממברנה ולמה?
גליקוליפידים נמצאים אך ורק בשכבה בממברנה שלא פונה לציטוזול, זאת משום שהסוכר שלהם מתווסף בגולג'י.
65
גליקוליפידים נוטים להתאסף יחד, בגלל קשרי המימן בין הסוכרים שלהם ובגלל קשרי הואן-דר ואלס בין הזנבות הארוכים והישרים שלהם, לכן ימצאו לרוב ב ....
lipidrafts
66
כמה אחוז מהשכבה החיצונית של הממברנה גליקוליפידים מרכיבים?
גליקוליפידים מרכיבים כ- 5% מהשכבה החיצונית של הממברנה.
67
גליקוליפידים כוללים את ה... המכילים חומצה .... וכך נותנים מטען שלילי לממברנה. יש מעל 40 סוגים של גנגליוזידים בתאי עצב.
גליקוליפידים כוללים את הגנגליוזידים המכילים ח.סיאלית וכך נותנים מטען שלילי לממברנה. יש מעל 40 סוגים של גנגליוזידים בתאי עצב.
68
שני סוגים של גליקוליפידים הם
galactocerebroside מאחר שהסוכר בקבוצת הראש שלו לא טעון, נקרא גם netural glycolipid ו- GM1 ganglioside מכיל תמיד אחד או יותר חלקי חומצה סיאלית בעלת מטען שלילי. ח.סיאלית בתאים אנושיים היא NANA
69
כאשר מולקולות אמפיפיליות נחשפות לסביבה מימית, הן באופן ... יתארגנו כדי .... ומצד שני, הן .....
כאשר מולקולות אמפיפיליות נחשפות לסביבה מימית, הן באופן ספונטני יתארגנו כדי "לקבור" את זנבותיהן ההידרופוביים בפנים. מצד שני, הן יחשפו את ראשיהן ההידרופיליים למים.
70
מולקולות אמפיפיליות במים יכולות להתנהג בשתי דרכים שהן
מיצלות- צורה כדורית של ממברנה עם פוספוליפיד עם זנב שומני אחד הפונה פנימה. יריעות דו שכבתיות- שני הזנבות ההידרופוביים דחוסים אחד מול השני בין קבוצות הראש ההידרופיליות.
71
מולקולה אמפיפילית בצורת חרוט/קונוס תיצור במים .... בעוד שמולקולה אמפיליפית בצורת גליל/צילינדר תיצור במים .....
מולקולה אמפיפילית בצורת חרוט/קונוס תיצור במים מיצלה. בעוד שמולקולה אמפיליפית בצורת גליל/צילינדר תיצור במים יריעה דו שכבתית.
72
מיצלה תיווצר בעזרת ..... בעוד שיריעה דו שכבתית תיווצר בעזרת .....
מיצלה תיווצר בעזרת מולקולה אמפיפילית בצורת חרוט/קונוס (זנב שומני אחד) בעוד שיריעה דו שכבתית תיווצר בעזרת מולקולה אמפיליפית בצורת גליל/צילינדר (שני זנבות)
73
אותם כוחות שמניעים פוספוליפידים ליצור ממברנות דו- שכבתיות מספקים .... ע"י כך ש .....
אותם כוחות שמניעים פוספוליפידים ליצור ממברנות דו- שכבתיות מספקים יכולת תיקון עצמית ע"י כך שקרע קטן בדו-שכבה יוצר קצה חופשי עם מים. מכיוון שזה לא מועדף מבחינה אנרגטית, השומנים נוטים להתארגן מחדש באופן ספונטני כדי לבטל את הקצה החופשי.
74
בסגירה ספונטנית של דו שכבה פוספוליפידית ליצירת תא אטום, המבנה הסגור יציב מכיוון ש.....
הוא מונע חשיפת זנבות פחמימנים הידרופוביים למים, דבר שהיה לא מועדף אנרגטית.
75
מבנה נוסף , לרוב מבנה מלאכותי, שיכול להיווצר על ידי התארגנות של ליפידים הוא
מבנה נוסף , לרוב מבנה מלאכותי, שיכול להיווצר על ידי התארגנות של ליפידים הוא ליפוזום liposome
76
ליפוזומים נוטים/לא נוטים להתאחות זה לזה באופן ספונטני בתוך מים? מהי הסיבה לכך
ליפוזומים לא נוטים להתאחות זה לזה באופן ספונטני בתוך מים. הסיבה לכך היא שהראשים הפולרים של הפוספוליפידים קושרים מולקולות מים ויונים שצריך להסיר כדי ששני ליפוזומים יוכלו להתקרב ולהתאחות.
77
מה מונע ממברנות פנימיות בתא להתאחות באופן לא מבוקר ומאפשר לשמור על המבנה של האברונים?
בממברנות ביולוגיות יש שכבת מים שמקיפה אותן שהיא עוד יותר גדולה הודות לחלבונים שבהן, מה שמונע ממברנות פנימיות בתא להתאחות באופן לא מבוקר וזה מאפשר לשמור על המבנה של האברונים.
78
כל איחוי ממברנלי בתא מזורז קטליטית ומבוקר על ידי
כל איחוי ממברנלי בתא מזורז קטליטית ומבוקר על ידי חלבונים שמקרבים את הממברנות tetheringproteins וחלבוני איחוי fusionproteins שמסלקים את שכבת המים שמפרידה בין הממברנות.
79
חוקרים גילו על ידי ליפוזומים שליפידים יכולים לעבור דיפוזיה חופשית בתוך הממברנה הדו- שכבתית. מהם 3 הסוגים עיקריים של תנועות בממברנה?
Flip-flop - מעבר בין שכבה אחת לשנייה. דורשת אנרגיה ועזרה מאנזימים. תדירות- פעם אחת בכמה שעות (איטי בגלל שהראש ההידרופילי צריך עבור דרך הליבה ההידרופובית של הדו-שכבה, מה שמאד לא מועדף אנרגטית). יוצא דופן הוא כולסטרול שיכול לעבור פליפ-פלופ במהירות. תנועה לטרלית- מעבר והחלפה בין פוספוליפיד אחד לאחר הצמוד לו. תנועה מאוד שכיחה כי לא דורשת הרבה אנרגיה. תדירות- 107 תנועות בשנייה, או מרחק של 1-2 מיקרומטר בשנייה אם עוקבים אחרי מולקולה מסומנת. תנועת רוטציה- יחסית שכיחה
80
תארי את תנועת ה Flip-flop בממברנה האם דורשת אנרגיה? מהי התדירות שלה?
מעבר בין שכבה אחת לשנייה. דורשת אנרגיה ועזרה מאנזימים. תדירות- פעם אחת בכמה שעות (איטי בגלל שהראש ההידרופילי צריך עבור דרך הליבה ההידרופובית של הדו-שכבה, מה שמאד לא מועדף אנרגטית). יוצא דופן הוא כולסטרול שיכול לעבור פליפ-פלופ במהירות.
81
תארי את התנועה הלטרלית בממברנה האם דורשת אנרגיה? מהי התדירות שלה?
מעבר והחלפה בין פוספוליפיד אחד לאחר הצמוד לו. תנועה מאוד שכיחה כי לא דורשת הרבה אנרגיה. תדירות- 107 תנועות בשנייה, או מרחק של 1-2 מיקרומטר בשנייה אם עוקבים אחרי מולקולה מסומנת.
82
הפלואידיות של הממברנה תלויה הן .... והן ....
הפלואידיות של הממברנה תלויה הן בהרכב שלה והן בטמפרטורה שלה.
83
שינוי הממברנה ממצב נוזלי למצב קשיח (כמו ג'ל) נקרא
phase transition
84
phase transition מתאר מצב בו
הממברנה השתנתה ממצב נוזלי למצב קשיח ,כמו ג'ל
85
הממברנה תהיה יותר פלואידית כאשר
הטמפ' גבוהה (יש שומנים שאינם רוויים (קשרי ציס כפולים. יש שרשראות קצרות יותר של שומנים (יעברו פחות אינטראקציה עם שרשראות סמוכות באותה שכבה או (בשכבה השנייה
86
כאשר השומנים לא רווים ושרשראות השומנים קצרות יותר, הטמפ' שבה הממברנה תעבור ממצב נוזלי לג'לי phase transition תהיה ......
כאשר השומנים לא רווים ושרשראות השומנים קצרות יותר, הטמפ' שבה הממברנה תעבור ממצב נוזלי לג'לי phase transition תהיה נמוכה יותר.
87
מתי הטמפ' שבה הממברנה תעבור ממצב נוזלי לג'לי phase transition תהיה נמוכה יותר?
כאשר השומנים לא רווים ושרשראות השומנים קצרות יותר
88
חיידקים, שמרים ושאר אורגניזמים אשר הטמפרטורה בסביבתם משתנה משנים בהתאם את .... בממברנה שלהם כדי לשמור על נוזליות קבועה יחסית.
חיידקים, שמרים ושאר אורגניזמים אשר הטמפרטורה בסביבתם משתנה משנים בהתאם את הרכב חומצות השומן בממברנה שלהם כדי לשמור על נוזליות קבועה יחסית. למשל, אם הטמפ' יורדת התאים מסנתזים חומצות שומן עם יותר קשרים כפולים מסוג cis .
89
הממברנה התאית מורכבת ממיקס של ליפידים שונים, וההרכב הזה עוזר לה ....
הממברנה התאית מורכבת ממיקס של ליפידים שונים, וההרכב הזה עוזר לה לשמור על מצב נוזלי בטמפרטורות קרובות ל phasetransition
90
כיצד קשרים כפולים מסוג cis תורמים לפלואידיות הממברנה?
הקשרים הכפולים מקשים על אריזת שרשראות השומנים יחד ובכך מקשים כל הקפאת הדו שכבה. בנוסף, מכיוון ששרשראות הפחמימנים של שומנים בלתי רווים מפוזרות יותר זו מזו, דו שכבות שומנים המכילות אותן דקות יותר מדו שכבות הנוצרות אך ורק משומנים רווים.
91
כיצד משפיע קשר כפול בפוספוליפידים על הממברנה? א . מאפשר הוספה של כולסטרול. ב. מעלה את הפלואידיות של הממברנה. ג. לא מאפשר יצירת ליפוזומים במבחנה. ד. מאפשר קשירת חלבונים טרנסממברנלים.
ב. מעלה את הפלואידיות של הממברנה.
92
האינטראקציה בין סטרול לפוספוליפידים .... את האזורים הללו. מדוע?
האינטרקציה הזו מקשיחה את האזורים הללו. בעזרת ההפחתה במוביליות של הפחמימנים בשרשרת הפופספוליפידים, הכולסטרול הופך את השכבה הליפידית הכפולה לפחות ניתנת לשינוים. כך באותו אזור יש גם הפחתה בחדירות של הממברנה למולקולות שמומסות במים.
93
למרות שכולסטרול מהדק את האריזה של ליפידים בממברנה, הוא אינו גורם לממברנה להיות פחות פלואידית. מדוע?
מכיוון שהוא מונע משרשראות הפחמימינים להתקרב זו לזו ולהתגבש.
94
מהו התפקיד הכפול של מולקולות הכולסטרול בממברנה?
כשהממברנה פלואידית, הוא מייצב פוספוליפידים עם ח.שומן בלתי-רוויות (עם קשרים כפולים) ע"י צימודם ודחיסתם. וכך הופך את הממברנה לפחות פלואידית. כשהממברנה קשיחה, כאשר יש ספינגוליפידים ופוספוליפידים ארוכים עם ח.שומן רוויות (בלי קשרים כפולים) הוא נוטה לגרום לממברנה להיות פלואידית יותר.
