MolBio 1.Termin 17-18 Flashcards

1
Q

-bei Typ II Endonucleasen sind die Erkennungssequenzen der DNA mit den Schnittstellen
identisch
- 6-base-cutter erzeugen 4 nt sticky ends, 8-base cutter erzeugen 6 nt sticky ends
- um cDNA für eine Klonierung herzustellen wird das Enzym Reverse Transkriptase
benötigt
- für die kovalente Verknüpfung der Ziel-DNA mit der Vektro-DNA wird die Ligase aus E.
coli oder des t4-Phagen genutzt

A

richtig
falsch
richtig
richtig

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2
Q

-der Phagen-Vektor wird mit der Ziel-DNA in vitro rekombiniert und dann verpackt, wobei
die Verpackung des Concatameres von Cos-site zu Cos-site erfolgt
- bei einem sog. Replacement-Vektor werden die lysogenen Gene durch die Ziel-DNA
ersetzt
- der Lambda-Phage weist eine Klonierungskapazität von ca. 20 kbp auf, welche
hauptsächlich durch das Volumen des Phagenkopfes bestimmt wird

A

richtig (Folie 22)
??
falsch

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3
Q

zuordnen der Transkripte zu verschiedenen RNA-PoIymerasen (Mehrfachnennungen oder fehlende
Zuordnungen können vorkommen, nur komplett richtige Zuordnung gibt Punkte):

1) tRNA 2) mRNA 3) 28s rRNA 4) 18s rRNA 5) 5s rRNA
6) snRNA

A

RNA Pol 3
RNA Pol2
RNA pol 1
RNA Pol 1
RNA pol 3
RNA Pol 3, Pol 2

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4
Q

zuordnen der Aufgaben/enzym. Funktionen zu TFIID und zu TFIIH (Mehrfachnennungen oder
fehlende Zuordnungen sind möglich, nur komplett richtige Zuordnung gibt Punkte):

1) bindet den Promotor 2) unterstützt die Bindung von Pol II und der DNA
3) Helikase-Aktivität 4) Histon-Acetylase-Aktivität 5) Ubiquitinligase-Aktivität
6) spielt eine Rolle im NER

A

TFIID
TFIID
TFIIH
TFIID
TFIID
TFIIH

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5
Q

ankreuzen (ja/nein):

  • RNA-Pol II bindet erst an die DNA, wenn TFIIA und TFIIB gebunden haben
  • RNA-Pol II bildet zusammen mit den basalen Transkriptionsfaktoren den PIC (Preinitiation complex)
  • für den Übergang des PIC vom geschlossenen zum offenen Zustand ist die Hydrolyse von
    ATP notwendig
  • die Elongation kann durch die Faktoren DSIF und NELF verhindert werden
A

richtig
richtig
richtig
richtig

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6
Q

Der Histon-Code umfaßt kovalente Modifikationen von Histonen. Wofür stehen die
Abkürzungen H3K27me3 und H4K5/12ac und welche Auswirkung haben sie auf die
Transkription?

A
  1. Lysin des Histon 3 ist trimethyliert–> Inaktivierend
    Acetylierung am 5./12. Lysin des Histon 4–> Aktivierend
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7
Q

Wie wird der Histon-Code dekodiert? Nennen Sie involvierte Faktoren, Domänen,
Mechanismen

A

Bromodomäne: Binden acetylierte Lysine Chromodomäne: Binden methylierte Lysine
pHd Finger: Zusammenspiel von PhD und Bromodomäne dekodieren den Code–> Länge des alpha-helikalen Linkers zwischen den beiden Domänen dekodert den Code.

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8
Q

ankreuzen zu Riboswitches (ja/nein):

  • die positive oder negative Regulation erfolgt ausschließlich auf der Ebene der
    Transkription
  • sie kommen in Prokaryoten und Eukaryoten bis hin zu Säugern vor
  • der Ligand bindet an die Expressionsplattform
  • die ligandenfreie und die ligandengebundene Form sind sich gegenseitig ausschließende
    RNA-Strukturen
  • die on/off-Konformation wird durch die Switching-Domäne vermittelt
  • der Purin-Riboswitch enthält four-stem-junction Strukturen
A

falsch (auch Translation)
falsch (keine Säuger)
falsch (Ligand bindet an Aptamer Domäne)
richtig
richtig
falsch (three-stem junction)

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9
Q

ankreuzen zu RNA-Thermometer (ja/nein):

  • im ROSE-Element führen kurze Abfolgen der Watson-Crick-Basenpaare A-U zum
    graduellen Aufschmelzen der RNA-Struktur
  • bei heat-shock RNA-Thermometern ist der Sensor gleichzeitig der Regulator
  • bei cold-shock RNA-Thermometern können zwei sich ausschließende RNA-Strukturen
    ausgebildet werden
  • das cspA cold-shock RNA-Thermometer stabilisiert bei niedriger Temperatur die mRNA
A

falsch
??
richtig
richtig

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10
Q

Ankreuzen zu trans-codierter sRNA (ja/nein):

