Brainscape's Knowledge GenomeTM

Browse over 1 million classes created by top students, professors, publishers, and experts.


See full index

Génétique moléculaire II > 1.4 : régulation de la traduction > Flashcards

1.4 : régulation de la traduction Flashcards

1
Q

Avantage de contrôler l’expression génétique (régulation) au niveau de la traduction par rapport à la transcription?

A

Rapidité d’action → ARNm prêt lors de la traduction donc production rapide d’une protéine.

Si régulation au niveau de la transcription, délai car on doit produire ARNm et +

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

À quel niveau se situe le contrôle de la traduction (régulation)?

A

Au niveau de l’initiation

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

Quels sont les 2 mécanismes de régulation de la traduction chez les bactéries?

A
  1. Fixation de protéines près du site de liaison du ribosome (RBS)
  2. ARNm forme des appariements de bases avec lui-même
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Comment agit le mécanisme de régulation qui fixe des protéines près du RBS?

A
  • Régule négativement l’initiation de la traduction

- Liaison empêche l’ARN 16S (petite SU) d’accéder au RBS → l’ARNm lie son propre RBS

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Comment fonctionne le mécanisme de régulation de la traduction lorsqu’un ARNm forme des appariements de bases avec lui-même?

A
  • Cela masque un/plusieurs RBS
  • Appariements interfèrent avec l’appariement de l’ARNr 16S

*** Souvent, cette inhibition est régulée par la traduction d’autres gènes du même opéron

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Avec quoi doit être coordonnée la synthèse de chaque protéine r?

A

Avec la quantité d’ARNr libre dans la cellule

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

À quoi sont liés la vitesse de synthèse protéique et le nombre de ribosomes requis?

A

À la vitesse de croissance dans la cellule

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Les protéines r agissent comme répresseur de? De quoi cela dépend-t’il?

A

Leur propre synthèse, mais dépend de la quantité d’ARN 16S présente dans la cellule

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Comment sont regroupés les gènes codant pour les protéines r?

A

Sous forme d’opérons

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Pour chaque opéron, où se lie la ou les 2 protéines r ? Conséquence?

A
  • Se lie au site de l’ARNm où débute la traduction de l’un des premiers gènes de l’opéron
  • Empêche les ribosomes de se lier et d’initier la traduction
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Comment l’expression des protéines r est-elle couplée à la quantité d’ARNr?

A

Présence d’ARNm libre :

  • protéines ont une grande affinité pour les sites de liaison de l’ARNr
  • Une fois liées à l’ARNr, les protéines facilitent le repliement correct de sa structure

PAS d’ARNr libre :

  • pas d’ARNr a lier pour les protéines
  • Prévient initiation de la traduction de l’ARNm → pas de traduction de la protéine
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Comment se nomme la protéine r régulatrice? Où se lie-t-elle et comment?

A

S8 → se lie également à un site de forte affinité sur l’ARNr (+++ 16S au lieu de l’ARNm), elle s’y fixe de manière préférentielle

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

Comment une protéine r peut-elle fonctionner à la fois comme composante du ribosome et comme régulateur de sa propre traduction?

A
  1. S8 : Structures très similaires des sites de liaison sur l’ARNr 16S et sur l’ARNm (beaucoup de correspondance)
  2. Site de liaison de S8 sur l’ARNm inclut le codon d’initiation AUG → liaison d’un excès de S8 sur l’ARNm inhibe l’initiation de la traduction (donc régule)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Qu’implique le fait que S8, une protéine r régulatrice, se lie plus fortement à l’ARNr qu’à l’ARNm?

A

La traduction est réprimée (en raison du codon AUG sur le site de liaison de l’ARNm) seulement lorsque la cellule a satisfait ses besoins en protéines pour l’assemblage des ribosomes.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Quelles sont d’autres cas d’inhibition de l’initiation de la traduction chez les bactéries (autre que les protéines r)?

A
  1. Quelques aaRS régulent leur expression en se fixant sur leur propre ARNm
  2. L’ARNm peut former différentes structures favorisant ou inhibant la traduction en fonction des conditions de température/concentrations métabolites.
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Que font les ribocommutateurs? Nomme un exemple

A

Régulent l’initiation de la traduction

- Ribocommutateur de la S-adénosyl méthionine (SAM) → position ouverte = RBS accessible, contraire = RBS pas accessible

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Pourquoi tous les ARNm bactériens ne sont-ils pas traduits à la même vitesse?