95
למרות שהאינטרקציה בין סטרול לפוספוליפידים .....הוא .....
למרות שהאינטרקציה בין סטרול לפוספוליפידים מקשיחה אזורים בממברנה (הפחתה במוביליות של הפחמימנים, הפיכת השכבה הליפידית לפחות ניתנת לשינוים והפחתה בחדירות של הממברנה למולקולות מומסות במים), הוא אינו גורם לממברנה להיות פחות פלואידית מכיוון שהוא מונע משרשראות הפחמימינים להתקרב זו לזו ולהתגבש.
96
כשהממברנה פלואידית, הכולסטרול ..... וכשהממברנה קשיחה, הוא .....
כשהממברנה פלואידית, הכולסטרול מייצב פוספוליפידים עם ח.שומן בלתי-רוויות (עם קשרים כפולים) ע"י צימודם ודחיסתם. וכך הופך את הממברנה לפחות פלואידית. כשהממברנה קשיחה, כאשר יש ספינגוליפידים ופוספוליפידים ארוכים עם ח.שומן רוויות (בלי קשרים כפולים) הוא נוטה לגרום לממברנה להיות פלואידית יותר.
97
אנו עשויים לצפות שהליפידים בממברנות יתערבבו ויפוזרו באופן אקראי, שהרי קשרי הואן דר-ואלס בין הזנבות הם לא סלקטיבים מספיק כדי להחזיק קבוצות של פוספוליפידים יחד. עם זאת, ראו במחקרים שכאשר מוסיפים ליפידים מסוימים בממברנה מלאכותית ....
ניתן לצפות בהתאחדות של ליפידים ספציפיים בדומיינים נפרדים. כך יש מעבר מפאזה פחות מסודרת לפאזה יותר מסודרת.
98
בדומיינים ממברנלים כוחות המשיכה בין הליפידים .....
חייבים להיות חזקים מספיק כדי להתגבר על הנטייה שלהם להתפזר באופן אקראי (שהרי כשהם מפוזרים יש פחות יותר אנטרופיה)
99
הממברנה שנוצרת בליפוזום המורכב מתערובת פופסוטודיל-כולין וספינגומיאלין ביחס של 1:1 היא .... הממברנה שנוצרת בליפוזום המורכב מתערובת פוספטידיל-כולין, ספינגומיאלין וכולסטרול ביחס של 1:1:1 היא .....
הממברנה שנוצרת בליפוזום המורכב מתערובת פופסוטודיל-כולין וספינגומיאלין ביחס של 1:1 היא אחידה. הממברנה שנוצרת בליפוזום המורכב מתערובת פוספטידיל-כולין, ספינגומיאלין וכולסטרול ביחס של 1:1:1 היא לא אחידה.
99
כולסטרול, ספינגוליפידים, גליקוליפידים, חלבונים טרנסממברנליים. וחלבונים מעוגני GPI יוצרים בממברנה ....
רפסודות ממברנליות- lipid rafts דומיינים מתמחים
99
מהן רפסודות ממברנליות (lipid rafts) ומה הן מכילות?
רפסודות ממברנליות- lipid rafts הן דומיינים מתמחים בממברנה המכילים כולסטרול, ספינגוליפידים, גליקוליפידים, חלבונים טרנסממברנליים. וחלבונים מעוגני GPI
99
הממברנה שנוצרת בליפוזום המורכב מתערובת ..... ו...... ביחס .... היא אחידה. הממברנה שנוצרת בליפוזום המורכב מתערובת ...., ..... ו.... ביחס של .... היא לא אחידה.
הממברנה שנוצרת בליפוזום המורכב מתערובת פופסוטודיל-כולין וספינגומיאלין ביחס של 1:1 היא אחידה. הממברנה שנוצרת בליפוזום המורכב מתערובת פוספטידיל-כולין, ספינגומיאלין וכולסטרול ביחס של 1:1:1 היא לא אחידה.
100
היווצרות הדומיינים הממברנלים/הרפסודות הממברנליות היא ..... הדומיינים יכולים להיות קטנים (ננומטרים) ויכולים להיות גדולים כך ....
היווצרות הדומיינים הממברנלים/הרפסודות הממברנליות היא דינמית וזמנית. הדומיינים יכולים להיות קטנים (ננומטרים) ויכולים להיות גדולים כך שניתן לראות אותם במיקרוסקופ אלקטרונים כמו) caveolae (שקשור לאנדוציטוזה
101
הדומיינים הממברנלים/הרפסודות הממברנליות נוצרים על ידי ..... הדומיינים הללו .... יותר לעומת שאר הממברנה
הדומיינים הממברנלים/הרפסודות הממברנליות נוצרים על ידי אינטראקציות חלשות. הדומיינים הללו עבים יותר לעומת שאר הממברנה.
102
רפסודות ליפידיות עוזרות לקבץ מרכיבים שונים יחד וזה יכול לתרום ל..... או כדי לסייע ב .....
רפסודות ליפידיות עוזרות לקבץ מרכיבים שונים יחד וזה יכול לתרום לטרנספורט וסיקולרי (כנראה הכוונה ל caveolae) או כדי לסייע במסלולים של מעבר סיגנלים על ידי המרה של סיגנל חוץ תאי לתוך תאי.
103
חלבון איי וחלבון בי יכולים לעבור דיפוזיה לטרלית בדומיינים שלהם בלבד/בשני הדומיינים.
חלבון איי וחלבון בי יכולים לעבור דיפוזיה לטרלית בדומיינים שלהם בלבד. חלק מזה הודות לצמתי אטימה.
104
טיפות שומן fatdroplets או lipiddroplets זו הדרך של רוב התאים האאוקריוטים ל..... מהם ניתן .....
טיפות שומן fatdroplets או lipiddroplets זו הדרך של רוב התאים האאוקריוטים לאגור שומן עודף. מהם ניתן לייצר אבני בניין לסינתזת ממברנה או מקור אנרגיה.
104
ליפידים בשכבה החיצונית של הממברנה לא/כן יכולים לעבור דיפוזיה בין שני הדומיינים, ואילו ליפידים בשכבה הפנימית הציטוזולית כן/לא יכולים לעבור דיפוזיה לטרלית בין שני הדומיינים.
ליפידים בשכבה החיצונית של הממברנה לא יכולים לעבור דיפוזיה בין שני הדומיינים, ואילו ליפידים בשכבה הפנימית הציטוזולית כן יכולים לעבור דיפוזיה לטרלית בין שני הדומיינים.
105
מה הם אדיפוציטים
אדיפוציטים הם תאי שומן - מתמחים באגירת שומן ויש להם טיפות שומן ענקיות שממלאות כמעט את כל הציטופלזמה ואינן מסיסות במים. ברוב התאים האחרים יש טיפות שומן מעטות וקטנות יותר. באדיפוציטים, טיפות שומן מתמזגות ויכולות להגיע לגודל עצום
106
טיפות שומן קבועות/משתנות בתא?
גם הגודל וגם הכמות משתנים לפי המצב המטבולי בתא.
107
טיפות שומן אוגרות בעיקר
טריאציל-גליצרול (מכונים גם טריגלצרידים) וכולסטרול-אסטר.
108
כיצד טיפות שומן נוצרות?
ליפידים ניטרלים מופקדים בין שתי שכבות ממברנת ה ER ויוצרים מבנה דמוי עדשה בין השכבות. העדשה נוצרת בזמן יצירת טריגליצרידים וכולסטריל-אסתר שנאגרים בממברנה ועוברים אגרגציה עצמית. עותקים רבים של החלבון הטרנסממברנלי סייפין (seipin) מתאספים ליצירת טבעת יחד עם lipid droplet assembly factor . בנוכחות טריגליצרידים סייפין מתנתק מפקטור ה- assembly והפקטור נודד אל השכבה הציטוזולית בממברנה, שם הוא עוזר לתהליך בו טיפת השומן המנצה מתמלאת בליפידים לא פולריים, ונצבטת החוצה ( pinches off ) כאורגנלה ייחודית המוקפת בשכבה אחת של פוספוליפידים וחלבונים. בחלק מהתאים, כמו באדיפוציטים, הטיפות מתאחות ויכולות להגיע לגדלים עצומים.
109
טריאציל-גליצרול (מכונים גם טריגלצרידים) וכולסטרול-אסטר מרכיבים לרוב
טיפות שומן
110
הממברנה אינה/הינה סימטרית מבחינת ההרכב שלה- יש מרכיבים שונים/זהים בעלעל הפנימי והחיצוני.
הממברנה אינה סימטרית מבחינת ההרכב שלה- יש מרכיבים שונים בעלעל (leaflet) הפנימי והחיצוני. הא-סימטריות הזו קריטית למסלולי מעבר סיגנלים בתא
111
איזה שומנים נמצאים באיזה עלעל בממברנה של אריתרוציטים / תאי דם אדומים ? מה עובדה זו מסבירה?
בעלעל הממברנה החיצוני נמצאים- פוספוטידיל-כולין וספינגומיאלין PC , SM . בעלעל הממברנה הפנימי נמצאים- פוספוטידיל-אתנולאמין, פוספוטידיל-אינוזיתול ופוספטידיל-סרין PE , PI , PS . כולסטרול נמצא באופן שווה בין הצד הפנימי לחיצוני זו הסיבה שיש הבדל במטען החשמלי בין שני צידי הממברנה- השכבה הפנימית שלילית יותר, בין היתר כי פוספטידיל-סרין טעון שלילית. הא-סימטריות הזו קריטית למסלולי מעבר סיגנלים בתא
112
מהי הסיבה שיש הבדל במטען החשמלי בין שני צידי הממברנה אריתרוציטים / תאי דם אדומים ?
השכבה הפנימית שלילית יותר, מאחר והיא מכילה פוספטידיל-סרין שטעון שלילית. הא-סימטריות הזו קריטית למסלולי מעבר סיגנלים בתא
113
איזה שומנים נמצאים בעלעל הממברנה החיצוני של אריתרוציטים / תאי דם אדומים ?
פוספוטידיל-כולין וספינגומיאלין PC , SM . כולסטרול נמצא באופן שווה בין הצד הפנימי לחיצוני
114
איזה שומנים נמצאים בעלעל הממברנה הפנימי של אריתרוציטים / תאי דם אדומים ?
פוספוטידיל-אתנולאמין, פוספוטידיל-אינוזיתול ופוספטידיל-סרין PE , PI , PS . כולסטרול נמצא באופן שווה בין הצד הפנימי לחיצוני
115
הא-סימטריות של הממברנה לא נוצרת באופן אקראי, אלא על ידי אנזימים שצורכים אנרגיה. האנזימים (הידועים כטרנסלוקטורים של פוספוליפידים) הם
פליפאז - מעביר לצד הפנימי של הממברנה. בעיקר את פוספוטידיל-סרין ואת פוספוטידיל-אתנול-אמין. דורש ATP. סקרמבלאז - טרנסלוקטור של פוספוליפידים, בצורה בלתי-סלקטיבית. גורם לערבוב ולכן לסימטריה של הממברנה. רוב הזמן לא פעיל בממברנה ולא דורש ATP . פי 100,000 מהיר יותר מהפליפ-פלופ הרגיל. פלופאז- מעביר לצד החיצוני של הממברנה. בעיקר את פוספוטידיל-כולין וספינגומיאלין. דורש .ATP מוגדר כמשאבה מסוג איי בי סי טרנספורטר.
