Föreläsningar Flashcards
Vad är virus för något?
“Obligata intracellulära parasiter utan egen metabolism”
De fyra grundstrukturerna av virus?
Ikosaeder
Helikal
Naken capsid - utan hölje
Höljd
(Ikosaeder eller Helikal - med eller utan hölje)
Herpesvirus består av?
Ikosaeder och lipidhölje
Valpsjukevirus består av?
Helikal och lipidhölje
Adenovirus består av?
Ikosaeder utan hölje
Tobaksmosaikvirus består av?
Helikal utan hölje
Virus är uppbyggda av?
Arvsmassa
Proteinskal
Vissa har lipidmembran
Proteinskalets uppbyggnad?
Byggs upp av enheter (subenheter)
- Strukturell enhet
- Organisation på femfaldiga axlar
- Kapsid
Exempel på poxvirus?
smittkoppor, kokoppor, apkoppor, getkoppor etc.
Vad är kapsid?
Proteinskalet
Vad är nukleokapsid?
Med arvsmassan
Vad är en virion?
En infektiös viruspartikel
Vart finns strukturella proteiner och icke-strukturella proteiner?
Strukturella proteiner - finns i virionet
Icke-strukturella - finns ej i virionet
Vilka strukturella komponenter består Ikosaeder utan hölje av?
består av kapsomer och nukleokapsid
Vilka strukturella komponenter består Helikal utan hölje av?
består av kapsomer och nukleokapsid
Vilka strukturella komponenter består Ikosaeder med hölje av?
består av kapsomer, spike/peplomer (viralt glykoprotein), kapsid och hölje (lipid)
Vilka strukturella komponenter består Helikal med hölje av?
består av kapsomer, spike/peplomer (viralt glykoprotein), hölje (lipid) och nukleokapsid
Vad är spike/peplomer?
Viralt glykoprotein?
Arvsmassans funktion?
“ritning” som styr hela förökningsprocessen i cellen och värddjuret
Proteinskalets funktion?
skydd mot miljön, bindning till celler
Andra kapsidproteiners funktion?
deltar i infektionsprocessen på olika sätt
Lipidhöljets funktion?
skydd och delta i virusets upptag
Arvsmassan innehåller all information som viruset behöver för att?
Kunna genomgå en full infektionscykel, dvs föröka sig
Virus DNA kan vara?
Dubbelsträngad enligt klassisk modell
- Linjär eller cirkulär
Enkelsträngad
- Linjär eller cirkulär
Virus RNA kan vara? och omvandlas från?
Enkelsträngad
- Positiv eller negativ sense
Dubbelsträngad
Omvandlas från RNA till DNA under replikationen
Ett exempel på ett “enkelt virus”?
Circovirus
Ett exempel på ett super komplext virus?
Asfarvirus
Ett exempel på ett enkelt RNA virus?
Picornavirus
Ett exempel på ett komplext RNA virus?
Coronavirus
- FIPV, SARS-CoV-2 och många mer
Två metoder för klassificering utifrån genom typer och hur dess mRNA bildas?
Baltimoremetoden
Molekylär metod-replikationen
Hur förökar sig virus? (virus infketionscykel i 7 steg)
Löpande band-delar produceras och sätts ihop
- Bindning till cellreceptor
- Inträde och uncoating
- Tidigt genuttryck
- Replikation av virusgenomet
- Sent genuttryck
- Samling av vironer
- Utträde / exit
Vad används av virus för att binda till cellen?
Cellulära receptormolekyler
- En hel del virus kan binda till fler receptorer på olika sätt
Upptag av virus sker via? (2 st)
- Direkt fusion
- Receptormedierad endocytos - olika varianter
Vart sker förökningen av virus?
I virusfabriker
Vad är virusfabriker?
Där sker förökningen
- Virusfabriker är intracellulära avdelningar (inneslutningar) som ökar effektiviteten i virusreplikationen och skyddar den mot värdförsvaret.
- Virusfabriker kan vara antingen cytoplasmatiska eller nukleära och uppstår ofta genom omfattande omarrangemang av värdcellens cytoskelett och/eller cellmembran.