A
  1. Vitesse d’initiation peut varier d’un facteur 100 en fonction de la séquence Shine-Dalgarno (donc différentes vitesses de traduction)
  2. Vitesse d’élongation de la chaîne dépend de la fréquence des codons préférés et donc de l’abondance des ARNt correspondants
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Comment le ribosome procaryotique s’associe-t-il à l’ARNm et comment reconnaît-il le codon initiateur?

A

Par appariements de bases entre la séquence de Shine-Dalgarno de l’ARNm et l’extrémité 3’ de l’ARNr 16S

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Chez les procaryotes, comment se passe la régulation vs les chez les eucaryotes?

A
  • Procaryotes : Seulement certains gènes sont régulés

- Eucaryotes : régulation au niveau global ou au niveau d’ARNm spécifique (mais initiation est la cible)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Eucaryotes : comment fonctionne la phosphorylation de la SU alpha de eIF2?

A
  • Mécanisme d’inhibition largement répandu
  • Inhibe l’activité d’eIF2B (ne peut plus effectuer sa fonction, soit lier le GTP) → abaisse le niveau de eIF2 lié au GTP (diminution du complexe tertiaire)
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Eucaryotes : la régulation a lieu au niveau global. À quelles étapes de l’initiation cela se produit-il? Dans chaque cas, par quoi est contrôlé le mécanisme d’inhibition?

A
  1. À la reconnaissance de l’ARNm
  2. Lors de la liaison de l’ARNt initiateur à la SU 40S

Mécanisme d’inhibition est contrôlé par la phosphorylation (par des kinases)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Qu’impliquent des niveaux réduits d’eIF2-GTP?

A

Puisqu’eIF2-GTP est nécessaire pour acheminer l’ARNt initiateur vers la SU 40S, cela se traduit par une faible initiation de la traduction

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Les cellules humaines possèdent 4 kinases qui phosphorylent eIF2. Sur quel résidu? Nomme les 4.

A

Sur le résidu Ser-51

  1. HRI
  2. PKR
  3. GCN2
  4. PEK
How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Comment est activé la kinase HRI?

A

Activée dans les réticulocytes lorsque l’hème est en quantité insuffisante suite à un stress oxydatif/hautes températures → kinase stop la production d’hémoglobine dans les globules rouges.

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Comment est activé la kinase PKR?

A

Activée par un ARN double brin plus grand que 30 pb (souvent pendant infection virale, stop la traduction dans les cellules infectés par les virus)

26
Q

Comment est activé la kinase GCN2?

A

Activée lors d’une carence en a.a, par la liaison avec des ARNt non chargés.

27
Q

Comment est activé la kinase PEK?

A

Activée en présence de concentrations anormalement élevées en sucre, lorsque le réticulum endo. contient un excès de protéines non repliées en raison de stress divers.

28
Q

Que prévient la phosphorylation d’eIF2? Comment?

A

Prévient l’initiation de la traduction de l’ARNm de la globine

  • Absence d’hème = accumulation de la forme active d’HRI (kinase phosphorylant eIF2)
  • Forme phosphorylée d’eIF2 se lie fortement avec eIF2B (empêche le changement du GTP en GDP)
  • eIF2 ne peut plus se lier au GTP → ARNm de la globine ne peut être traduit
29
Q

Que sont les inhibiteurs de mTor, une protéine kinase?

A

Des agents de chimiothérapie efficaces

30
Q

À l’exception de la phosphorylation de la SU alpha d’eIF2, quel autre mécanisme inhibe globalement la traduction? Comment?

A

Un mécanisme ciblant la protéine eIF4E (liant la coiffe 5’)
- Les protéines 4E-BP, non-phosphorylées, sont en compétition avec eIF4G pour la liaison à eIF4E → agissent comme des inhibiteurs généraux de l’initiation de la traduction

31
Q

À l’exception de la phosphorylation de la SU alpha d’eIF2, quel autre mécanisme inhibe globalement la traduction? Comment?