116
האנזים פליפאז מעביר לצד ה___ של הממברנה. בעיקר את _____. דורש/לא דורש ATP.
האנזים פליפאז מעביר לצד הפנימי של הממברנה. בעיקר את פוספוטידיל-סרין ואת פוספוטידיל-אתנול-אמין. דורש ATP.
117
האנזים ____ הינו טרנסלוקטור של פוספוליפידים, בצורה בלתי-סלקטיבית. גורם ל___ ולכן ל___ של הממברנה. רוב הזמן פעיל/לא פעיל בממברנה ודורש/לא דורש ATP . פי 100,000 מהיר יותר מהפליפ-פלופ הרגיל.
האנזים סקרמבלאז הינו טרנסלוקטור של פוספוליפידים, בצורה בלתי-סלקטיבית. גורם לערבוב ולכן לסימטריה של הממברנה. רוב הזמן לא פעיל בממברנה ולא דורש ATP . פי 100,000 מהיר יותר מהפליפ-פלופ הרגיל.
118
האנזים ___ מעביר לצד החיצוני של הממברנה. בעיקר את _____ ו______. דורש/לא דורש .ATP מוגדר כמשאבה מסוג איי בי סי טרנספורטר.
האנזים פלופאז מעביר לצד החיצוני של הממברנה. בעיקר את פוספוטידיל-כולין וספינגומיאלין. דורש .ATP מוגדר כמשאבה מסוג איי בי סי טרנספורטר.
119
בעלי חיים מנצלים את הא-סימטריה של הממברנה כדי _____. כיצד?
בעלי חיים מנצלים את הא-סימטריה של הממברנה כדי להבחין בין תאים חיים ומתים. כאשר תאי בעלי חיים עוברים אפופטוזיס (מוות תאי מתוכנן) פוספטידיל-סרין עובר במהירות אל העלעל החיצוני של הממברנה. הפוספטידיל-סרין שנחשף על פני התא מאותת לתאים שכנים, כגון מקרופאגים כדי לעודד פגוציטוזה של התא המת ולעכל אותו.
120
פוספטידיל-סרין שעובר במהירות אל העלעל החיצוני של הממברנה מסמן ____ דבר זה מדגים כיצד ____
שתא בעל החיים עובר אפופטוזיס (מוות תאי מתוכנן). הפוספטידיל-סרין שנחשף על פני התא מאותת לתאים שכנים, כגון מקרופאגים כדי לעודד פגוציטוזה של התא המת ולעכל אותו. דבר זה מדגים כיצד בעלי חיים מנצלים את הא-סימטריה של הממברנה כדי להבחין בין תאים חיים ומתים.
121
כמעט כל הליפידים של התא מיוצרים ב___ כולל פוספוליפידים וכולסטרול.
כמעט כל הליפידים של התא מיוצרים בממברנת ה - ER .כולל פוספוליפידים וכולסטרול.
122
הפוספוליפיד העיקרי הוא ____ שכולל ____
הפוספוליפיד העיקרי הוא פופסטידילכולין PC שכולל מולקולת כולין, פוספט, גליצרול ושתי חומצות שומן.
123
כיצד פופסטידילכולין, פוספטידיל-אתנולמין, פוספטידיל-סרין ופוספטידיל-אינוזיטול מיוצרים?
חומצת שומן מועברת אל ה ER על ידי חלבון ציטוזולי קושר חומצת שומן fatty acid binding protein ומחוברת שם אל גליצרול 3 -פוספט ליצירת חומצה פוספטידית, שמשמשת כפרקורסור ליצירת פוספוליפידים עם קבוצות ראש שונות.
123
איזה ליפידים מיוצרים באותה הדרך ומהי?
פופסטידילכולין, פוספטידיל-אתנולמין, פוספטידיל-סרין ופוספטידיל-אינוזיטול. חומצת שומן מועברת אל ה ER על ידי חלבון ציטוזולי קושר חומצת שומן fatty acid binding protein ומחוברת שם אל גליצרול 3 -פוספט ליצירת חומצה פוספטידית, שמשמשת כפרקורסור ליצירת פוספוליפידים עם קבוצות ראש שונות.
124
Ceramide הוא מרכיב של: .1חומצת אמינו. .2 כולסטרול. .3 ספינגוליפיד. .4 פוספוליפיד
ספינגוליפיד
125
הכמות וסוג החלבונים משתנים בין ממברנה אחת לאחרת. בממברנת המיאלין באקסונים של תאי עצב, ___ אחוז ממסת הממברנה היא חלבון. לעומת זאת, בממברנות המעורבות בייצור ATP כגון ____, כ- ___ אחוז ממסת הממברנה היא חלבון. בממברנה פלזמטית טיפוסית ___ אחוז ממסת הממברנה היא חלבונים.
בממברנת המיאלין באקסונים של תאי עצב, פחות מ- 25% ממסת הממברנה היא חלבון. לעומת זאת, בממברנות המעורבות בייצור ATP כגון הממברנות הפנימיות של מיטוכונדריה וכלורופלסטים, כ- 75% ממסת הממברנה היא חלבון. ממברנה פלזמטית טיפוסית נמצאת איפשהו באמצע, כאשר 50% ממסת הממברנה היא חלבונים.
126
בממברנה פלזמטית טיפוסית ___ אחוז ממסת הממברנה היא חלבונים. עם זאת, מכיוון שליפידים הם ___ בהשוואה לחלבונים, תמיד יש הרבה/פחות ליפידים מחלבונים- כ- ___ ליפידים על כל חלבון בממברנה.
בממברנה פלזמטית טיפוסית 50% ממסת הממברנה היא חלבונים. עם זאת, מכיוון שליפידים הם קטנים בהשוואה לחלבונים, תמיד יש הרבה יותר ליפידים מחלבונים- כ- 50 ליפידים על כל חלבון בממברנה.
127
חלבוני הממברנה הם ___ - יש להם קצה ___ וקצה ____.
חלבוני הממברנה הם אמפיפילים - יש להם קצה הידרופובי וקצה הידרופילי.
128
מהם חלבונים אינטגרלים/ טרנסממברנליים? תני 3 דוגמאות לחלבונים כאלו.
חלבונים אינטגרלים/ טרנסממברנליים- חוצים את הממברנה. החלק ההידרופובי שלהם עובר דרך הממברנה ומקיים אינטראקציה עם הזנבות ההידרופוביים של הליפידים. האזורים ההידרופיליים שלהם חשופים למים בשני הצדדים של הממברנה. דוגמאות: אלפא הליקס יחיד,מספר אלפא הליקסים, חבית β
129
ליפידים יכולים להיות מחוברים לצד ה____ של חלבונים טרנסממברנלים כדרך נוספת ל____.
ליפידים יכולים להיות מחוברים לצד הציטוזולי של חלבונים טרנסממברנלים כדרך נוספת לעגן אותם לממברנה.
130
חלבונים טרנסממברנלים מוחזקים בממברנה כשהמסה העיקרית שלהם פונה באופן חלקי/כמעט בלעדי כלפי צד אחד של הממברנה. תני שתי דוגמאות.
חלבונים טרנסממברנלים מוחזקים בממברנה כשהמסה העיקרית שלהם פונה באופן כמעט בלעדי כלפי צד אחד של הממברנה. דוגמאות: 1. גליקוזיל טרנספראזות בגולג'י שמבצעות גליקוזילציה בגולג'י. 2. חלבוני SNARE שמזרזים איחוי.
131
חלבונים שממוקמים במלואם בציטוזול נוצרים ב____, ומחוברים לעלעל הציטוזולי של הממברנה על ידי: 1. ____ 2. ____
חלבונים שממוקמים במלואם בציטוזול נוצרים בציטוזול, ומחוברים לעלעל הציטוזולי של הממברנה על ידי: 1. סליל α אמפיפילי עוגן ליפידי שמחובר קוולנטית לחלבון, 2. שיכול להיות חומצת שומן או קבוצת prenyl
132
חלבונים שחשופים לחלוטין על פני שטח התא מחוברים לממברנה על ידי _____ החלבונים הללו נוצרים ב ____ כאשר ______
חלבונים שחשופים לחלוטין על פני שטח התא מחוברים לממברנה על ידי קישור קוולנטי לאוליגוסכריד ספציפי שהוא .מחובר לעוגן ליפידי בממברנה החלבונים הללו נוצרים ב ER כאשר בתוך ה ER החלק הטרנסממברנלי נחתך ובמקומו מתווסף glycosylphosphatidylinositol (GPI) . בסופו של דבר החלבון עובר טרנספורט לממברנה על ידי וסיקולות.
133
?מה הם חלבונים פריפריאליים ?כיצד הם יכולים להשתחרר מהממברנה האם חלבונים אינטגרלים וחלבונים שמצומדים לעוגן ליפידי יכולים להשתחרר בדרכים אלו?
חלבונים שמצומדים לחלבונים אינטגרלים (membrane associated proteins) החלבונים הללו מחוברים בקשרים לא קוולנטים לחלבון ממברנלי אחר. רבים מהחלבונים מסוג זה יכולים להשתחרר מהממברנה על ידי הליכי מיצוי עדינים יחסית, כמו חשיפה לתמיסות בעלות חוזק יוני גבוה מאוד או נמוך או בעלות pH קיצוני, אשר מפריעות לאינטראקציות בין חלבון לחלבון אך משאירות את הממברנה שלמה. חלבונים אינטגרלים וחלבונים שמצומדים לעוגן ליפידי אינם יכולים להשתחרר בדרכים אלו.
134
מהן הקבוצות הליפידיות לחלבונים מעוגנים?
מיריסיטול- myristoyl פלמיטול- palmitoyl פרנסיל- farnesyl
135
לחלבון טרנס-ממברנלי תמיד יש אוריינטציה ייחודית בממברנה. זֶה משקף גם את _____ וגם את ______
לחלבון טרנס-ממברנלי תמיד יש אוריינטציה ייחודית בממברנה. זֶה משקף גם את האופן הא-סימטרי שבו הוא מוחדר לממברנה ב ER במהלך הסינתזה שלו וגם את התפקידים השונים שלו בתחום הציטוזול ובתחום החוץ תאי.
136
החלק של החלבון שעטוף בממברנה מורכב ברובו מחומצות אמינו פולריות/לא פולריות
החלק של החלבון שעטוף בממברנה מורכב ברובו מחומצות אמינו לא פולריות.
137
הקשרים הפפטידים עצמם הם ____ לכן הם יוצרים קשרי ____ אחד עם השני. יצירת הקשרים היא מקסימלית אם השרשרת הפוליפפטידית יוצרת ____ וכך לרוב נראה המבנה של רוב המקטעים החלבוניים שחוצים את הממברנה.
הקשרים הפפטידים עצמם הם פולריים לכן הם יוצרים קשרי מימן אחד עם השני. יצירת הקשרים היא מקסימלית אם השרשרת הפוליפפטידית יוצרת סליל .α וכך לרוב נראה המבנה של רוב המקטעים החלבוניים שחוצים את הממברנה.
138
דרך נוספת למקסם את יצירת קשרי המימן בין הקשרים הפפטידים היא על ידי ______
דרך נוספת למקסם את יצירת קשרי המימן בין הקשרים הפפטידים היא על ידי strands רבים שמאורגנים בבטא sheet בצורת צילינדר
139
אפשר להשתמש ב____ על מנת לדעת כמה פעמים החלבון חוצה את הממברנה.
עקומת הידרופתיות Hydropathy index
140
מתי משתמשים בעקומת הידרופתיות Hydropathy index וכיצד?
