Descendencia con modificación y filogenias

Question 1

cuál fue el gran planteamineto del “origen de las especies de Darwin”

Answer 1

los organismos que viven en la actualidad descienden de un ancestro en común

Question 2

cuáles son los 2 ámbitos en los que se relacionan los seres vivos al tener un mismo ancestro

Answer 2

• diversidad de los seres vivos por la modificación de las estructuras de los ancestros
• unicidad de los individuos al compartir el mismo ancestro

Question 3

qué es la taxonomía

Answer 3

es el estudio de las relaciones entre grupos de organismos (con un ancestro en común)

Question 4

qué es la filogenética

Answer 4

es un método de clasificación taxonómica basado en la historia evolutiva (a diferencia de la taxonomía, ahora se relacionan los individuos considerando el ancestro en común)

Question 5

qué es la filogenia

Answer 5

representación gráfica de las relaciones de afinidad genética entre las taxas de individuos respecto a un ancestro en común

Question 6

qué requerimientos se deben considerar para la construcción de filogenias

Answer 6

• definir carácteres discretos (presencia-ausencia) o continuos
• los individuos deben compartir dichos caracteres por transmisión desde un ancestro en común

Question 7

cuáles son las posibles fuentes de carácteres para la construcción de filogenias

Answer 7

a) rasgos morfológicos: huesos, partes de flores, miembros, etc
b) rasgos moleculares: DNA, RNA, proteínas
(rasgos heredables, estables, inambiguos e inequivocos)

Question 8

qué es la homología de carácteres

Answer 8

comparación de estructiras con un origen común, aunque tengan diferencias importantes en su forma final y funcionalidad, tienen características comunes y se relacionan con un origen en común

Question 9

carácteres homólogos primitivos o ancestrales

Answer 9

son compartidos por todos los miembros en estudio que se desea comparar

Question 10

carácteres homólogos derivados

Answer 10

son distintos al ancestro común más lejano, pero compartidos por un ancestro más cercano (sinapomorfías)

Question 11

sinapomorfías

Answer 11

carácteres derivados compartidos

Question 12

simplesiomorfías

Answer 12

carácteres derivados de un ancestro común más remoto que el ancestro común más cercano

Question 13

autopomorfías

Answer 13

carácteres derivados propios

Question 14

qué es la homoplasia

Answer 14

carácteres similares que no derivan del mismo carácter ancestral (similitudes no vienen de la homología)
ej: alas de murciélago y de ave sirven para volar, pero surgen de organismos distintos

Question 15

qué son los carácteres análogos

Answer 15

son carácteres con igual función, aparentemente similares, pero con distintos ancestros (se explica por convergencia evolutiva, un caso particular de homoplasia)

Question 16

qué representa la raíz en un árbol filogenético

Answer 16

es la separación entre un grupo externo y el resto de la filogenia (el árbol se polariza por mayor longitud de una rama)

Question 17

¿para qué se realiza un análisis filogenético?

Answer 17

• determinar la historia evolutiva de un gen o especie
• caracterizar ancestros
• estimar el tiempo de divergencia entre 2 organismos desde el último ancestro compartido
• caracterizar familias génicas y protéicas

Question 18

cómo se hace el alineamiento de secuencias

Answer 18

• establecer posiciones homólogas entre las secuencias
• se debe asegurar que se están alineando correctamente

Question 19

qué nomenclatura se utiliza en el alineamiento de secuencias

Answer 19

• cuando las bases son iguales se ponen puntos
• en las regiones discordantes se pone la letra de otro color

Question 20

cómo se pueden comparar organismos rxtremadamente distales en el alineamiento de secuencias

Answer 20

se comparan con genes altamente conservados

Question 21

qué es un estado de carácteres distintos

Answer 21

es donde había una posición de carácter original del ancestro en común desde el cual han variado hacia distintas variables (bases)

Question 22

cuál es el método de neighbor joining

Answer 22

a partir de un alineamineto se utiliza método de distancia (mínima evolución o NJ), genera valor de distancia a partir de la diferencia nucleotídica

Question 23

qué muestra una matriz elaborada por el método de NJ

Answer 23

muestra qué tan cercanos o lejanos son los pares de secuencias comparadas (en porcentaje)

Question 24

método de máxima parsimonia

Answer 24

• se crean múltiples árboles filogenéticos
• se determina cuántos pasos se requieren para llegar a cada árbol
• el árbol elegido corresponde al cual requiere de menos pasos

Question 25

cuáles son los tipos de VIH

Answer 25

• HIV-1 es el principal en el mundo, uera de África
• VIH-2está principalmente dentro de África

Question 26

qué establece la primera filogenia realizada para VIH-1 y 2

Answer 26

• HIV-1 está más relacionado con el SIV del chimpancé
• la filogenia sugiere más de un evento de transmisión entre hjumano-chimpancé
• HIV-2 está relacionado filogenéticamente de forma más estrecha con SIV de monos del viejo mundo
• la filogenia sugiere más de un evento de transmisión entre humanos y monos del viejo mundo

Question 27

qué establece la segunda filogenia realizada para VIH-1

Answer 27

• VIH aparece 3 veces al interior de distintas ramas de SIV
• no hay claridad sobre las cepas O y P
• las cepas de los grupos N y M se relacionan directamente con el SIV del chimpancé

Question 28

cómo se determinó la fecha de origen del sida

Answer 28

a partir de la cepa M se construyó una filogenia y se determinó un ancestro en común de ñas distintas variantes, se tomó la secuencia del ancestro en común y la compararon con la secuencia de todos los virus de la filogenia que demostró que las muestras de los 80s eran más similares a la muestra de los 90s, y a partir de esto se trazó una tendencia para determinar la fecha de aparición