Vad kan uppstå vid kopiering av arvsmassan?
punktmutationer (istället för a blir det ett b)
deletioner
insertioner (små inkorporeringar)
RNA beroende RNA polymeras tillåter?
Felinkorporering, vilket gör att punktmutationer uppstår
- även insertioner och deletioner (vid själva kopieringen)
Vad är reassortment?
Blandning av gensegment via saminfektion
- gör att helt nya virus uppkommer
- Segmenten är utbytbara
- Gensegmenten omfördelas
- Finns andra virus som har segmenterande genom, men influensa är vanligast
Vad är rekombination?
Delar av två liknande RNA molekyler bryts och delas under replikationen
- Inga segmenterande genom
- Polymeraset kan byta från det röda till det blå viruset - rekombination
- Ett känt virus för detta är coronavirus
- Vaccin måste uppdateras hela tiden
Vad är assembly?
Ihopsättning av komponenterna
- Alla virioner genomför en gemensam uppsättning sammansättningsreaktioner (assembly reactions)
Hur går ihopsättningen av komponenterna för virus till? (6 steg)
Bildande av enskilda strukturella enheter av proteinskalet från ett eller flera virusproteiner.
↓
Proteinskalets sammansättning genom lämpliga och ibland varierande interaktioner mellan strukturella enheter.
↓
Selektiv paketering av nukleinsyragenomet och andra viktiga virionkomponenter.
↓
Anskaffning av ett hölje. (görs inte av alla)
↓
Frigörelse från värdcellen.
↓
Mognad av viruspartiklar. (görs inte av alla)
Virala nukleinsyran har? Vad är problemet med nukleinsyra?
Packningssignaler
Problemet med nukleinsyra - viruset har lagt ner mycket energi för att bygga upp sig
Vad är packningssignaler?
- markeringar som känns igen av en pump
- matar in arvsmassan genom ett hål i viruspartikeln
- när ett helt virusgenom har kommit in stängs kanalen igen
- (detta är ex. på herpesvirus)
Frigörning av virus från cellen?
- genom avknoppning (budding)
- genom cell-lys
Vad är avknoppning (budding)?
Avknoppning - i cellmembranet sitter virala proteiner - viruset tar sig in och knoppas av från cellens membran
Vad är cell-lys?
- “Death protein” (adenovirus E3-11,6K)
- Klara att infektera ny cell (vissa behöver “mogna”)
- Virus lyserar / sprängs
Vad är R0?
Det antal personer som en sjuk person i genomsnitt kommer att smitta kallas R0.
- Varje individ som är smittat, hur många kan de smitta i sin tur - ett mått på hur många som blir/är smittade
Vad är horisontell smittspridning? (2 olika)
Horisontellt:
- Indirekt: vektorer (insekter), luftburna droppar (aerosol), vatten, mat/föda, transporter/redskap, veterinärer
- Direkt: fysisk kontakt, sexuell, slickande, bitande
Vad är vertikal smittspridning?
Vertikalt:
- Överföring till foster eller nyfödd
- Egenskaper och “livsstil” hos respektive virus - en del kan smitta på flera sätt
Smitta via vattendroppar? (2 olika)
- Droppsmitta (hosta, nysningar) - vattendropparna har en viss storlek, när de åker ut droppar de ner på marken väldigt snabbt
- Aerosol (vanlig utandning) - mindre vattendroppar men kan sprida sig mycket längre
Smittcykel vektorer?
- Sylvatisk smittcykel - vild
- Viruset snurrar runt i smittcykeln
- Vilda fåglar - nilfeber - kan smitta runt via fåglar och myggor - en smittcykel i naturen som generellt sett inte påverkar fåglarna eller myggorna - biter myggan ett djur eller människa kan vi bli väldigt sjuka - men vi kan inte sprida tillbaka (dead end host)
Vilka symtom orsakar rotavirus?
- Inducerad diarré och kräkningar
- Enorma mängder i mag-tarmkanalen - inducerar reflexer till kräkningar via hjärnan
Rabies - påverkar hjärnan till aggressivt beteende?
Rabiesvirus kommer in via bett och transporteras till hjärnan och vidare till spottkörtlarna vilket kan inducera ett aggressivt beteende - aggressiva djur kan i sin tur attackera andra och sprida vidare viruset