משתמשים בעקומת הידרופתיות על מנת לדעת כמה פעמים החלבון חוצה את הממברנה. כאשר ההליקס הוא הידרופובי נדרשת אנרגיה כדי להעבירו מתמיסה לא פולארית למים. מספר חומצות אמינו - X ציר האינדקס ההידרופתי - Y ציר אם הערך חיובי הסגמנט הוא הידרופובי, ואם הערך הוא שלילי הסגמנט הוא הידרופילי.
141
הסגמנטים ההידרופוביים של סליל אלפא מכילים ____ חומצות אמינו.
הסגמנטים ההידרופוביים של סליל אלפא מכילים 20-30 חומצות אמינו.
142
בעקבות ____ מעריכים ש- ___% מכלל החלבונים של האורגניזמים הם חלבונים טרנסממברנליים.
בעקבות עקומת הידרופתיות Hydropathy index מעריכים ש- 30% מכלל החלבונים של האורגניזמים הם חלבונים טרנסממברנליים.
143
לא ניתן לזהות ____ בעקומת הידרופתיות, משום ש
לא ניתן לזהות חביות β בעקומת הידרופתיות, משום ש- 10 חומצות אמינו או פחות מספיקות כדי לעבור בממברנה במבנה של גדיל בטא פרוס, ורק כל חומצת אמינו שנייה היא הידרופובית.
144
כיצד סלילי אלפא "מגנים" על סלילי אלפא אחרים מפני הליפידים בממברנה בחלבונים טרנסממברנלים? מדוע יכולת זו חשובה?
כשסלילי האלפא נארזים ביחד לצורה הסופית של החלבון, פני השטח החיצוניים שלהם חשופים לשכבה הליפידים ומורכבים בעיקר מחומצות אמינו הידרופוביות. הצד הפנימי של הצרור החלבוני לא חשוף באופן ישיר לליפידים, ויכול להכיל חומצות אמינו פולריות וטעונות שבאופן רגיל היו לא מועדפות בממברנה. היכולת הזו להכיל חומצות אמינו הידרופיליות חשובה ליצירת אתרי קשירה ותעלות למולקולות הידרופיליות. התכונה הזו מאפשרת לחלבונים שחוצים כמה פעמים מגוון יחסית רחב של תפקודים ביולוגים, והיא כנראה מסבירה למה הם רוב החלבונים בממברנה.
145
כיצד מתאפשרים אתרי קשירה ותעלות למולקולות הידרופיליות בחלבונים טרנסממברנלים המוקפים בליפידים הידרופוביים בממברנה?
סלילי אלפא "מגנים" על סלילי אלפא אחרים מפני הליפידים בממברנה- כשסלילי האלפא נארזים ביחד לצורה הסופית של החלבון, פני השטח החיצוניים שלהם חשופים לשכבה הליפידים ומורכבים בעיקר מחומצות אמינו הידרופוביות. הצד הפנימי של הצרור החלבוני לא חשוף באופן ישיר לליפידים, ויכול להכיל חומצות אמינו פולריות וטעונות שבאופן רגיל היו לא מועדפות בממברנה. היכולת הזו להכיל חומצות אמינו הידרופיליות חשובה ליצירת אתרי קשירה ותעלות למולקולות הידרופיליות. התכונה הזו מאפשרת לחלבונים שחוצים כמה פעמים מגוון יחסית רחב של תפקודים ביולוגים, והיא כנראה מסבירה למה הם רוב החלבונים בממברנה.
146
בניגוד לאלפא הליקסים שיכולים להיות מאורגנים במס' צורות, חביות בטא יכולות להתארגן בצורת _____ מדוע?
בניגוד לאלפא הליקסים שיכולים להיות מאורגנים במס' צורות, חביות בטא יכולות להתארגן בצורת צילינדר בלבד זאת מכיוון שכל קשרי המימן צריכים להתרחש, כך שלא יהיה sheet שחושף קצה משום שזה לא מועדף אנרגטית. מה שאומר שכל חביות הבטא חולקות את אותה ארכיטקטורה כשחומצות האמינו שפונות לצד החיצוני של הצילינדר הן הידרופוביות.
147
כל חביות הבטא חולקות את אותה ארכיטקטורה כשחומצות האמינו שפונות לצד החיצוני של הצילינדר הן _____.
הידרופוביות
148
חלבוני חבית בטא β-barrel הם שכיחים בממברנות החיצוניות של ______
חלבוני חבית בטא β-barrel הם שכיחים בממברנות החיצוניות של חיידקים, מיטוכונדריה וכלורופלסטים
149
חלק מחביות הבטא יוצרים פורות, שיוצרות ערוצים ____ שמאפשרים _____
חלק מחביות הבטא יוצרים פורות, שיוצרות ערוצים מלאים במים שמאפשרים למולקולות סלקטיביות קטנות והידרופיליות לחצות את הממברנה.
150
בחביות בטא, חומצות אמינו פולריות יוצרות את החלק ה___ של התעלה, בעוד שחומצות אמינו לא פולריות יוצרות את החלק ה___ של התעלה שפונה לליפידים בממברנה.
בחביות בטא, חומצות אמינו פולריות יוצרות את החלק הפנימי של התעלה, בעוד שחומצות אמינו לא פולריות יוצרות את החלק החיצוני של התעלה שפונה לליפידים בממברנה.
151
חביות בטא נוטים ליצור מבנים ____, ולכן ____. הודות לכך קל יותר לזהות אותם ב
חביות בטא נוטים ליצור מבנים קשיחים, ולכן יציבים. הודות לכך קל יותר לזהות אותם בקריסטלוגרפיית x-ray .
152
מספר משטחי בטא (β strands) בכל חבית בטא נע בין
מספר משטחי בטא (β strands) בכל חבית בטא נע בין 8-22.
153
רוב החלבונים בתאים האאוקריוטים והפרוקריוטים שחוצים את הממברנה בנויים מסלילי אלפא/מחביות בטא? מדוע?
רוב החלבונים בתאים האאוקריוטים והפרוקריוטים שחוצים את הממברנה בנויים מסלילי אלפא! סלילי אלפא מאפשרים ליצור שינויים בחלבון, כך שאם מדובר בתעלה – היא תוכל להיפתח ולהיסגר. לעומת זאת, חבית בטא בקושי מאפשרת שינויים במבנה החלבון.
154
היכן סביר למצוא מבנים של חביות בטא באחוז גבוה יותר? א. ממברנה פלסמטית. ב. גולג'י. ג. ER . ד. מיטוכונדריה.
ד. מיטוכונדריה.
155
הממברנה הפלזמטית חשופה לסביבה החוץ תאית שהיא בדרך כלל קשה ומשתנה ללא הרף. מהו אחד ההסברים לכך שהממברנה והחלבונים בה מוגנים מנזקים?
אחד ההסברים הוא שלתאים רבים יש שרשראות אוליגוסכרידים ופוליסכרידים שמחוברות לליפידים והחלבונים שפונים כלפי חוץ.
156
הממברנה הפלזמטית חשופה לסביבה החוץ תאית שהיא בדרך כלל קשה ומשתנה ללא הרף. על מנת שהממברנה והחלבונים בה יהיו מוגנים מנזקים, רוב החלבונים הטרנסממברנליים בבעלי חיים עוברים ____
גליקוזילציה
157
על מנת שהממברנה והחלבונים בה יהיו מוגנים מנזקים, רוב החלבונים הטרנסממברנליים בבעלי חיים עוברים ____. בדומה לגליקוליפידים, גם בחלבונים שיירי הסוכר מתווספים ב____ וה____. לכן השרשרת האוליגוסכרידית תמיד תימצא בצד ה-____ של הממברנה הפלזמתית.
על מנת שהממברנה והחלבונים בה יהיו מוגנים מנזקים, רוב החלבונים הטרנסממברנליים בבעלי חיים עוברים גליקוזילציה. בדומה לגליקוליפידים, גם בחלבונים שיירי הסוכר מתווספים בלומן של ה ER והגולג'י. לכן השרשרת האוליגוסכרידית תמיד תימצא בצד הלא ציטוזולי של הממברנה הפלזמתית- בחוץ התא.
158
תוך התא הוא סביבה ___- מה שגורם לקשרים דיסולפידים ____ . ואילו בסביבה החוץ תאית ____ והם
תוך התא הוא סביבה מחזרת (מוסיפה פרוטונים)- מה שגורם לקשרים דיסולפידים להתפרק בתוך התא. ( S-S ) ואילו בסביבה החוץ תאית יש יותר קשרים די-סולפידים ( S-S ) והם לוקחים חלק בייצוב המבנה המקופל של החלבון.
159
הכיסוי הסוכרי של החלבונים הטרנסממברנלים נקרא
glycocalyx או cell coat . מתאר את שטח פני התאים שעשיר בסוכרים- המעטפת הסוכרית.
160
מה המושג glycocalyx מתאר?
את שטח פני התאים שעשיר בסוכרים- המעטפת הסוכרית של החלבונים הטרנסממברנלים.
161
ניתן לראות את המעטפת הסוכרים של החלבונים הטרנסממברנלים על ידי צביעה באמצעות _____ . וגם באמצעות האפיניות של המעטפת הסוכרית לחלבונים שנקשרים לסוכרים הנקראים ____, כך שניתן לסמן את ה____ על ידי צבע פלורסנטי.
ניתן לראות את המעטפת הסוכרים של החלבונים הטרנסממברנלים על ידי צביעה באמצעות ruthenium red , וגם באמצעות האפיניות של המעטפת הסוכרית לחלבונים שנקשרים לסוכרים הנקראים לקטינים, כך שניתן לסמן את הלקטינים על ידי צבע פלורסנטי.
162
רוב הסוכרים קשורים למולקולות____, וישנם סוכרים כמו ____ ו____ שהופרשו ל ECM ונצמדו לשטח פני התא, כך שהגבול בין ממברנת התא ל ECM _____
רוב הסוכרים קשורים למולקולות תוך ממברנליות, וישנם סוכרים כמו גליקופרוטאינים ופרוטאוגליקנים שהופרשו ל ECM ונצמדו לשטח פני התא, כך שהגבול בין ממברנת התא ל ECM לא תמיד ברור.
163
תפקיד אחד מתוך תפקידים רבים של המעטפת הסוכרית על חלבונים טרנסממברנלים הוא _____, תפקיד נוסף הוא _______ .
תפקיד אחד מתוך תפקידים רבים של המעטפת הסוכרית על חלבונים טרנסממברנלים הוא להגן על התאים מפני נזק מכאני וכימי, תפקיד נוסף הוא לשמור מרחק בין תאים וכך למנוע אינטראקציות לא רצויות.
164
דטרגנטים הם חומרים ____. לכן הם מפריעים ל_____, הורסים את ____ והופכים את החלבונים הממברנליים ל.
דטרגנטים הם חומרים אמפיפטיים. לכן הם מפריעים לאסוציאציות הידרופוביות, הורסים את הממברנה והופכים את החלבונים הממברנליים למסיסים.
165
דטרגנטים מסיסים יותר במים או בשומן?
דטרגנטים מסיסים יותר במים מאשר בשומן.
166
האם הקצה הפולרי של דטרגנטים חייב להיות יוני ?
לא. הקצה הפולרי של דטרגנטים יכול להיות יוני או לא יוני.
167
תני שתי דוגמאות לדטרגנטים לא-יוניים ודוגמה אחת לדטרגנט יוני
דטרגנטים לא-יוניים: Triton X-100 b-octylglucoside דטרגנט יוני: Sodium dodecyl sulfate (SDS)
168
מה הוא Triton X-100?
