MolBio 1.Termin 17-18 Flashcards
-bei Typ II Endonucleasen sind die Erkennungssequenzen der DNA mit den Schnittstellen
identisch
- 6-base-cutter erzeugen 4 nt sticky ends, 8-base cutter erzeugen 6 nt sticky ends
- um cDNA für eine Klonierung herzustellen wird das Enzym Reverse Transkriptase
benötigt
- für die kovalente Verknüpfung der Ziel-DNA mit der Vektro-DNA wird die Ligase aus E.
coli oder des t4-Phagen genutzt
richtig
falsch
richtig
richtig
-der Phagen-Vektor wird mit der Ziel-DNA in vitro rekombiniert und dann verpackt, wobei
die Verpackung des Concatameres von Cos-site zu Cos-site erfolgt
- bei einem sog. Replacement-Vektor werden die lysogenen Gene durch die Ziel-DNA
ersetzt
- der Lambda-Phage weist eine Klonierungskapazität von ca. 20 kbp auf, welche
hauptsächlich durch das Volumen des Phagenkopfes bestimmt wird
richtig (Folie 22)
??
falsch
zuordnen der Transkripte zu verschiedenen RNA-PoIymerasen (Mehrfachnennungen oder fehlende
Zuordnungen können vorkommen, nur komplett richtige Zuordnung gibt Punkte):
1) tRNA 2) mRNA 3) 28s rRNA 4) 18s rRNA 5) 5s rRNA
6) snRNA
RNA Pol 3
RNA Pol2
RNA pol 1
RNA Pol 1
RNA pol 3
RNA Pol 3, Pol 2
zuordnen der Aufgaben/enzym. Funktionen zu TFIID und zu TFIIH (Mehrfachnennungen oder
fehlende Zuordnungen sind möglich, nur komplett richtige Zuordnung gibt Punkte):
1) bindet den Promotor 2) unterstützt die Bindung von Pol II und der DNA
3) Helikase-Aktivität 4) Histon-Acetylase-Aktivität 5) Ubiquitinligase-Aktivität
6) spielt eine Rolle im NER
TFIID
TFIID
TFIIH
TFIID
TFIID
TFIIH
ankreuzen (ja/nein):
- RNA-Pol II bindet erst an die DNA, wenn TFIIA und TFIIB gebunden haben
- RNA-Pol II bildet zusammen mit den basalen Transkriptionsfaktoren den PIC (Preinitiation complex)
- für den Übergang des PIC vom geschlossenen zum offenen Zustand ist die Hydrolyse von
ATP notwendig - die Elongation kann durch die Faktoren DSIF und NELF verhindert werden
richtig
richtig
richtig
richtig
Der Histon-Code umfaßt kovalente Modifikationen von Histonen. Wofür stehen die
Abkürzungen H3K27me3 und H4K5/12ac und welche Auswirkung haben sie auf die
Transkription?
- Lysin des Histon 3 ist trimethyliert–> Inaktivierend
Acetylierung am 5./12. Lysin des Histon 4–> Aktivierend
Wie wird der Histon-Code dekodiert? Nennen Sie involvierte Faktoren, Domänen,
Mechanismen
Bromodomäne: Binden acetylierte Lysine Chromodomäne: Binden methylierte Lysine
pHd Finger: Zusammenspiel von PhD und Bromodomäne dekodieren den Code–> Länge des alpha-helikalen Linkers zwischen den beiden Domänen dekodert den Code.
ankreuzen zu Riboswitches (ja/nein):
- die positive oder negative Regulation erfolgt ausschließlich auf der Ebene der
Transkription - sie kommen in Prokaryoten und Eukaryoten bis hin zu Säugern vor
- der Ligand bindet an die Expressionsplattform
- die ligandenfreie und die ligandengebundene Form sind sich gegenseitig ausschließende
RNA-Strukturen - die on/off-Konformation wird durch die Switching-Domäne vermittelt
- der Purin-Riboswitch enthält four-stem-junction Strukturen
falsch (auch Translation)
falsch (keine Säuger)
falsch (Ligand bindet an Aptamer Domäne)
richtig
richtig
falsch (three-stem junction)
ankreuzen zu RNA-Thermometer (ja/nein):
- im ROSE-Element führen kurze Abfolgen der Watson-Crick-Basenpaare A-U zum
graduellen Aufschmelzen der RNA-Struktur - bei heat-shock RNA-Thermometern ist der Sensor gleichzeitig der Regulator
- bei cold-shock RNA-Thermometern können zwei sich ausschließende RNA-Strukturen
ausgebildet werden - das cspA cold-shock RNA-Thermometer stabilisiert bei niedriger Temperatur die mRNA
falsch
??
richtig
richtig
Ankreuzen zu trans-codierter sRNA (ja/nein):
- sie regulieren die Virulenz, den Stoffwechsel und die Stressadaptation
- sie können Translationsinhibition, mRNA-Degradation und Translationsaktivierung
bewirken - sie haben mehrere mRNAs als target
- sie stammen von einem anderen Lokus im Genom, als das target
- sie benötigen meistens andere Proteinfaktoren um an das tagret zu binden
- Hfq rekrutiert das Degradosom über RNAse III
richtig
richtig (??)
richtig
richtig
falsch
falsch (Rnase E rekrutiert das Degradosom)
. ankreuzen zu cis-codierter asRNA (ja/nein):
- sie stammen vom selben Genlokus und haben einen eigenen Promotor und Terminator
- die von RNAse III vermittelte Spaltung kann zur Stabilisierung oder zur Degradation der
target-mRNA führen - sie können mehrere mRNAs als targets haben
- sie kontrollieren den Stoffwechsel, die Stressantwort oder die Toxinbildung
- die Regulation erfolgt auf Ebene der Transkription, der Translation oder der mRNAStabilität
richtig
falsch (eiegntlich nur Degradation und keine Stabilisierung)
falsch (nur eine DNA als target)
richtig
richtig
. Welche Funktion hat das CRIPR-Cas-System bei Prokaryoten? Wie heißen die drei
Hauptphasen des CRISPR-Mechanismus?
Verteidigungsmechanismus gegen Fremd-DNA von z.B Phagen.
Adaption, Expression, Interferenz
ankreuzen zu siRNA (ja/nein):
- der Mechanismus kommt bei Prokaryoten und Eukaryoten bis hin zu Säugern vor
- das Protein Dicer ist eine Exonuclease, die doppelsträngige RNA zu 20-25 nt langer siRNA
schneidet - effizientes Silencing erfolgt nur, wenn die siRNA im Überschuss zum target vorliegt
- die prozessierte siRNA hat einen 3 nt Überhang am 3´ Ende
- die prozessierte siRNA hat einen 2´-3´ cyclisches Phosphat am 5´Ende
- in Chloroplasten gibt es keine siRNA-Maschinerie
falsch
richtig
falsch (erfolgt bereits bei wenigen siRNA Molekülen)
falsch (2nt Überhang)
falsch (Monophosphat am 3´ ende)
??
Nennen Sie 2 Humanimpfstoffe, die in Hefe hergestellt werden mit zugehörigem Antigen und
Virus, gegen das sie schützen.
Hepatitis B Virus, HBS Antigenpartikel
HPV, rekombinantes L1 bildet virus-like Particles
Seit 2017 ist in Deutschland der Impfstoff „Strimvelis“ zugelassen. Gegen welchen Gendefekt
und welche Folgeerkrankung dient die Therapie? Wie erfolgt der Genteransfer (Vektor und
Zielzellen nennen)?
Strimvelis hilft Kindern mit der schweren Erbkrankheit ADA-SCID.
??