A

Un mécanisme ciblant la protéine eIF4E (liant la coiffe 5’)
- Les protéines 4E-BP, non-phosphorylées, sont en compétition avec eIF4G pour la liaison à eIF4E → agissent comme des inhibiteurs généraux de l’initiation de la traduction

32
Q

La liaison des 4E-BP à eIF4E est régulée par..?

A

Par la phosphorylation

33
Q

Que se passe-t-il suite à la phosphorylation des protéines 4E-BP par la protéine kinase mTor?

A

les 4E-BP ne peuvent se lier à eIF4E et n’interfèrent donc pas avec la traduction (seule la forme non-phosphorylée de ces protéines inhibe)

34
Q

Que se passe-t-il lorsque mTor est inhibée?

A

Pas de prolifération des cellules

35
Q

Qu’est-ce qui active mTor, une kinase?

A

Facteurs de croissance, cellules qui se divisent rapidement

36
Q

Qu’utilise la régulation de la traduction d’ARNm spécifique chez les eucaryotes?

A

La liaison à eIF4E (impliquée dans la localisation précise de plusieurs protéines → expliquée par la traduction restreinte à des zones cellulaires)

37
Q

Quand la traduction des ARNm Oskar (drosophile) doit-elle être inhibée? De quoi dépend l’inhibition?

A
  • Pendant leur transport du pôle antérieur vers la région postérieure dans l’ovocyte avant la fécondation.
  • L’inhibition dépend de 2 protéines : Cup (se lie à Bruno) et Bruno (3’)
38
Q

Qu’est-ce que la protéine Cup chez la drosophile?

A
  • Une protéine 4E-BP qui se lie à Bruno (et à eIF4E) sur ARNm, inhibe spécifiquement la traduction de l’ARNm Oskar en prévenant la fixation d’eIF4G.
  • Besoin de Bruno pour inhibée car elle n’a pas assez d’affinité pour eIF4E (ne peut pas se lier directement)
39
Q

VRAI OU FAUX : chez la drosophile, l’ARNm Oskar est active pendant le transport vers l’œuf mature

A

Faux, pas fonctionnelle pendant le transport : juste quand elle est rendue dans l’œuf.

40
Q

Que fait la protéine Maskin chez les vertébrés?

A

Lie eIF4E et inhibe la traduction de plusieurs ARNm pendant le développement de l’ovocyte (œuf non fécondé)

  • Possède un domaine 4E-BP
41
Q

Que fait la protéine CPEB chez les vertébrés?

A

Se lie spécifiquement à des séquences dans la région 3’ non traduite de plusieurs ARNm à, puis recrute la Maskin, inhibant ainsi la traduction.

42
Q

Quel est le principal régulateur des niveaux de fer chez l’Homme? Par quoi est régulée sa synthèse?

A

La ferritine, une protéine liant le fer (senseur de la concentration de fer).
- Sa synthèse est régulée par l’IRP, une protéine liant le fer et l’ARNm de la ferritine

43
Q

Que reconnaît l’IRP, la protéine régulant la synthèse de la ferritine?

A

Peut reconnaître une structure en tige-boucle (IRE) dans la région 5’ non traduite de son propre ARNm

44
Q

Par quoi est contrôlé le taux de traduction de l’ARNm ferritine?

A

Par l’affinité des IRP pour le fer libre et leur liaison à l’IRE

45
Q

Chez la levure, par quoi est contrôlé la traduction de l’activateur transcriptionnel Gcn4?
Rôle de Gcn4?

A
  • Par de court ORF en amont et l’abondance d’un complexe ternaire.
  • Gcn4 régule l’expression des enzymes impliquées dans la synthèse des acides aminés.
46
Q

Que se passe-t-il en cas de mutation ponctuelle ne modifiant qu’un a.a?

A

Aucun mécanisme permettant d’éliminer l’ARNm mutant ou son produit protéique

47
Q

Qu’est-ce qui assure le sauvetage des ribosomes qui traduisent des ARNm brisés?

A

L’ARN SsrA

48
Q

Vrai ou faux :
La traduction d’un ARNm dépourvu de codon stop dans le cadre de lecture approprié peut être initiée normalement et se poursuivre jusqu’à l’extrémité 3’ de l’ARNm.