דטרגנט לא יוני
169
מה הוא b-octylglucoside?
דטרגנט לא יוני
170
מה הוא Sodium dodecyl sulfate (SDS)?
דטרגנט יוני
171
בגלל שהם בצורת ____ דטרגנטים יוצרים ____ ולא .
בגלל שהם בצורת חרוט דטרגנטים יוצרים מיצלות ולא יריעה דו שכבתית.
172
בריכוזים נמוכים, מולקולות דטרגנט ____ בתמיסה. בריכוזים גבוהים, כש____, חלק ממולקולות הדטרגנט
בריכוזים נמוכים, מולקולות דטרגנט מונומריות בתמיסה. בריכוזים גבוהים, כשהריכוז שלהן עולה מעל הריכוז הקריטי של המיצלות CMC חלק ממולקולות הדטרגנט יוצרות מיצלות
173
מתי מולקולות הדטרגנט יצרו מיצלות?
בריכוזים גבוהים, כשהריכוז שלהן עולה מעל הריכוז הקריטי של המיצלות CMC
174
ריכוז המונומרים של הדטרגנט ____ מעל ה CMC כיצד?
ריכוז המונומרים של הדטרגנט נשאר קבוע מעל ה CMC. מעל ה CMC מולקולות הדטרגנט עוברות דיפוזיה מהירה פנימה והחוצה מהמיצלה, ובכך שומרות על ריכוז המונומרים בתמיסה קבוע.
175
כיצד ריכוז המונומרים של הדטרגנט נשאר קבוע מעל ה CMC?
מעל ה CMC מולקולות הדטרגנט עוברות דיפוזיה מהירה פנימה והחוצה מהמיצלה, ובכך שומרות על ריכוז המונומרים בתמיסה קבוע.
176
דטרגנטים ___ כמו ____ יכולים לגרום אפילו לחלבוני הממברנה ההידרופוביים ביותר להפוך למסיסים. זה מאפשר ניתוח של חלבונים בעזרת שיטת _____ .
דטרגנטים יוניים חזקים כמו SDS יכולים לגרום אפילו לחלבוני הממברנה ההידרופוביים ביותר להפוך למסיסים. זה מאפשר ניתוח של חלבונים בעזרת שיטת SDS-PAGE.
177
דטרגנטים ___ כמו ____ יכולים לגרום אפילו לחלבוני הממברנה ההידרופוביים ביותר להפוך למסיסים. כיצד?
דטרגנטים יוניים חזקים כמו SDS יכולים לגרום אפילו לחלבוני הממברנה ההידרופוביים ביותר להפוך למסיסים. דטרגנטים חזקים אלו שנקשרו לאזור ההידרופובי של החלבון גורמים לקיפול לא תקין שלו (דנטורציה) ובכך מפסיקים את פעילותו ותפקודו. לאחר מכן ניתן לבודד אותם מהמרכיבים האחרים ובכך לטהר את החלבונים. בחלק מהמקרים אף להחזיר את תפקודם ע"י הסרת SDS
178
חלבוני ממברנה רבים יכולים להיות מומסים ומטוהרים *בצורה הפעילה שלהם* על ידי שימוש ב
דטרגנטים חלשים
179
דטרגנטים יונים חזקים גורמים ל____ של החלבון ובכך _____ (בחלק מהמקרים ניתן ______). לעומתם, דטרגנטים חלשים
דטרגנטים יונים חזקים גורמים לקיפול לא תקין של החלבון (דנטורציה) ובכך מפסיקים את פעילותו ותפקודו. (בחלק מהמקרים ניתן להחזיר את התפקוד ע"י הסרת אס די אס). לעומתם, דטרגנטים חלשים אינם מובילים לשינוי בקיפול החלבון.
180
במיוחד כשעובדים עם חלבונים שחוצים כמה פעמים, חשוב לשמור ש_____ בעת המיצוי בעזרת הדטרגנט, שזה יחקה את הסביבה הטבעית של החלבון, כדי ______.
במיוחד כשעובדים עם חלבונים שחוצים כמה פעמים, חשוב לשמור שתהיה שכבה דקה של ליפידים בעת המיצוי בעזרת הדטרגנט, שזה יחקה את הסביבה הטבעית של החלבון, כדי לשמר את פעילותו.
181
דטרגנטים ____ מכסים את האזורים ההידרופוביים הפרושים בסגמנטים של הממברנה וכך הופכים לחשופים לאחר הסרת הליפידים, אך הם אינם מובילים לשינוי בקיפול החלבון.
דטרגנטים חלשים
182
מהם תפקידי ממברנת התא?
תחימת מדורים - Compartmentalization שלד לפעילויות ביוכימיות - scaffold הממברנה מספקת מחסום סלקטיבי חדיר - טרנספורטרים למשל מעבר מומסים- מאפשר לספוג חומרים לתא תגובה לסיגנלים חיצוניים - רצפטורים למשל אינטראקציה בין תאית- בין תאים שכנים מעבר של אנרגיה- פוטוסינתזה- פיגמנטים
183
גרעינון Nucleolus האתר בו מעובד _____ ומורכב לתוך ______. הגודל של הגרעינון משקף את ___. .גודלו משתנה בתאים שונים ויכול להשתנות באותו התא, כתלות ב___. יכול להוות ___% מנפח הגרעין בתאים שמייצרים כמות גדולה מאוד של חלבונים.
גרעינון Nucleolus האתר בו מעובד rRNA ומורכב לתוך תת היחידות של הריבוזום. הגודל של הגרעינון משקף את מספר הריבוזומים שהתא מייצר. גודלו משתנה בתאים שונים ויכול להשתנות באותו התא, כתלות בצרכי התא. יכול להוות 25% מנפח הגרעין בתאים שמייצרים כמות גדולה מאוד של חלבונים.
184
rRNA -מהווה כ-__% מה- RNA בתאים, בעוד ש- mRNA מהווה
rRNA -מהווה כ-80% מה- RNA בתאים, בעוד ש- mRNA מהווה רק 3-5%
185
snRNA ולעומתם snoRNA
מולקולות מסוג רנ"א שנמצאות בגרעין שמכוונות את תהליך השחבור. מולקולות מסוג רנ"א שנמצאות בגרעינון שמכוונות את העיבוד של rRNA .
186
snRNP
מולקולת snRNA עם 7 תתי יחידות חלבוניות לפחות, לדוגמא U1 , U2 ,U4 , U5 , U6
187
snoRNP
מולקולת snoRNA שקשורה לחלבונים
188
הגופיפים הגרעיניים
גופיפי קחאל- CajalBodies צברים של אינטרכרומטין גרנולה ("נקראים גם "כתמים"- Speckles )
189
גופיפי קחאל הם אתרים שבהם _____. בניגוד לכך, צברי האינטרכרומטין גרנולה ככל הנראה מהווים
גופיפי קחאל הם אתרים שבהם snRNPs ו- snoRNPs עוברים את שלבי המטורציה הסופיים שלהם, והיכן ש snRNPs עוברים מחזור והרנ"א שלהם עובר "איפוס" לאחר תהליכי הארגון מחדש. בניגוד לכך, צברי האינטרכרומטין גרנולה ככל הנראה מהווים מאגר של snRNPs בוגרים לחלוטין ואלמנטים נוספים שקשורים לעיבוד רנ"א, שמוכנים לשימוש ביצירה של mRNA
190
פגיעה בסוג מסוים של גופיף גרעיני היא בעלת אפקט ____ על חיות התא.
קטן
191
הפונקציה העיקרית של גופיפים גרעיניים היא ______ כדי ______. תני דוגמה.
הפונקציה העיקרית של גופיפים גרעיניים היא להביא מרכיבים תאיים ביחד בריכוז גבוה כדי להאיץ את ההרכבה שלהם. לדוגמא: מוערך שההרכבה של snRNP מסוג U4/U6 קורת פי 10 מהר יותר בגופיפי קחאל לעומת מה שהיה קורה אם אותם מרכיבים היו מפוזרים על פני הגרעין כולו
192
גופיפי קחאל נראים מיותרים בסוגים רבים של תאים אבל הם לגמרי דרושים במצבים בהם _____, כמו ב_____. במצב זה, סינתזת חלבון (שתלויה בשחבור רנ"א) חייבת להיות מהירה, ועיכובים עלולים להיות לטאליים (גורמים לתמותה.
גופיפי קחאל נראים מיותרים בסוגים רבים של תאים אבל הם לגמרי דרושים במצבים בהם התאים צריכים להתחלק במהירות, כמו בהתפתחות המוקדמת של בעלי חוליות. במצב זה, סינתזת חלבון (שתלויה בשחבור רנ"א) חייבת להיות מהירה, ועיכובים עלולים להיות לטאליים (גורמים לתמותה.
193
המעטפת הגרעינית Nuclear envelope מורכבת מ_____ (בדומה למיטוכונדריה ולכלורופלסט)- חיצונית ופנימית. למרות שהממברנות הן המשכיות (הפנימית קשורה ל____, החיצונית המשכית ל ___) הן מכילות הרכב חלבונים _____.
המעטפת הגרעינית Nuclear envelope- מורכבת מ- 2 ממברנות דו שכבתיות (בדומה למיטוכונדריה ולכלורופלסט)- חיצונית ופנימית. למרות שהממברנות הן המשכיות (הפנימית קשורה למטריקס הגרעיני, החיצונית המשכית ל ER הן מכילות הרכב חלבונים שונה.
194
Karyoplasm/Nucleoplasm
הנוזל הפנימי בגרעין
195
הלמינה הגרעינית nuclear lamina רשת חלבונית המספקת ____ למעטפת הגרעינית. הלמינה משמשת גם כ___ עבור כרומוזומים וגם כ__ בתוך הגרעין. הלאמינה מחוברת גם לשלד התא הציטופלזמטי דרך קומפלקסים חלבוניים ומהווה קישור סטרוקטורלי בין __, ___ ו___.
הלמינה הגרעינית nuclear lamina רשת חלבונית המספקת תמיכה מבנית למעטפת הגרעינית. הלמינה משמשת גם כאתר עיגון עבור כרומוזומים וגם כשלד בתוך הגרעין. הלאמינה מחוברת גם לשלד התא הציטופלזמטי דרך קומפלקסים חלבוניים ומהווה קישור סטרוקטורלי בין מעטפת הגרעין, שלד התא והדנ"א
196
Perinuclear space - החלל ה____ והוא המשכי ל___ של ה
Perinuclear space - החלל הבין-ממברנלי והוא המשכי ללומן של ה ER
197
מהו NPC (nuclear pore complexes)
חורים במעטפת הגרעין. ממברנת הגרעין כמעט ולא חדירה לדבר ואלו שחוצים אותה עושים זאת דרך NPC
198
Nuclear transport
מעבר מולקולות דרך מעטפת הגרעין.
199
מה ההבדל בין הממברנה הפנימית לבין החיצונית בגרעין?
הממברנה הפנימית מכילה חלבונים הפועלים כאתרי קישור לכרומוזומים ואתרי קישור ללמינה הגרעינית. הממברנה החיצונית רציפה עם הממברנה של ER. לכן הממברנה החיצונית משובצת בריבוזומים.
200
הלמינה הגרעינית מצד אחד קשורה ל__ ו__ בממברנה הפנימית של הגרעין, ומצד שני הלמינה קשורה ישירות ל____. ה____ גם הוא בעצמו נקשר עם חלבונים טרנסממברנליים בממברנה הפנימית של הגרעין.
