Instuderingsfrågor Flashcards
Hur stora är virus?
- 20 till 300 nm
- Gigantiska virus är större, men är undantag och få
- Virus är ca 100 till 1000 gånger mindre än bakterier.
Hur är virus uppbyggda?
Uppbyggda av arvsmassa, proteinskal, vissa har lipidmembran
Hur är virus uppbyggda? (längre definition)
Beståndsdelar:
- Arvsmassa (DNA eller RNA, enkel eller dubbelsträngat)
- Proteinskal, s.k kapsid (naket virus)
- Vissa har lipidmembran (enveloped virus)
- Spikes/peplomerer
- Ytprotein som hemagglutinin & neuroaminidas
Nukleokapsiden kan ha olika form:
- Många virus är uppbyggda ikosahedriskt, regelbundet av proteinenheter.
- Andra är uppbyggda helikalt, som cylindrar.
Enligt vilka fyra huvudsakliga grundstrukturer är virus uppbyggda?
- Ikosahedral
- Helikal
- Nakna
- Med lipidmembran (enveloped)
Ikosahedral och helikal (nakna - utan hölje).
Ikosahedral och helikal med hölje (lipidhölje med glykoproteiner).
Vad är en kapsid?
Kapsid: proteinskal, skydd runt arvsmassan uppbyggt av små identiska subenheter: kapsomer.
Vad är en nukleokapsid?
Nukleokapsid= kapsid + arvsmassa
(hölje med innesluten aminosyra)
Vad är en virion?
En infektiös viruspartikel
Nämn några egenskaper som skiljer virus från alla andra kända livsformer?
- Kan ha olika typer av arvsmassa. RNA/DNA och dubbel/enkelsträngat.
- Måste föröka sig i en levande cell
- Har flera förökningssätt
- Samtliga har förmågan att fördröja eller hejda värdens immunsvar.
- Virus saknar metabolism
Vilka olika typer av arvsmassa kan virus ha?
- dsDNA (dubbelsträngat) (linjär eller cirkulär)
- ssDNA (enkelsträngat) (linjär eller cirkulär)
- dsRNA (dubbelsträngat)
- ssRNA (+/-) (enkelsträngat, positiv eller negativ sense)
Hur förökar sig virus? (7 steg)
Löpande band-delar produceras och sätts ihop.
OBS levande celler är nödvändiga!
- Binder till cellreceptor
- Inträde i cellen och öppnar kapsid - arvsmassan frisätts
- Tidig genexpression - ta över cellerna, bygga om och förändra cellen - kommer bara producera virus
- Replikation av virusgenom
- Sen genexpression - andra gener produceras - de som bygger ihop viruspartikeln
- Ihopsättning av virioner
- Exit, nya virus tar sig ut
Vad är tropism?
möjlighet att föröka sig - förmåga att infektera
Vad är skillnaden mellan en generell replikationscykel hos DNA- resp. RNA-virus?
RNA kan alltid använda sig av cellens DNA-polymerase, och har ingen tidig eller sen fas.
- RNA virus har replikation i cytoplasman
DNA behöver sitt eget polymerase och har både tidig och sen fas.
- DNA virus har replikation i cellkärnan
Beskriv gemensamma steg i replikationscykeln för ett DNA respektive RNA virus? (3 st)
- Fastsättning till cell
- Tar sig in i cellen, direktfussion eller via endosytos
- Väl inne måste viruspartickeln öppnas upp så att arvsmassan kommer fram
Allmänt om RNA-virus och dess replikationscykel?
- Har RNA genom,
- finns inga enzymer i cellen som kan kopiera RNAmolekyler
- Finns + eller - RNAvirus
- RNAvirus har genom som kan fungera som mRNA -> celler börjar producera proteiner direkt
- Ett av dessa proteioner gör en komplimentär -RNAsträng
- Andra delar av uppchoppat protein används för att bygga nya virus
- Sen tar virus sig ut genom avknoppning eller att cellen sprängs
Allmänt om DNA-virus och dess replikationscykel?
- Måste in i cellkärnan
- Där uppfattas de som vilket DNA som helst
- mRNA produceras
- Stänger av imunförsvar tar över cellen
- När har dubbelsträngade DNAkopior så börjar proteiner som ska bygga virusparticklar tillverkas
- Virus transporteras till cellmembranet knoppas av eller cellen sprängs
Vad är “attachment” eller fastsättning?