A

Vrai, mais à ce point le ribosome est bloqué.

49
Q

Chez les procaryotes, comment les ribosome bloqués (pas de codons de terminaison) sont-ils secourus?

A

Par l’ARNtm, une molécule qui est en partie un ARNt (ressemblant à l’ARNt Ala) et en partie un ARNm

50
Q

Qu’est-ce que SsrA?

A

Une ARNtm (457 nt) qui peut être chargé par l’alanine et se lier à EF-Tu-GTP

51
Q

Que se passe-t-il lorsqu’un ribosome bloque à l’extrémité 3’ d’un ARNm?

A

Le complexe SsrA Ala-EF-Tu-GTP se lie au site A et participe à la réaction de peptidyl-transférase → pour poursuivre la synthèse au niveau de la synthèse du produit protéique.

52
Q

Rôle de l’ARNtm SsrA?

A

Libère les ribosomes bloqués sur un ARNm complet.

53
Q

En l’absence de traduction, comment sont les ARNm endommagés?

A

Présentent une stabilité normale (pas de traduction = pas de destruction = ARNm intactes)

54
Q

Comment les cellules eucaryotes vérifient l’intégrité de leurs ARNm en cours de traduction grâce à deux mécanismes?

A
  1. Le processus de dégradation de l’ARNm induite par un codon non-sens (codon stop prématuré) → protéine tronquée
  2. Le processus de dégradation de l’ARNm induite par l’absence de codon stop → ARNm cassé
55
Q

Chez les eucaryotes, la traduction est étroitement liée à…?

A

Liée au processus de dégradation de l’ARNm

56
Q

Chez les eucaryotes, comment fonctionne le processus de dégradation de l’ARNm induite par un codon stop prématuré?

A
  • La traduction d’un ARNm possédant un codon stop prématuré ne déplace pas les complexes d’une ou plusieurs jonctions d’exons
  • Recrutement des protéines d’Upf1, Upf2 et Upf3 sur le ribosome
  • Protéines Upf activent une endonucléase qui hydrolyse la coiffe de l’ARNm → sans coiffe en 5’, l’ARNm est rapidement dégradé par des exonucléases
57
Q

Chez les eucaryotes, comment fonctionne le processus de dégradation de l’ARNm induite par un codon stop prématuré

A
  • La traduction d’un ARNm possédant un codon stop prématuré ne déplace pas les complexes d’une ou plusieurs jonctions d’exons
  • Recrutement des protéines d’Upf1, Upf2 et Upf3 sur le ribosome
  • Protéines Upf activent une endonucléase qui hydrolyse la coiffe de l’ARNm → sans coiffe en 5’, l’ARNm est rapidement dégradé par des exonucléases
58
Q

Vrai ou faux :

Chez les mammifères, la traduction d’un ARNm normal déplace tous les complexes des jonctions des exons

A

Vrai

59
Q

Qu’est-ce que l’exosome? À quoi se lie-t-il?

A
  • Complexe incluant Ski7 et une exonucléase 3’-5’

- Se lie à tout ribosome bloqué à l’extrémité 3’ de la queue poly(A)

59
Q

Qu’est-ce que l’exosome? À quoi se lie-t-il?

A
  • Complexe incluant Ski7 et une exonucléase 3’-5’

- Se lie à tout ribosome bloqué à l’extrémité 3’ de la queue poly(A)

60
Q

Qu’est-ce que la protéine Ski7 chez les eucaryotes?

A

Protéine apparentée au facteur de terminaison de classe II eRF3

61
Q

Décrit le processus de dégradation de l’ARNm induite par l’absence de codon stop.

A
  • Sans codon stop, le ribosome traduit la queue poly(A), ce qui entraîne l’ajout de lysines à la fin de la protéine → rend la protéine instable et entraîne le blocage du ribosome
  • L’exosome se lie au ribosome bloqué
  • Ski& stimule la dissociation du ribosome, alors que l’activité exonucléase de l’exosome dégrade l’ARNm
  • La protéine contenant la suite de lysines est dégradée

Génétique moléculaire II (10 decks)

Brainscape helps you reach your goals faster, through stronger study habits.
© 2024 Bold Learning Solutions. Terms and Conditions