הלמינה הגרעינית מצד אחד קשורה ל NPC וחלבונים טרנסממברנליים בממברנה הפנימית של הגרעין, ומצד שני הלמינה קשורה ישירות לכרומטין. הכרומטין גם הוא בעצמו נקשר עם חלבונים טרנסממברנליים בממברנה הפנימית של הגרעין.
201
פוספורילציה גורמת לרשת הלמינה הגרעינית ____, וזה קורה ב____. מה הרעיון מאחורי זה ואיך זה גורם לחסכון אנרגטי של התא?
פוספורילציה גורמת לרשת הלמינה הגרעינית להתפרק, וזה קורה במיטוזה. הרעיון הוא שהרשת מפורקת למרכיביה הבסיסיים מבלי לפרק כל למינה לגורמים- זה חסכון אנרגטי של התא. כשנצטרך לבנות את הגרעין אז מורידים את הזרחנים ויש הרכבה מחדש של הלמינה.
202
הלמינים הגרעיניים נקשרים לחומרים רבים כמו
NPC, ממברנת הגרעין , כרומטין/היסטונים (גורמים רה-מודלינג)
203
SUN ו- KASH הם
חלבונים שמקשרים בין הציטוסקלטון לבין תוך הגרעין כדי לשמור על הגרעין יציב בתוך התא.
204
SUN נמצא בממברנה ה____ של הגרעין KASH נמצא בממברנה ה____ של הגרעין.
SUN נמצא בממברנה הפנימית של הגרעין KASH נמצא בממברנה החיצונית של הגרעין.
205
SUN ו- KASH נקשרים וכך יוצרים ___ בין __ לבין ___. בתוך הגרעין ____ נקשר ל___ או ל___, ומחוץ לגרעין ____ נקשר ישירות ל____ ובאופן לא ישיר ל___ ו.
SUN ו- KASH נקשרים וכך יוצרים מעין "גשר" בין הסביבה בגרעין לבין הסביבה שמחוץ לגרעין. בתוך הגרעין SUN נקשר ללמינה הגרעינית או לכרומוזמים, ומחוץ לגרעין KASH נקשר ישירות לסיבי אקטין ובאופן לא ישיר למיקרוטובולים וסיבי ביניים.
206
KASH נקשר ישירות ל___ ובאופן לא ישיר ל___ ו.
KASH נקשר ישירות לסיבי אקטין ובאופן לא ישיר למיקרוטובולים וסיבי ביניים.
207
הקישור בין KASH -ל SUN מצמד בצורה מכנית את __ ו___ ומעורב בתהליכים רבים כמו
הקישור בין KASH -ל SUN מצמד בצורה מכנית את הגרעין ושלד התא ומעורב בתהליכים רבים כמו: תנועת כרומוזומים בגרעין בזמן מיוזה, מיקום הגרעין והצנטרוזום, נדידת הגרעין וארגון גלובלי של שלד התא.
208
Nuclear transport
תעבורה דו-כיוונית שמתרחשת בין הציטוזול לגרעין.
209
החלבונים הרבים שמתפקדים בגרעין - כולל היסטונים ופולימראזות ____ באופן סלקטיבי ל____ מה_____- שם הם מיוצרים. במקביל, כמעט כל הרנ"א – מסונתזים ב___ ולאחר מכן _____ באופן סלקטיבי ל
החלבונים הרבים שמתפקדים בגרעין - כולל היסטונים ופולימראזות מיובאים באופן סלקטיבי לגרעין מהציטוזול- שם הם מיוצרים. במקביל, כמעט כל הרנ"א – מסונתזים בגרעין ולאחר מכן מיוצאים באופן סלקטיבי לציטוזול. למשל mRNA מיוצאים רק לאחר שהם עברו עיבוד בגרעין.
209
ה_____ , כולל _____ מיובאים באופן סלקטיבי לגרעין מהציטוזול- שם הם מיוצרים. במקביל, כמעט כל ה___ מסונתזים בגרעין ולאחר מכן מיוצאים באופן סלקטיבי לציטוזול.
החלבונים הרבים שמתפקדים בגרעין - כולל היסטונים ופולימראזות מיובאים באופן סלקטיבי לגרעין מהציטוזול- שם הם מיוצרים. במקביל, כמעט כל הרנ"א – מסונתזים בגרעין ולאחר מכן מיוצאים באופן סלקטיבי לציטוזול. למשל mRNA מיוצאים רק לאחר שהם עברו עיבוד בגרעין.
210
החלבונים בגרעין (כולל היסטונים ופולימראזות) מיוצרים בציטוזול ומיובאים לגרעין. הרנ"א מסונתזים בגרעין ומיוצאים לציטוזול. במקרים מסוימים, ההובלה היא מורכבת. תני דוגמה.
חלבונים ריבוזומליים, למשל, מיוצרים בציטוזול ומיובאים לגרעין, שם הם מורכבים עם rRNA . לאחר מכן, החלבונים יחד עם rRNA מיוצאים לציטוזול, שם הם מורכבים לריבוזום הסופי. כל אחד מהשלבים הללו דורש הובלה סלקטיבית דרך המעטפת הגרעינית.
211
NPC קיימים במעטפת הגרעינית של כל/חלק מהתאים האאוקריוטים וזאת מפני שהם מאפשרים
NPC קיימים במעטפת הגרעינית של כל התאים האאוקריוטים וזאת מפני שהם מאפשרים תנועה דרך הממברנות של הגרעין של חלבונים, יחידות ריבוזומליות , mRNA , tRNA ועוד
212
מה מאפשר תנועה דרך הממברנות של הגרעין? האם קיים בכל האאוקריוטים?
NPC קיימים במעטפת הגרעינית של כל התאים האאוקריוטים וזאת מפני שהם מאפשרים תנועה דרך הממברנות של הגרעין של חלבונים, יחידות ריבוזומליות , mRNA , tRNA ועוד
213
ב- NPC המעבר יכול להיות
דו-כיווני באותו זמן והוא יכול להיות אקטיבי או פסיבי (דורש ולא דורש אנרגיה) פסיבי (לא דורש אנרגיה) כשהמולקולה שוקלת פחות מ- 40,000 דלטון ובגודל של פחות מ 5nm .
214
האם המעבר ב NPC מוגבל לכיוון מסוים בזמן מסוים? האם הוא אקטיבי או פסיבי? (האם דורש אנרגיה)
המעבר יכול להיות דו-כיווני באותו זמן והוא יכול להיות אקטיבי או פסיבי. פסיבי כשהמולקולה שוקלת פחות מ- 40,000 דלטון ובגודל של פחות מ 5nm .
215
מתי המעבר ב NPC הוא פסיבי (לא דורש אנרגיה)?
כשהמולקולה שוקלת פחות מ- 40,000 דלטון ובגודל של פחות מ 5nm . מולקולות קטנות (עד 5,000 דלטון) עוברות דיפוזיה מהירה עד לרמה שניתן להתייחס אל המעטפת כחדירה לחלוטין עבורן.
216
מתי המעבר ב NPC הוא אקטיבי (דורש אנרגיה)?
כשהמולקולה שוקלת יותר מ- 40,000 דלטון ובגודל של יותר מ 5nm . מולקולות קטנות (עד 5,000 דלטון) עוברות דיפוזיה מהירה עד לרמה שניתן להתייחס אל המעטפת כחדירה לחלוטין עבורן.
217
האיזורים ה_____ יוצרים את החלל של תעלת NPC. הם מכילים חזרות מרובות של רצפים ____ שעשירים בשיירי ____ ו (__ חזרות) חזרות אלו יוצרות אינטראקציה ___ זו עם זו, כך שנוצר מטריקס ____ דמוי __ המהווה _____.
האיזורים הלא מאורגנים יוצרים את החלל של תעלת NPC. הם מכילים חזרות מרובות של רצפים הידרופוביים קצרים שעשירים בשיירי פנילאלנין F ו- גליצין G (FG חזרות) חזרות אלו יוצרות אינטראקציה חלשה זו עם זו, כך שנוצר מטריקס גמיש דמוי ג'ל המהווה מסננת עבור מולקולות גדולות.
218
כיצד ה NPC מהווה מסננת עבור מולקולות גדולות?
האיזורים הלא מאורגנים יוצרים את החלל של תעלת NPC. הם מכילים חזרות מרובות של רצפים הידרופוביים קצרים שעשירים בשיירי פנילאלנין F ו- גליצין G (FG חזרות) חזרות אלו יוצרות אינטראקציה חלשה זו עם זו, כך שנוצר מטריקס גמיש דמוי ג'ל המהווה מסננת עבור מולקולות גדולות.
219
כיצד טרנספורט דרך NPC שונה מהותית מטרנספורט דרך ממברנות של אברונים אחרים?
טרנספורט ב NPC קורה דרך פורה גדולה שפתוחה באופן תמידי ומלאה בג'ל, לעומת רוב האברונים שם הטרנסלוקטורים קטנים והפורה שלהם בדרך כלל עוברת gating על ידי החלבון המועבר. לכן, חלבונים שהתקפלו למבנה הסופי שלהם ומולטי-חלבונים גדולים יכולים לעבור בשני הכיוונים של ה NPC . טרנספורט באברונים כמו המיטוכונדריה, הכלורופלסטים וה ER הוא חד כיווני ודורש שהחלבון המועבר יהיה לא מקופל.
220
בניגוד לאברונים אחרים, בהם הטרנסלוקטורים ____ והפורה שלהם בדרך כלל עוברת _____. טרנספורט ב NPC קורה דרך פורה ____ ש___ ומלאה בג'ל. לכן, חלבונים ש____ שלהם ו____ גדולים יכולים.
בניגוד לאברונים אחרים, בהם הטרנסלוקטורים קטנים והפורה שלהם בדרך כלל עוברת gating, טרנספורט ב NPC קורה דרך פורה גדולה שפתוחה באופן תמידי ומלאה בג'ל. לכן, חלבונים שהתקפלו למבנה הסופי שלהם ומולטי-חלבונים גדולים יכולים לעבור בשני הכיוונים של ה- NPC.
221
מהי הסיבה שחלבונים שהתקפלו למבנה הסופי שלהם ומולטי-חלבונים גדולים יכולים לעבור בשני הכיוונים של ה NPC?
טרנספורט ב NPC קורה דרך פורה גדולה שפתוחה באופן תמידי ומלאה בג'ל, לעומת רוב האברונים שם הטרנסלוקטורים קטנים והפורה שלהם בדרך כלל עוברת gating על ידי החלבון המועבר. לכן, חלבונים שהתקפלו למבנה הסופי שלהם ומולטי-חלבונים גדולים יכולים לעבור בשני הכיוונים של ה NPC . טרנספורט באברונים כמו המיטוכונדריה, הכלורופלסטים וה ER הוא חד כיווני ודורש שהחלבון המועבר יהיה לא מקופל.
222
מעבר אקטיבי של חלבונים דורש:
1. cargo/מטען - NES/NLS 2. רצפטור מעבורת/shuttling receptor - import/export 3. חלבון נמל - Ran
223
רצף NLS הוא סיגנל ל___. לחלבון שמיובא לגרעין יש סיגנל שמכיל ___ או ___ קצרים שעשירים ב____ ו___. משמע הרצף טעון ____. הרצף המדויק משתנה בין חלבון לחלבון.