  • sie regulieren die Virulenz, den Stoffwechsel und die Stressadaptation
  • sie können Translationsinhibition, mRNA-Degradation und Translationsaktivierung
    bewirken
  • sie haben mehrere mRNAs als target
  • sie stammen von einem anderen Lokus im Genom, als das target
  • sie benötigen meistens andere Proteinfaktoren um an das tagret zu binden
  • Hfq rekrutiert das Degradosom über RNAse III
A

richtig
richtig (??)
richtig
richtig
falsch
falsch (Rnase E rekrutiert das Degradosom)

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11
Q

. ankreuzen zu cis-codierter asRNA (ja/nein):

  • sie stammen vom selben Genlokus und haben einen eigenen Promotor und Terminator
  • die von RNAse III vermittelte Spaltung kann zur Stabilisierung oder zur Degradation der
    target-mRNA führen
  • sie können mehrere mRNAs als targets haben
  • sie kontrollieren den Stoffwechsel, die Stressantwort oder die Toxinbildung
  • die Regulation erfolgt auf Ebene der Transkription, der Translation oder der mRNAStabilität
A

richtig
falsch (eiegntlich nur Degradation und keine Stabilisierung)
falsch (nur eine DNA als target)
richtig
richtig

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12
Q

. Welche Funktion hat das CRIPR-Cas-System bei Prokaryoten? Wie heißen die drei
Hauptphasen des CRISPR-Mechanismus?

A

Verteidigungsmechanismus gegen Fremd-DNA von z.B Phagen.

Adaption, Expression, Interferenz

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13
Q

ankreuzen zu siRNA (ja/nein):

  • der Mechanismus kommt bei Prokaryoten und Eukaryoten bis hin zu Säugern vor
  • das Protein Dicer ist eine Exonuclease, die doppelsträngige RNA zu 20-25 nt langer siRNA
    schneidet
  • effizientes Silencing erfolgt nur, wenn die siRNA im Überschuss zum target vorliegt
  • die prozessierte siRNA hat einen 3 nt Überhang am 3´ Ende
  • die prozessierte siRNA hat einen 2´-3´ cyclisches Phosphat am 5´Ende
  • in Chloroplasten gibt es keine siRNA-Maschinerie
A

falsch
richtig
falsch (erfolgt bereits bei wenigen siRNA Molekülen)
falsch (2nt Überhang)
falsch (Monophosphat am 3´ ende)
??

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14
Q

Nennen Sie 2 Humanimpfstoffe, die in Hefe hergestellt werden mit zugehörigem Antigen und
Virus, gegen das sie schützen.

A

Hepatitis B Virus, HBS Antigenpartikel
HPV, rekombinantes L1 bildet virus-like Particles

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15
Q

Seit 2017 ist in Deutschland der Impfstoff „Strimvelis“ zugelassen. Gegen welchen Gendefekt
und welche Folgeerkrankung dient die Therapie? Wie erfolgt der Genteransfer (Vektor und
Zielzellen nennen)?

A

Strimvelis hilft Kindern mit der schweren Erbkrankheit ADA-SCID.

??

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16
Q

Nennen Sie die Vorteile des eukaryotischen Exon-Intron-Systems!

A

Alternatives Spleißen ermögliciht eine große Proteinvielfalt

Introns können Enhancer & Silencer besitzen

17
Q

Wodurch können PTCs in prä-mRNA eingeführt werden?

A

frameshift-Mutation, Fehler beim Spleißen, Nonsense-Mutation, Vdj-rearrangement

18
Q

Welchen enzymatischen Prozess katalysiert das Enzym Katalase?

-Die Umwandlung von Wasserstoffperoxid in Wasser und Sauerstoff
- Die Umwandlung von Wasserstoffperoxid in Wasser
- Die Umwandlung von Wasserstoffperoxid in Wasserstoff und Sauerstoff
- Die Umwandlung des Hyperoxidanions in Wasserstoffperoxid und Sauerstoff

A

richtig
falsch
falsch
falsch

19
Q

Welche Zellen haben eine Telomerase Aktivität? Bitte kreuzen Sie die richtigen Antworten
an.
- Keimzellen
- Endothelzellen
- Retinazellen
- Tumorzellen
- Nervenzellen
- Embryonische Stammzellen

A

Tumorzellen, embryonale stammzellen

20
Q

Die Enzym der long-Patch NER Reparatur in die richtige Reihenfolge bringen. (long Patch NER erkkären !)

A
  1. XPC-HR23B (erkennung der geschädigten Stelle) 2. Rekrutierung von XPD und XPB (Helikase-Aktivität) 3. Recruitment of endonucleases: If the damage is verified, TFIIH recruits two endonucleases, XPG and ERCC1-XPF, which are responsible for making incisions on both sides of the damaged site.
21
Q

Bitte kreuzen Sie die richtige Antworten zu den DNA-Schadens-Kontrollpunkten an.

  • p53 aktiviert die Expression des CDK Inhibitors p21.
  • Die Kinasen Chk1 / Chk2 phosphorylieren den Transkriptionsfaktor p21.
  • p21 inhibiert Cdk/Cyclin Komplexe
  • p21 aktiiert die Expression der Kinase Chk1
A

richtig
falsch
richtig
falsch