Attachment är när viruset fäster till cellmembranet med hjälp av receptorer på cellmembranet som cellen egentligen ska ha till något annat.
- Viruset binder till cellens receptorer för att kunna ta sig in i cellen.
Hur tar sig virus in i celler? (allmänt - 2 metoder)
Direkt fussion och receptormedierad-endocytos.
Hur tar sig virus in i celler? - Receptormedierad endocytos?
För virus med och utan hölje:
-Tas in via en vesikel, blir en endosom
- arvsmassan tar sig på olika sätt ut i cytoplasman (te.x fussera med lysosom).
Hur tar sig virus in i celler? - Direkt fusion?
Endast för virus med lipidhölje:
- Peplomerer med fusionsegenskaper penetrerar cellmembranet.
- Virusets lipidmembran smälter samman med cellmembranet
- Naken nukleokapsid tar sig in i cytoplasman.
Hur tar sig virus in i celler? - Vissa virus, bacterial phage - vad är det?
- Virus injicerar sitt genetiska material direkt i cellen.
Vad kännetrcknar fasen under replikationscykeln som kallar “early” eller tidig? (5 st)
- Sker endast i DNA
- Förbereder sig på att över cellen,
- Viruset måste värja sig mot cellens försvar - stänger av försvarsmekanismer
- Proteiner produceras som kan vinna över kroppens försvar.
- Genomreplikation.
Vad kännetecknar fasen under replikationscykeln som kallas “late” eller sena fasen? (2 st)
-Beståndsdelar till virionen produceras - de som bygger upp viruspartikeln
- Nya viruspartiklar lämnar värdcellen.
Fundera lite på hur mRNAn bildas utifrån de olika typerna av viral arvsmassa? (ssDNA)
ssDNA -> dsDNA -> +ssRNA = mRNA, en komplimentärsträng görs innan transkription till mRNA kan göras
Fundera lite på hur mRNAn bildas utifrån de olika typerna av viral arvsmassa? (dsDNA)
dsDNA -> +ssRNA= mRNA, inne i cellkärnan transkriberar cellens RNA-polymeras det virala genomet.
Fundera lite på hur mRNAn bildas utifrån de olika typerna av viral arvsmassa? (+ssRNA)
+ssRNA är ett funktionellt mRNA, i cytoplasman läser ribosomerna det virala genomet som ett mRNA, det translateras direkt till virala proteiner.
Fundera lite på hur mRNAn bildas utifrån de olika typerna av viral arvsmassa? (-ssRNA)
-ssRNA -> +ssRNA =mRNA, virus gör i cytoplasman om sig själv till en mRNAmall dsRNA -> mRNA
Hur kopieras dess arvsmassa utifrån de olika typerna av arvsmassa som virus kan ha? (positivt RNA)
Positivt RNA kan translateras direkt till mRNA.
Hur kopieras dess arvsmassa utifrån de olika typerna av arvsmassa som virus kan ha? (negativt RNA)
Negativt RNA behöver polymeras för att kunna bli ett positivt RNA (–> mRNA), eftersom den inte kan translateras direkt.
Hur kopieras dess arvsmassa utifrån de olika typerna av arvsmassa som virus kan ha? (dsRNA)
Dubbelsträngat RNA - en sträng används som mall till translationen.
Hur kopieras dess arvsmassa utifrån de olika typerna av arvsmassa som virus kan ha? (dsDNA och ssDNA)
Dubbelsträngat DNA sker som vanligt.
Enkel-strängat DNA transkriberas till dubbelsträngat.
Hur undviker virus att packa in cellens nukleinsyra i sina kapsider?
Genom packnings signaler som är unika sekvensmotiv i arvsmassan som viruset känner igen. Signalerna binder till en “vev” som vevar in in nukleinsyrorna som sedan stängs igen.
Varför talar man om “löpande band principen” när det gäller virusreplikationen?
Ett virus tar sig in i cellen, replikeras och producerar nya komponenter, nya och flera virus kommer ut och sprids vidare.
Hur tar sig virus ut ur celler? (2 st)
Knoppas av eller blir så många att cellen spricker (lyserar)
- Avknoppning (virus med hölje)
- Lysering (virus utan hölje).
Nämn några sätt som virus transporteras i cellen? (2 st)
- Med vesiklar (endosom, lysosom)
- Fritt i cellen