רצף NLS הוא סיגנל להכנסה. לחלבון שמיובא לגרעין יש סיגנל שמכיל רצף אחד או שני רצפים קצרים שעשירים בארגינין וליזין Arg Lys משמע הרצף טעון חיובית. הרצף המדויק משתנה בין חלבון לחלבון.
224
רצף NLS יכול להימצא ____ בחלבון, על כן ____. מספיק שבקומפלקס ענק של חלבונים יהיה NLS ___ כדי שכל הקומפלקס יהיה מיובא לגרעין.
רצף NLS יכול להימצא בכל מקום בחלבון, על כן המיקום שלו לא משנה. מספיק שבקומפלקס ענק של חלבונים יהיה NLS אחד כדי שכל הקומפלקס יהיה מיובא לגרעין.
225
מה התגלה באמצעות אנליזה של מוטציות בגן largeT-antigen שמקודד ע"י SV40
NLS
226
רצף NES הוא סיגנל ל____. רצף עשיר ב_____ (הידרופובי/הידרופילי?)
רצף NES הוא סיגנל להוצאה. רצף עשיר בלאוצין Leu (הידרופובי)
227
nuclear import receptor הוא סוג של _____ שמזהה את ה ____ בחלבון המטען שמיועד לגרעין.
nuclear import receptor הוא סוג של רצפטור מעבורת (Shuttling Receptor) שמזהה את ה NLS בחלבון המטען שמיועד לגרעין.
228
ל______ לעיתים נדרש חלבון מתאם (אדפטור) שיגשר בין ____ לבין ____. חלק מהאדפטורים דומים מבנית ל _____ מה שמצביע על
ל nuclear import receptor לעיתים נדרש חלבון מתאם (אדפטור) שיגשר בינו לבין לחלבון המטען. חלק מהאדפטורים דומים מבנית ל nuclear impor treceptor מה שמצביע על מוצא אבולוציוני משותף
229
nuclear import receptor קושרים סיגנלים שונים ולכן ____ שונים. הודות למגוון של nuclear import receptor ואדפטורים, ניתן לזהות
nuclear import receptor קושרים סיגנלים שונים ולכן חלבוני מטען שונים. הודות למגוון של nuclear import receptor ואדפטורים, ניתן לזהות את מגוון רצפי ה- NLS
230
nuclear import receptor הוא חלבון ציטוזולי ___ בעל ____ רבים שלהם אפיניות ___ לרצפי ה FG .
nuclear import receptor הוא חלבון ציטוזולי מסיס בעל אתרי קשירה רבים שלהם אפיניות נמוכה לרצפי ה FG .
231
רצפי ה FG בצד הציטוזולי מהווים אתרי עגינה שמגייסים אליהם את ה ______ וה____. כיצד תהליך זה נראה ולמה הוא גורם?
רצפי ה FG בצד הציטוזולי מהווים אתרי עגינה שמגייסים אליהם את ה import receptors והמטען הקשור. זה נראה כך: קישור import receptors אל חזרות FG ניתוק, ושוב קישור לחזרות FG פנימיים יותר. הקישור בכל פעם אל חזרות FG גורם להפרעה מרחבית בקשרים בין החזרות ויכול לפרום מעט את פאזת הג'ל באופן מקומי, מה שיאפשר מעבר דרך התעלה של קומפלקס רצפטור-חלבון מטען.
232
מה מאפשר את המעבר של קומפלקס רצפטור-חלבון מטען לתוך הגרעין?
רצפי ה FG בצד הציטוזולי מהווים אתרי עגינה שמגייסים אליהם את ה import receptors והמטען הקשור. זה נראה כך: קישור import receptors אל חזרות FG ניתוק, ושוב קישור לחזרות FG פנימיים יותר. הקישור בכל פעם אל חזרות FG גורם להפרעה מרחבית בקשרים בין החזרות ויכול לפרום מעט את פאזת הג'ל באופן מקומי, מה שיאפשר מעבר דרך התעלה של קומפלקס רצפטור-חלבון מטען.
233
מעבר קומפלקס רצפטור-חלבון מטען דרך רצפי ה FG ____ את הדיפוזיה של חלבון המטען דרך ה NPC. חלבונים _____ לא יכולים לעבור בקלות בין הרצפים האלו והדיפוזיה שלהם דרך ה NPC _____.
מעבר קומפלקס רצפטור-חלבון מטען דרך רצפי ה FG מאיץ את הדיפוזיה של חלבון המטען דרך ה NPC. חלבונים ללא אתרי קשירה לרצפי FG לא יכולים לעבור בקלות בין הרצפים האלו והדיפוזיה שלהם דרך ה NPC איטית.
234
תהליך הייבוא והייצוא של חלבונים דרך ה- NPC תלוי בחלבון _______ שהוא חלבון מונומרי מסוג ______. האנרגיה לתהליכי הייצוא והייבוא אצורה ב.
תהליך הייבוא והייצוא של חלבונים דרך ה- NPC תלוי בחלבון Ran שהוא חלבון מונומרי מסוג GTPase. האנרגיה לתהליכי הייצוא והייבוא אצורה באותם חלבוני Ran .
235
Ran-GAP ._____הופך את _____ ל .____ממוקם ב Ran-GEF _____הופך את _____ ל ._____ממוקם ב
Ran-GAP - גורם להידרוליזה של GTP והופך את Ran-GTP ל Ran-GDP ממוקם בציטוזול Ran-GEF מעודד את ההחלפה של GDP ב GTP ולכן הופך את Ran-GDP ל Ran-GTP ממוקם בגרעין על הכרומטין
236
ממוקם בציטוזול ______ ממוקם בגרעין על הכרומטין ______ . לכן יהיה בציטוזול בעיקר _______ ובגרעין _____ יהיה בעיקר
GAP ממוקם בציטוזול GEF ממוקם בגרעין על הכרומטין. לכן יהיה בציטוזול בעיקר Ran-GDP ובגרעין יהיה בעיקר Ran-GTP
237
החלוקה של ____ לציטוזול ו___ לגרעין, קורית הודות לאסוציאציה המועדפת של ____ ל_____ ושל _____ ל
החלוקה של GAP -לציטוזול ו GEF לגרעין קורית הודות לאסוציאציה המועדפת של GAP לשלד התא ושל GEF לכרומטין.
238
הגרדיאנט של שתי קונפורמציות של Ran הוא זה שמניע את הטרנספורט של חלבוני המטען בכיוון הנכון. כיצד?
import נכנס עם חלבון המטען אל הגרעין ונקשר אליהם Ran-GTP הקשירה הזו גורמת ל import לשחרר את חלבון המטען. import שקשור ל Ran-GTP יחזור אל הציטוזול. בציטוזול Ran-GAP מעודד את ההידרוליזה של ה ATP כך נוצר Ran-GDP כך הוא עובר דיסוציאציה מ import. import מוכן לקישור של חלבון מטען נוסף.
239
הימצאותו של _____ בגרעין מאפשרת את הכיווניות הנכונה של הייבוא. הקשירה בין _____ ל_____ נעשית _____ רק ב____, כך בוודאות
הימצאותו של Ran-GTP בגרעין מאפשרת את הכיווניות הנכונה של הייבוא. הקשירה בין nuclear import receptor ל Ran-GTP נעשית רק בגרעין, כך בוודאות חלבון המטען ישתחרר בגרעין.
240
240
תארי את תהליך ייצוא החלבונים מהגרעין
התהליך מסתמך על סיגנל NES שיש בחלבונים שאמורים לצאת מהגרעין. הסיגנל מזוהה על ידי Nuclear export receptor. export receptor נקשר גם לסיגנל NES וגם לחלבונים ב NPC . Ran-GTP בגרעין מעודד קישור של export receptor לחלבון מטען (לא מעודד דיסוציאציה כמו בייבוא). כאשר כל הקומפלקס של export receptor, חלבון מטען ו Ran-GTP מגיע לציטוזול, Ran-GAP מעודד הידרוליזה ל GDP. כתוצאה מכך, export receptor משחרר את חלבון המטען ואת Ran-GDP בציטוזול. לאחר מכן export receptor חוזר לגרעין.
241
תהליך יצוא החלבונים מהגרעין התהליך מסתמך על סיגנל _____ שיש בחלבונים שאמורים לצאת מהגרעין. הסיגנל מזוהה על ידי _____. _____ נקשר גם לסיגנל וגם לחלבונים ב______ . ____ בגרעין מעודד קישור של _____ לחלבון מטען (לא מעודד ____ כמו בייבוא). כאשר כל הקומפלקס של export receptor, חלבון מטען ו Ran-GTP מגיע ל____, _____ מעודד הידרוליזה ל _____. כתוצאה מכך, export receptor .משחרר את ______ ואת ______ בציטוזול. לאחר מכן ______ חוזר לגרעין.
התהליך מסתמך על סיגנל NES שיש בחלבונים שאמורים לצאת מהגרעין. הסיגנל מזוהה על ידי Nuclear export receptor. export receptor נקשר גם לסיגנל NES וגם לחלבונים ב NPC . Ran-GTP בגרעין מעודד קישור של export receptor לחלבון מטען (לא מעודד דיסוציאציה כמו בייבוא). כאשר כל הקומפלקס של export receptor, חלבון מטען ו Ran-GTP מגיע לציטוזול, Ran-GAP מעודד הידרוליזה ל GDP. כתוצאה מכך, export receptor משחרר את חלבון המטען ואת Ran-GDP בציטוזול. לאחר מכן export receptor חוזר לגרעין.
242
nuclear import and export שייכים לאותה משפחת חלבונים שנקראת ......
קריופרינים karyopherins בשמרים יש 14 גנים שמקודדים לקריופרינים, ומעל 20 בתאי יונקים.
243
תארי את תהליך בקרת הטרנספורט הגרעיני ע"י NF-AT (nuclear factor of activating T cells) מהי המסקנה מתהליך זה?
תהליך בקרת הטרנספורט הגרעיני ע"י NF-AT (nuclear factor of activating T cells) 1. מאוקטב T תא 2. עלייה בריכוז סידן בציטוזול 3. קלצינאורין (סוג של פוספטאז) מסיר זרחון NF-ATמ 4. נחשף NLS סיגנל 5. NF-AT נכנס לגרעין ע"י אימפורט ומבצע את פעילותו- אקטיבציה של שעתוק גנים. 6. ריכוז סידן נמוך 7. קינאז מזרחן את NF-AT נחשף NES כך שסיגנל 8. חוזר אל הציטוזול NF-AT מסקנה- קיימת בקרה גם על הופעת הסיגנל של כניסה/יציאה מהגרעין.
244
בתהליך בקרת הטרנספורט הגרעיני ע"י _____, תא ____מאוקטב, ___ בריכוז סידן בציטוזול, קלצינאורין (סוג של פוספטאז) ____ סיגנל ___ נחשף, ____ נכנס לגרעין ע"י אימפורט ומבצע את פעילותו: _____. ריכוז סידן ____, קינאז מזרחן את ____ כך שסיגנל ____ נחשף, ___ חוזר אל הציטוזול מסקנה?
תהליך בקרת הטרנספורט הגרעיני ע"י NF-AT (nuclear factor of activating T cells) 1. מאוקטב T תא 2. עלייה בריכוז סידן בציטוזול 3. קלצינאורין (סוג של פוספטאז) מסיר זרחון NF-ATמ 4. נחשף NLS סיגנל 5. NF-AT נכנס לגרעין ע"י אימפורט ומבצע את פעילותו- אקטיבציה של שעתוק גנים. 6. ריכוז סידן נמוך 7. קינאז מזרחן את NF-AT נחשף NES כך שסיגנל 8. חוזר אל הציטוזול NF-AT מסקנה- קיימת בקרה גם על הופעת הסיגנל של כניסה/יציאה מהגרעין.
245
מעטפת הגרעין _____ בזמן מיטוזה
מתפרקת ונבנית מחדש
246
בתאים אנימלים מעטפת הגרעין ___ בזמן מיטוזה כדי שהמיקרוטובולי יוכלו ____ לצורך ____. בסוף ההפרדה, מעטפת הגרעין____ והחלוקה ה___ של המרכיבים בין הציטוזול לגרעין ____.
בתאים אנימלים מעטפת הגרעין מתפרקת בזמן מיטוזה כדי שהמיקרוטובולי יוכלו להיקשר אל הכרומוזומים המשוכפלים לצורך ההפרדה שלהם לתאי הבת. בסוף ההפרדה, מעטפת הגרעין נבנית מחדש והחלוקה הא-סימטרית של המרכיבים בין הציטוזול לגרעין מתחדשת.
247
המרכיבים המרכזיים במעטפת הגרעין שצריכים להתפרק באופן רברסבילי בזמן מיטוזה הם
הלאמינה הגרעינית NPC הממברנה של הגרעין
248
תהליך פירוק מעטפת הגרעין בזמן ____ משופעל על ידי _____ שעובר אקטיבציה בתחילת ה____. ה-____ מזרחן נוקליאופורינים, למינים וחלבונים של הממברנה הפנימית כדי ______.
תהליך פירוק מעטפת הגרעין בזמן מיטוזה משופעל על ידי Cdk (cyclin dependent kinase) שעובר אקטיבציה בתחילת המיטוזה. Cdk מזרחן נוקליאופורינים, למינים וחלבונים של הממברנה הפנימית כדי להפריע לאינטראקציות שלהם אחד עם השני ועם הכרומטין.
249
מיהו Cdk וכיצד הוא עובד
קינאז שמשפעל את תהליך פירוק מעטפת הגרעין בזמן מיטוזה. Cdk (cyclin dependent kinase) עובר אקטיבציה בתחילת המיטוזה ומזרחן נוקליאופורינים, למינים וחלבונים של ממברנה הפנימית כדי להפריע לאינטראקציות שלהם אחד עם השני ועם הכרומטין.
250
מי מהבאים אינו מרכיב של ממברנת התא? פוספוליפיד ספינגוליפיד טריאצילגליצרול אף תשובה לא נכונה
טריאצילגליצרול פוספוליפיד: המרכיב העיקרי בממברנת התא ספינגוליפיד: מרכיב שני בממברנת התא. נמצא בממברנות של כל התאים ובריכוז גבוה במוח. כולסטרול: מול' אמפיפאטית שמרכיבה את ממברנות התאים. קשור בממברנה בעזרת קשרי מימן (בין הקב' ההידרוקסילית של הכולסטרול לראש הפולרי של הפוספוליפידים). כולסטרול הוא דוגמא לליפיד שלא מורכב מח.שומן. טריאצילגליצרול: איננו מרכיב של ממברנות התאים! אלא משמש כצורה בה התא אוגר שומנים .
251
מה מהבאים אינו נכון בנוגע לליפוזום? 1. משמש לנשיאת חומרים הידרופיליים בלבד 2. משמש לנשיאת חומרים הידרופיליים והידרופוביים 3. עטוף בממברנה שדומה לממברנת התא 4. הווצרות הליפוזום נעשה באופן ספונטני
משמש לנשיאת חומרים הידרופיליים והידרופוביים ליפוזום הינו ווסיקולה מלאכותית, אשר מורכבת, בדומה לממברנת התא, משכבת lipid bilayer. הווסיקולה נוצרת באופן ספונטני מכוון שהווצרותה מועדפת תרמודינמית (הראשים הפולריים של הפוספוליפידים פונים החוצה ויוצרים שכבה הידרופילית שבאה במגע עם המים בסביבה, ואילו הזנבות ההידרופוביות פונות כלפי פנים). בנוסף, הליבה שלה היא הידרופילית (מאחר שהיא עטופה גם מבפנים בראשים פולריים). מכוון שכך – היא יכולה לשמש כנשאית לחומרם הידרופיליים בלבד, ולא לשומנים .
252
לפוספוליפידים שמרכיבים את ממברנת התא יש חופשיות תנועה מסויימת. אילו מבין התנועות הבאות היא איננה תנועה ספונטנית שלהם בממברנה? lateral diffusion flexion rotation flip-flop
flip-flop קיימות שלוש תנועות ספונטניות שהפוספוליפיד יכול לעשות כשהוא בתוך הממברנה: lateral diffusion (דיפוזיה לטראלית, תזוזה של הפוספוליפיד ימינה ושמאלה), rotation (סיבוב על עצמו) ו- flexion (כיפוף של הפוספולידים והתרחקות/התקרבות שלהם אחד מהשני). שלושת תנועות אלו נעשות באופן ספונטנטי ללא התערבות של אנזים ומתרחשות ע"ג השכבה בה הפוספוליפיד נמצא. בניגוד, תנועת ה Flip-Flop דורשת התערבות של אנזים, במהלכה הפוספוליפיד "מקפץ" בין שכבה אחת לשניה, תנועה שהיא שכיחה הרבה פחות מהקודמות.
253
מי מהבאים משפיע על נוזליות הממברנה (Membrane fluidity)? אורך חומצות השומן סוג חומצות השומן (רוויות ובלתי-רוויות) טמפרטורה כל התשובות נכונות
כל התשובות נכונות נוזליות הממברנה מושפעת מהטמפרטורה וסוג חומצות השומן שמרכיבה את הפוספוליפיד. ככל שאורך חומצת השומן קצרה יותר – כך הסיכויי שחומצות שומן מפוספוליפידים שכנים יעברו אינטראקציה זה עם זה ויתאגדו יחד פוחת. בנוסף, ככל שריכוז חומצות השומן הבלתי-רוויות גדול יותר – כך קשה יותר לאגד את הפוספוליפידים יחד, מכוון שהקשר הכפול בחומצת שומן בלתי-רווייה יוצר כיפוף שמפריע לאריזה שלהן יחד. מכוון שחומצות שומן קצרות ובלתי-רוויות מקשות על האריזה של פוספוליפידים שכנים – נוזליות הממברנה עולה ככל שריכוזם בממברנה עולה. בנוסף למבנה חומצות השומן, גם הטמפרטורה משפיעה על נוזליות הממברנה: ככל שהטמפרטורה גבוהה יותר, כך יש לפוספוליפידים בממברנה יותר אנרגיית תנועה, ונוזליות הממברנה עולה.
254
מה מהבאים אינו נכון בנוגע לדטרגנטים (Detergents)? בעלי ראש פולרי וזנב הידרופובי משמשים לבידוד חלבונים ממברנאליים יכולים להיות טעונים או לא טעונים משמשים לסימון חלבונים בממברנה
משמשים לסימון חלבונים בממברנה דטרגנט הינו מולקולה אמפיפאטית בעלת ראש פולרי וזנב הידרופובי. הדטרגנטים משמשים להמסת חלבונים ממברנאליים ומיצויי שלהם מהממברנה. כשרוצים למצות חלבונים ממברנאליים, אנחנו נתקלים בבעיה: בעת חשיפת החלבון הממברנאלי, נחשפים האיזורים ההידרופוביים שלו שבעזרתם הוא עוגן בממברנה. במצב זה, חשיפת האיזורים ההידרופוביים בחלבון, בתמיסה שהיא מימית – תוביל לשקיעת החלבון ולהרס שלו ולא נוכל להשתמש בו. לכן, כשרוצים למצות חלבון ממברנאלי, נעזרים בדטרגנט "שממיס" את חלבון המטרה ומאפשר לנו לבודד אותו מהממברנה בצורה יעילה (הוא עושה זאת ע"י כך שהוא נקשר לאותם איזורים הידרופוביים וממסך אותם, כך שהם אינם חשופים יותר לתמיסה המימית והחלבון אינו שוקע. בנוסף, הדטרגנט יכול להיות טעון (ולהקרא דטרגנט יוני) ולא טעון (ולהקרא דטרגנט לא-יוני). הדטרגנטים אינם משמשים לסימון של חלבונים, אלא להפרדה ובידוד שלהם מהממברנה.
255
דטרגנט הינו מולקולה ____ בעלת ראש ____ וזנב ____. הדטרגנטים משמשים ל____.
דטרגנט הינו מולקולה אמפיפאטית בעלת ראש פולרי וזנב הידרופובי. הדטרגנטים משמשים להמסת חלבונים ממברנאליים ומיצויי שלהם מהממברנה.
256
כשרוצים למצות חלבונים ממברנאליים, אנחנו נתקלים בבעיה: בעת חשיפת החלבון הממברנאלי, נחשפים האיזורים ה____ שלו שבעזרתם הוא עוגן בממברנה. במצב זה, חשיפת האיזורים ה____ בחלבון, בתמיסה שהיא מימית – תוביל ל____ החלבון ול___ שלו ולא נוכל להשתמש בו. לכן, כשרוצים למצות חלבון ממברנאלי, נעזרים ב____ "ש___" את חלבון המטרה ומאפשר לנו לבודד אותו מהממברנה בצורה יעילה (הוא עושה זאת ע"י כך שהוא נקשר לאותם איזורים ____ ו____ אותם, כך שהם אינם חשופים יותר לתמיסה המימית והחלבון אינו ____.
כשרוצים למצות חלבונים ממברנאליים, אנחנו נתקלים בבעיה: בעת חשיפת החלבון הממברנאלי, נחשפים האיזורים ההידרופוביים שלו שבעזרתם הוא עוגן בממברנה. במצב זה, חשיפת האיזורים ההידרופוביים בחלבון, בתמיסה שהיא מימית – תוביל לשקיעת החלבון ולהרס שלו ולא נוכל להשתמש בו. לכן, כשרוצים למצות חלבון ממברנאלי, נעזרים בדטרגנט "שממיס" את חלבון המטרה ומאפשר לנו לבודד אותו מהממברנה בצורה יעילה (הוא עושה זאת ע"י כך שהוא נקשר לאותם איזורים הידרופוביים וממסך אותם, כך שהם אינם חשופים יותר לתמיסה המימית והחלבון אינו שוקע.
257
דטרגנט יכול להיות ___ (ולהקרא דטרגנט ____) ולא ____ (ולהקרא דטרגנט ____).
בנוסף, הדטרגנט יכול להיות טעון (ולהקרא דטרגנט יוני) ולא טעון (ולהקרא דטרגנט לא-יוני).
258
הדטרגנטים משמשים ל____ ו___ של חלבונים מהממברנה.
הדטרגנטים משמשים להפרדה ובידוד של חלבונים מהממברנה.
259
מה מהבאים אינו נכון בנוגע ל bacteriorhodopsin? 1. משמש כמשאבת פרוטונים 2. מוביל לכניסה של פרוטונים אל תוך התא 3. קיים בממברנות של חיידקים 4. חלבון טרנס ממברנאלי שעוגן בממברנה 7 פעמים
מוביל לכניסה של פרוטונים אל תוך התא ה bacteriorodopsin הינו דוגמא למשאבת פרוטונים שקיימות בממברנות של חיידקים. כשהמשאבה פועלת, היא מפמפמת פרוטונים H+ החוצה, מתוך התא לסביבה החוץ תאית. המשאבה הינה חלבון טרנסממברנאלי שחוצה את הממברנה 7 פעמים